MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL01

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014213	CCCGGC	2	12	302	313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014213	GGTGGC	2	12	14390	14401	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014213	CACGGC	2	12	25003	25014	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014213	GCAGTT	2	12	36545	36556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014213	GCAGTT	2	12	43225	43236	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014213	GGCAGA	2	12	43801	43812	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014213	GCAGTT	2	12	61227	61238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014213	CCTGCG	2	12	67463	67474	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014213	CAACTG	2	12	80685	80696	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014213	CAGGGC	2	12	142857	142868	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014213	CAGGGC	2	12	142923	142934	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014213	CAACTG	2	12	160145	160156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014213	CAACTG	2	12	167797	167808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014213	CAGGGC	2	12	202195	202206	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014213	GCTCTT	2	12	212085	212096	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014213	GCAGTT	2	12	217685	217696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014213	CAACTG	2	12	232942	232953	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014213	GCCGTG	2	12	244483	244494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014213	CGCCAC	2	12	255093	255104	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014213	GTACAT	2	12	274789	274800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014213	TTATAA	2	12	275000	275011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014213	GCTCGT	2	12	277377	277388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014213	CACAGG	2	12	283459	283470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014213	GTGCCA	2	12	283674	283685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014213	GCAGTT	2	12	297810	297821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014213	CCCAGC	2	12	309173	309184	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014213	AGGGGC	2	12	309441	309452	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014213	GCGGCT	2	12	316438	316449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014213	AGCCCC	2	12	316907	316918	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014213	CCAGGC	2	12	334470	334481	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014213	AACCGT	2	12	337226	337237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014213	ACCCCG	2	12	341830	341841	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014213	CCCGTT	2	12	345584	345595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014213	CTGGAG	2	12	346406	346417	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014213	CGGGGA	2	12	347079	347090	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.