MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 plasmid pMESIL01

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014213	GC	3	6	560	565	0 %	0 %	50 %	50 %	297567558
2	NC_014213	CG	4	8	3003	3010	0 %	0 %	50 %	50 %	297567560
3	NC_014213	CG	3	6	6182	6187	0 %	0 %	50 %	50 %	297567564
4	NC_014213	CG	3	6	6365	6370	0 %	0 %	50 %	50 %	297567564
5	NC_014213	GC	3	6	7220	7225	0 %	0 %	50 %	50 %	297567564
6	NC_014213	TC	3	6	7689	7694	0 %	50 %	0 %	50 %	297567565
7	NC_014213	GC	3	6	9129	9134	0 %	0 %	50 %	50 %	297567566
8	NC_014213	CT	3	6	11064	11069	0 %	50 %	0 %	50 %	297567567
9	NC_014213	TC	4	8	12890	12897	0 %	50 %	0 %	50 %	297567569
10	NC_014213	CT	3	6	12991	12996	0 %	50 %	0 %	50 %	297567569
11	NC_014213	AC	3	6	13348	13353	50 %	0 %	0 %	50 %	297567569
12	NC_014213	AG	3	6	15345	15350	50 %	0 %	50 %	0 %	297567571
13	NC_014213	CT	3	6	16796	16801	0 %	50 %	0 %	50 %	297567571
14	NC_014213	TC	3	6	18101	18106	0 %	50 %	0 %	50 %	297567573
15	NC_014213	TC	3	6	18409	18414	0 %	50 %	0 %	50 %	297567573
16	NC_014213	CG	3	6	18446	18451	0 %	0 %	50 %	50 %	297567573
17	NC_014213	GC	4	8	22701	22708	0 %	0 %	50 %	50 %	297567577
18	NC_014213	CG	3	6	22872	22877	0 %	0 %	50 %	50 %	297567578
19	NC_014213	AC	3	6	26073	26078	50 %	0 %	0 %	50 %	297567581
20	NC_014213	GC	3	6	26188	26193	0 %	0 %	50 %	50 %	297567581
21	NC_014213	CG	3	6	26977	26982	0 %	0 %	50 %	50 %	297567581
22	NC_014213	CG	3	6	28335	28340	0 %	0 %	50 %	50 %	297567582
23	NC_014213	GC	3	6	32276	32281	0 %	0 %	50 %	50 %	297567585
24	NC_014213	CT	3	6	33054	33059	0 %	50 %	0 %	50 %	297567587
25	NC_014213	TC	3	6	33176	33181	0 %	50 %	0 %	50 %	297567587
26	NC_014213	GA	3	6	33979	33984	50 %	0 %	50 %	0 %	297567588
27	NC_014213	CG	4	8	34308	34315	0 %	0 %	50 %	50 %	297567588
28	NC_014213	CG	3	6	34371	34376	0 %	0 %	50 %	50 %	297567588
29	NC_014213	CG	4	8	34816	34823	0 %	0 %	50 %	50 %	297567588
30	NC_014213	GC	3	6	35214	35219	0 %	0 %	50 %	50 %	297567588
31	NC_014213	GC	3	6	35624	35629	0 %	0 %	50 %	50 %	297567588
32	NC_014213	GC	3	6	38450	38455	0 %	0 %	50 %	50 %	297567591
33	NC_014213	AG	3	6	39738	39743	50 %	0 %	50 %	0 %	297567592
34	NC_014213	AG	3	6	42270	42275	50 %	0 %	50 %	0 %	297567594
35	NC_014213	CT	3	6	46473	46478	0 %	50 %	0 %	50 %	297567599
36	NC_014213	CA	3	6	47786	47791	50 %	0 %	0 %	50 %	297567602
37	NC_014213	CG	3	6	51431	51436	0 %	0 %	50 %	50 %	297567606
38	NC_014213	CG	3	6	54172	54177	0 %	0 %	50 %	50 %	297567609
39	NC_014213	CG	3	6	54882	54887	0 %	0 %	50 %	50 %	297567610
40	NC_014213	GC	3	6	54940	54945	0 %	0 %	50 %	50 %	297567610
41	NC_014213	CG	3	6	56323	56328	0 %	0 %	50 %	50 %	297567612
42	NC_014213	CG	3	6	58730	58735	0 %	0 %	50 %	50 %	297567616
43	NC_014213	CG	3	6	59003	59008	0 %	0 %	50 %	50 %	297567616
44	NC_014213	AG	3	6	64568	64573	50 %	0 %	50 %	0 %	297567623
45	NC_014213	GA	3	6	65664	65669	50 %	0 %	50 %	0 %	297567625
46	NC_014213	CT	3	6	66105	66110	0 %	50 %	0 %	50 %	297567625
47	NC_014213	TC	3	6	68021	68026	0 %	50 %	0 %	50 %	297567627
48	NC_014213	GA	3	6	68928	68933	50 %	0 %	50 %	0 %	297567628
49	NC_014213	GA	3	6	74819	74824	50 %	0 %	50 %	0 %	297567635
50	NC_014213	CA	3	6	76277	76282	50 %	0 %	0 %	50 %	297567636
51	NC_014213	GC	3	6	76654	76659	0 %	0 %	50 %	50 %	297567636
52	NC_014213	AG	3	6	77023	77028	50 %	0 %	50 %	0 %	297567637
53	NC_014213	CG	3	6	77909	77914	0 %	0 %	50 %	50 %	297567637
54	NC_014213	CG	3	6	79287	79292	0 %	0 %	50 %	50 %	297567639
55	NC_014213	CG	4	8	79467	79474	0 %	0 %	50 %	50 %	297567639
56	NC_014213	CG	3	6	81774	81779	0 %	0 %	50 %	50 %	297567642
57	NC_014213	CG	3	6	87444	87449	0 %	0 %	50 %	50 %	297567647
58	NC_014213	GA	3	6	87660	87665	50 %	0 %	50 %	0 %	297567647
59	NC_014213	TC	3	6	88938	88943	0 %	50 %	0 %	50 %	297567648
60	NC_014213	AG	3	6	91974	91979	50 %	0 %	50 %	0 %	297567651
61	NC_014213	AG	4	8	93496	93503	50 %	0 %	50 %	0 %	297567652
62	NC_014213	GC	3	6	93666	93671	0 %	0 %	50 %	50 %	297567652
63	NC_014213	CG	3	6	95575	95580	0 %	0 %	50 %	50 %	297567653
64	NC_014213	TC	3	6	95620	95625	0 %	50 %	0 %	50 %	297567653
65	NC_014213	CG	3	6	95717	95722	0 %	0 %	50 %	50 %	297567654
66	NC_014213	GC	4	8	95964	95971	0 %	0 %	50 %	50 %	297567654
67	NC_014213	CG	3	6	96621	96626	0 %	0 %	50 %	50 %	297567654
68	NC_014213	CG	3	6	97176	97181	0 %	0 %	50 %	50 %	297567655
69	NC_014213	GC	3	6	98129	98134	0 %	0 %	50 %	50 %	297567657
70	NC_014213	CG	3	6	98763	98768	0 %	0 %	50 %	50 %	297567657
71	NC_014213	CG	3	6	98945	98950	0 %	0 %	50 %	50 %	297567657
72	NC_014213	GC	3	6	100009	100014	0 %	0 %	50 %	50 %	297567658
73	NC_014213	GT	3	6	100247	100252	0 %	50 %	50 %	0 %	297567658
74	NC_014213	CG	3	6	100957	100962	0 %	0 %	50 %	50 %	297567658
75	NC_014213	GC	3	6	102078	102083	0 %	0 %	50 %	50 %	297567659
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77	NC_014213	GC	3	6	104178	104183	0 %	0 %	50 %	50 %	297567660
78	NC_014213	GC	3	6	104471	104476	0 %	0 %	50 %	50 %	297567660
79	NC_014213	GC	3	6	104886	104891	0 %	0 %	50 %	50 %	297567661
80	NC_014213	GC	3	6	105560	105565	0 %	0 %	50 %	50 %	297567662
81	NC_014213	GC	3	6	105629	105634	0 %	0 %	50 %	50 %	297567662
82	NC_014213	CA	3	6	105792	105797	50 %	0 %	0 %	50 %	297567662
83	NC_014213	CG	3	6	105816	105821	0 %	0 %	50 %	50 %	297567662
84	NC_014213	GC	3	6	106349	106354	0 %	0 %	50 %	50 %	297567663
85	NC_014213	GC	3	6	106569	106574	0 %	0 %	50 %	50 %	297567663
86	NC_014213	CG	3	6	107258	107263	0 %	0 %	50 %	50 %	297567664
87	NC_014213	CG	3	6	108823	108828	0 %	0 %	50 %	50 %	297567666
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89	NC_014213	GC	3	6	109903	109908	0 %	0 %	50 %	50 %	297567667
90	NC_014213	CG	3	6	110112	110117	0 %	0 %	50 %	50 %	297567667
91	NC_014213	CG	3	6	111051	111056	0 %	0 %	50 %	50 %	297567668
92	NC_014213	CG	3	6	111119	111124	0 %	0 %	50 %	50 %	297567668
93	NC_014213	GC	3	6	111303	111308	0 %	0 %	50 %	50 %	297567668
94	NC_014213	GC	3	6	111405	111410	0 %	0 %	50 %	50 %	297567668
95	NC_014213	AG	3	6	112525	112530	50 %	0 %	50 %	0 %	297567670
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101	NC_014213	GA	3	6	118966	118971	50 %	0 %	50 %	0 %	297567676
102	NC_014213	CG	3	6	122013	122018	0 %	0 %	50 %	50 %	297567678
103	NC_014213	CG	3	6	122156	122161	0 %	0 %	50 %	50 %	297567679
104	NC_014213	CG	3	6	124158	124163	0 %	0 %	50 %	50 %	297567681
105	NC_014213	GC	3	6	129415	129420	0 %	0 %	50 %	50 %	297567685
106	NC_014213	GA	3	6	130352	130357	50 %	0 %	50 %	0 %	297567685
107	NC_014213	CG	3	6	130433	130438	0 %	0 %	50 %	50 %	297567685
108	NC_014213	GC	3	6	131954	131959	0 %	0 %	50 %	50 %	297567688
109	NC_014213	CG	3	6	132273	132278	0 %	0 %	50 %	50 %	297567688
110	NC_014213	CT	3	6	133475	133480	0 %	50 %	0 %	50 %	297567689
111	NC_014213	CG	3	6	135316	135321	0 %	0 %	50 %	50 %	297567691
112	NC_014213	GA	3	6	136867	136872	50 %	0 %	50 %	0 %	297567693
113	NC_014213	CA	3	6	137331	137336	50 %	0 %	0 %	50 %	297567693
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117	NC_014213	GC	3	6	138282	138287	0 %	0 %	50 %	50 %	297567694
118	NC_014213	CG	3	6	139205	139210	0 %	0 %	50 %	50 %	297567695
119	NC_014213	GC	3	6	139553	139558	0 %	0 %	50 %	50 %	297567695
120	NC_014213	CG	3	6	139586	139591	0 %	0 %	50 %	50 %	297567695
121	NC_014213	CG	3	6	141217	141222	0 %	0 %	50 %	50 %	297567697
122	NC_014213	CG	3	6	141661	141666	0 %	0 %	50 %	50 %	297567697
123	NC_014213	CT	3	6	141895	141900	0 %	50 %	0 %	50 %	297567697
124	NC_014213	GA	3	6	142227	142232	50 %	0 %	50 %	0 %	297567697
125	NC_014213	GA	3	6	143879	143884	50 %	0 %	50 %	0 %	297567698
126	NC_014213	GC	3	6	144002	144007	0 %	0 %	50 %	50 %	297567698
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.