MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	GCAAG	2	10	890	899	40 %	0 %	40 %	20 %	297567865
2	NC_014214	CAAAA	2	10	3599	3608	80 %	0 %	0 %	20 %	297567870
3	NC_014214	TTTCC	2	10	10911	10920	0 %	60 %	0 %	40 %	297567880
4	NC_014214	CGCCC	2	10	12417	12426	0 %	0 %	20 %	80 %	297567885
5	NC_014214	TGCGC	2	10	14433	14442	0 %	20 %	40 %	40 %	297567889
6	NC_014214	TGGGG	2	10	14994	15003	0 %	20 %	80 %	0 %	297567889
7	NC_014214	GGGGA	2	10	15278	15287	20 %	0 %	80 %	0 %	297567890
8	NC_014214	ATCGG	2	10	17352	17361	20 %	20 %	40 %	20 %	297567892
9	NC_014214	GGCCG	2	10	18076	18085	0 %	0 %	60 %	40 %	297567893
10	NC_014214	AGCCG	2	10	19996	20005	20 %	0 %	40 %	40 %	297567895
11	NC_014214	CCCGG	2	10	21490	21499	0 %	0 %	40 %	60 %	297567898
12	NC_014214	CAGCG	2	10	22208	22217	20 %	0 %	40 %	40 %	297567899
13	NC_014214	GGGCC	2	10	29066	29075	0 %	0 %	60 %	40 %	297567904
14	NC_014214	GGCCT	2	10	35604	35613	0 %	20 %	40 %	40 %	297567910
15	NC_014214	GGGCC	2	10	36024	36033	0 %	0 %	60 %	40 %	297567910
16	NC_014214	ACAGC	2	10	36266	36275	40 %	0 %	20 %	40 %	297567910
17	NC_014214	CAACG	2	10	39302	39311	40 %	0 %	20 %	40 %	297567913
18	NC_014214	AGCGG	2	10	42071	42080	20 %	0 %	60 %	20 %	297567915
19	NC_014214	CGCCA	2	10	42264	42273	20 %	0 %	20 %	60 %	297567915
20	NC_014214	CGCCC	2	10	45258	45267	0 %	0 %	20 %	80 %	297567918
21	NC_014214	CCACC	2	10	45284	45293	20 %	0 %	0 %	80 %	297567918
22	NC_014214	CCACC	2	10	45305	45314	20 %	0 %	0 %	80 %	297567918
23	NC_014214	GGGCT	2	10	45865	45874	0 %	20 %	60 %	20 %	297567918
24	NC_014214	CCCGC	2	10	47607	47616	0 %	0 %	20 %	80 %	297567920
25	NC_014214	GCCGG	2	10	49774	49783	0 %	0 %	60 %	40 %	297567923
26	NC_014214	GGGCC	2	10	52648	52657	0 %	0 %	60 %	40 %	297567926
27	NC_014214	CCGGG	2	10	55223	55232	0 %	0 %	60 %	40 %	297567926
28	NC_014214	GGCCT	2	10	56071	56080	0 %	20 %	40 %	40 %	297567926
29	NC_014214	CCGCC	2	10	58043	58052	0 %	0 %	20 %	80 %	297567928
30	NC_014214	GCTGC	2	10	59414	59423	0 %	20 %	40 %	40 %	297567929
31	NC_014214	GGGAC	2	10	61275	61284	20 %	0 %	60 %	20 %	297567930
32	NC_014214	CCCGG	2	10	61953	61962	0 %	0 %	40 %	60 %	297567932
33	NC_014214	GGTCG	2	10	63151	63160	0 %	20 %	60 %	20 %	297567934
34	NC_014214	CCCGC	2	10	63572	63581	0 %	0 %	20 %	80 %	297567934
35	NC_014214	GCGAA	2	10	64723	64732	40 %	0 %	40 %	20 %	297567935
36	NC_014214	CCGTC	2	10	66994	67003	0 %	20 %	20 %	60 %	297567936
37	NC_014214	CCTGC	2	10	68640	68649	0 %	20 %	20 %	60 %	297567939
38	NC_014214	GCCCA	2	10	70578	70587	20 %	0 %	20 %	60 %	297567943
39	NC_014214	GGGTG	2	10	71483	71492	0 %	20 %	80 %	0 %	297567945
40	NC_014214	CAGCG	2	10	74480	74489	20 %	0 %	40 %	40 %	297567948
41	NC_014214	TCCCG	2	10	76026	76035	0 %	20 %	20 %	60 %	297567949
42	NC_014214	TTCTG	2	10	76082	76091	0 %	60 %	20 %	20 %	297567949
43	NC_014214	GGGTG	2	10	76512	76521	0 %	20 %	80 %	0 %	297567949
44	NC_014214	GCAGC	2	10	77699	77708	20 %	0 %	40 %	40 %	297567952
45	NC_014214	GAAGG	2	10	80882	80891	40 %	0 %	60 %	0 %	297567954
46	NC_014214	GGGAA	2	10	81233	81242	40 %	0 %	60 %	0 %	297567954
47	NC_014214	GCCGC	2	10	83248	83257	0 %	0 %	40 %	60 %	297567955
48	NC_014214	GGGTC	2	10	83888	83897	0 %	20 %	60 %	20 %	297567955
49	NC_014214	CCCCG	2	10	85658	85667	0 %	0 %	20 %	80 %	297567957
50	NC_014214	CCGCC	2	10	89243	89252	0 %	0 %	20 %	80 %	297567960
51	NC_014214	CAGCG	2	10	89710	89719	20 %	0 %	40 %	40 %	297567960
52	NC_014214	GCCCC	2	10	89855	89864	0 %	0 %	20 %	80 %	297567960
53	NC_014214	CCGGG	2	10	90144	90153	0 %	0 %	60 %	40 %	297567960
54	NC_014214	AGCCC	2	10	91349	91358	20 %	0 %	20 %	60 %	297567962
55	NC_014214	ACCGC	2	10	93532	93541	20 %	0 %	20 %	60 %	297567964
56	NC_014214	CCCCG	2	10	93570	93579	0 %	0 %	20 %	80 %	297567964
57	NC_014214	GGGAG	2	10	96080	96089	20 %	0 %	80 %	0 %	297567967
58	NC_014214	CCTGG	2	10	97067	97076	0 %	20 %	40 %	40 %	297567967
59	NC_014214	GCTGA	2	10	97406	97415	20 %	20 %	40 %	20 %	297567967
60	NC_014214	AACCG	2	10	97689	97698	40 %	0 %	20 %	40 %	297567968
61	NC_014214	GGGCC	2	10	98747	98756	0 %	0 %	60 %	40 %	297567970
62	NC_014214	AGGGC	2	10	102315	102324	20 %	0 %	60 %	20 %	297567971
63	NC_014214	GCCAT	2	10	107628	107637	20 %	20 %	20 %	40 %	297567974
64	NC_014214	GGCGA	2	10	109768	109777	20 %	0 %	60 %	20 %	297567975
65	NC_014214	CTCAC	2	10	113515	113524	20 %	20 %	0 %	60 %	297567979
66	NC_014214	TCCCA	2	10	113530	113539	20 %	20 %	0 %	60 %	297567979
67	NC_014214	CCCAG	2	10	113552	113561	20 %	0 %	20 %	60 %	297567979
68	NC_014214	AAGCG	2	10	113921	113930	40 %	0 %	40 %	20 %	297567979
69	NC_014214	ACCCC	2	10	114506	114515	20 %	0 %	0 %	80 %	297567979
70	NC_014214	CTGGC	2	10	115932	115941	0 %	20 %	40 %	40 %	297567980
71	NC_014214	GCCGG	2	10	116243	116252	0 %	0 %	60 %	40 %	297567980
72	NC_014214	GGCTG	2	10	116563	116572	0 %	20 %	60 %	20 %	297567980
73	NC_014214	GTGGC	2	10	118238	118247	0 %	20 %	60 %	20 %	297567982
74	NC_014214	GCCTC	2	10	120207	120216	0 %	20 %	20 %	60 %	297567984
75	NC_014214	GGGTA	2	10	120243	120252	20 %	20 %	60 %	0 %	297567984
76	NC_014214	GCAGG	2	10	120425	120434	20 %	0 %	60 %	20 %	297567984
77	NC_014214	GCCTG	2	10	122168	122177	0 %	20 %	40 %	40 %	297567988

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.