MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	GCAAG	2	10	890	899	40 %	0 %	40 %	20 %	297567865
2	NC_014214	CAAAA	2	10	3599	3608	80 %	0 %	0 %	20 %	297567870
3	NC_014214	GTTTT	2	10	10562	10571	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014214	TATTT	3	15	10599	10613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014214	TTTCC	2	10	10911	10920	0 %	60 %	0 %	40 %	297567880
6	NC_014214	CGCCC	2	10	12417	12426	0 %	0 %	20 %	80 %	297567885
7	NC_014214	TGCGC	2	10	14433	14442	0 %	20 %	40 %	40 %	297567889
8	NC_014214	TGGGG	2	10	14994	15003	0 %	20 %	80 %	0 %	297567889
9	NC_014214	GGGGA	2	10	15278	15287	20 %	0 %	80 %	0 %	297567890
10	NC_014214	ATCGG	2	10	17352	17361	20 %	20 %	40 %	20 %	297567892
11	NC_014214	GGAAA	2	10	17650	17659	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014214	GGCCG	2	10	18076	18085	0 %	0 %	60 %	40 %	297567893
13	NC_014214	AGCCG	2	10	19996	20005	20 %	0 %	40 %	40 %	297567895
14	NC_014214	CCCGG	2	10	21490	21499	0 %	0 %	40 %	60 %	297567898
15	NC_014214	CAGCG	2	10	22208	22217	20 %	0 %	40 %	40 %	297567899
16	NC_014214	CGCGC	2	10	26441	26450	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_014214	GGGCC	2	10	29066	29075	0 %	0 %	60 %	40 %	297567904
18	NC_014214	CTCTA	2	10	30230	30239	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014214	CCAGC	2	10	30716	30725	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_014214	CCGGG	2	10	30735	30744	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014214	CCGTG	2	10	31407	31416	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014214	TTTTC	2	10	35073	35082	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014214	GGCCT	2	10	35604	35613	0 %	20 %	40 %	40 %	297567910
24	NC_014214	GGGCC	2	10	36024	36033	0 %	0 %	60 %	40 %	297567910
25	NC_014214	ACAGC	2	10	36266	36275	40 %	0 %	20 %	40 %	297567910
26	NC_014214	CAACG	2	10	39302	39311	40 %	0 %	20 %	40 %	297567913
27	NC_014214	AGCGG	2	10	42071	42080	20 %	0 %	60 %	20 %	297567915
28	NC_014214	CGCCA	2	10	42264	42273	20 %	0 %	20 %	60 %	297567915
29	NC_014214	CGCCC	2	10	45258	45267	0 %	0 %	20 %	80 %	297567918
30	NC_014214	CCACC	2	10	45284	45293	20 %	0 %	0 %	80 %	297567918
31	NC_014214	CCACC	2	10	45305	45314	20 %	0 %	0 %	80 %	297567918
32	NC_014214	GGGCT	2	10	45865	45874	0 %	20 %	60 %	20 %	297567918
33	NC_014214	CCCGC	2	10	47607	47616	0 %	0 %	20 %	80 %	297567920
34	NC_014214	GCCGG	2	10	49774	49783	0 %	0 %	60 %	40 %	297567923
35	NC_014214	GGGCC	2	10	52648	52657	0 %	0 %	60 %	40 %	297567926
36	NC_014214	CCGGG	2	10	55223	55232	0 %	0 %	60 %	40 %	297567926
37	NC_014214	GGCCT	2	10	56071	56080	0 %	20 %	40 %	40 %	297567926
38	NC_014214	CCGCC	2	10	58043	58052	0 %	0 %	20 %	80 %	297567928
39	NC_014214	GCTGC	2	10	59414	59423	0 %	20 %	40 %	40 %	297567929
40	NC_014214	GGGAC	2	10	61275	61284	20 %	0 %	60 %	20 %	297567930
41	NC_014214	CCCGG	2	10	61953	61962	0 %	0 %	40 %	60 %	297567932
42	NC_014214	GGTCG	2	10	63151	63160	0 %	20 %	60 %	20 %	297567934
43	NC_014214	CCCGC	2	10	63572	63581	0 %	0 %	20 %	80 %	297567934
44	NC_014214	GCGAA	2	10	64723	64732	40 %	0 %	40 %	20 %	297567935
45	NC_014214	CCGTC	2	10	66994	67003	0 %	20 %	20 %	60 %	297567936
46	NC_014214	CCTGC	2	10	68640	68649	0 %	20 %	20 %	60 %	297567939
47	NC_014214	GCCCA	2	10	70578	70587	20 %	0 %	20 %	60 %	297567943
48	NC_014214	GGGTG	2	10	71483	71492	0 %	20 %	80 %	0 %	297567945
49	NC_014214	CAGCG	2	10	74480	74489	20 %	0 %	40 %	40 %	297567948
50	NC_014214	TCCCG	2	10	76026	76035	0 %	20 %	20 %	60 %	297567949
51	NC_014214	TTCTG	2	10	76082	76091	0 %	60 %	20 %	20 %	297567949
52	NC_014214	GGGTG	2	10	76512	76521	0 %	20 %	80 %	0 %	297567949
53	NC_014214	GCAGC	2	10	77699	77708	20 %	0 %	40 %	40 %	297567952
54	NC_014214	GAAGG	2	10	80882	80891	40 %	0 %	60 %	0 %	297567954
55	NC_014214	GGGAA	2	10	81233	81242	40 %	0 %	60 %	0 %	297567954
56	NC_014214	GCCGC	2	10	83248	83257	0 %	0 %	40 %	60 %	297567955
57	NC_014214	GGGTC	2	10	83888	83897	0 %	20 %	60 %	20 %	297567955
58	NC_014214	CCCCG	2	10	85658	85667	0 %	0 %	20 %	80 %	297567957
59	NC_014214	CCGCC	2	10	89243	89252	0 %	0 %	20 %	80 %	297567960
60	NC_014214	CAGCG	2	10	89710	89719	20 %	0 %	40 %	40 %	297567960
61	NC_014214	GCCCC	2	10	89855	89864	0 %	0 %	20 %	80 %	297567960
62	NC_014214	CCGGG	2	10	90144	90153	0 %	0 %	60 %	40 %	297567960
63	NC_014214	AGCCC	2	10	91349	91358	20 %	0 %	20 %	60 %	297567962
64	NC_014214	CGGCG	2	10	92381	92390	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014214	CGCTG	2	10	92579	92588	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014214	ACCGC	2	10	93532	93541	20 %	0 %	20 %	60 %	297567964
67	NC_014214	CCCCG	2	10	93570	93579	0 %	0 %	20 %	80 %	297567964
68	NC_014214	GGGAG	2	10	96080	96089	20 %	0 %	80 %	0 %	297567967
69	NC_014214	CCTGG	2	10	97067	97076	0 %	20 %	40 %	40 %	297567967
70	NC_014214	GCTGA	2	10	97406	97415	20 %	20 %	40 %	20 %	297567967
71	NC_014214	AACCG	2	10	97689	97698	40 %	0 %	20 %	40 %	297567968
72	NC_014214	CTTTC	2	10	98118	98127	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_014214	ACCCC	2	10	98148	98157	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
74	NC_014214	GGGCC	2	10	98747	98756	0 %	0 %	60 %	40 %	297567970
75	NC_014214	AGGGC	2	10	102315	102324	20 %	0 %	60 %	20 %	297567971
76	NC_014214	AGGCG	2	10	104434	104443	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014214	GCCCA	2	10	105902	105911	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_014214	GCCAT	2	10	107628	107637	20 %	20 %	20 %	40 %	297567974
79	NC_014214	GGCGA	2	10	109768	109777	20 %	0 %	60 %	20 %	297567975
80	NC_014214	GGCCC	2	10	113091	113100	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_014214	GGCCC	2	10	113355	113364	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_014214	CTCAC	2	10	113515	113524	20 %	20 %	0 %	60 %	297567979
83	NC_014214	TCCCA	2	10	113530	113539	20 %	20 %	0 %	60 %	297567979
84	NC_014214	CCCAG	2	10	113552	113561	20 %	0 %	20 %	60 %	297567979
85	NC_014214	AAGCG	2	10	113921	113930	40 %	0 %	40 %	20 %	297567979
86	NC_014214	ACCCC	2	10	114506	114515	20 %	0 %	0 %	80 %	297567979
87	NC_014214	CTGGC	2	10	115932	115941	0 %	20 %	40 %	40 %	297567980
88	NC_014214	GCCGG	2	10	116243	116252	0 %	0 %	60 %	40 %	297567980
89	NC_014214	GGCTG	2	10	116563	116572	0 %	20 %	60 %	20 %	297567980
90	NC_014214	GTGGC	2	10	118238	118247	0 %	20 %	60 %	20 %	297567982
91	NC_014214	CTCTT	2	10	118681	118690	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014214	GCCTC	2	10	120207	120216	0 %	20 %	20 %	60 %	297567984
93	NC_014214	GGGTA	2	10	120243	120252	20 %	20 %	60 %	0 %	297567984
94	NC_014214	GCAGG	2	10	120425	120434	20 %	0 %	60 %	20 %	297567984
95	NC_014214	CCCCT	2	10	121141	121150	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_014214	GCCTG	2	10	122168	122177	0 %	20 %	40 %	40 %	297567988
97	NC_014214	CCACG	2	10	124360	124369	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.