MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 1940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	TCT	2	6	155	160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
2	NC_014214	CTC	2	6	399	404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567865
3	NC_014214	GCC	2	6	442	447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567865
4	NC_014214	CAG	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
5	NC_014214	CGT	3	9	479	487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567865
6	NC_014214	TGG	2	6	589	594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567865
7	NC_014214	CTG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567865
8	NC_014214	GCC	2	6	650	655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567865
9	NC_014214	GGT	2	6	663	668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567865
10	NC_014214	GCC	2	6	717	722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567865
11	NC_014214	AGC	2	6	864	869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
12	NC_014214	AGG	2	6	884	889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567865
13	NC_014214	CCT	2	6	959	964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567865
14	NC_014214	GGC	2	6	1031	1036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
15	NC_014214	GCG	2	6	1074	1079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
16	NC_014214	TTC	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
17	NC_014214	GAC	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
18	NC_014214	CAC	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
19	NC_014214	TGC	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567865
20	NC_014214	ACG	2	6	1486	1491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567865
21	NC_014214	TTC	2	6	1521	1526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
22	NC_014214	TCT	2	6	1549	1554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
23	NC_014214	GCG	3	9	1597	1605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
24	NC_014214	CCA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
25	NC_014214	CAC	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
26	NC_014214	CAC	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
27	NC_014214	CGG	2	6	1970	1975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567865
28	NC_014214	GGT	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567865
29	NC_014214	CAC	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567865
30	NC_014214	TCC	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567865
31	NC_014214	TTC	2	6	2067	2072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567865
32	NC_014214	TGA	2	6	2102	2107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567865
33	NC_014214	TCT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567866
34	NC_014214	CAG	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567866
35	NC_014214	CAG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567866
36	NC_014214	CGG	2	6	2426	2431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567866
37	NC_014214	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567866
38	NC_014214	GCC	2	6	2491	2496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567866
39	NC_014214	GCG	2	6	2590	2595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567866
40	NC_014214	CTC	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567867
41	NC_014214	CCG	2	6	2702	2707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567867
42	NC_014214	CGT	2	6	2725	2730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567867
43	NC_014214	GCT	2	6	2770	2775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567867
44	NC_014214	TCC	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567867
45	NC_014214	TCC	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567867
46	NC_014214	CAC	2	6	2946	2951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567868
47	NC_014214	GCC	2	6	2967	2972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567868
48	NC_014214	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567869
49	NC_014214	CTC	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567869
50	NC_014214	GGA	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567869
51	NC_014214	TCC	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567869
52	NC_014214	CTC	2	6	3384	3389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567870
53	NC_014214	CTC	2	6	3431	3436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567870
54	NC_014214	CCG	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567870
55	NC_014214	CCT	2	6	3493	3498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567870
56	NC_014214	GAT	2	6	3500	3505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567870
57	NC_014214	CAG	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567870
58	NC_014214	TCG	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567870
59	NC_014214	CCT	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567871
60	NC_014214	CCT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567871
61	NC_014214	CTC	2	6	4551	4556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567871
62	NC_014214	GAA	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567871
63	NC_014214	GCC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567871
64	NC_014214	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567871
65	NC_014214	CGG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567871
66	NC_014214	GCC	2	6	5598	5603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567872
67	NC_014214	TCC	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567872
68	NC_014214	CCT	2	6	5662	5667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567872
69	NC_014214	GCC	2	6	5670	5675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567872
70	NC_014214	CAG	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
71	NC_014214	CAC	2	6	5735	5740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567872
72	NC_014214	CAG	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
73	NC_014214	CAG	2	6	5783	5788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
74	NC_014214	CTG	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567872
75	NC_014214	AGC	2	6	5838	5843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567872
76	NC_014214	ACC	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567872
77	NC_014214	CTC	2	6	5957	5962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567872
78	NC_014214	CCG	2	6	5972	5977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567872
79	NC_014214	CTT	2	6	5980	5985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567872
80	NC_014214	GCG	2	6	6017	6022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567872
81	NC_014214	ACC	2	6	6030	6035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567872
82	NC_014214	CAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567872
83	NC_014214	GGA	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567873
84	NC_014214	ACC	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567873
85	NC_014214	AGG	2	6	6328	6333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567873
86	NC_014214	CGC	2	6	6374	6379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567873
87	NC_014214	TCA	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567873
88	NC_014214	CTA	2	6	6665	6670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567873
89	NC_014214	CGG	2	6	6686	6691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567873
90	NC_014214	CGC	2	6	6884	6889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567874
91	NC_014214	AAC	2	6	6951	6956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297567874
92	NC_014214	CAG	2	6	6989	6994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567874
93	NC_014214	CCG	2	6	6995	7000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567874
94	NC_014214	CCA	2	6	7072	7077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567874
95	NC_014214	TGG	2	6	7167	7172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567874
96	NC_014214	CTG	2	6	7184	7189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567874
97	NC_014214	CCT	2	6	7204	7209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567874
98	NC_014214	CAG	3	9	7367	7375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567874
99	NC_014214	CAG	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567874
100	NC_014214	CGT	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567874
101	NC_014214	CCA	2	6	7447	7452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567874
102	NC_014214	GAC	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567874
103	NC_014214	CTG	2	6	7655	7660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567874
104	NC_014214	CCT	2	6	7748	7753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567875
105	NC_014214	CGG	2	6	7773	7778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567875
106	NC_014214	GGC	2	6	7818	7823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567875
107	NC_014214	TCT	2	6	7883	7888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567875
108	NC_014214	CAG	2	6	7902	7907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567875
109	NC_014214	CGC	2	6	7944	7949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567875
110	NC_014214	GGC	2	6	7980	7985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567875
111	NC_014214	CGA	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567875
112	NC_014214	CGT	2	6	8057	8062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567875
113	NC_014214	AGC	2	6	8068	8073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567875
114	NC_014214	CCG	2	6	8204	8209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567875
115	NC_014214	GCG	2	6	8252	8257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567875
116	NC_014214	GGC	2	6	8259	8264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567875
117	NC_014214	CGC	2	6	8290	8295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567875
118	NC_014214	CCA	3	9	8297	8305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567875
119	NC_014214	GCC	2	6	8399	8404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567875
120	NC_014214	TCC	3	9	8422	8430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567875
121	NC_014214	TCC	2	6	8434	8439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567875
122	NC_014214	TCC	2	6	8458	8463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567875
123	NC_014214	CTT	2	6	8478	8483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567875
124	NC_014214	CTC	2	6	8571	8576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567875
125	NC_014214	TGC	2	6	8642	8647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567875
126	NC_014214	GCA	2	6	8690	8695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567875
127	NC_014214	CAG	2	6	8730	8735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567875
128	NC_014214	TGG	2	6	8773	8778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567875
129	NC_014214	GGC	2	6	8817	8822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567875
130	NC_014214	CCA	2	6	8834	8839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567875
131	NC_014214	CGG	2	6	8873	8878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567875
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388	NC_014214	CTC	2	6	27627	27632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567904
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500	NC_014214	GTG	2	6	36387	36392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567910

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