MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	GGTCGT	2	12	233	244	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	297567865
2	NC_014214	ACTCGG	2	12	1469	1480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297567865
3	NC_014214	CGCTTG	2	12	3465	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567870
4	NC_014214	TCCCGG	2	12	6891	6902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567874
5	NC_014214	CCAGCG	2	12	8091	8102	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297567875
6	NC_014214	GCACCG	2	12	8948	8959	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297567875
7	NC_014214	CCACCG	2	12	10189	10200	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	297567878
8	NC_014214	CCACCC	2	12	13794	13805	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	297567888
9	NC_014214	TGGGCA	2	12	13944	13955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297567888
10	NC_014214	GACACG	2	12	15475	15486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567890
11	NC_014214	CGAGGA	2	12	15657	15668	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	297567890
12	NC_014214	GACCGG	2	12	16406	16417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567892
13	NC_014214	GCCTCG	2	12	16971	16982	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567892
14	NC_014214	GCGCAC	2	12	19062	19073	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297567894
15	NC_014214	GATACC	2	12	20333	20344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297567896
16	NC_014214	GGGGTG	2	12	20856	20867	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	297567897
17	NC_014214	GCTGGC	2	12	23047	23058	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297567899
18	NC_014214	CTCCTT	2	12	23646	23657	0 %	50 %	0 %	50 %	297567900
19	NC_014214	GTCTTC	2	12	24612	24623	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	297567901
20	NC_014214	CCAGCT	2	12	28442	28453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297567904
21	NC_014214	CAGCAC	2	12	33333	33344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297567908
22	NC_014214	TTTCCG	2	12	34437	34448	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	297567909
23	NC_014214	GCTGGG	2	12	36155	36166	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	297567910
24	NC_014214	CCCAGG	2	12	36508	36519	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297567910
25	NC_014214	TCATGC	2	12	36939	36950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297567911
26	NC_014214	CGCTGG	2	12	37675	37686	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297567912
27	NC_014214	CTGGCC	2	12	39350	39361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567913
28	NC_014214	TCAAGG	2	12	39657	39668	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297567913
29	NC_014214	CCGGGA	2	12	40126	40137	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567913
30	NC_014214	CATGGA	2	12	40702	40713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297567914
31	NC_014214	CGGGGG	2	12	41961	41972	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	297567915
32	NC_014214	CTCGCT	2	12	42839	42850	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	297567915
33	NC_014214	GGGTGC	2	12	43427	43438	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	297567916
34	NC_014214	AACCCC	2	12	44098	44109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567917
35	NC_014214	CCAGAC	2	12	44236	44247	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297567917
36	NC_014214	GGTGGG	2	12	44386	44397	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	297567917
37	NC_014214	CGCATC	2	12	44471	44482	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297567917
38	NC_014214	GCACCG	2	12	46034	46045	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297567918
39	NC_014214	GCACCA	2	12	46061	46072	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297567918
40	NC_014214	AGCCTC	2	12	46487	46498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297567918
41	NC_014214	GCCAAT	2	12	46583	46594	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297567919
42	NC_014214	CCAACG	2	12	46861	46872	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297567919
43	NC_014214	CCTCCC	2	12	47517	47528	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	297567920
44	NC_014214	CAGGTG	2	12	52426	52437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297567926
45	NC_014214	CCTGAC	2	12	52917	52928	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297567926
46	NC_014214	ACCGTG	2	12	54139	54150	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297567926
47	NC_014214	CCCTGA	2	12	54371	54382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297567926
48	NC_014214	CAGCGC	2	12	54714	54725	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297567926
49	NC_014214	CCTCAG	2	12	55134	55145	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297567926
50	NC_014214	CCGCTT	2	12	55164	55175	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	297567926
51	NC_014214	GGTTAA	2	12	58756	58767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567929
52	NC_014214	GGGCGG	2	12	59312	59323	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	297567929
53	NC_014214	CCAGAC	2	12	59963	59974	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297567929
54	NC_014214	GTCCTG	2	12	60335	60346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567930
55	NC_014214	CCGCTT	2	12	60565	60576	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	297567930
56	NC_014214	CGGTGG	2	12	60702	60713	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	297567930
57	NC_014214	GGGCCA	2	12	62190	62201	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567932
58	NC_014214	CGGCAG	2	12	63949	63960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567934
59	NC_014214	GCCGGG	2	12	64840	64851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567935
60	NC_014214	CAGGGC	2	12	68070	68081	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567938
61	NC_014214	GCCCCA	2	12	70640	70651	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	297567943
62	NC_014214	CTCCGC	2	12	72569	72580	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	297567947
63	NC_014214	CTCGCC	2	12	72728	72739	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	297567947
64	NC_014214	GCCCTG	2	12	73808	73819	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567948
65	NC_014214	CATCCC	2	12	74686	74697	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	297567948
66	NC_014214	CAGCTA	2	12	74905	74916	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297567948
67	NC_014214	CTGGGC	2	12	78107	78118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297567952
68	NC_014214	GTTGGG	2	12	79795	79806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567953
69	NC_014214	GATGGC	2	12	82113	82124	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297567955
70	NC_014214	GAGTAG	2	12	82939	82950	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297567955
71	NC_014214	GTAGAG	2	12	83097	83108	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297567955
72	NC_014214	CCGCTG	2	12	83224	83235	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567955
73	NC_014214	CACCAG	2	12	83694	83705	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	297567955
74	NC_014214	GGCCTG	2	12	84351	84362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	297567956
75	NC_014214	GGCCTC	2	12	84582	84593	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567956
76	NC_014214	GGGGCC	2	12	87192	87203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567957
77	NC_014214	GCCATC	2	12	88533	88544	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297567959
78	NC_014214	CTGCCG	2	12	89801	89812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567960
79	NC_014214	GGGCCA	2	12	91310	91321	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567962
80	NC_014214	TTTCCA	2	12	93876	93887	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	297567965
81	NC_014214	CGGGTG	2	12	96900	96911	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	297567967
82	NC_014214	GGGCCA	2	12	100923	100934	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567971
83	NC_014214	TCCAGG	2	12	101594	101605	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297567971
84	NC_014214	GGCCTC	2	12	102532	102543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567971
85	NC_014214	ACCGCT	2	12	110326	110337	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297567975
86	NC_014214	GGGGAT	2	12	111860	111871	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	297567977
87	NC_014214	CCCCCA	2	12	112619	112630	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	297567978
88	NC_014214	CCAGCC	2	12	114155	114166	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	297567979
89	NC_014214	CCAGGG	2	12	115001	115012	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	297567979
90	NC_014214	ACCCCT	2	12	116038	116049	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	297567980
91	NC_014214	CCGGCA	2	12	116416	116427	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	297567980
92	NC_014214	TTCCAG	2	12	119028	119039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297567983
93	NC_014214	CCTGGC	2	12	122939	122950	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	297567990

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.