MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	CCTC	2	8	116	123	0 %	25 %	0 %	75 %	297567865
2	NC_014214	CCTC	2	8	494	501	0 %	25 %	0 %	75 %	297567865
3	NC_014214	GGTT	2	8	776	783	0 %	50 %	50 %	0 %	297567865
4	NC_014214	CGGG	2	8	1924	1931	0 %	0 %	75 %	25 %	297567865
5	NC_014214	CAGC	2	8	2195	2202	25 %	0 %	25 %	50 %	297567866
6	NC_014214	GCGG	2	8	2364	2371	0 %	0 %	75 %	25 %	297567866
7	NC_014214	AGCC	2	8	2550	2557	25 %	0 %	25 %	50 %	297567866
8	NC_014214	TCCA	2	8	2605	2612	25 %	25 %	0 %	50 %	297567866
9	NC_014214	CCGC	2	8	3457	3464	0 %	0 %	25 %	75 %	297567870
10	NC_014214	CGGG	2	8	4452	4459	0 %	0 %	75 %	25 %	297567871
11	NC_014214	GGGC	2	8	4524	4531	0 %	0 %	75 %	25 %	297567871
12	NC_014214	AAAG	2	8	4734	4741	75 %	0 %	25 %	0 %	297567871
13	NC_014214	CGAG	2	8	6604	6611	25 %	0 %	50 %	25 %	297567873
14	NC_014214	CCGC	2	8	6943	6950	0 %	0 %	25 %	75 %	297567874
15	NC_014214	CCGC	2	8	7258	7265	0 %	0 %	25 %	75 %	297567874
16	NC_014214	CGGT	2	8	7287	7294	0 %	25 %	50 %	25 %	297567874
17	NC_014214	CGGT	2	8	7329	7336	0 %	25 %	50 %	25 %	297567874
18	NC_014214	GAGC	2	8	7502	7509	25 %	0 %	50 %	25 %	297567874
19	NC_014214	CTTC	2	8	7802	7809	0 %	50 %	0 %	50 %	297567875
20	NC_014214	CGCC	2	8	8154	8161	0 %	0 %	25 %	75 %	297567875
21	NC_014214	CGCT	2	8	8794	8801	0 %	25 %	25 %	50 %	297567875
22	NC_014214	CGCT	2	8	9228	9235	0 %	25 %	25 %	50 %	297567876
23	NC_014214	CCCG	2	8	9401	9408	0 %	0 %	25 %	75 %	297567876
24	NC_014214	CCAC	2	8	9500	9507	25 %	0 %	0 %	75 %	297567876
25	NC_014214	CTTC	2	8	9839	9846	0 %	50 %	0 %	50 %	297567877
26	NC_014214	CCGA	2	8	10280	10287	25 %	0 %	25 %	50 %	297567878
27	NC_014214	CCCG	2	8	11449	11456	0 %	0 %	25 %	75 %	297567882
28	NC_014214	GGTA	2	8	12870	12877	25 %	25 %	50 %	0 %	297567887
29	NC_014214	CTGC	2	8	13293	13300	0 %	25 %	25 %	50 %	297567888
30	NC_014214	CTGC	2	8	13452	13459	0 %	25 %	25 %	50 %	297567888
31	NC_014214	ACCC	2	8	13811	13818	25 %	0 %	0 %	75 %	297567888
32	NC_014214	CAGG	2	8	14815	14822	25 %	0 %	50 %	25 %	297567889
33	NC_014214	GAGC	2	8	15186	15193	25 %	0 %	50 %	25 %	297567890
34	NC_014214	CCGC	2	8	18090	18097	0 %	0 %	25 %	75 %	297567893
35	NC_014214	AGGT	2	8	18353	18360	25 %	25 %	50 %	0 %	297567893
36	NC_014214	CTGG	2	8	18749	18756	0 %	25 %	50 %	25 %	297567894
37	NC_014214	GCTC	2	8	18848	18855	0 %	25 %	25 %	50 %	297567894
38	NC_014214	CGCT	2	8	19245	19252	0 %	25 %	25 %	50 %	297567894
39	NC_014214	CGGG	2	8	20788	20795	0 %	0 %	75 %	25 %	297567897
40	NC_014214	CCCA	2	8	20934	20941	25 %	0 %	0 %	75 %	297567897
41	NC_014214	CGAG	2	8	21263	21270	25 %	0 %	50 %	25 %	297567898
42	NC_014214	CCCG	2	8	21597	21604	0 %	0 %	25 %	75 %	297567898
43	NC_014214	GTGG	2	8	21750	21757	0 %	25 %	75 %	0 %	297567898
44	NC_014214	GGCG	2	8	22755	22762	0 %	0 %	75 %	25 %	297567899
45	NC_014214	CTGG	2	8	23317	23324	0 %	25 %	50 %	25 %	297567899
46	NC_014214	CGCC	2	8	23404	23411	0 %	0 %	25 %	75 %	297567899
47	NC_014214	GGGT	2	8	23780	23787	0 %	25 %	75 %	0 %	297567900
48	NC_014214	GGCT	2	8	24417	24424	0 %	25 %	50 %	25 %	297567901
49	NC_014214	CTGG	2	8	24944	24951	0 %	25 %	50 %	25 %	297567902
50	NC_014214	GCTC	2	8	25043	25050	0 %	25 %	25 %	50 %	297567902
51	NC_014214	CGCT	2	8	25440	25447	0 %	25 %	25 %	50 %	297567902
52	NC_014214	CCAG	2	8	27644	27651	25 %	0 %	25 %	50 %	297567904
53	NC_014214	CCCG	2	8	28832	28839	0 %	0 %	25 %	75 %	297567904
54	NC_014214	GCAG	2	8	28856	28863	25 %	0 %	50 %	25 %	297567904
55	NC_014214	GGGA	2	8	29394	29401	25 %	0 %	75 %	0 %	297567905
56	NC_014214	GGCC	2	8	29622	29629	0 %	0 %	50 %	50 %	297567905
57	NC_014214	GGCA	2	8	29687	29694	25 %	0 %	50 %	25 %	297567905
58	NC_014214	TTCT	2	8	31452	31459	0 %	75 %	0 %	25 %	297567906
59	NC_014214	CCCT	2	8	31746	31753	0 %	25 %	0 %	75 %	297567906
60	NC_014214	TGCT	2	8	31934	31941	0 %	50 %	25 %	25 %	297567906
61	NC_014214	CCCG	2	8	32046	32053	0 %	0 %	25 %	75 %	297567906
62	NC_014214	TTCC	2	8	32280	32287	0 %	50 %	0 %	50 %	297567906
63	NC_014214	GCTC	2	8	33635	33642	0 %	25 %	25 %	50 %	297567908
64	NC_014214	AGGG	2	8	33787	33794	25 %	0 %	75 %	0 %	297567908
65	NC_014214	AGTA	2	8	34393	34400	50 %	25 %	25 %	0 %	297567909
66	NC_014214	GCGG	2	8	34680	34687	0 %	0 %	75 %	25 %	297567909
67	NC_014214	CTGG	2	8	35396	35403	0 %	25 %	50 %	25 %	297567910
68	NC_014214	CCCA	2	8	36132	36139	25 %	0 %	0 %	75 %	297567910
69	NC_014214	CTGG	2	8	36488	36495	0 %	25 %	50 %	25 %	297567910
70	NC_014214	CACC	2	8	36629	36636	25 %	0 %	0 %	75 %	297567910
71	NC_014214	GGGA	2	8	36772	36779	25 %	0 %	75 %	0 %	297567910
72	NC_014214	ACCA	2	8	36983	36990	50 %	0 %	0 %	50 %	297567911
73	NC_014214	ACCG	2	8	37058	37065	25 %	0 %	25 %	50 %	297567911
74	NC_014214	GGTC	2	8	37161	37168	0 %	25 %	50 %	25 %	297567911
75	NC_014214	CGTG	2	8	37270	37277	0 %	25 %	50 %	25 %	297567911
76	NC_014214	GAGG	2	8	37429	37436	25 %	0 %	75 %	0 %	297567911
77	NC_014214	CTGG	2	8	37447	37454	0 %	25 %	50 %	25 %	297567911
78	NC_014214	CGCC	2	8	37997	38004	0 %	0 %	25 %	75 %	297567912
79	NC_014214	GAGG	2	8	38405	38412	25 %	0 %	75 %	0 %	297567913
80	NC_014214	CCCG	2	8	38910	38917	0 %	0 %	25 %	75 %	297567913
81	NC_014214	GGCG	2	8	39259	39266	0 %	0 %	75 %	25 %	297567913
82	NC_014214	CCCG	2	8	39966	39973	0 %	0 %	25 %	75 %	297567913
83	NC_014214	ACCG	2	8	40502	40509	25 %	0 %	25 %	50 %	297567913
84	NC_014214	CAGC	2	8	40665	40672	25 %	0 %	25 %	50 %	297567914
85	NC_014214	CGGT	2	8	41234	41241	0 %	25 %	50 %	25 %	297567914
86	NC_014214	CAGC	2	8	41518	41525	25 %	0 %	25 %	50 %	297567914
87	NC_014214	CCGC	2	8	41652	41659	0 %	0 %	25 %	75 %	297567914
88	NC_014214	CGCC	2	8	42884	42891	0 %	0 %	25 %	75 %	297567915
89	NC_014214	CAGC	2	8	43118	43125	25 %	0 %	25 %	50 %	297567915
90	NC_014214	CAGC	2	8	43232	43239	25 %	0 %	25 %	50 %	297567915
91	NC_014214	GCCT	2	8	43502	43509	0 %	25 %	25 %	50 %	297567916
92	NC_014214	GAAG	2	8	43716	43723	50 %	0 %	50 %	0 %	297567916
93	NC_014214	CCGC	3	12	43813	43824	0 %	0 %	25 %	75 %	297567916
94	NC_014214	CGCT	2	8	44307	44314	0 %	25 %	25 %	50 %	297567917
95	NC_014214	GCCC	2	8	45042	45049	0 %	0 %	25 %	75 %	297567918
96	NC_014214	GGGC	2	8	45357	45364	0 %	0 %	75 %	25 %	297567918
97	NC_014214	GCCT	2	8	45560	45567	0 %	25 %	25 %	50 %	297567918
98	NC_014214	GCCC	2	8	46464	46471	0 %	0 %	25 %	75 %	297567918
99	NC_014214	CCTG	2	8	47334	47341	0 %	25 %	25 %	50 %	297567920
100	NC_014214	GAGC	2	8	47357	47364	25 %	0 %	50 %	25 %	297567920
101	NC_014214	AGCC	2	8	47460	47467	25 %	0 %	25 %	50 %	297567920
102	NC_014214	GGCG	2	8	47508	47515	0 %	0 %	75 %	25 %	297567920
103	NC_014214	CGCC	2	8	47702	47709	0 %	0 %	25 %	75 %	297567920
104	NC_014214	AGAC	2	8	47799	47806	50 %	0 %	25 %	25 %	297567920
105	NC_014214	GGTA	2	8	47846	47853	25 %	25 %	50 %	0 %	297567920
106	NC_014214	AGCC	2	8	48805	48812	25 %	0 %	25 %	50 %	297567921
107	NC_014214	GCTG	2	8	49550	49557	0 %	25 %	50 %	25 %	297567922
108	NC_014214	CGGG	2	8	49908	49915	0 %	0 %	75 %	25 %	297567923
109	NC_014214	CAGA	2	8	50068	50075	50 %	0 %	25 %	25 %	297567923
110	NC_014214	GGCA	2	8	50076	50083	25 %	0 %	50 %	25 %	297567923
111	NC_014214	CCGC	2	8	50336	50343	0 %	0 %	25 %	75 %	297567924
112	NC_014214	GGCG	2	8	51690	51697	0 %	0 %	75 %	25 %	297567925
113	NC_014214	ACTC	2	8	51958	51965	25 %	25 %	0 %	50 %	297567925
114	NC_014214	CGCT	2	8	52231	52238	0 %	25 %	25 %	50 %	297567926
115	NC_014214	CCCG	2	8	52416	52423	0 %	0 %	25 %	75 %	297567926
116	NC_014214	ACCG	2	8	52600	52607	25 %	0 %	25 %	50 %	297567926
117	NC_014214	GACC	2	8	53535	53542	25 %	0 %	25 %	50 %	297567926
118	NC_014214	ACCT	2	8	53596	53603	25 %	25 %	0 %	50 %	297567926
119	NC_014214	GCCC	2	8	53860	53867	0 %	0 %	25 %	75 %	297567926
120	NC_014214	CGGG	2	8	55419	55426	0 %	0 %	75 %	25 %	297567926
121	NC_014214	CGGG	2	8	56804	56811	0 %	0 %	75 %	25 %	297567927
122	NC_014214	CGGG	2	8	57355	57362	0 %	0 %	75 %	25 %	297567928
123	NC_014214	TCCG	2	8	57931	57938	0 %	25 %	25 %	50 %	297567928
124	NC_014214	CGCT	2	8	58055	58062	0 %	25 %	25 %	50 %	297567928
125	NC_014214	ACCC	2	8	58251	58258	25 %	0 %	0 %	75 %	297567928
126	NC_014214	GGCG	2	8	58507	58514	0 %	0 %	75 %	25 %	297567928
127	NC_014214	GTGG	2	8	59189	59196	0 %	25 %	75 %	0 %	297567929
128	NC_014214	GCTG	2	8	59200	59207	0 %	25 %	50 %	25 %	297567929
129	NC_014214	CCCG	2	8	59525	59532	0 %	0 %	25 %	75 %	297567929
130	NC_014214	CCCG	2	8	60029	60036	0 %	0 %	25 %	75 %	297567929
131	NC_014214	CCAC	2	8	60037	60044	25 %	0 %	0 %	75 %	297567929
132	NC_014214	CGGT	2	8	60119	60126	0 %	25 %	50 %	25 %	297567929
133	NC_014214	CTGG	2	8	60409	60416	0 %	25 %	50 %	25 %	297567930
134	NC_014214	ACCT	2	8	60854	60861	25 %	25 %	0 %	50 %	297567930
135	NC_014214	GGCG	2	8	61905	61912	0 %	0 %	75 %	25 %	297567932
136	NC_014214	AGCC	2	8	61994	62001	25 %	0 %	25 %	50 %	297567932
137	NC_014214	GCCA	2	8	62398	62405	25 %	0 %	25 %	50 %	297567933
138	NC_014214	CGGC	2	8	62575	62582	0 %	0 %	50 %	50 %	297567933
139	NC_014214	TACA	2	8	62820	62827	50 %	25 %	0 %	25 %	297567933
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.