MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Starkeya novella DSM 506 chromosome

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014217	CCGCGC	2	12	28896	28907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014217	GAAGCG	2	12	32867	32878	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014217	CTTGGT	2	12	38668	38679	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014217	CATCCT	2	12	86511	86522	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014217	GAAGAC	2	12	88083	88094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014217	CCGATC	2	12	202425	202436	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014217	GGGCCG	2	12	230243	230254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014217	TGCTCC	2	12	257096	257107	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014217	CGATCC	2	12	272032	272043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014217	AGGATG	2	12	281912	281923	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014217	GGCGGG	2	12	307001	307012	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014217	CTGGTT	2	12	387808	387819	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014217	AGCGGT	2	12	419112	419123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014217	ATGGAG	2	12	426137	426148	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014217	CGACCG	2	12	536555	536566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014217	TTTCCC	2	12	569600	569611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014217	GCTTCC	2	12	595280	595291	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014217	GGCGCG	2	12	610165	610176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014217	GGCGCG	2	12	610202	610213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014217	CATCCT	2	12	615823	615834	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014217	CATGGC	2	12	616774	616785	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014217	GGCTTT	2	12	723782	723793	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014217	AGGATG	2	12	752605	752616	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014217	CCCGTT	2	12	783887	783898	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014217	CGAAGC	2	12	805137	805148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014217	GACCGC	2	12	808850	808861	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014217	GGCCTT	2	12	809163	809174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014217	AGCTTC	2	12	818720	818731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014217	CTTCCA	2	12	834957	834968	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014217	TCTGCG	2	12	841580	841591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014217	GGGCGC	2	12	843258	843269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014217	CAGGTC	2	12	893025	893036	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014217	AAGGCT	2	12	946640	946651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014217	CGAGCG	2	12	1020434	1020445	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014217	TCGCAG	2	12	1073301	1073312	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014217	CTCCCT	2	12	1086679	1086690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014217	TTTTGC	2	12	1135991	1136002	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014217	TCGGGA	2	12	1141610	1141621	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014217	CAGGCT	2	12	1168322	1168333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014217	CGCGGG	2	12	1178180	1178191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014217	CGAATG	2	12	1237110	1237121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014217	CGGGGG	2	12	1247703	1247714	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014217	CGCTGG	2	12	1248477	1248488	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014217	TCATCG	2	12	1252121	1252132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014217	TCGATG	2	12	1347408	1347419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014217	TCCGGC	2	12	1372979	1372990	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014217	CCGTTT	2	12	1384270	1384281	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014217	GTTGCG	2	12	1402256	1402267	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014217	CCCGGC	2	12	1409626	1409637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014217	CATCCT	2	12	1434442	1434453	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014217	CTCCCG	2	12	1474043	1474054	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014217	CGTTTG	2	12	1494892	1494903	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014217	CCGCGA	2	12	1497475	1497486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014217	AACGGG	2	12	1556666	1556677	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014217	GCGCCC	2	12	1568426	1568437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014217	GGCGCA	2	12	1586487	1586498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014217	GGGCGG	2	12	1624600	1624611	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014217	GCGACG	2	12	1638794	1638805	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014217	CGTCAA	2	12	1645488	1645499	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014217	ACGACA	2	12	1666297	1666308	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014217	CGTTTT	2	12	1689987	1689998	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014217	GGGAGG	2	12	1702783	1702794	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014217	GAAACC	2	12	1712628	1712639	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014217	CAGCCC	2	12	1719342	1719353	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014217	CCGCGC	2	12	1743444	1743455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014217	GGATGT	2	12	1748935	1748946	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014217	GCCGCG	2	12	1769072	1769083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014217	TCGCCA	2	12	1789847	1789858	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014217	CAGGAA	2	12	1796414	1796425	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014217	GATCCC	2	12	1839896	1839907	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014217	TGCCGT	2	12	1951811	1951822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014217	CGGGGC	2	12	1954366	1954377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014217	GCGATC	2	12	1988885	1988896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014217	GGTCTC	2	12	2029160	2029171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014217	GCCGAA	2	12	2038585	2038596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014217	TAACGC	2	12	2041560	2041571	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014217	CGCACG	2	12	2051690	2051701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014217	GGTGGG	2	12	2051901	2051912	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014217	AGGCCG	2	12	2076837	2076848	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014217	GGCCGG	2	12	2113135	2113146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014217	TCCTCG	2	12	2180874	2180885	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014217	TATCCG	2	12	2211060	2211071	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014217	CAAACG	2	12	2218998	2219009	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014217	GACACG	2	12	2231986	2231997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014217	GCCCCC	2	12	2246019	2246030	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_014217	GAATCC	2	12	2263097	2263108	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014217	CAGCGC	2	12	2318266	2318277	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014217	GCTTTT	2	12	2369109	2369120	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014217	ATCGGC	2	12	2379597	2379608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014217	CCGGCC	2	12	2389810	2389821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014217	AGGATG	2	12	2411458	2411469	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014217	TCTGCC	2	12	2443239	2443250	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014217	CGGCGC	2	12	2452188	2452199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014217	GGATGG	2	12	2498076	2498087	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014217	GGATGG	2	12	2498091	2498102	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014217	CAGCGC	2	12	2498241	2498252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014217	GGCCGA	2	12	2576191	2576202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014217	CACCGA	2	12	2593045	2593056	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014217	GCACCG	2	12	2644118	2644129	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014217	CATCCT	2	12	2706527	2706538	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014217	GTTTTT	2	12	2712293	2712304	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014217	CCGGAC	2	12	2793976	2793987	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014217	GACCGA	2	12	2795893	2795904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014217	ATCCAT	2	12	2837016	2837027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014217	CCGGCG	2	12	2837561	2837572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014217	ACGGTT	2	12	2859045	2859056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014217	GCCAAG	2	12	2878833	2878844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014217	TTCGCC	2	12	2880695	2880706	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014217	GCTTTT	2	12	2881002	2881013	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014217	TTAAAA	2	12	2962547	2962558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014217	GACGGA	2	12	2996525	2996536	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014217	CAGAAG	2	12	3020521	3020532	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014217	TTCGCT	2	12	3036544	3036555	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014217	GTCTTC	2	12	3036784	3036795	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014217	GCGCCG	2	12	3040861	3040872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014217	CCGTGG	2	12	3059194	3059205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014217	GAGTTC	2	12	3064418	3064429	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014217	CGGGCG	2	12	3101895	3101906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014217	GCGGCC	2	12	3109148	3109159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014217	CGGGCA	2	12	3137170	3137181	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014217	CTTAAC	2	12	3139348	3139359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014217	CCGACT	2	12	3169970	3169981	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014217	GTTAAT	2	12	3184711	3184722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014217	CCCGTA	2	12	3248966	3248977	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014217	GTTGCG	2	12	3302222	3302233	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014217	CAAAAG	2	12	3385639	3385650	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014217	TTGGCG	2	12	3408741	3408752	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014217	CGGACC	2	12	3521295	3521306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014217	TACAAT	2	12	3553950	3553961	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014217	CGTCAT	2	12	3764066	3764077	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014217	CGCGGC	2	12	3796688	3796699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014217	ACGCCG	2	12	3863699	3863710	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014217	AACAAA	2	12	3932965	3932976	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014217	CGTGCT	2	12	4087642	4087653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014217	ATCCTG	2	12	4096822	4096833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014217	AGGATG	2	12	4102453	4102464	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014217	TGCCTC	2	12	4121876	4121887	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014217	CGCCCC	2	12	4145738	4145749	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
139	NC_014217	GCCTTC	2	12	4157446	4157457	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014217	GCCGGC	2	12	4212671	4212682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014217	TCGGGA	2	12	4264727	4264738	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_014217	GGCCTT	2	12	4337576	4337587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014217	GGATGC	2	12	4402097	4402108	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_014217	GGTCGA	2	12	4490022	4490033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014217	AAGCGC	2	12	4500605	4500616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014217	GTGCCC	2	12	4515745	4515756	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014217	CGCAAA	2	12	4520916	4520927	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014217	GCTGGC	2	12	4561967	4561978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014217	GATCGT	2	12	4562240	4562251	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_014217	ATGTGG	2	12	4562493	4562504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014217	ATCAAA	2	12	4569563	4569574	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_014217	CAAAGC	2	12	4577548	4577559	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014217	TCGCTG	2	12	4589643	4589654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014217	GGCGCG	2	12	4597064	4597075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014217	TGATTA	2	12	4607605	4607616	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014217	CGTCGC	2	12	4612896	4612907	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014217	GCTCGG	2	12	4638985	4638996	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_014217	GACGGG	2	12	4678687	4678698	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_014217	GTGCGA	2	12	4709453	4709464	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_014217	GCAGGG	2	12	4711457	4711468	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_014217	GGTGGC	2	12	4736587	4736598	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.