MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Starkeya novella DSM 506 chromosome

Total Repeats: 1759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014217	GCGG	2	8	62	69	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014217	TTCC	2	8	6903	6910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014217	TCAC	2	8	19688	19695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014217	CCGG	2	8	28925	28932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014217	CGGC	2	8	29049	29056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014217	CGGC	2	8	33188	33195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014217	GGGC	2	8	35669	35676	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014217	CTGG	2	8	38490	38497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014217	CCGG	2	8	38519	38526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014217	CCTG	2	8	39900	39907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014217	GTGG	2	8	44701	44708	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014217	GCCC	2	8	50198	50205	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_014217	CGGA	2	8	51687	51694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014217	CCGG	2	8	58555	58562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014217	CGGG	2	8	66130	66137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014217	CCGG	2	8	68992	68999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014217	ACCC	2	8	74069	74076	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_014217	GGCG	2	8	77639	77646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014217	GTTG	2	8	83337	83344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014217	GTCT	2	8	87797	87804	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014217	CGGG	2	8	87848	87855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014217	GCCG	2	8	88075	88082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014217	AGGC	2	8	88737	88744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014217	GCTC	2	8	89543	89550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014217	GCCG	2	8	89660	89667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014217	CGGA	2	8	89734	89741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014217	CTTC	2	8	91033	91040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014217	CGCC	2	8	93616	93623	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_014217	GCCG	2	8	94814	94821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014217	AAGA	2	8	97491	97498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014217	TGGT	2	8	99351	99358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014217	GGCC	2	8	99377	99384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014217	GGCG	2	8	108923	108930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014217	GAGG	2	8	120749	120756	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014217	CCGG	2	8	121827	121834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014217	GCGG	2	8	122260	122267	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014217	TCCC	2	8	122628	122635	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_014217	CGGC	2	8	123313	123320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014217	GAAC	2	8	123347	123354	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014217	TTCT	2	8	126435	126442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014217	CCCG	2	8	128182	128189	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_014217	GCCG	2	8	128328	128335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014217	GCCC	2	8	135516	135523	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_014217	CCGG	2	8	139455	139462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014217	GGGC	2	8	140449	140456	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014217	CGTC	2	8	159112	159119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014217	CCGC	2	8	166463	166470	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_014217	TCTT	2	8	175275	175282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014217	CGGC	2	8	175425	175432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014217	GCCG	2	8	178116	178123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014217	CCCT	2	8	180193	180200	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_014217	GGGA	2	8	181494	181501	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014217	CGCC	2	8	182504	182511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_014217	ACCG	2	8	182515	182522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014217	CGGG	2	8	184629	184636	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014217	TTCC	2	8	196111	196118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014217	GCAG	2	8	199028	199035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014217	GAAA	2	8	199800	199807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014217	ATAA	2	8	202346	202353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014217	ATAA	2	8	202414	202421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014217	GCCC	2	8	204718	204725	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_014217	GCCG	2	8	204744	204751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014217	ACGA	2	8	206628	206635	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014217	TTAT	2	8	214108	214115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014217	CTGC	2	8	217218	217225	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014217	GAAA	2	8	217343	217350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014217	CGGG	2	8	220309	220316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014217	ATGG	2	8	220582	220589	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014217	TCGG	2	8	220741	220748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014217	GTTT	2	8	220856	220863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014217	CGCC	2	8	231157	231164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_014217	GGAG	2	8	233485	233492	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014217	GAAA	2	8	235446	235453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014217	GTGA	2	8	235463	235470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014217	CGGC	2	8	235991	235998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014217	GGAA	2	8	236035	236042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014217	GGAA	2	8	237288	237295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014217	CCGG	2	8	240184	240191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014217	CCGC	2	8	242239	242246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_014217	GAGG	2	8	245132	245139	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014217	TCCT	2	8	245168	245175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014217	GTCG	2	8	245219	245226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014217	GCGA	2	8	247153	247160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014217	GGCC	2	8	247213	247220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014217	CGGC	2	8	247223	247230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014217	GCCC	2	8	247322	247329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_014217	GAAG	2	8	247362	247369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014217	TCCT	2	8	252708	252715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014217	AGCG	2	8	258013	258020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014217	CGCC	2	8	262387	262394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_014217	TTTG	2	8	263639	263646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014217	CCGG	2	8	263668	263675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014217	GCCT	2	8	269187	269194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014217	GCCG	2	8	271609	271616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014217	CGGG	2	8	271831	271838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014217	CGGC	2	8	271897	271904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014217	CAGC	2	8	272005	272012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014217	CCCG	2	8	278089	278096	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_014217	GTCC	2	8	279735	279742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014217	CCAC	2	8	280343	280350	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_014217	CGTC	2	8	284972	284979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014217	GCCG	2	8	288433	288440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014217	TGCC	2	8	300532	300539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014217	CCGG	2	8	301223	301230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014217	ACCT	2	8	301319	301326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014217	TCCC	2	8	301357	301364	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_014217	GTCG	2	8	303388	303395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014217	ACGA	2	8	303551	303558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014217	CCGC	2	8	304760	304767	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_014217	CCGG	2	8	308205	308212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014217	ACCG	2	8	309131	309138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014217	GACA	2	8	310273	310280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014217	GGCG	2	8	314221	314228	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014217	CCGT	2	8	314232	314239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014217	GCAT	2	8	321209	321216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014217	AACG	2	8	321440	321447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014217	GCCG	2	8	323291	323298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014217	GACA	2	8	323331	323338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014217	GGAC	2	8	324563	324570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014217	AGCG	2	8	330803	330810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014217	GCCG	2	8	333402	333409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014217	GGGC	2	8	333496	333503	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014217	GAAG	2	8	335046	335053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014217	CCGG	2	8	335110	335117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014217	ACCC	2	8	337423	337430	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_014217	CGCC	2	8	337449	337456	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_014217	GGCT	2	8	339706	339713	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014217	GCGT	2	8	342745	342752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014217	TGCG	2	8	346331	346338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014217	GCTC	2	8	348124	348131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014217	CCGG	2	8	351026	351033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014217	CGGG	2	8	352283	352290	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014217	ACAT	2	8	357542	357549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014217	ATTT	2	8	360857	360864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014217	CGGG	2	8	361037	361044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014217	GCCG	2	8	361190	361197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014217	GCGG	2	8	370665	370672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014217	CGGG	2	8	375976	375983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014217	ACGG	2	8	378983	378990	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014217	CGGC	2	8	378999	379006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014217	CCGA	2	8	383266	383273	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014217	ACCG	2	8	396031	396038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014217	CCGG	2	8	396144	396151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014217	CAGG	2	8	400151	400158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014217	CCGA	2	8	402527	402534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014217	CAGG	2	8	416968	416975	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014217	GGTC	2	8	416983	416990	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014217	CGGT	2	8	418481	418488	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014217	CGGC	2	8	419144	419151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014217	CCCG	2	8	420268	420275	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_014217	GGCT	2	8	420333	420340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014217	GGCG	2	8	425063	425070	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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473	NC_014217	CGCT	2	8	1249050	1249057	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
474	NC_014217	CAAC	2	8	1249320	1249327	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_014217	GGCG	2	8	1259815	1259822	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
482	NC_014217	GCTT	2	8	1261851	1261858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
483	NC_014217	GTAT	2	8	1261954	1261961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_014217	AGCC	2	8	1285805	1285812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_014217	GTCG	2	8	1288255	1288262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_014217	GCGA	2	8	1289330	1289337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_014217	CGGG	2	8	1292899	1292906	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
491	NC_014217	TCAA	2	8	1293033	1293040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
492	NC_014217	CCAG	2	8	1301139	1301146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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494	NC_014217	GATC	2	8	1304628	1304635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
495	NC_014217	ATCG	2	8	1306446	1306453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_014217	CGGG	2	8	1309364	1309371	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
497	NC_014217	GAAG	2	8	1309442	1309449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_014217	GCTG	2	8	1309793	1309800	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_014217	GCGA	2	8	1310296	1310303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_014217	GACC	2	8	1311180	1311187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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