MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 25751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014220	ACT	2	6	118	123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616215
2	NC_014220	ACA	2	6	223	228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616215
3	NC_014220	GTA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616215
4	NC_014220	TGC	2	6	446	451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616215
5	NC_014220	CGG	2	6	506	511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616215
6	NC_014220	CTT	2	6	574	579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616215
7	NC_014220	CAG	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616215
8	NC_014220	GAC	2	6	696	701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616215
9	NC_014220	AAG	2	6	733	738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616215
10	NC_014220	TTA	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616215
11	NC_014220	ATG	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616215
12	NC_014220	TTG	2	6	1021	1026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616215
13	NC_014220	AGA	3	9	1166	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616215
14	NC_014220	CGG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616215
15	NC_014220	CAT	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616215
16	NC_014220	CAC	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616215
17	NC_014220	TCT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616215
18	NC_014220	TTA	2	6	1356	1361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616215
19	NC_014220	TGC	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616216
20	NC_014220	ACT	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616216
21	NC_014220	AGA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
22	NC_014220	GAC	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616216
23	NC_014220	GTC	2	6	1913	1918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616216
24	NC_014220	CCT	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616216
25	NC_014220	GTT	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616216
26	NC_014220	GTA	2	6	2059	2064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616216
27	NC_014220	ATG	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616216
28	NC_014220	TCT	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616216
29	NC_014220	AGA	2	6	2178	2183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
30	NC_014220	AAG	2	6	2489	2494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616216
31	NC_014220	CCT	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616216
32	NC_014220	GCC	2	6	2906	2911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616217
33	NC_014220	TGA	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616217
34	NC_014220	ATT	2	6	2959	2964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616217
35	NC_014220	AGC	2	6	2969	2974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616217
36	NC_014220	AAC	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616217
37	NC_014220	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
38	NC_014220	CGT	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
39	NC_014220	AGA	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
40	NC_014220	CGG	2	6	3106	3111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616217
41	NC_014220	TAC	2	6	3242	3247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616217
42	NC_014220	TGC	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616217
43	NC_014220	AGA	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
44	NC_014220	GGA	2	6	3683	3688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616217
45	NC_014220	GCA	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616217
46	NC_014220	AGA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616217
47	NC_014220	GTA	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616217
48	NC_014220	GAG	2	6	3808	3813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616217
49	NC_014220	ATA	2	6	3922	3927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616218
50	NC_014220	ATA	2	6	3991	3996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616218
51	NC_014220	TTC	2	6	4026	4031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616218
52	NC_014220	AGG	3	9	4065	4073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616218
53	NC_014220	TCT	2	6	4074	4079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616218
54	NC_014220	CAC	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616219
55	NC_014220	ACA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
56	NC_014220	TGA	2	6	4262	4267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616219
57	NC_014220	TTA	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616219
58	NC_014220	GAC	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616219
59	NC_014220	GTG	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616219
60	NC_014220	ATC	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616219
61	NC_014220	AAC	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
62	NC_014220	ATA	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616219
63	NC_014220	GGA	2	6	4749	4754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616219
64	NC_014220	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
65	NC_014220	CAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616219
66	NC_014220	GGT	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616219
67	NC_014220	GCG	2	6	5220	5225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616219
68	NC_014220	CGG	2	6	5226	5231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616219
69	NC_014220	AGC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616219
70	NC_014220	CCG	2	6	5371	5376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616219
71	NC_014220	ACC	2	6	5557	5562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616219
72	NC_014220	TTA	2	6	5566	5571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616219
73	NC_014220	TTG	2	6	5613	5618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616219
74	NC_014220	TTC	2	6	5625	5630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616219
75	NC_014220	GCC	2	6	5681	5686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616219
76	NC_014220	AAG	2	6	5710	5715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
77	NC_014220	AAG	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616219
78	NC_014220	GCT	2	6	5861	5866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616219
79	NC_014220	ACT	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
80	NC_014220	TCG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616220
81	NC_014220	TGG	2	6	6430	6435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
82	NC_014220	ATG	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
83	NC_014220	GTA	2	6	6693	6698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
84	NC_014220	CTA	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
85	NC_014220	TTG	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
86	NC_014220	AGA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
87	NC_014220	TTG	2	6	6997	7002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
88	NC_014220	TGG	2	6	7039	7044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
89	NC_014220	AGG	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616220
90	NC_014220	TGG	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616220
91	NC_014220	ACC	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616220
92	NC_014220	TAA	2	6	7303	7308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616220
93	NC_014220	GGC	2	6	7309	7314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616220
94	NC_014220	TAG	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
95	NC_014220	AAC	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616220
96	NC_014220	TTG	2	6	7492	7497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
97	NC_014220	GGA	2	6	7541	7546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616220
98	NC_014220	GAA	2	6	7725	7730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
99	NC_014220	GAC	2	6	7868	7873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616220
100	NC_014220	TTG	2	6	7887	7892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
101	NC_014220	TTA	2	6	7975	7980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616220
102	NC_014220	CGA	2	6	8099	8104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616220
103	NC_014220	CAT	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616220
104	NC_014220	TGA	2	6	8237	8242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616220
105	NC_014220	GCT	2	6	8271	8276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616220
106	NC_014220	TGT	2	6	8350	8355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616220
107	NC_014220	GTC	2	6	8586	8591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616220
108	NC_014220	GAA	3	9	8649	8657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616220
109	NC_014220	TAC	2	6	8775	8780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616221
110	NC_014220	GAA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616221
111	NC_014220	AAT	2	6	8907	8912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616221
112	NC_014220	TTG	2	6	8960	8965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616221
113	NC_014220	TGA	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
114	NC_014220	CAA	2	6	9048	9053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616221
115	NC_014220	AGC	2	6	9126	9131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616221
116	NC_014220	TGA	2	6	9245	9250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
117	NC_014220	TAG	3	9	9284	9292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
118	NC_014220	GGT	2	6	9318	9323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616221
119	NC_014220	ATG	2	6	9370	9375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
120	NC_014220	ATG	2	6	9473	9478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616221
121	NC_014220	GAA	2	6	9556	9561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616221
122	NC_014220	AGG	2	6	9633	9638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616222
123	NC_014220	TCG	2	6	9750	9755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616222
124	NC_014220	GGC	2	6	9784	9789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616222
125	NC_014220	GAA	2	6	9791	9796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616222
126	NC_014220	GAT	2	6	9826	9831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616222
127	NC_014220	ATT	2	6	9848	9853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616222
128	NC_014220	GAG	2	6	9932	9937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616222
129	NC_014220	GAG	2	6	10014	10019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616222
130	NC_014220	GAA	2	6	10477	10482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616223
131	NC_014220	ACC	2	6	10556	10561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616223
132	NC_014220	AGC	2	6	10674	10679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616223
133	NC_014220	GTT	3	9	10873	10881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616223
134	NC_014220	ACC	2	6	10946	10951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616223
135	NC_014220	ATT	2	6	10956	10961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616223
136	NC_014220	TTA	2	6	11133	11138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616223
137	NC_014220	GAT	2	6	11235	11240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616223
138	NC_014220	TCG	2	6	11353	11358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616223
139	NC_014220	GTC	2	6	11434	11439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616223
140	NC_014220	CGG	2	6	11445	11450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616223
141	NC_014220	GAC	2	6	11464	11469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616223
142	NC_014220	CCT	2	6	11514	11519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616223
143	NC_014220	GCC	2	6	11530	11535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616223
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147	NC_014220	TGG	2	6	11834	11839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616224
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151	NC_014220	TCT	2	6	11965	11970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616224
152	NC_014220	TGG	2	6	12095	12100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616224
153	NC_014220	ATC	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616224
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155	NC_014220	AGA	2	6	12201	12206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616224
156	NC_014220	ATC	2	6	12226	12231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616224
157	NC_014220	GAT	2	6	12267	12272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616224
158	NC_014220	CAT	2	6	12336	12341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616224
159	NC_014220	TGG	2	6	12356	12361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616224
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162	NC_014220	GTT	2	6	12435	12440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616224
163	NC_014220	CTC	2	6	12464	12469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616224
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238	NC_014220	TTC	2	6	21765	21770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616232
239	NC_014220	TAG	2	6	21875	21880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616232
240	NC_014220	CAG	2	6	21933	21938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616232
241	NC_014220	TCG	2	6	21973	21978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616232
242	NC_014220	GAA	2	6	21983	21988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616232
243	NC_014220	GCT	2	6	21995	22000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616232
244	NC_014220	GCA	2	6	22016	22021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616232
245	NC_014220	CGG	2	6	22027	22032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616232
246	NC_014220	GTG	2	6	22086	22091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616232
247	NC_014220	ACC	2	6	22093	22098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616232
248	NC_014220	TTC	2	6	22195	22200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616232
249	NC_014220	GTC	2	6	22308	22313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616232
250	NC_014220	AAC	2	6	22333	22338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616232
251	NC_014220	GAT	2	6	22812	22817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616233
252	NC_014220	ACG	2	6	22824	22829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616233
253	NC_014220	ACT	2	6	22859	22864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616233
254	NC_014220	GGC	2	6	22913	22918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616233
255	NC_014220	TCA	2	6	23052	23057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616233
256	NC_014220	CTA	2	6	23115	23120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616233
257	NC_014220	GCC	2	6	23210	23215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616233
258	NC_014220	ATG	2	6	23417	23422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616233
259	NC_014220	AGG	2	6	23450	23455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616233
260	NC_014220	GAT	2	6	23525	23530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616233
261	NC_014220	TCC	2	6	23805	23810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616234
262	NC_014220	CTC	2	6	23819	23824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616234
263	NC_014220	TCC	2	6	23856	23861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616234
264	NC_014220	ATT	2	6	23918	23923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616234
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267	NC_014220	CTC	2	6	24104	24109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616234
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271	NC_014220	ATG	2	6	24231	24236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616234
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275	NC_014220	GCC	2	6	24322	24327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616234
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279	NC_014220	AGG	2	6	24442	24447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616234
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284	NC_014220	CGG	2	6	25153	25158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616235
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287	NC_014220	CAG	2	6	25630	25635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616235
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328	NC_014220	TCG	2	6	30191	30196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616238
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370	NC_014220	GGA	2	6	33595	33600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616241
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