MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Arcanobacterium haemolyticum DSM 20595 chromosome

Total Repeats: 5148

< Previous1234567891011Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014218	ATGC	2	8	1932281	1932288	25 %	25 %	25 %	25 %	297572299
5002	NC_014218	TGGC	2	8	1932365	1932372	0 %	25 %	50 %	25 %	297572299
5003	NC_014218	GCTG	2	8	1932965	1932972	0 %	25 %	50 %	25 %	297572300
5004	NC_014218	CCGG	2	8	1933003	1933010	0 %	0 %	50 %	50 %	297572300
5005	NC_014218	TCCG	2	8	1933331	1933338	0 %	25 %	25 %	50 %	297572300
5006	NC_014218	ATTT	2	8	1933565	1933572	25 %	75 %	0 %	0 %	297572300
5007	NC_014218	CGGC	2	8	1933746	1933753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_014218	GGCC	2	8	1933770	1933777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_014218	ATTC	2	8	1934229	1934236	25 %	50 %	0 %	25 %	297572301
5010	NC_014218	CACT	2	8	1934324	1934331	25 %	25 %	0 %	50 %	297572301
5011	NC_014218	CTGC	2	8	1934394	1934401	0 %	25 %	25 %	50 %	297572301
5012	NC_014218	CGTA	2	8	1935395	1935402	25 %	25 %	25 %	25 %	297572302
5013	NC_014218	TGCC	2	8	1935854	1935861	0 %	25 %	25 %	50 %	297572302
5014	NC_014218	AAAC	2	8	1935888	1935895	75 %	0 %	0 %	25 %	297572302
5015	NC_014218	TGGC	2	8	1937001	1937008	0 %	25 %	50 %	25 %	297572305
5016	NC_014218	TGAC	2	8	1937242	1937249	25 %	25 %	25 %	25 %	297572305
5017	NC_014218	ACCA	2	8	1937577	1937584	50 %	0 %	0 %	50 %	297572305
5018	NC_014218	TCGA	2	8	1938515	1938522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_014218	GGGC	2	8	1938744	1938751	0 %	0 %	75 %	25 %	297572307
5020	NC_014218	AGCC	2	8	1939372	1939379	25 %	0 %	25 %	50 %	297572307
5021	NC_014218	TCAA	2	8	1939715	1939722	50 %	25 %	0 %	25 %	297572307
5022	NC_014218	AGCG	2	8	1941013	1941020	25 %	0 %	50 %	25 %	297572308
5023	NC_014218	ACGC	2	8	1941074	1941081	25 %	0 %	25 %	50 %	297572308
5024	NC_014218	TAAA	2	8	1941628	1941635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_014218	TTGC	2	8	1941853	1941860	0 %	50 %	25 %	25 %	297572309
5026	NC_014218	TTGA	2	8	1942363	1942370	25 %	50 %	25 %	0 %	297572309
5027	NC_014218	TGGC	2	8	1942653	1942660	0 %	25 %	50 %	25 %	297572309
5028	NC_014218	GCCG	2	8	1942980	1942987	0 %	0 %	50 %	50 %	297572309
5029	NC_014218	TTTC	2	8	1943290	1943297	0 %	75 %	0 %	25 %	297572310
5030	NC_014218	GTGC	2	8	1943333	1943340	0 %	25 %	50 %	25 %	297572310
5031	NC_014218	GGTG	2	8	1944718	1944725	0 %	25 %	75 %	0 %	297572311
5032	NC_014218	TCGC	2	8	1944841	1944848	0 %	25 %	25 %	50 %	297572311
5033	NC_014218	CGTG	2	8	1944929	1944936	0 %	25 %	50 %	25 %	297572311
5034	NC_014218	GCTT	2	8	1945233	1945240	0 %	50 %	25 %	25 %	297572312
5035	NC_014218	TGTT	2	8	1945326	1945333	0 %	75 %	25 %	0 %	297572312
5036	NC_014218	TCGT	2	8	1946289	1946296	0 %	50 %	25 %	25 %	297572313
5037	NC_014218	CAGC	2	8	1946819	1946826	25 %	0 %	25 %	50 %	297572314
5038	NC_014218	AAGG	2	8	1946930	1946937	50 %	0 %	50 %	0 %	297572314
5039	NC_014218	GATG	2	8	1947634	1947641	25 %	25 %	50 %	0 %	297572315
5040	NC_014218	CCCA	2	8	1947652	1947659	25 %	0 %	0 %	75 %	297572315
5041	NC_014218	CCGG	2	8	1948184	1948191	0 %	0 %	50 %	50 %	297572316
5042	NC_014218	GGGC	2	8	1948324	1948331	0 %	0 %	75 %	25 %	297572316
5043	NC_014218	CGGG	2	8	1948551	1948558	0 %	0 %	75 %	25 %	297572316
5044	NC_014218	GCAA	2	8	1948774	1948781	50 %	0 %	25 %	25 %	297572316
5045	NC_014218	CGGG	2	8	1949165	1949172	0 %	0 %	75 %	25 %	297572317
5046	NC_014218	CGGG	3	12	1949270	1949281	0 %	0 %	75 %	25 %	297572317
5047	NC_014218	TACC	3	12	1949585	1949596	25 %	25 %	0 %	50 %	297572317
5048	NC_014218	AATC	2	8	1950122	1950129	50 %	25 %	0 %	25 %	297572318
5049	NC_014218	GGGC	2	8	1950448	1950455	0 %	0 %	75 %	25 %	297572318
5050	NC_014218	CCAG	2	8	1950529	1950536	25 %	0 %	25 %	50 %	297572318
5051	NC_014218	CGGC	2	8	1950890	1950897	0 %	0 %	50 %	50 %	297572318
5052	NC_014218	TCAC	2	8	1951087	1951094	25 %	25 %	0 %	50 %	297572318
5053	NC_014218	GGCT	2	8	1951895	1951902	0 %	25 %	50 %	25 %	297572319
5054	NC_014218	CGCC	2	8	1952145	1952152	0 %	0 %	25 %	75 %	297572319
5055	NC_014218	TGGG	2	8	1952729	1952736	0 %	25 %	75 %	0 %	297572319
5056	NC_014218	AAAG	2	8	1953338	1953345	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_014218	TTTA	2	8	1953378	1953385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_014218	TCGT	2	8	1953609	1953616	0 %	50 %	25 %	25 %	297572320
5059	NC_014218	CCGT	2	8	1956076	1956083	0 %	25 %	25 %	50 %	297572320
5060	NC_014218	TCTT	2	8	1956177	1956184	0 %	75 %	0 %	25 %	297572320
5061	NC_014218	CTTT	2	8	1956256	1956263	0 %	75 %	0 %	25 %	297572320
5062	NC_014218	GAAC	2	8	1956360	1956367	50 %	0 %	25 %	25 %	297572320
5063	NC_014218	ATAG	2	8	1956612	1956619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014218	GGAT	2	8	1956709	1956716	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014218	CGAT	2	8	1957364	1957371	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_014218	CTGC	2	8	1957733	1957740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_014218	TGAA	2	8	1957893	1957900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_014218	ACAA	2	8	1958456	1958463	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_014218	CCGT	2	8	1958789	1958796	0 %	25 %	25 %	50 %	297572321
5070	NC_014218	AATA	2	8	1959006	1959013	75 %	25 %	0 %	0 %	297572321
5071	NC_014218	CGAG	2	8	1959359	1959366	25 %	0 %	50 %	25 %	297572321
5072	NC_014218	GCAC	2	8	1959383	1959390	25 %	0 %	25 %	50 %	297572321
5073	NC_014218	CTTT	2	8	1959602	1959609	0 %	75 %	0 %	25 %	297572321
5074	NC_014218	GCCG	2	8	1961315	1961322	0 %	0 %	50 %	50 %	297572321
5075	NC_014218	GCCA	2	8	1962078	1962085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_014218	CACC	2	8	1962095	1962102	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5077	NC_014218	GATC	2	8	1962479	1962486	25 %	25 %	25 %	25 %	297572322
5078	NC_014218	GAAG	2	8	1962533	1962540	50 %	0 %	50 %	0 %	297572322
5079	NC_014218	TGCG	2	8	1962542	1962549	0 %	25 %	50 %	25 %	297572322
5080	NC_014218	GTGA	2	8	1962603	1962610	25 %	25 %	50 %	0 %	297572322
5081	NC_014218	AGCG	2	8	1962649	1962656	25 %	0 %	50 %	25 %	297572323
5082	NC_014218	CCGG	2	8	1963017	1963024	0 %	0 %	50 %	50 %	297572324
5083	NC_014218	ATCC	2	8	1963192	1963199	25 %	25 %	0 %	50 %	297572324
5084	NC_014218	AACG	2	8	1963303	1963310	50 %	0 %	25 %	25 %	297572324
5085	NC_014218	GTTT	2	8	1963337	1963344	0 %	75 %	25 %	0 %	297572324
5086	NC_014218	GCCA	2	8	1963463	1963470	25 %	0 %	25 %	50 %	297572324
5087	NC_014218	GGCT	2	8	1964031	1964038	0 %	25 %	50 %	25 %	297572326
5088	NC_014218	CTGG	2	8	1964054	1964061	0 %	25 %	50 %	25 %	297572326
5089	NC_014218	TGGT	2	8	1964099	1964106	0 %	50 %	50 %	0 %	297572326
5090	NC_014218	ACGA	2	8	1964598	1964605	50 %	0 %	25 %	25 %	297572326
5091	NC_014218	CCTG	2	8	1964986	1964993	0 %	25 %	25 %	50 %	297572326
5092	NC_014218	CGCC	2	8	1965040	1965047	0 %	0 %	25 %	75 %	297572326
5093	NC_014218	CGAT	2	8	1965644	1965651	25 %	25 %	25 %	25 %	297572326
5094	NC_014218	CTTT	2	8	1966134	1966141	0 %	75 %	0 %	25 %	297572327
5095	NC_014218	GGAT	2	8	1966399	1966406	25 %	25 %	50 %	0 %	297572327
5096	NC_014218	GCCA	2	8	1966561	1966568	25 %	0 %	25 %	50 %	297572327
5097	NC_014218	TGGG	2	8	1966591	1966598	0 %	25 %	75 %	0 %	297572327
5098	NC_014218	TGGC	2	8	1966956	1966963	0 %	25 %	50 %	25 %	297572327
5099	NC_014218	GCCG	2	8	1968127	1968134	0 %	0 %	50 %	50 %	297572328
5100	NC_014218	CACC	2	8	1968225	1968232	25 %	0 %	0 %	75 %	297572328
5101	NC_014218	AACG	2	8	1968493	1968500	50 %	0 %	25 %	25 %	297572328
5102	NC_014218	GGAT	2	8	1968642	1968649	25 %	25 %	50 %	0 %	297572328
5103	NC_014218	GCTT	2	8	1968708	1968715	0 %	50 %	25 %	25 %	297572328
5104	NC_014218	CAAG	2	8	1968937	1968944	50 %	0 %	25 %	25 %	297572329
5105	NC_014218	AGCG	2	8	1969750	1969757	25 %	0 %	50 %	25 %	297572329
5106	NC_014218	CGCC	2	8	1969822	1969829	0 %	0 %	25 %	75 %	297572329
5107	NC_014218	CCCG	2	8	1969844	1969851	0 %	0 %	25 %	75 %	297572329
5108	NC_014218	ACTC	2	8	1970242	1970249	25 %	25 %	0 %	50 %	297572329
5109	NC_014218	CGCC	2	8	1970558	1970565	0 %	0 %	25 %	75 %	297572330
5110	NC_014218	CATC	2	8	1970698	1970705	25 %	25 %	0 %	50 %	297572330
5111	NC_014218	ATCG	2	8	1970838	1970845	25 %	25 %	25 %	25 %	297572330
5112	NC_014218	AACG	2	8	1970871	1970878	50 %	0 %	25 %	25 %	297572330
5113	NC_014218	GCAC	2	8	1970895	1970902	25 %	0 %	25 %	50 %	297572330
5114	NC_014218	CCAC	2	8	1971156	1971163	25 %	0 %	0 %	75 %	297572331
5115	NC_014218	TCGT	2	8	1971380	1971387	0 %	50 %	25 %	25 %	297572331
5116	NC_014218	CGCA	2	8	1971416	1971423	25 %	0 %	25 %	50 %	297572331
5117	NC_014218	ACGC	2	8	1972537	1972544	25 %	0 %	25 %	50 %	297572331
5118	NC_014218	TGGC	2	8	1972782	1972789	0 %	25 %	50 %	25 %	297572331
5119	NC_014218	CCAG	2	8	1972822	1972829	25 %	0 %	25 %	50 %	297572331
5120	NC_014218	GTGG	2	8	1972922	1972929	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_014218	TTTG	2	8	1972937	1972944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_014218	GCTT	2	8	1973007	1973014	0 %	50 %	25 %	25 %	297572332
5123	NC_014218	CAGG	2	8	1973025	1973032	25 %	0 %	50 %	25 %	297572332
5124	NC_014218	TGAT	2	8	1973099	1973106	25 %	50 %	25 %	0 %	297572332
5125	NC_014218	TGAA	2	8	1973597	1973604	50 %	25 %	25 %	0 %	297572332
5126	NC_014218	TCAC	2	8	1974897	1974904	25 %	25 %	0 %	50 %	297572332
5127	NC_014218	GTTT	2	8	1975689	1975696	0 %	75 %	25 %	0 %	297572333
5128	NC_014218	CACG	2	8	1976028	1976035	25 %	0 %	25 %	50 %	297572334
5129	NC_014218	GATT	2	8	1976890	1976897	25 %	50 %	25 %	0 %	297572335
5130	NC_014218	ATCG	2	8	1977002	1977009	25 %	25 %	25 %	25 %	297572335
5131	NC_014218	CTAG	2	8	1977198	1977205	25 %	25 %	25 %	25 %	297572335
5132	NC_014218	ATCG	2	8	1977278	1977285	25 %	25 %	25 %	25 %	297572335
5133	NC_014218	TCTT	2	8	1977701	1977708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_014218	ATCG	2	8	1979242	1979249	25 %	25 %	25 %	25 %	297572336
5135	NC_014218	CGTA	2	8	1979410	1979417	25 %	25 %	25 %	25 %	297572337
5136	NC_014218	TTAG	2	8	1980557	1980564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_014218	GGAT	2	8	1981933	1981940	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_014218	GACC	2	8	1982026	1982033	25 %	0 %	25 %	50 %	297572339
5139	NC_014218	GACC	2	8	1982064	1982071	25 %	0 %	25 %	50 %	297572339
5140	NC_014218	GACC	2	8	1982394	1982401	25 %	0 %	25 %	50 %	297572339
5141	NC_014218	TCAA	2	8	1982459	1982466	50 %	25 %	0 %	25 %	297572339
5142	NC_014218	CCAC	2	8	1982813	1982820	25 %	0 %	0 %	75 %	297572339
5143	NC_014218	CTTT	2	8	1983953	1983960	0 %	75 %	0 %	25 %	297572341
5144	NC_014218	AGGC	2	8	1984241	1984248	25 %	0 %	50 %	25 %	297572341
5145	NC_014218	GTTG	2	8	1984524	1984531	0 %	50 %	50 %	0 %	297572341
5146	NC_014218	TTGG	2	8	1985169	1985176	0 %	50 %	50 %	0 %	297572342
5147	NC_014218	GGTT	2	8	1985312	1985319	0 %	50 %	50 %	0 %	297572342
5148	NC_014218	TTTC	2	8	1986123	1986130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

< Previous1234567891011Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.