MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 2206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_014214	CGC	2	6	113334	113339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2002	NC_014214	GTT	2	6	113613	113618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297567979
2003	NC_014214	GTA	2	6	113625	113630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297567979
2004	NC_014214	GCT	2	6	113709	113714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567979
2005	NC_014214	GCT	2	6	114036	114041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567979
2006	NC_014214	CCA	2	6	114053	114058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567979
2007	NC_014214	CCG	2	6	114092	114097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567979
2008	NC_014214	CTC	2	6	114105	114110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2009	NC_014214	CAG	2	6	114213	114218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567979
2010	NC_014214	CCG	2	6	114260	114265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567979
2011	NC_014214	GGC	2	6	114275	114280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567979
2012	NC_014214	CCA	2	6	114326	114331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567979
2013	NC_014214	GTC	2	6	114399	114404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567979
2014	NC_014214	CCG	2	6	114439	114444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567979
2015	NC_014214	CTT	2	6	114543	114548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567979
2016	NC_014214	CTC	2	6	114612	114617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2017	NC_014214	GCC	2	6	114641	114646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567979
2018	NC_014214	CCT	2	6	114686	114691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2019	NC_014214	CCT	2	6	114710	114715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2020	NC_014214	GGC	2	6	114729	114734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567979
2021	NC_014214	GCC	2	6	114758	114763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567979
2022	NC_014214	CTC	2	6	114771	114776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2023	NC_014214	CTG	2	6	114786	114791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567979
2024	NC_014214	CCT	2	6	114848	114853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2025	NC_014214	CGC	2	6	114883	114888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567979
2026	NC_014214	GCC	2	6	114892	114897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567979
2027	NC_014214	CTC	2	6	114936	114941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2028	NC_014214	TCG	2	6	114967	114972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567979
2029	NC_014214	CCT	2	6	115049	115054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2030	NC_014214	TCC	2	6	115072	115077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2031	NC_014214	TCC	2	6	115237	115242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2032	NC_014214	TGC	2	6	115267	115272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567979
2033	NC_014214	GGC	2	6	115373	115378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567979
2034	NC_014214	CCT	2	6	115385	115390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567979
2035	NC_014214	CCG	2	6	115403	115408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567979
2036	NC_014214	CAA	2	6	115455	115460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297567979
2037	NC_014214	CAG	2	6	115461	115466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567979
2038	NC_014214	TAT	2	6	115481	115486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_014214	ATG	2	6	115564	115569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_014214	CGG	2	6	115659	115664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567980
2041	NC_014214	GGC	2	6	115960	115965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567980
2042	NC_014214	CTG	2	6	116001	116006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2043	NC_014214	CCG	2	6	116016	116021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567980
2044	NC_014214	CTG	2	6	116052	116057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2045	NC_014214	ACC	2	6	116083	116088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567980
2046	NC_014214	GGA	2	6	116138	116143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567980
2047	NC_014214	CTG	2	6	116145	116150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2048	NC_014214	GGC	2	6	116204	116209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567980
2049	NC_014214	CTC	2	6	116229	116234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567980
2050	NC_014214	CTT	2	6	116297	116302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567980
2051	NC_014214	CGC	3	9	116304	116312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567980
2052	NC_014214	AGC	2	6	116359	116364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2053	NC_014214	CTC	2	6	116400	116405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567980
2054	NC_014214	CGG	2	6	116408	116413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567980
2055	NC_014214	GCC	2	6	116457	116462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567980
2056	NC_014214	GTC	2	6	116481	116486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2057	NC_014214	CTG	2	6	116487	116492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2058	NC_014214	ACC	2	6	116536	116541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567980
2059	NC_014214	CAC	2	6	116601	116606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567980
2060	NC_014214	TGG	4	12	116623	116634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567980
2061	NC_014214	CTG	2	6	116661	116666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2062	NC_014214	GCC	2	6	116667	116672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567980
2063	NC_014214	CTG	3	9	116703	116711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2064	NC_014214	GCG	2	6	116810	116815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567980
2065	NC_014214	GGC	2	6	116902	116907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567980
2066	NC_014214	GGA	2	6	116942	116947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567980
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2068	NC_014214	GGC	2	6	117073	117078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567980
2069	NC_014214	GGC	2	6	117081	117086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567980
2070	NC_014214	CGG	2	6	117175	117180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567980
2071	NC_014214	CTG	2	6	117192	117197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2072	NC_014214	CGA	2	6	117206	117211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2073	NC_014214	GCC	2	6	117244	117249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567980
2074	NC_014214	TGC	2	6	117310	117315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567980
2075	NC_014214	TGG	2	6	117316	117321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297567980
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2078	NC_014214	CGC	2	6	117597	117602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567981
2079	NC_014214	CTG	3	9	117610	117618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567981
2080	NC_014214	GGC	2	6	117657	117662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567981
2081	NC_014214	GCA	2	6	117675	117680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567981
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2083	NC_014214	CGC	2	6	117730	117735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567981
2084	NC_014214	CCG	2	6	117756	117761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567981
2085	NC_014214	GGA	3	9	117819	117827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567981
2086	NC_014214	GCA	2	6	117848	117853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567981
2087	NC_014214	ACC	2	6	117865	117870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567981
2088	NC_014214	AAG	2	6	117910	117915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297567981
2089	NC_014214	CTG	2	6	117961	117966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567981
2090	NC_014214	CAC	2	6	117982	117987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567981
2091	NC_014214	AGG	2	6	118013	118018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_014214	GAG	2	6	118031	118036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567982
2093	NC_014214	CAT	2	6	118060	118065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297567982
2094	NC_014214	AGG	2	6	118077	118082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567982
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2096	NC_014214	GAG	2	6	118253	118258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567982
2097	NC_014214	GCA	3	9	118278	118286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567982
2098	NC_014214	CGG	2	6	118332	118337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567982
2099	NC_014214	CCG	2	6	118348	118353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567982
2100	NC_014214	ACC	2	6	118428	118433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567982
2101	NC_014214	TCC	2	6	118446	118451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567982
2102	NC_014214	GCC	3	9	118457	118465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567982
2103	NC_014214	GTC	2	6	118496	118501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567982
2104	NC_014214	AGG	2	6	118581	118586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297567982
2105	NC_014214	GCT	2	6	118612	118617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567982
2106	NC_014214	GGC	2	6	118701	118706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297567983
2107	NC_014214	CCT	2	6	118757	118762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567983
2108	NC_014214	CTC	2	6	118794	118799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567983
2109	NC_014214	CCT	2	6	118832	118837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567983
2110	NC_014214	CCT	2	6	118853	118858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567983
2111	NC_014214	CCA	2	6	118868	118873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567983
2112	NC_014214	TCC	2	6	118876	118881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297567983
2113	NC_014214	CCA	2	6	119048	119053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567983
2114	NC_014214	AGC	2	6	119062	119067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297567983
2115	NC_014214	CTT	2	6	119178	119183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297567983
2116	NC_014214	CCA	2	6	119192	119197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297567983
2117	NC_014214	TCG	2	6	119233	119238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297567983
2118	NC_014214	GCC	2	6	119379	119384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297567983
2119	NC_014214	CCT	2	6	119415	119420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2120	NC_014214	AGG	2	6	119545	119550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.