MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL01

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014213	CTACC	2	10	547	556	20 %	20 %	0 %	60 %	297567558
2	NC_014213	CGGCC	2	10	1437	1446	0 %	0 %	40 %	60 %	297567559
3	NC_014213	CTGGC	2	10	2354	2363	0 %	20 %	40 %	40 %	297567560
4	NC_014213	GGGAG	2	10	3738	3747	20 %	0 %	80 %	0 %	297567561
5	NC_014213	GCCTG	2	10	3942	3951	0 %	20 %	40 %	40 %	297567561
6	NC_014213	CTGGG	2	10	6032	6041	0 %	20 %	60 %	20 %	297567564
7	NC_014213	CCGAC	2	10	8539	8548	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_014213	GGGGT	2	10	9162	9171	0 %	20 %	80 %	0 %	297567566
9	NC_014213	GCCCA	2	10	9785	9794	20 %	0 %	20 %	60 %	297567566
10	NC_014213	GCGGG	2	10	11765	11774	0 %	0 %	80 %	20 %	297567568
11	NC_014213	GGACG	2	10	11970	11979	20 %	0 %	60 %	20 %	297567568
12	NC_014213	GGCCC	2	10	12877	12886	0 %	0 %	40 %	60 %	297567569
13	NC_014213	GCAAA	2	10	13455	13464	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014213	CAGCC	2	10	14117	14126	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_014213	CCGAA	2	10	14127	14136	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014213	CATAG	2	10	15072	15081	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014213	GGCCC	2	10	15911	15920	0 %	0 %	40 %	60 %	297567571
18	NC_014213	TGGGC	2	10	15946	15955	0 %	20 %	60 %	20 %	297567571
19	NC_014213	TGGCC	2	10	16420	16429	0 %	20 %	40 %	40 %	297567571
20	NC_014213	GACCG	2	10	22012	22021	20 %	0 %	40 %	40 %	297567576
21	NC_014213	GAGCG	2	10	22335	22344	20 %	0 %	60 %	20 %	297567576
22	NC_014213	GGCAC	2	10	23017	23026	20 %	0 %	40 %	40 %	297567578
23	NC_014213	CAGCC	2	10	23835	23844	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_014213	GCCCC	2	10	26592	26601	0 %	0 %	20 %	80 %	297567581
25	NC_014213	CCAGC	2	10	28716	28725	20 %	0 %	20 %	60 %	297567583
26	NC_014213	CGGCG	2	10	31870	31879	0 %	0 %	60 %	40 %	297567585
27	NC_014213	TGGGT	2	10	32338	32347	0 %	40 %	60 %	0 %	297567585
28	NC_014213	GCCCG	2	10	35352	35361	0 %	0 %	40 %	60 %	297567588
29	NC_014213	GGGAA	2	10	37198	37207	40 %	0 %	60 %	0 %	297567590
30	NC_014213	GGGGA	2	10	37237	37246	20 %	0 %	80 %	0 %	297567590
31	NC_014213	CCTTT	2	10	39928	39937	0 %	60 %	0 %	40 %	297567592
32	NC_014213	CTACC	2	10	40691	40700	20 %	20 %	0 %	60 %	297567593
33	NC_014213	GGGGT	2	10	40814	40823	0 %	20 %	80 %	0 %	297567593
34	NC_014213	TCTTT	2	10	40921	40930	0 %	80 %	0 %	20 %	297567593
35	NC_014213	GAAGG	2	10	41597	41606	40 %	0 %	60 %	0 %	297567594
36	NC_014213	GCTGG	2	10	41910	41919	0 %	20 %	60 %	20 %	297567594
37	NC_014213	GAGCG	2	10	43954	43963	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014213	GGGGT	2	10	44091	44100	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014213	GCTTC	2	10	44327	44336	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014213	GCGGA	2	10	44528	44537	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014213	CGCTT	2	10	46171	46180	0 %	40 %	20 %	40 %	297567599
42	NC_014213	GCCCG	2	10	47225	47234	0 %	0 %	40 %	60 %	297567601
43	NC_014213	CCTCC	2	10	48014	48023	0 %	20 %	0 %	80 %	297567602
44	NC_014213	GTGAT	2	10	51154	51163	20 %	40 %	40 %	0 %	297567606
45	NC_014213	GGGTT	2	10	51731	51740	0 %	40 %	60 %	0 %	297567606
46	NC_014213	GTGGC	2	10	52739	52748	0 %	20 %	60 %	20 %	297567608
47	NC_014213	GGGCC	2	10	55350	55359	0 %	0 %	60 %	40 %	297567610
48	NC_014213	CGGCT	2	10	56179	56188	0 %	20 %	40 %	40 %	297567612
49	NC_014213	CCCAG	2	10	57865	57874	20 %	0 %	20 %	60 %	297567616
50	NC_014213	CCGCA	2	10	57983	57992	20 %	0 %	20 %	60 %	297567616
51	NC_014213	GAGGT	2	10	58683	58692	20 %	20 %	60 %	0 %	297567616
52	NC_014213	CCAGC	2	10	60541	60550	20 %	0 %	20 %	60 %	297567617
53	NC_014213	GCCGC	2	10	60585	60594	0 %	0 %	40 %	60 %	297567617
54	NC_014213	GGGAA	2	10	61880	61889	40 %	0 %	60 %	0 %	297567618
55	NC_014213	GGGGA	2	10	61919	61928	20 %	0 %	80 %	0 %	297567618
56	NC_014213	CCCTT	2	10	64806	64815	0 %	40 %	0 %	60 %	297567624
57	NC_014213	CCCCG	2	10	65270	65279	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
58	NC_014213	GGGGC	2	10	65812	65821	0 %	0 %	80 %	20 %	297567625
59	NC_014213	GGGCC	2	10	66118	66127	0 %	0 %	60 %	40 %	297567625
60	NC_014213	AAAGG	2	10	66529	66538	60 %	0 %	40 %	0 %	297567626
61	NC_014213	GCCTG	2	10	68212	68221	0 %	20 %	40 %	40 %	297567627
62	NC_014213	CGGGG	2	10	71735	71744	0 %	0 %	80 %	20 %	297567631
63	NC_014213	CGGGC	2	10	71767	71776	0 %	0 %	60 %	40 %	297567631
64	NC_014213	CCTGG	2	10	71972	71981	0 %	20 %	40 %	40 %	297567631
65	NC_014213	GCGCC	2	10	72221	72230	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_014213	CGCAG	2	10	72394	72403	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014213	GGGGT	2	10	73199	73208	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014213	GGGGT	2	10	74122	74131	0 %	20 %	80 %	0 %	297567634
69	NC_014213	CGCCT	2	10	74638	74647	0 %	20 %	20 %	60 %	297567635
70	NC_014213	TCATC	2	10	75036	75045	20 %	40 %	0 %	40 %	297567635
71	NC_014213	GCTCT	2	10	76357	76366	0 %	40 %	20 %	40 %	297567636
72	NC_014213	GCCGG	2	10	78653	78662	0 %	0 %	60 %	40 %	297567638
73	NC_014213	CGACC	2	10	79142	79151	20 %	0 %	20 %	60 %	297567639
74	NC_014213	GCTCG	2	10	79478	79487	0 %	20 %	40 %	40 %	297567639
75	NC_014213	CTCCC	2	10	79995	80004	0 %	20 %	0 %	80 %	297567640
76	NC_014213	TTCCC	2	10	80035	80044	0 %	40 %	0 %	60 %	297567640
77	NC_014213	AGCCC	2	10	81819	81828	20 %	0 %	20 %	60 %	297567642
78	NC_014213	GGCCG	2	10	84259	84268	0 %	0 %	60 %	40 %	297567644
79	NC_014213	CTCCG	2	10	88901	88910	0 %	20 %	20 %	60 %	297567648
80	NC_014213	CGGTG	2	10	89192	89201	0 %	20 %	60 %	20 %	297567648
81	NC_014213	ACCGC	2	10	90481	90490	20 %	0 %	20 %	60 %	297567649
82	NC_014213	CCGAG	2	10	91966	91975	20 %	0 %	40 %	40 %	297567651
83	NC_014213	CCCCA	2	10	93356	93365	20 %	0 %	0 %	80 %	297567652
84	NC_014213	ACCCC	2	10	94160	94169	20 %	0 %	0 %	80 %	297567652
85	NC_014213	CAGGC	2	10	94393	94402	20 %	0 %	40 %	40 %	297567652
86	NC_014213	CCCAG	2	10	95868	95877	20 %	0 %	20 %	60 %	297567654
87	NC_014213	CGCGG	2	10	97026	97035	0 %	0 %	60 %	40 %	297567655
88	NC_014213	AGCCC	2	10	97930	97939	20 %	0 %	20 %	60 %	297567656
89	NC_014213	ACGGT	2	10	100405	100414	20 %	20 %	40 %	20 %	297567658
90	NC_014213	GGGCG	2	10	102209	102218	0 %	0 %	80 %	20 %	297567659
91	NC_014213	TAGCT	2	10	104630	104639	20 %	40 %	20 %	20 %	297567660
92	NC_014213	CGGGC	2	10	108763	108772	0 %	0 %	60 %	40 %	297567666
93	NC_014213	CCAGG	2	10	109120	109129	20 %	0 %	40 %	40 %	297567666
94	NC_014213	GCCCG	2	10	111209	111218	0 %	0 %	40 %	60 %	297567668
95	NC_014213	AGCCC	2	10	112009	112018	20 %	0 %	20 %	60 %	297567669
96	NC_014213	AACCA	2	10	112140	112149	60 %	0 %	0 %	40 %	297567669
97	NC_014213	GCCTG	2	10	112491	112500	0 %	20 %	40 %	40 %	297567670
98	NC_014213	CACCC	2	10	112585	112594	20 %	0 %	0 %	80 %	297567670
99	NC_014213	TGCGC	2	10	112674	112683	0 %	20 %	40 %	40 %	297567670
100	NC_014213	CCAAC	2	10	113446	113455	40 %	0 %	0 %	60 %	297567671
101	NC_014213	CTTCG	2	10	114119	114128	0 %	40 %	20 %	40 %	297567672
102	NC_014213	GCGCG	2	10	115454	115463	0 %	0 %	60 %	40 %	297567672
103	NC_014213	GCGGG	2	10	115557	115566	0 %	0 %	80 %	20 %	297567672
104	NC_014213	ATCGG	2	10	118096	118105	20 %	20 %	40 %	20 %	297567675
105	NC_014213	AAAAG	2	10	119156	119165	80 %	0 %	20 %	0 %	297567676
106	NC_014213	TAGAA	2	10	119246	119255	60 %	20 %	20 %	0 %	297567676
107	NC_014213	CCTTT	2	10	122198	122207	0 %	60 %	0 %	40 %	297567679
108	NC_014213	GCCTT	2	10	122433	122442	0 %	40 %	20 %	40 %	297567679
109	NC_014213	CAGCC	2	10	122775	122784	20 %	0 %	20 %	60 %	297567679
110	NC_014213	GGGTG	2	10	124388	124397	0 %	20 %	80 %	0 %	297567681
111	NC_014213	CGGAA	2	10	126790	126799	40 %	0 %	40 %	20 %	297567682
112	NC_014213	TTGCC	2	10	127803	127812	0 %	40 %	20 %	40 %	297567683
113	NC_014213	CCTGC	2	10	128524	128533	0 %	20 %	20 %	60 %	297567683
114	NC_014213	GCAGC	2	10	129957	129966	20 %	0 %	40 %	40 %	297567685
115	NC_014213	CAGCG	2	10	131122	131131	20 %	0 %	40 %	40 %	297567688
116	NC_014213	CGGGG	2	10	134712	134721	0 %	0 %	80 %	20 %	297567690
117	NC_014213	GCCGC	2	10	134788	134797	0 %	0 %	40 %	60 %	297567690
118	NC_014213	CGGCG	2	10	135166	135175	0 %	0 %	60 %	40 %	297567691
119	NC_014213	GCCCG	2	10	135427	135436	0 %	0 %	40 %	60 %	297567691
120	NC_014213	GGGGC	2	10	135946	135955	0 %	0 %	80 %	20 %	297567691
121	NC_014213	CGGCG	2	10	136223	136232	0 %	0 %	60 %	40 %	297567692
122	NC_014213	CGGGC	2	10	136844	136853	0 %	0 %	60 %	40 %	297567693
123	NC_014213	CCGGC	2	10	137309	137318	0 %	0 %	40 %	60 %	297567693
124	NC_014213	CGGTC	2	10	137982	137991	0 %	20 %	40 %	40 %	297567694
125	NC_014213	CGCCC	2	10	138045	138054	0 %	0 %	20 %	80 %	297567694
126	NC_014213	CACCG	2	10	140000	140009	20 %	0 %	20 %	60 %	297567695
127	NC_014213	GCCGC	2	10	141057	141066	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
128	NC_014213	GCTGG	2	10	143856	143865	0 %	20 %	60 %	20 %	297567698
129	NC_014213	GCCTG	2	10	144278	144287	0 %	20 %	40 %	40 %	297567698
130	NC_014213	GAGAT	2	10	144755	144764	40 %	20 %	40 %	0 %	297567698
131	NC_014213	TGGGT	2	10	145818	145827	0 %	40 %	60 %	0 %	297567699
132	NC_014213	TCTCT	2	10	147034	147043	0 %	60 %	0 %	40 %	297567699
133	NC_014213	TCCCC	2	10	148833	148842	0 %	20 %	0 %	80 %	297567699
134	NC_014213	AGGGG	2	10	149505	149514	20 %	0 %	80 %	0 %	297567699
135	NC_014213	GGGGT	2	10	150201	150210	0 %	20 %	80 %	0 %	297567699
136	NC_014213	TCCAG	2	10	150652	150661	20 %	20 %	20 %	40 %	297567699
137	NC_014213	CAAAC	2	10	150697	150706	60 %	0 %	0 %	40 %	297567699
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.