MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL01

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014213	CTACC	2	10	547	556	20 %	20 %	0 %	60 %	297567558
2	NC_014213	CGGCC	2	10	1437	1446	0 %	0 %	40 %	60 %	297567559
3	NC_014213	CTGGC	2	10	2354	2363	0 %	20 %	40 %	40 %	297567560
4	NC_014213	GGGAG	2	10	3738	3747	20 %	0 %	80 %	0 %	297567561
5	NC_014213	GCCTG	2	10	3942	3951	0 %	20 %	40 %	40 %	297567561
6	NC_014213	CTGGG	2	10	6032	6041	0 %	20 %	60 %	20 %	297567564
7	NC_014213	GGGGT	2	10	9162	9171	0 %	20 %	80 %	0 %	297567566
8	NC_014213	GCCCA	2	10	9785	9794	20 %	0 %	20 %	60 %	297567566
9	NC_014213	GCGGG	2	10	11765	11774	0 %	0 %	80 %	20 %	297567568
10	NC_014213	GGACG	2	10	11970	11979	20 %	0 %	60 %	20 %	297567568
11	NC_014213	GGCCC	2	10	12877	12886	0 %	0 %	40 %	60 %	297567569
12	NC_014213	GGCCC	2	10	15911	15920	0 %	0 %	40 %	60 %	297567571
13	NC_014213	TGGGC	2	10	15946	15955	0 %	20 %	60 %	20 %	297567571
14	NC_014213	TGGCC	2	10	16420	16429	0 %	20 %	40 %	40 %	297567571
15	NC_014213	GACCG	2	10	22012	22021	20 %	0 %	40 %	40 %	297567576
16	NC_014213	GAGCG	2	10	22335	22344	20 %	0 %	60 %	20 %	297567576
17	NC_014213	GGCAC	2	10	23017	23026	20 %	0 %	40 %	40 %	297567578
18	NC_014213	GCCCC	2	10	26592	26601	0 %	0 %	20 %	80 %	297567581
19	NC_014213	CCAGC	2	10	28716	28725	20 %	0 %	20 %	60 %	297567583
20	NC_014213	CGGCG	2	10	31870	31879	0 %	0 %	60 %	40 %	297567585
21	NC_014213	TGGGT	2	10	32338	32347	0 %	40 %	60 %	0 %	297567585
22	NC_014213	GCCCG	2	10	35352	35361	0 %	0 %	40 %	60 %	297567588
23	NC_014213	GGGAA	2	10	37198	37207	40 %	0 %	60 %	0 %	297567590
24	NC_014213	GGGGA	2	10	37237	37246	20 %	0 %	80 %	0 %	297567590
25	NC_014213	CCTTT	2	10	39928	39937	0 %	60 %	0 %	40 %	297567592
26	NC_014213	CTACC	2	10	40691	40700	20 %	20 %	0 %	60 %	297567593
27	NC_014213	GGGGT	2	10	40814	40823	0 %	20 %	80 %	0 %	297567593
28	NC_014213	TCTTT	2	10	40921	40930	0 %	80 %	0 %	20 %	297567593
29	NC_014213	GAAGG	2	10	41597	41606	40 %	0 %	60 %	0 %	297567594
30	NC_014213	GCTGG	2	10	41910	41919	0 %	20 %	60 %	20 %	297567594
31	NC_014213	CGCTT	2	10	46171	46180	0 %	40 %	20 %	40 %	297567599
32	NC_014213	GCCCG	2	10	47225	47234	0 %	0 %	40 %	60 %	297567601
33	NC_014213	CCTCC	2	10	48014	48023	0 %	20 %	0 %	80 %	297567602
34	NC_014213	GTGAT	2	10	51154	51163	20 %	40 %	40 %	0 %	297567606
35	NC_014213	GGGTT	2	10	51731	51740	0 %	40 %	60 %	0 %	297567606
36	NC_014213	GTGGC	2	10	52739	52748	0 %	20 %	60 %	20 %	297567608
37	NC_014213	GGGCC	2	10	55350	55359	0 %	0 %	60 %	40 %	297567610
38	NC_014213	CGGCT	2	10	56179	56188	0 %	20 %	40 %	40 %	297567612
39	NC_014213	CCCAG	2	10	57865	57874	20 %	0 %	20 %	60 %	297567616
40	NC_014213	CCGCA	2	10	57983	57992	20 %	0 %	20 %	60 %	297567616
41	NC_014213	GAGGT	2	10	58683	58692	20 %	20 %	60 %	0 %	297567616
42	NC_014213	CCAGC	2	10	60541	60550	20 %	0 %	20 %	60 %	297567617
43	NC_014213	GCCGC	2	10	60585	60594	0 %	0 %	40 %	60 %	297567617
44	NC_014213	GGGAA	2	10	61880	61889	40 %	0 %	60 %	0 %	297567618
45	NC_014213	GGGGA	2	10	61919	61928	20 %	0 %	80 %	0 %	297567618
46	NC_014213	CCCTT	2	10	64806	64815	0 %	40 %	0 %	60 %	297567624
47	NC_014213	GGGGC	2	10	65812	65821	0 %	0 %	80 %	20 %	297567625
48	NC_014213	GGGCC	2	10	66118	66127	0 %	0 %	60 %	40 %	297567625
49	NC_014213	AAAGG	2	10	66529	66538	60 %	0 %	40 %	0 %	297567626
50	NC_014213	GCCTG	2	10	68212	68221	0 %	20 %	40 %	40 %	297567627
51	NC_014213	CGGGG	2	10	71735	71744	0 %	0 %	80 %	20 %	297567631
52	NC_014213	CGGGC	2	10	71767	71776	0 %	0 %	60 %	40 %	297567631
53	NC_014213	CCTGG	2	10	71972	71981	0 %	20 %	40 %	40 %	297567631
54	NC_014213	GGGGT	2	10	74122	74131	0 %	20 %	80 %	0 %	297567634
55	NC_014213	CGCCT	2	10	74638	74647	0 %	20 %	20 %	60 %	297567635
56	NC_014213	TCATC	2	10	75036	75045	20 %	40 %	0 %	40 %	297567635
57	NC_014213	GCTCT	2	10	76357	76366	0 %	40 %	20 %	40 %	297567636
58	NC_014213	GCCGG	2	10	78653	78662	0 %	0 %	60 %	40 %	297567638
59	NC_014213	CGACC	2	10	79142	79151	20 %	0 %	20 %	60 %	297567639
60	NC_014213	GCTCG	2	10	79478	79487	0 %	20 %	40 %	40 %	297567639
61	NC_014213	CTCCC	2	10	79995	80004	0 %	20 %	0 %	80 %	297567640
62	NC_014213	TTCCC	2	10	80035	80044	0 %	40 %	0 %	60 %	297567640
63	NC_014213	AGCCC	2	10	81819	81828	20 %	0 %	20 %	60 %	297567642
64	NC_014213	GGCCG	2	10	84259	84268	0 %	0 %	60 %	40 %	297567644
65	NC_014213	CTCCG	2	10	88901	88910	0 %	20 %	20 %	60 %	297567648
66	NC_014213	CGGTG	2	10	89192	89201	0 %	20 %	60 %	20 %	297567648
67	NC_014213	ACCGC	2	10	90481	90490	20 %	0 %	20 %	60 %	297567649
68	NC_014213	CCGAG	2	10	91966	91975	20 %	0 %	40 %	40 %	297567651
69	NC_014213	CCCCA	2	10	93356	93365	20 %	0 %	0 %	80 %	297567652
70	NC_014213	ACCCC	2	10	94160	94169	20 %	0 %	0 %	80 %	297567652
71	NC_014213	CAGGC	2	10	94393	94402	20 %	0 %	40 %	40 %	297567652
72	NC_014213	CCCAG	2	10	95868	95877	20 %	0 %	20 %	60 %	297567654
73	NC_014213	CGCGG	2	10	97026	97035	0 %	0 %	60 %	40 %	297567655
74	NC_014213	AGCCC	2	10	97930	97939	20 %	0 %	20 %	60 %	297567656
75	NC_014213	ACGGT	2	10	100405	100414	20 %	20 %	40 %	20 %	297567658
76	NC_014213	GGGCG	2	10	102209	102218	0 %	0 %	80 %	20 %	297567659
77	NC_014213	TAGCT	2	10	104630	104639	20 %	40 %	20 %	20 %	297567660
78	NC_014213	CGGGC	2	10	108763	108772	0 %	0 %	60 %	40 %	297567666
79	NC_014213	CCAGG	2	10	109120	109129	20 %	0 %	40 %	40 %	297567666
80	NC_014213	GCCCG	2	10	111209	111218	0 %	0 %	40 %	60 %	297567668
81	NC_014213	AGCCC	2	10	112009	112018	20 %	0 %	20 %	60 %	297567669
82	NC_014213	AACCA	2	10	112140	112149	60 %	0 %	0 %	40 %	297567669
83	NC_014213	GCCTG	2	10	112491	112500	0 %	20 %	40 %	40 %	297567670
84	NC_014213	CACCC	2	10	112585	112594	20 %	0 %	0 %	80 %	297567670
85	NC_014213	TGCGC	2	10	112674	112683	0 %	20 %	40 %	40 %	297567670
86	NC_014213	CCAAC	2	10	113446	113455	40 %	0 %	0 %	60 %	297567671
87	NC_014213	CTTCG	2	10	114119	114128	0 %	40 %	20 %	40 %	297567672
88	NC_014213	GCGCG	2	10	115454	115463	0 %	0 %	60 %	40 %	297567672
89	NC_014213	GCGGG	2	10	115557	115566	0 %	0 %	80 %	20 %	297567672
90	NC_014213	ATCGG	2	10	118096	118105	20 %	20 %	40 %	20 %	297567675
91	NC_014213	AAAAG	2	10	119156	119165	80 %	0 %	20 %	0 %	297567676
92	NC_014213	TAGAA	2	10	119246	119255	60 %	20 %	20 %	0 %	297567676
93	NC_014213	CCTTT	2	10	122198	122207	0 %	60 %	0 %	40 %	297567679
94	NC_014213	GCCTT	2	10	122433	122442	0 %	40 %	20 %	40 %	297567679
95	NC_014213	CAGCC	2	10	122775	122784	20 %	0 %	20 %	60 %	297567679
96	NC_014213	GGGTG	2	10	124388	124397	0 %	20 %	80 %	0 %	297567681
97	NC_014213	CGGAA	2	10	126790	126799	40 %	0 %	40 %	20 %	297567682
98	NC_014213	TTGCC	2	10	127803	127812	0 %	40 %	20 %	40 %	297567683
99	NC_014213	CCTGC	2	10	128524	128533	0 %	20 %	20 %	60 %	297567683
100	NC_014213	GCAGC	2	10	129957	129966	20 %	0 %	40 %	40 %	297567685
101	NC_014213	CAGCG	2	10	131122	131131	20 %	0 %	40 %	40 %	297567688
102	NC_014213	CGGGG	2	10	134712	134721	0 %	0 %	80 %	20 %	297567690
103	NC_014213	GCCGC	2	10	134788	134797	0 %	0 %	40 %	60 %	297567690
104	NC_014213	CGGCG	2	10	135166	135175	0 %	0 %	60 %	40 %	297567691
105	NC_014213	GCCCG	2	10	135427	135436	0 %	0 %	40 %	60 %	297567691
106	NC_014213	GGGGC	2	10	135946	135955	0 %	0 %	80 %	20 %	297567691
107	NC_014213	CGGCG	2	10	136223	136232	0 %	0 %	60 %	40 %	297567692
108	NC_014213	CGGGC	2	10	136844	136853	0 %	0 %	60 %	40 %	297567693
109	NC_014213	CCGGC	2	10	137309	137318	0 %	0 %	40 %	60 %	297567693
110	NC_014213	CGGTC	2	10	137982	137991	0 %	20 %	40 %	40 %	297567694
111	NC_014213	CGCCC	2	10	138045	138054	0 %	0 %	20 %	80 %	297567694
112	NC_014213	CACCG	2	10	140000	140009	20 %	0 %	20 %	60 %	297567695
113	NC_014213	GCTGG	2	10	143856	143865	0 %	20 %	60 %	20 %	297567698
114	NC_014213	GCCTG	2	10	144278	144287	0 %	20 %	40 %	40 %	297567698
115	NC_014213	GAGAT	2	10	144755	144764	40 %	20 %	40 %	0 %	297567698
116	NC_014213	TGGGT	2	10	145818	145827	0 %	40 %	60 %	0 %	297567699
117	NC_014213	TCTCT	2	10	147034	147043	0 %	60 %	0 %	40 %	297567699
118	NC_014213	TCCCC	2	10	148833	148842	0 %	20 %	0 %	80 %	297567699
119	NC_014213	AGGGG	2	10	149505	149514	20 %	0 %	80 %	0 %	297567699
120	NC_014213	GGGGT	2	10	150201	150210	0 %	20 %	80 %	0 %	297567699
121	NC_014213	TCCAG	2	10	150652	150661	20 %	20 %	20 %	40 %	297567699
122	NC_014213	CAAAC	2	10	150697	150706	60 %	0 %	0 %	40 %	297567699
123	NC_014213	CTTGG	2	10	152132	152141	0 %	40 %	40 %	20 %	297567700
124	NC_014213	ATCTG	2	10	155010	155019	20 %	40 %	20 %	20 %	297567701
125	NC_014213	GGGTG	2	10	155183	155192	0 %	20 %	80 %	0 %	297567701
126	NC_014213	GCAGG	2	10	157330	157339	20 %	0 %	60 %	20 %	297567701
127	NC_014213	CTCCC	2	10	159455	159464	0 %	20 %	0 %	80 %	297567703
128	NC_014213	TTCCC	2	10	159495	159504	0 %	40 %	0 %	60 %	297567703
129	NC_014213	TCCCC	2	10	160401	160410	0 %	20 %	0 %	80 %	297567704
130	NC_014213	GTCCC	2	10	161761	161770	0 %	20 %	20 %	60 %	297567704
131	NC_014213	TCTCG	2	10	162942	162951	0 %	40 %	20 %	40 %	297567705
132	NC_014213	CGCGC	2	10	166234	166243	0 %	0 %	40 %	60 %	297567706
133	NC_014213	CTCCC	2	10	167107	167116	0 %	20 %	0 %	80 %	297567707
134	NC_014213	TTCCC	2	10	167147	167156	0 %	40 %	0 %	60 %	297567707
135	NC_014213	AACCC	2	10	168337	168346	40 %	0 %	0 %	60 %	297567708
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.