MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL01

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014213	CCGAC	2	10	8539	8548	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_014213	GCAAA	2	10	13455	13464	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014213	CAGCC	2	10	14117	14126	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_014213	CCGAA	2	10	14127	14136	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014213	CATAG	2	10	15072	15081	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014213	CAGCC	2	10	23835	23844	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_014213	GAGCG	2	10	43954	43963	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014213	GGGGT	2	10	44091	44100	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014213	GCTTC	2	10	44327	44336	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014213	GCGGA	2	10	44528	44537	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014213	CCCCG	2	10	65270	65279	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12	NC_014213	GCGCC	2	10	72221	72230	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_014213	CGCAG	2	10	72394	72403	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014213	GGGGT	2	10	73199	73208	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014213	GCCGC	2	10	141057	141066	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014213	AAGAA	2	10	182393	182402	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014213	AGGGG	2	10	217515	217524	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014213	GGCGA	2	10	222663	222672	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014213	GGGCT	2	10	245653	245662	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014213	TGCTA	2	10	254415	254424	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014213	TTCGG	2	10	255359	255368	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014213	GGCTG	2	10	255369	255378	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014213	GCTTT	2	10	256029	256038	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014213	GTCGG	2	10	260947	260956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014213	TCGAG	2	10	277925	277934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014213	CAGGG	2	10	282973	282982	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014213	CGCAG	2	10	283361	283370	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014213	GGGTG	2	10	285030	285039	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014213	AGCGA	2	10	297694	297703	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014213	ACTCG	2	10	305710	305719	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014213	CATAG	2	10	309032	309041	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014213	CAGGC	2	10	309723	309732	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014213	CTTGG	2	10	313922	313931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014213	CTACC	2	10	341978	341987	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_014213	AAAGG	2	10	346449	346458	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014213	CCAGA	2	10	347777	347786	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014213	ACCCA	2	10	347812	347821	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.