MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Starkeya novella DSM 506 chromosome

Total Repeats: 4643

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014217	GCCGG	2	10	160	169	0 %	0 %	60 %	40 %	298290018
2	NC_014217	ACCAC	2	10	1557	1566	40 %	0 %	0 %	60 %	298290019
3	NC_014217	GCGCC	2	10	2164	2173	0 %	0 %	40 %	60 %	298290021
4	NC_014217	CGGCT	2	10	3180	3189	0 %	20 %	40 %	40 %	298290021
5	NC_014217	CCGAC	2	10	5754	5763	20 %	0 %	20 %	60 %	298290025
6	NC_014217	CGGCG	2	10	6097	6106	0 %	0 %	60 %	40 %	298290025
7	NC_014217	GCTCG	2	10	6447	6456	0 %	20 %	40 %	40 %	298290026
8	NC_014217	CGCCT	2	10	7027	7036	0 %	20 %	20 %	60 %	298290027
9	NC_014217	CGGCG	2	10	7326	7335	0 %	0 %	60 %	40 %	298290027
10	NC_014217	GGCCG	2	10	7769	7778	0 %	0 %	60 %	40 %	298290028
11	NC_014217	CGCGG	2	10	11013	11022	0 %	0 %	60 %	40 %	298290031
12	NC_014217	ATGCC	2	10	11027	11036	20 %	20 %	20 %	40 %	298290031
13	NC_014217	TCCTT	2	10	13298	13307	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014217	CCGAG	2	10	13815	13824	20 %	0 %	40 %	40 %	298290034
15	NC_014217	GGGCA	2	10	17337	17346	20 %	0 %	60 %	20 %	298290041
16	NC_014217	GGTGC	2	10	18057	18066	0 %	20 %	60 %	20 %	298290041
17	NC_014217	CGGCG	2	10	18204	18213	0 %	0 %	60 %	40 %	298290041
18	NC_014217	TGCTC	2	10	19080	19089	0 %	40 %	20 %	40 %	298290043
19	NC_014217	TTGCC	2	10	19749	19758	0 %	40 %	20 %	40 %	298290044
20	NC_014217	CCTGC	2	10	20059	20068	0 %	20 %	20 %	60 %	298290044
21	NC_014217	ACGCG	2	10	22958	22967	20 %	0 %	40 %	40 %	298290046
22	NC_014217	CGGCG	2	10	22987	22996	0 %	0 %	60 %	40 %	298290046
23	NC_014217	TTCAC	2	10	25715	25724	20 %	40 %	0 %	40 %	298290048
24	NC_014217	GCGCC	2	10	27551	27560	0 %	0 %	40 %	60 %	298290051
25	NC_014217	TCATT	2	10	29250	29259	20 %	60 %	0 %	20 %	298290056
26	NC_014217	CCCAT	2	10	30169	30178	20 %	20 %	0 %	60 %	298290056
27	NC_014217	CGAGG	2	10	31278	31287	20 %	0 %	60 %	20 %	298290057
28	NC_014217	CGGCT	2	10	32684	32693	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014217	CAGGG	2	10	34742	34751	20 %	0 %	60 %	20 %	298290062
30	NC_014217	GCGCC	2	10	35560	35569	0 %	0 %	40 %	60 %	298290063
31	NC_014217	GGCCG	2	10	35889	35898	0 %	0 %	60 %	40 %	298290064
32	NC_014217	GCCAC	2	10	36717	36726	20 %	0 %	20 %	60 %	298290064
33	NC_014217	AGCCG	2	10	37500	37509	20 %	0 %	40 %	40 %	298290064
34	NC_014217	AGTTC	2	10	38760	38769	20 %	40 %	20 %	20 %	298290065
35	NC_014217	CGAGC	2	10	38935	38944	20 %	0 %	40 %	40 %	298290065
36	NC_014217	GAGCC	2	10	38987	38996	20 %	0 %	40 %	40 %	298290065
37	NC_014217	TTCAG	2	10	39423	39432	20 %	40 %	20 %	20 %	298290066
38	NC_014217	GCGCC	2	10	39786	39795	0 %	0 %	40 %	60 %	298290066
39	NC_014217	CAGAC	2	10	40120	40129	40 %	0 %	20 %	40 %	298290067
40	NC_014217	GCGCC	2	10	40490	40499	0 %	0 %	40 %	60 %	298290067
41	NC_014217	CCGCG	2	10	43701	43710	0 %	0 %	40 %	60 %	298290072
42	NC_014217	TCGCC	2	10	44926	44935	0 %	20 %	20 %	60 %	298290073
43	NC_014217	CGGCG	2	10	45889	45898	0 %	0 %	60 %	40 %	298290073
44	NC_014217	CTTCG	2	10	46725	46734	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014217	GGCGC	3	15	47103	47117	0 %	0 %	60 %	40 %	298290075
46	NC_014217	TCCGC	2	10	50313	50322	0 %	20 %	20 %	60 %	298290080
47	NC_014217	GCCGG	2	10	50428	50437	0 %	0 %	60 %	40 %	298290080
48	NC_014217	CGCGC	2	10	51257	51266	0 %	0 %	40 %	60 %	298290080
49	NC_014217	CGGCG	2	10	53529	53538	0 %	0 %	60 %	40 %	298290083
50	NC_014217	AGGCG	2	10	56421	56430	20 %	0 %	60 %	20 %	298290085
51	NC_014217	GGTCG	2	10	57144	57153	0 %	20 %	60 %	20 %	298290086
52	NC_014217	GCCGA	2	10	57217	57226	20 %	0 %	40 %	40 %	298290086
53	NC_014217	GTGGA	2	10	57484	57493	20 %	20 %	60 %	0 %	298290086
54	NC_014217	GGCGA	2	10	57705	57714	20 %	0 %	60 %	20 %	298290087
55	NC_014217	CGGCG	2	10	59493	59502	0 %	0 %	60 %	40 %	298290089
56	NC_014217	TGCGC	2	10	60171	60180	0 %	20 %	40 %	40 %	298290089
57	NC_014217	CCTCG	2	10	60525	60534	0 %	20 %	20 %	60 %	298290089
58	NC_014217	CGCTG	2	10	61918	61927	0 %	20 %	40 %	40 %	298290090
59	NC_014217	TCGCT	2	10	62106	62115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014217	GCGCG	2	10	63471	63480	0 %	0 %	60 %	40 %	298290091
61	NC_014217	CGTCG	2	10	65206	65215	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_014217	ACCGC	2	10	66630	66639	20 %	0 %	20 %	60 %	298290093
63	NC_014217	GGATC	2	10	66733	66742	20 %	20 %	40 %	20 %	298290093
64	NC_014217	GCCGA	2	10	68024	68033	20 %	0 %	40 %	40 %	298290095
65	NC_014217	GTGGG	2	10	68397	68406	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014217	CGCGG	2	10	69034	69043	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014217	CGCGG	2	10	70433	70442	0 %	0 %	60 %	40 %	298290098
68	NC_014217	CCGGG	2	10	71150	71159	0 %	0 %	60 %	40 %	298290098
69	NC_014217	GCCGC	2	10	71961	71970	0 %	0 %	40 %	60 %	298290098
70	NC_014217	GCCGC	2	10	73227	73236	0 %	0 %	40 %	60 %	298290098
71	NC_014217	CCGGC	3	15	73371	73385	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_014217	TCGGC	2	10	74773	74782	0 %	20 %	40 %	40 %	298290101
73	NC_014217	TCGCT	2	10	74854	74863	0 %	40 %	20 %	40 %	298290101
74	NC_014217	CGGGC	2	10	75008	75017	0 %	0 %	60 %	40 %	298290101
75	NC_014217	GCGCT	2	10	75066	75075	0 %	20 %	40 %	40 %	298290101
76	NC_014217	CGGCG	2	10	77034	77043	0 %	0 %	60 %	40 %	298290103
77	NC_014217	TTCCA	2	10	78371	78380	20 %	40 %	0 %	40 %	298290104
78	NC_014217	AGTTC	2	10	78950	78959	20 %	40 %	20 %	20 %	298290105
79	NC_014217	GGGAC	2	10	80952	80961	20 %	0 %	60 %	20 %	298290107
80	NC_014217	AGCGC	2	10	81562	81571	20 %	0 %	40 %	40 %	298290108
81	NC_014217	GGCGC	2	10	82166	82175	0 %	0 %	60 %	40 %	298290109
82	NC_014217	CGAGC	2	10	86611	86620	20 %	0 %	40 %	40 %	298290113
83	NC_014217	CGAGC	2	10	86638	86647	20 %	0 %	40 %	40 %	298290113
84	NC_014217	CGGGG	2	10	87727	87736	0 %	0 %	80 %	20 %	298290113
85	NC_014217	GGCGC	2	10	88160	88169	0 %	0 %	60 %	40 %	298290114
86	NC_014217	ACCGC	2	10	88603	88612	20 %	0 %	20 %	60 %	298290114
87	NC_014217	GGACG	2	10	88698	88707	20 %	0 %	60 %	20 %	298290114
88	NC_014217	CGACG	2	10	90991	91000	20 %	0 %	40 %	40 %	298290116
89	NC_014217	CGCGG	2	10	91774	91783	0 %	0 %	60 %	40 %	298290117
90	NC_014217	GGACG	2	10	92395	92404	20 %	0 %	60 %	20 %	298290117
91	NC_014217	GCCCC	2	10	92821	92830	0 %	0 %	20 %	80 %	298290118
92	NC_014217	ACGGC	2	10	95002	95011	20 %	0 %	40 %	40 %	298290120
93	NC_014217	CGCTG	2	10	98586	98595	0 %	20 %	40 %	40 %	298290123
94	NC_014217	TCGGG	2	10	98739	98748	0 %	20 %	60 %	20 %	298290123
95	NC_014217	GCCTT	2	10	98814	98823	0 %	40 %	20 %	40 %	298290123
96	NC_014217	CTGAC	2	10	99262	99271	20 %	20 %	20 %	40 %	298290123
97	NC_014217	GGCGA	2	10	103035	103044	20 %	0 %	60 %	20 %	298290127
98	NC_014217	CGGGC	2	10	103259	103268	0 %	0 %	60 %	40 %	298290127
99	NC_014217	AGCGT	2	10	108248	108257	20 %	20 %	40 %	20 %	298290130
100	NC_014217	GGCCG	2	10	109113	109122	0 %	0 %	60 %	40 %	298290131
101	NC_014217	GAAGA	2	10	110504	110513	60 %	0 %	40 %	0 %	298290132
102	NC_014217	GGATG	2	10	111411	111420	20 %	20 %	60 %	0 %	298290132
103	NC_014217	GAGCG	2	10	111650	111659	20 %	0 %	60 %	20 %	298290132
104	NC_014217	GCGAT	2	10	112523	112532	20 %	20 %	40 %	20 %	298290133
105	NC_014217	ACGGA	2	10	113302	113311	40 %	0 %	40 %	20 %	298290134
106	NC_014217	GCAGA	2	10	117849	117858	40 %	0 %	40 %	20 %	298290138
107	NC_014217	GGCGC	2	10	119438	119447	0 %	0 %	60 %	40 %	298290140
108	NC_014217	CGCGG	2	10	119576	119585	0 %	0 %	60 %	40 %	298290140
109	NC_014217	CGAGC	2	10	119814	119823	20 %	0 %	40 %	40 %	298290140
110	NC_014217	TCGCC	2	10	120464	120473	0 %	20 %	20 %	60 %	298290140
111	NC_014217	GCGCG	2	10	120480	120489	0 %	0 %	60 %	40 %	298290140
112	NC_014217	CGGCG	2	10	123223	123232	0 %	0 %	60 %	40 %	298290143
113	NC_014217	GCCCG	2	10	125053	125062	0 %	0 %	40 %	60 %	298290146
114	NC_014217	GGCCC	2	10	126104	126113	0 %	0 %	40 %	60 %	298290147
115	NC_014217	GCCGC	2	10	127532	127541	0 %	0 %	40 %	60 %	298290148
116	NC_014217	GCCGG	2	10	128618	128627	0 %	0 %	60 %	40 %	298290150
117	NC_014217	CGGGC	2	10	128749	128758	0 %	0 %	60 %	40 %	298290150
118	NC_014217	CGCAC	2	10	130652	130661	20 %	0 %	20 %	60 %	298290152
119	NC_014217	CGCGG	2	10	133348	133357	0 %	0 %	60 %	40 %	298290154
120	NC_014217	GGCGC	2	10	133630	133639	0 %	0 %	60 %	40 %	298290154
121	NC_014217	GCCGC	2	10	134169	134178	0 %	0 %	40 %	60 %	298290155
122	NC_014217	AGGCG	2	10	134825	134834	20 %	0 %	60 %	20 %	298290155
123	NC_014217	CGGAC	2	10	135350	135359	20 %	0 %	40 %	40 %	298290156
124	NC_014217	TGCCG	2	10	135575	135584	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014217	GTGTG	2	10	135595	135604	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014217	CGGCC	2	10	136253	136262	0 %	0 %	40 %	60 %	298290157
127	NC_014217	GTCGC	2	10	136612	136621	0 %	20 %	40 %	40 %	298290158
128	NC_014217	GCGCG	2	10	136788	136797	0 %	0 %	60 %	40 %	298290158
129	NC_014217	GCGCG	2	10	137088	137097	0 %	0 %	60 %	40 %	298290158
130	NC_014217	ACGAC	2	10	138879	138888	40 %	0 %	20 %	40 %	298290160
131	NC_014217	CCGGC	2	10	139841	139850	0 %	0 %	40 %	60 %	298290161
132	NC_014217	CCTCG	2	10	142566	142575	0 %	20 %	20 %	60 %	298290163
133	NC_014217	CGCGG	2	10	143299	143308	0 %	0 %	60 %	40 %	298290164
134	NC_014217	GCGCC	2	10	143545	143554	0 %	0 %	40 %	60 %	298290165
135	NC_014217	GTACG	2	10	143992	144001	20 %	20 %	40 %	20 %	298290165
136	NC_014217	CGTGC	2	10	144239	144248	0 %	20 %	40 %	40 %	298290165
137	NC_014217	CCGAG	2	10	144713	144722	20 %	0 %	40 %	40 %	298290166
138	NC_014217	CGGCG	2	10	145611	145620	0 %	0 %	60 %	40 %	298290166
139	NC_014217	GCCGC	2	10	146983	146992	0 %	0 %	40 %	60 %	298290167
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143	NC_014217	GCGCC	2	10	153198	153207	0 %	0 %	40 %	60 %	298290172
144	NC_014217	GCCGA	2	10	153419	153428	20 %	0 %	40 %	40 %	298290172
145	NC_014217	GTGCC	2	10	154413	154422	0 %	20 %	40 %	40 %	298290173
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153	NC_014217	GTCGC	2	10	159389	159398	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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155	NC_014217	GGGAG	2	10	160456	160465	20 %	0 %	80 %	0 %	298290180
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255	NC_014217	CGGCG	2	10	261712	261721	0 %	0 %	60 %	40 %	298290285
256	NC_014217	CTCTT	2	10	262403	262412	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
257	NC_014217	CGCGG	2	10	262441	262450	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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266	NC_014217	CGACC	2	10	269345	269354	20 %	0 %	20 %	60 %	298290293
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