MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcanobacterium haemolyticum DSM 20595 chromosome

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014218	CTCCC	2	10	10937	10946	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_014218	TCACT	2	10	16780	16789	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014218	GCTGG	2	10	22102	22111	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014218	CCACC	2	10	46102	46111	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5	NC_014218	GTGTT	2	10	47438	47447	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014218	AGGAA	2	10	50155	50164	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014218	GCCTT	2	10	59204	59213	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014218	TCTCC	2	10	74081	74090	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_014218	GTTTA	2	10	109495	109504	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014218	ACATA	2	10	123062	123071	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014218	TAAGT	2	10	123573	123582	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014218	GGGGC	2	10	139827	139836	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014218	GTTGG	2	10	147966	147975	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014218	CTCAT	2	10	154787	154796	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014218	AAGCG	2	10	161974	161983	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014218	CTAAA	2	10	162017	162026	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014218	TGGAC	2	10	206757	206766	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014218	ACAAT	2	10	215998	216007	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014218	TTCCT	2	10	218565	218574	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014218	GAAAG	2	10	247964	247973	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014218	ATGTG	2	10	256110	256119	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014218	TAAGC	2	10	265481	265490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014218	CTAAA	2	10	280100	280109	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014218	AGGTC	2	10	316515	316524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014218	TCGTA	2	10	372073	372082	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014218	AGTGC	2	10	384064	384073	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014218	TCGGT	2	10	384165	384174	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014218	CCTAA	2	10	396911	396920	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014218	GTGAA	2	10	398355	398364	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014218	CGATA	2	10	406442	406451	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014218	ATCAT	2	10	414116	414125	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014218	GATGT	2	10	415984	415993	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014218	AGTCC	2	10	420768	420777	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014218	TCACT	2	10	431349	431358	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014218	GAAAT	2	10	437198	437207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014218	TTTTA	2	10	454332	454341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014218	AGGAA	2	10	458118	458127	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014218	TGGTT	2	10	467827	467836	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014218	TGGTT	2	10	467841	467850	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014218	GAGGG	2	10	488437	488446	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014218	TGGTG	2	10	493353	493362	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014218	TTGGT	2	10	493393	493402	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014218	TCGTG	2	10	494787	494796	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014218	CTTGT	2	10	494831	494840	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014218	CGTCA	2	10	495123	495132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014218	TGGTG	2	10	495449	495458	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014218	GGGAG	2	10	496063	496072	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014218	CACAA	2	10	498836	498845	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014218	CGTTG	2	10	499804	499813	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014218	TGAGT	2	10	508313	508322	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014218	AACGT	2	10	524170	524179	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014218	CCACC	2	10	529971	529980	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
53	NC_014218	GCTCT	2	10	536744	536753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014218	GAAAC	2	10	539010	539019	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014218	GGTTT	2	10	540203	540212	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014218	TCTGC	2	10	540529	540538	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014218	GGTTG	2	10	542133	542142	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014218	GCTGT	2	10	546316	546325	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014218	CAAAA	2	10	546820	546829	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014218	AGCCT	2	10	562296	562305	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014218	GGTTG	2	10	571930	571939	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014218	CCAAC	2	10	571948	571957	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_014218	GGTCA	2	10	591139	591148	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014218	CGCCT	2	10	595264	595273	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_014218	AGCGA	2	10	599519	599528	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014218	GGGTG	2	10	615521	615530	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014218	TTGGT	2	10	615585	615594	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014218	GCTTT	2	10	615617	615626	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014218	TGCGT	2	10	616197	616206	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014218	GGGTG	2	10	619164	619173	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014218	AGGCT	2	10	633084	633093	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014218	GATCT	2	10	633234	633243	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014218	GCCAC	2	10	637713	637722	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
74	NC_014218	CACGC	2	10	654450	654459	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_014218	TGCAA	2	10	658581	658590	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014218	AAAAT	2	10	665166	665175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014218	CATCG	2	10	678861	678870	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014218	AGCCC	2	10	681521	681530	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_014218	CGGCC	2	10	719546	719555	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_014218	TCGGT	2	10	719746	719755	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014218	GCGTG	2	10	724014	724023	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014218	GCGCC	2	10	724312	724321	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
83	NC_014218	CTGTT	2	10	739466	739475	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014218	ACGCT	2	10	756557	756566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_014218	GCAGT	2	10	758359	758368	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014218	GGTAG	2	10	790978	790987	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014218	GTGGG	2	10	805726	805735	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014218	ATGAG	2	10	805749	805758	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014218	TAAGG	2	10	823264	823273	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014218	GGCAC	2	10	834815	834824	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014218	CTTCA	2	10	879281	879290	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014218	AAGAT	2	10	897699	897708	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014218	GAGGC	2	10	911976	911985	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014218	AGGCA	2	10	935884	935893	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014218	TGCCT	2	10	935899	935908	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014218	AGAAT	2	10	941157	941166	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014218	TGTGG	2	10	967593	967602	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014218	CTTGA	2	10	971564	971573	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014218	TTTTG	2	10	1006797	1006806	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014218	ATTCG	2	10	1007368	1007377	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014218	TCTCT	2	10	1053790	1053799	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014218	TGGTG	2	10	1069716	1069725	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014218	CTCCC	2	10	1072435	1072444	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
104	NC_014218	CGTGA	2	10	1073373	1073382	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014218	ACAAG	2	10	1073667	1073676	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014218	CACGA	2	10	1073711	1073720	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014218	CAAAC	2	10	1075101	1075110	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_014218	GTTCT	2	10	1094113	1094122	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014218	AAAAC	2	10	1096351	1096360	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014218	GATCA	2	10	1105993	1106002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014218	CAACT	2	10	1109463	1109472	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_014218	GAATT	2	10	1109913	1109922	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014218	GCAAA	2	10	1111927	1111936	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014218	GCACG	2	10	1134840	1134849	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014218	GCCGT	2	10	1143655	1143664	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014218	AACCA	2	10	1149081	1149090	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_014218	CGATC	2	10	1176856	1176865	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014218	GGTTT	2	10	1178660	1178669	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014218	CCATG	2	10	1199457	1199466	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014218	AATCA	2	10	1199564	1199573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014218	ATTTT	2	10	1202192	1202201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014218	ATGTG	2	10	1209221	1209230	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014218	TTAGG	2	10	1212228	1212237	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014218	CGCAA	2	10	1248301	1248310	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014218	TCCCA	2	10	1261758	1261767	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_014218	GCACG	2	10	1273214	1273223	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014218	TAGAG	2	10	1279191	1279200	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014218	CTCCC	2	10	1287270	1287279	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
129	NC_014218	CGTAA	2	10	1329402	1329411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014218	CTCCA	2	10	1331100	1331109	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_014218	GGTCA	2	10	1341927	1341936	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014218	AGCGT	2	10	1345719	1345728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014218	TTCCC	2	10	1367872	1367881	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_014218	GTGGG	2	10	1395373	1395382	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014218	ATAAA	2	10	1411888	1411897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014218	ATGAG	2	10	1426350	1426359	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014218	TTTGT	2	10	1435662	1435671	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014218	TCTTT	2	10	1445320	1445329	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014218	TGGCA	2	10	1446559	1446568	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014218	TGCCA	2	10	1448012	1448021	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_014218	TATTT	2	10	1458491	1458500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014218	CCGGA	2	10	1491488	1491497	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_014218	ACGTG	2	10	1492060	1492069	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014218	TTCTT	3	15	1535952	1535966	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014218	GCAGG	2	10	1537265	1537274	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014218	TTACT	2	10	1537410	1537419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014218	GGGCT	2	10	1547741	1547750	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014218	AGCCC	2	10	1547766	1547775	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
149	NC_014218	TCACA	2	10	1550345	1550354	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_014218	CGAGC	2	10	1679721	1679730	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_014218	CGAGG	2	10	1693452	1693461	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
168	NC_014218	CTGCT	2	10	1700130	1700139	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
169	NC_014218	CGGAT	2	10	1700206	1700215	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
170	NC_014218	CAGGT	2	10	1700730	1700739	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
171	NC_014218	GGCCG	2	10	1703198	1703207	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
172	NC_014218	GTCGA	2	10	1707601	1707610	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_014218	CGTTT	2	10	1776980	1776989	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_014218	TCACA	2	10	1785581	1785590	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
175	NC_014218	TCTAC	2	10	1789205	1789214	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
176	NC_014218	CTCCC	2	10	1813797	1813806	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
177	NC_014218	CGTGA	2	10	1814736	1814745	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
178	NC_014218	ACAAG	2	10	1815030	1815039	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_014218	GTTGA	2	10	1817387	1817396	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014218	GGAGC	2	10	1817807	1817816	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
183	NC_014218	ATTGG	2	10	1820497	1820506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014218	TTGGA	2	10	1822320	1822329	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014218	CTCCA	2	10	1822405	1822414	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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187	NC_014218	TAAAC	2	10	1829183	1829192	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_014218	TTTTC	2	10	1834951	1834960	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_014218	CCTTC	2	10	1853457	1853466	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
190	NC_014218	CACCC	2	10	1859499	1859508	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
191	NC_014218	ATTTT	2	10	1860496	1860505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014218	AGCCA	2	10	1861465	1861474	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_014218	TCACG	2	10	1864413	1864422	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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195	NC_014218	GCAAA	2	10	1888055	1888064	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_014218	GAAGA	2	10	1912856	1912865	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014218	GCGCG	2	10	1913152	1913161	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
199	NC_014218	AATAA	2	10	1916031	1916040	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_014218	GCTCG	2	10	1916641	1916650	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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204	NC_014218	CAAAA	2	10	1925807	1925816	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
205	NC_014218	CACCC	2	10	1933693	1933702	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
206	NC_014218	GCCCA	2	10	1933728	1933737	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
207	NC_014218	CCCCA	2	10	1951280	1951289	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
208	NC_014218	TTTCC	2	10	1951712	1951721	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
209	NC_014218	ACTGG	2	10	1957115	1957124	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
210	NC_014218	ACCTA	2	10	1981241	1981250	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
211	NC_014218	CTCAT	2	10	1981549	1981558	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
212	NC_014218	ACACC	2	10	1983243	1983252	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.