MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL02

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014214	GC	3	6	2388	2393	0 %	0 %	50 %	50 %	297567866
2	NC_014214	CG	3	6	2657	2662	0 %	0 %	50 %	50 %	297567867
3	NC_014214	TA	4	8	3134	3141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014214	CG	3	6	3528	3533	0 %	0 %	50 %	50 %	297567870
5	NC_014214	TC	3	6	3681	3686	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014214	CT	3	6	4171	4176	0 %	50 %	0 %	50 %	297567871
7	NC_014214	GC	4	8	4857	4864	0 %	0 %	50 %	50 %	297567871
8	NC_014214	AG	3	6	4919	4924	50 %	0 %	50 %	0 %	297567871
9	NC_014214	AT	3	6	6164	6169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014214	GC	3	6	7572	7577	0 %	0 %	50 %	50 %	297567874
11	NC_014214	AG	3	6	8585	8590	50 %	0 %	50 %	0 %	297567875
12	NC_014214	CG	3	6	10357	10362	0 %	0 %	50 %	50 %	297567879
13	NC_014214	TA	3	6	13972	13977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014214	CG	3	6	15360	15365	0 %	0 %	50 %	50 %	297567890
15	NC_014214	CG	3	6	16746	16751	0 %	0 %	50 %	50 %	297567892
16	NC_014214	GC	3	6	18341	18346	0 %	0 %	50 %	50 %	297567893
17	NC_014214	GT	3	6	19342	19347	0 %	50 %	50 %	0 %	297567894
18	NC_014214	GC	3	6	19714	19719	0 %	0 %	50 %	50 %	297567895
19	NC_014214	GC	3	6	19738	19743	0 %	0 %	50 %	50 %	297567895
20	NC_014214	TC	3	6	20723	20728	0 %	50 %	0 %	50 %	297567897
21	NC_014214	TC	3	6	21203	21208	0 %	50 %	0 %	50 %	297567898
22	NC_014214	TA	3	6	21869	21874	50 %	50 %	0 %	0 %	297567898
23	NC_014214	AG	3	6	21982	21987	50 %	0 %	50 %	0 %	297567899
24	NC_014214	GC	3	6	22870	22875	0 %	0 %	50 %	50 %	297567899
25	NC_014214	GT	3	6	25537	25542	0 %	50 %	50 %	0 %	297567902
26	NC_014214	TC	3	6	25778	25783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014214	GA	3	6	26977	26982	50 %	0 %	50 %	0 %	297567903
28	NC_014214	GC	3	6	28580	28585	0 %	0 %	50 %	50 %	297567904
29	NC_014214	TA	3	6	29126	29131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014214	GA	3	6	29276	29281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014214	TA	3	6	31399	31404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014214	CT	3	6	31848	31853	0 %	50 %	0 %	50 %	297567906
33	NC_014214	GA	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	297567906
34	NC_014214	GT	3	6	32577	32582	0 %	50 %	50 %	0 %	297567906
35	NC_014214	CG	3	6	34171	34176	0 %	0 %	50 %	50 %	297567909
36	NC_014214	AG	5	10	34321	34330	50 %	0 %	50 %	0 %	297567909
37	NC_014214	AT	3	6	35265	35270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014214	GT	3	6	35288	35293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014214	CG	3	6	35332	35337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014214	AG	3	6	35470	35475	50 %	0 %	50 %	0 %	297567910
41	NC_014214	GC	3	6	38524	38529	0 %	0 %	50 %	50 %	297567913
42	NC_014214	CG	3	6	43756	43761	0 %	0 %	50 %	50 %	297567916
43	NC_014214	AG	3	6	44491	44496	50 %	0 %	50 %	0 %	297567917
44	NC_014214	TG	3	6	47381	47386	0 %	50 %	50 %	0 %	297567920
45	NC_014214	GT	3	6	51139	51144	0 %	50 %	50 %	0 %	297567924
46	NC_014214	TG	3	6	51544	51549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014214	CG	3	6	52377	52382	0 %	0 %	50 %	50 %	297567926
48	NC_014214	CG	3	6	56161	56166	0 %	0 %	50 %	50 %	297567926
49	NC_014214	GA	3	6	58535	58540	50 %	0 %	50 %	0 %	297567928
50	NC_014214	GC	3	6	64144	64149	0 %	0 %	50 %	50 %	297567934
51	NC_014214	CA	3	6	65987	65992	50 %	0 %	0 %	50 %	297567936
52	NC_014214	CA	3	6	66240	66245	50 %	0 %	0 %	50 %	297567936
53	NC_014214	CT	3	6	67767	67772	0 %	50 %	0 %	50 %	297567937
54	NC_014214	CG	3	6	70024	70029	0 %	0 %	50 %	50 %	297567942
55	NC_014214	TC	3	6	70164	70169	0 %	50 %	0 %	50 %	297567943
56	NC_014214	TC	4	8	71759	71766	0 %	50 %	0 %	50 %	297567945
57	NC_014214	TA	3	6	73091	73096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014214	GC	3	6	75817	75822	0 %	0 %	50 %	50 %	297567948
59	NC_014214	CT	3	6	77671	77676	0 %	50 %	0 %	50 %	297567951
60	NC_014214	GA	3	6	81514	81519	50 %	0 %	50 %	0 %	297567954
61	NC_014214	CT	3	6	83494	83499	0 %	50 %	0 %	50 %	297567955
62	NC_014214	AC	3	6	84936	84941	50 %	0 %	0 %	50 %	297567956
63	NC_014214	GA	3	6	87282	87287	50 %	0 %	50 %	0 %	297567957
64	NC_014214	GC	3	6	91120	91125	0 %	0 %	50 %	50 %	297567962
65	NC_014214	AT	3	6	93604	93609	50 %	50 %	0 %	0 %	297567964
66	NC_014214	GC	3	6	93982	93987	0 %	0 %	50 %	50 %	297567965
67	NC_014214	CT	3	6	95813	95818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014214	TC	3	6	95996	96001	0 %	50 %	0 %	50 %	297567967
69	NC_014214	GC	3	6	96830	96835	0 %	0 %	50 %	50 %	297567967
70	NC_014214	CT	3	6	97487	97492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014214	CG	3	6	98177	98182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014214	GC	4	8	98396	98403	0 %	0 %	50 %	50 %	297567969
73	NC_014214	CG	3	6	99215	99220	0 %	0 %	50 %	50 %	297567970
74	NC_014214	CT	3	6	101984	101989	0 %	50 %	0 %	50 %	297567971
75	NC_014214	GC	3	6	104555	104560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014214	CT	3	6	108148	108153	0 %	50 %	0 %	50 %	297567974
77	NC_014214	GT	3	6	109341	109346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014214	GC	3	6	109556	109561	0 %	0 %	50 %	50 %	297567975
79	NC_014214	CG	3	6	109839	109844	0 %	0 %	50 %	50 %	297567975
80	NC_014214	TC	3	6	111143	111148	0 %	50 %	0 %	50 %	297567975
81	NC_014214	CT	3	6	111260	111265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014214	AC	3	6	112357	112362	50 %	0 %	0 %	50 %	297567977
83	NC_014214	CG	3	6	113074	113079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014214	GA	3	6	113185	113190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014214	GA	3	6	115222	115227	50 %	0 %	50 %	0 %	297567979
86	NC_014214	CG	3	6	116856	116861	0 %	0 %	50 %	50 %	297567980
87	NC_014214	AG	3	6	118043	118048	50 %	0 %	50 %	0 %	297567982
88	NC_014214	CG	3	6	118163	118168	0 %	0 %	50 %	50 %	297567982
89	NC_014214	TC	4	8	118593	118600	0 %	50 %	0 %	50 %	297567982
90	NC_014214	TA	3	6	119527	119532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014214	GC	3	6	119780	119785	0 %	0 %	50 %	50 %	297567984
92	NC_014214	TG	4	8	121193	121200	0 %	50 %	50 %	0 %	297567986
93	NC_014214	TA	3	6	121887	121892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014214	CG	3	6	123438	123443	0 %	0 %	50 %	50 %	297567990
95	NC_014214	CG	3	6	123695	123700	0 %	0 %	50 %	50 %	297567991

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.