MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 29732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014220	CAG	2	6	89	94	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014220	ACT	2	6	118	123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616215
3	NC_014220	ACA	2	6	223	228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616215
4	NC_014220	GTA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616215
5	NC_014220	TGC	2	6	446	451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616215
6	NC_014220	CGG	2	6	506	511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616215
7	NC_014220	CTT	2	6	574	579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616215
8	NC_014220	CAG	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616215
9	NC_014220	GAC	2	6	696	701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616215
10	NC_014220	AAG	2	6	733	738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616215
11	NC_014220	TTA	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616215
12	NC_014220	ATG	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616215
13	NC_014220	TTG	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616215
14	NC_014220	AGA	3	9	1166	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616215
15	NC_014220	CGG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616215
16	NC_014220	CAT	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616215
17	NC_014220	CAC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616215
18	NC_014220	TCT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616215
19	NC_014220	TTA	2	6	1356	1361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616215
20	NC_014220	CTA	3	9	1490	1498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014220	AAC	2	6	1514	1519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014220	AAG	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014220	TGC	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616216
24	NC_014220	ACT	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616216
25	NC_014220	AGA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
26	NC_014220	GAC	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616216
27	NC_014220	GTC	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616216
28	NC_014220	CCT	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616216
29	NC_014220	GTT	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616216
30	NC_014220	GTA	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616216
31	NC_014220	ATG	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616216
32	NC_014220	TCT	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616216
33	NC_014220	AGA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
34	NC_014220	AAG	2	6	2489	2494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
35	NC_014220	CCT	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616216
36	NC_014220	GCC	2	6	2906	2911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616217
37	NC_014220	TGA	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616217
38	NC_014220	ATT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616217
39	NC_014220	AGC	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616217
40	NC_014220	AAC	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616217
41	NC_014220	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
42	NC_014220	CGT	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
43	NC_014220	AGA	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
44	NC_014220	CGG	2	6	3106	3111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616217
45	NC_014220	TAC	2	6	3242	3247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616217
46	NC_014220	TGC	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
47	NC_014220	AGA	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
48	NC_014220	GGA	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616217
49	NC_014220	GCA	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616217
50	NC_014220	AGA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
51	NC_014220	GTA	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616217
52	NC_014220	GAG	2	6	3808	3813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616217
53	NC_014220	ATA	2	6	3922	3927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616218
54	NC_014220	ATA	2	6	3991	3996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616218
55	NC_014220	TTC	2	6	4026	4031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616218
56	NC_014220	AGG	3	9	4065	4073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616218
57	NC_014220	TCT	2	6	4074	4079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616218
58	NC_014220	CAC	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616219
59	NC_014220	ACA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
60	NC_014220	TGA	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616219
61	NC_014220	TTA	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616219
62	NC_014220	GAC	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616219
63	NC_014220	GTG	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616219
64	NC_014220	ATC	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616219
65	NC_014220	AAC	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
66	NC_014220	ATA	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616219
67	NC_014220	GGA	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616219
68	NC_014220	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
69	NC_014220	CAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
70	NC_014220	GGT	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616219
71	NC_014220	GCG	2	6	5220	5225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616219
72	NC_014220	CGG	2	6	5226	5231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616219
73	NC_014220	AGC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616219
74	NC_014220	CCG	2	6	5371	5376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616219
75	NC_014220	ACC	2	6	5557	5562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616219
76	NC_014220	TTA	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616219
77	NC_014220	TTG	2	6	5613	5618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616219
78	NC_014220	TTC	2	6	5625	5630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616219
79	NC_014220	GCC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616219
80	NC_014220	AAG	2	6	5710	5715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
81	NC_014220	AAG	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
82	NC_014220	GCT	2	6	5861	5866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616219
83	NC_014220	TGA	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014220	GAA	2	6	6207	6212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014220	ACT	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
86	NC_014220	TCG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616220
87	NC_014220	TGG	2	6	6430	6435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
88	NC_014220	ATG	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
89	NC_014220	GTA	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
90	NC_014220	CTA	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
91	NC_014220	TTG	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
92	NC_014220	AGA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
93	NC_014220	TTG	2	6	6997	7002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
94	NC_014220	TGG	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
95	NC_014220	AGG	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616220
96	NC_014220	TGG	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
97	NC_014220	ACC	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616220
98	NC_014220	TAA	2	6	7303	7308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616220
99	NC_014220	GGC	2	6	7309	7314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616220
100	NC_014220	TAG	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
101	NC_014220	AAC	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616220
102	NC_014220	TTG	2	6	7492	7497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
103	NC_014220	GGA	2	6	7541	7546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616220
104	NC_014220	GAA	2	6	7725	7730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
105	NC_014220	GAC	2	6	7868	7873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616220
106	NC_014220	TTG	2	6	7887	7892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
107	NC_014220	TTA	2	6	7975	7980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616220
108	NC_014220	CGA	2	6	8099	8104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616220
109	NC_014220	CAT	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
110	NC_014220	TGA	2	6	8237	8242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
111	NC_014220	GCT	2	6	8271	8276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616220
112	NC_014220	TGT	2	6	8350	8355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
113	NC_014220	GTC	2	6	8586	8591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616220
114	NC_014220	GAA	3	9	8649	8657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
115	NC_014220	TAC	2	6	8775	8780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616221
116	NC_014220	GAA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616221
117	NC_014220	AAT	2	6	8907	8912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616221
118	NC_014220	TTG	2	6	8960	8965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616221
119	NC_014220	TGA	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
120	NC_014220	CAA	2	6	9048	9053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616221
121	NC_014220	AGC	2	6	9126	9131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616221
122	NC_014220	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
123	NC_014220	TAG	3	9	9284	9292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
124	NC_014220	GGT	2	6	9318	9323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616221
125	NC_014220	ATG	2	6	9370	9375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
126	NC_014220	ATG	2	6	9473	9478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
127	NC_014220	GAA	2	6	9556	9561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616221
128	NC_014220	AGG	2	6	9633	9638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616222
129	NC_014220	TCG	2	6	9750	9755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616222
130	NC_014220	GGC	2	6	9784	9789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616222
131	NC_014220	GAA	2	6	9791	9796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616222
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259	NC_014220	GAA	2	6	19580	19585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_014220	ATA	2	6	19692	19697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_014220	TAA	2	6	19709	19714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_014220	ATT	2	6	19718	19723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_014220	CGA	2	6	19786	19791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616230
264	NC_014220	GCA	2	6	19792	19797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616230
265	NC_014220	GTT	2	6	19804	19809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616230
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267	NC_014220	GAA	2	6	19928	19933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616230
268	NC_014220	ACG	2	6	19986	19991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616230
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270	NC_014220	AGC	2	6	20334	20339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_014220	TCG	2	6	20531	20536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616231
272	NC_014220	TGC	3	9	20603	20611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616231
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279	NC_014220	TCT	2	6	20979	20984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616231
280	NC_014220	GCC	2	6	21106	21111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616231
281	NC_014220	TCG	2	6	21188	21193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616231
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498	NC_014220	TAA	2	6	37996	38001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616246
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