MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL01

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014213	GGCC	2	8	223	230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014213	CCCG	2	8	13431	13438	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_014213	GGTC	2	8	14642	14649	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014213	CGCC	2	8	23501	23508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_014213	GCGG	2	8	23700	23707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014213	CGCC	2	8	25097	25104	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_014213	CGCC	2	8	25327	25334	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_014213	CTGG	2	8	25541	25548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014213	CCCG	2	8	30208	30215	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_014213	ACCA	2	8	30353	30360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014213	GCTG	2	8	30621	30628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014213	CTGG	2	8	30688	30695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014213	TTTC	2	8	30895	30902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014213	GGCA	2	8	36332	36339	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014213	TATC	2	8	40592	40599	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014213	GGAT	2	8	59716	59723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014213	TAGA	2	8	62440	62447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014213	CCCG	2	8	64113	64120	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_014213	CGCC	2	8	64192	64199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_014213	TGCC	2	8	65085	65092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014213	TCCA	2	8	72184	72191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014213	CGGT	2	8	72237	72244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014213	CCAG	2	8	72519	72526	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014213	GCCC	2	8	72934	72941	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014213	GCTC	2	8	73342	73349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014213	CGCT	2	8	73537	73544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014213	CTGG	2	8	75666	75673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014213	TAAT	2	8	80706	80713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014213	ACGC	2	8	83259	83266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014213	CAAG	2	8	86337	86344	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014213	TCCC	2	8	99804	99811	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_014213	CGGG	2	8	117042	117049	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014213	GCAC	2	8	117119	117126	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014213	CCCA	2	8	117532	117539	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_014213	CCTG	2	8	123871	123878	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014213	AGTC	2	8	125646	125653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014213	AGTA	2	8	125695	125702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014213	TCCT	2	8	125832	125839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014213	GAGG	2	8	125869	125876	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014213	CTTT	2	8	127388	127395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014213	GCGT	2	8	127531	127538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014213	CTTG	2	8	127681	127688	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014213	CTGC	2	8	129040	129047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014213	GCTC	2	8	134022	134029	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014213	GGGC	2	8	140597	140604	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014213	CCCG	2	8	140840	140847	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_014213	AAAC	2	8	166626	166633	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014213	AACG	2	8	169223	169230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014213	TACC	2	8	177370	177377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014213	TCGC	2	8	182266	182273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014213	CTTG	2	8	183702	183709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014213	TATG	2	8	202131	202138	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014213	CCGA	2	8	212156	212163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014213	AGGG	2	8	216694	216701	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014213	TGCC	2	8	233160	233167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014213	GCCA	2	8	243948	243955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014213	GGGC	2	8	244392	244399	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014213	GCCC	2	8	245789	245796	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_014213	GACC	2	8	254846	254853	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014213	CGGG	2	8	256057	256064	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014213	CCTC	2	8	258211	258218	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_014213	TGCT	2	8	274972	274979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014213	GCGG	2	8	276239	276246	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014213	CAAG	2	8	277234	277241	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014213	TTGT	2	8	277597	277604	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014213	ACGA	2	8	277735	277742	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014213	CAGC	2	8	277820	277827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014213	CAGC	2	8	278623	278630	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014213	CTTC	2	8	278759	278766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014213	TGGG	2	8	280168	280175	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014213	GGAG	2	8	280217	280224	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014213	GCCC	2	8	282845	282852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_014213	CCGG	2	8	282874	282881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014213	CCCG	2	8	283037	283044	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_014213	CCGC	2	8	283170	283177	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_014213	CAGC	2	8	283178	283185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014213	GCCG	2	8	283242	283249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014213	TGAA	2	8	283405	283412	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014213	GGGA	2	8	283807	283814	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014213	TAAT	2	8	285108	285115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014213	TTAG	2	8	288453	288460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014213	TGGG	2	8	288483	288490	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014213	TCCA	2	8	291816	291823	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014213	TGGG	2	8	297549	297556	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014213	CCGA	2	8	297653	297660	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014213	GGTC	2	8	301683	301690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014213	CGAC	2	8	308678	308685	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014213	GGGA	2	8	308948	308955	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014213	CATT	2	8	309334	309341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014213	CCAG	2	8	310042	310049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014213	CGGA	2	8	310200	310207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014213	ACCC	2	8	310384	310391	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_014213	AAGA	2	8	313826	313833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014213	CCAC	2	8	317470	317477	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_014213	GACG	2	8	318571	318578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014213	CCAC	2	8	318872	318879	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_014213	TAGG	2	8	319017	319024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014213	AGGG	2	8	319079	319086	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014213	GGCA	2	8	319349	319356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014213	GCGG	2	8	322076	322083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014213	GCAG	2	8	332195	332202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014213	TACC	2	8	332210	332217	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014213	ACGC	2	8	333446	333453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014213	GTTG	2	8	333788	333795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014213	GGAG	2	8	334886	334893	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014213	GCTG	2	8	334960	334967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014213	CCGC	2	8	335147	335154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_014213	TACC	2	8	335244	335251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014213	GCCT	2	8	335888	335895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014213	GCCG	2	8	335949	335956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014213	CTCC	2	8	336045	336052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_014213	GCAG	2	8	336130	336137	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014213	CGTG	2	8	341660	341667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014213	CTGG	2	8	341878	341885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014213	GCCG	2	8	342067	342074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014213	GGTC	2	8	342787	342794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014213	AGGC	2	8	343389	343396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014213	GGAA	2	8	344684	344691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014213	GTGG	2	8	344750	344757	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014213	GAAG	2	8	345650	345657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014213	CCAG	2	8	345716	345723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014213	ACTA	2	8	345896	345903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014213	GTGG	2	8	346824	346831	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014213	AGGG	2	8	346975	346982	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014213	GTGG	2	8	347143	347150	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014213	AGGC	3	12	347455	347466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014213	CTCA	2	8	347476	347483	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014213	CCCA	2	8	347521	347528	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_014213	CCCG	2	8	347759	347766	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.