MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014212	GGATTG	2	12	8719	8730	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014212	GCAGTT	2	12	9967	9978	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014212	TCCCCT	2	12	19593	19604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014212	CAACTG	2	12	22043	22054	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014212	CCCCAA	2	12	26703	26714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_014212	ACGGAT	2	12	45774	45785	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014212	CCCGAC	2	12	45844	45855	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014212	ACGCTA	2	12	51432	51443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014212	GCAGTT	2	12	130558	130569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014212	CGCTTC	2	12	173636	173647	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014212	AGGGTA	2	12	198027	198038	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014212	GAGGAT	2	12	250585	250596	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014212	CTCCGC	2	12	285090	285101	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014212	AACCCT	2	12	294229	294240	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014212	GAGGTC	2	12	300130	300141	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014212	CCCTTA	2	12	304432	304443	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014212	CGTTCA	2	12	312307	312318	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014212	TCCCTC	2	12	314672	314683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014212	TCCCCG	2	12	399474	399485	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014212	CCTTGT	2	12	408457	408468	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014212	CAACTG	2	12	409899	409910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014212	GGGGGT	2	12	413432	413443	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014212	AAGCAG	2	12	447040	447051	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014212	CCCTCC	2	12	447394	447405	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
25	NC_014212	GCTGAA	2	12	477253	477264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014212	GGTGGG	2	12	509426	509437	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014212	CTGGAG	2	12	535318	535329	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014212	GGGAGG	2	12	535373	535384	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014212	GTCCTT	2	12	539691	539702	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014212	CAATCC	2	12	561821	561832	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014212	GGGATA	2	12	564679	564690	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014212	CAGCGC	2	12	564975	564986	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014212	CCAGCA	2	12	572475	572486	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014212	GCACCA	2	12	572493	572504	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014212	TGGAGC	2	12	622216	622227	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014212	CCTTCT	2	12	649439	649450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014212	GCCTTT	2	12	660019	660030	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014212	CGGGCG	2	12	663979	663990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014212	CAGGCG	2	12	664459	664470	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014212	CTGGAG	2	12	687769	687780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014212	GGCCAG	2	12	698324	698335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014212	GCGGGG	2	12	715603	715614	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014212	GCAGTT	2	12	785123	785134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014212	ATCGTA	2	12	795659	795670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014212	GTCGAA	2	12	831635	831646	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014212	GCAGTT	2	12	831731	831742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014212	AGGGTG	2	12	841086	841097	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014212	GCAGTT	2	12	896505	896516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014212	AGGGTG	2	12	907253	907264	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014212	GCTTCC	2	12	933457	933468	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014212	GCAGTT	2	12	945600	945611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014212	TGGAGC	2	12	1013701	1013712	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014212	CTACCT	2	12	1014753	1014764	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014212	GAAAGC	2	12	1016652	1016663	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014212	CAACTG	2	12	1145985	1145996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014212	GCTCCC	2	12	1151804	1151815	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014212	GCAGTT	2	12	1165008	1165019	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014212	CCCGGA	2	12	1187273	1187284	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014212	GAGGTG	3	18	1189529	1189546	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014212	CAACTG	2	12	1211143	1211154	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014212	GCTCCA	2	12	1242624	1242635	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014212	TGCTTC	2	12	1269370	1269381	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014212	GTCGGA	2	12	1269548	1269559	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014212	GCTAAG	2	12	1294079	1294090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014212	GGCCCC	2	12	1302530	1302541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014212	GCAGTT	2	12	1330118	1330129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014212	CAACTG	2	12	1375639	1375650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014212	ATCAGC	2	12	1454023	1454034	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014212	ATCGCT	2	12	1461730	1461741	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014212	CAACTG	2	12	1462908	1462919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014212	CAACTG	2	12	1494637	1494648	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014212	GCAGTT	2	12	1495797	1495808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014212	GAGAGC	2	12	1496952	1496963	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014212	CGCCAG	2	12	1579144	1579155	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014212	TTCGCG	2	12	1583086	1583097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014212	CAACTG	2	12	1584970	1584981	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014212	TGGAGC	2	12	1634190	1634201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014212	ACCAAA	2	12	1647599	1647610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014212	CAGTCG	2	12	1691389	1691400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014212	CAACTG	2	12	1699975	1699986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014212	AGGGTA	2	12	1745504	1745515	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014212	CTGGTG	2	12	1746926	1746937	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014212	TCGGAG	2	12	1773367	1773378	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014212	GGTGGG	2	12	1810425	1810436	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014212	ATGAGA	2	12	1848186	1848197	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014212	TGGAGC	2	12	1860770	1860781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014212	GCAGGA	2	12	1894761	1894772	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014212	CAACTG	2	12	1916753	1916764	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014212	GGTGGG	2	12	1948708	1948719	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014212	GCTCCA	2	12	2008924	2008935	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014212	CCTGGC	2	12	2015750	2015761	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014212	CCTCTT	2	12	2061909	2061920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014212	GCAGTT	2	12	2094163	2094174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014212	ATCCCC	2	12	2105549	2105560	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014212	CCCGCA	2	12	2122119	2122130	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_014212	AAAACC	2	12	2141137	2141148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014212	GCAGTT	2	12	2176797	2176808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014212	CTGGCT	2	12	2189450	2189461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014212	TCAGGC	2	12	2210767	2210778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014212	GCTCCA	2	12	2212803	2212814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014212	AGGCCC	2	12	2274736	2274747	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014212	GCTTCC	2	12	2290663	2290674	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014212	CTGGAG	2	12	2318534	2318545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014212	ACCTCG	2	12	2319788	2319799	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014212	AGGGTG	2	12	2378217	2378228	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014212	GCAGTT	2	12	2390766	2390777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014212	GGCGAC	2	12	2408682	2408693	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014212	AGGGTG	2	12	2413734	2413745	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014212	CGTTCT	2	12	2427644	2427655	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014212	TACCCC	2	12	2492979	2492990	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014212	TCGAGG	2	12	2570451	2570462	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014212	AGGGTG	2	12	2571925	2571936	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014212	GGTTTT	2	12	2662000	2662011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014212	CAACTG	2	12	2691931	2691942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014212	TTTGGA	2	12	2698199	2698210	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014212	AGGGTG	2	12	2702971	2702982	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014212	GATCGG	2	12	2713437	2713448	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014212	GCAGTT	2	12	2750956	2750967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014212	CCGGTA	2	12	2792634	2792645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014212	TGGGCC	2	12	2792703	2792714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014212	GTCTGC	2	12	2838147	2838158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014212	ACCCTG	2	12	2839987	2839998	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014212	GCCGGG	2	12	2840197	2840208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014212	CAACGG	2	12	2840421	2840432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014212	ACACCC	2	12	2842599	2842610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014212	CACCGC	2	12	2842822	2842833	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014212	TCGCCC	2	12	2908266	2908277	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014212	CCGCCC	2	12	2919456	2919467	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
129	NC_014212	CTGGTG	2	12	2933095	2933106	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014212	AGGGTG	2	12	2961861	2961872	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014212	CAACTG	2	12	2963557	2963568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014212	GTCCAA	2	12	3011165	3011176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014212	CTGCGG	2	12	3013269	3013280	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014212	GCTTTT	2	12	3089224	3089235	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_014212	CACCGT	2	12	3125105	3125116	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014212	TGTTTT	2	12	3136899	3136910	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014212	CCGGGT	2	12	3139480	3139491	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014212	AGGGTG	2	12	3140188	3140199	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014212	TTTGGG	2	12	3140906	3140917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014212	TCCAAA	2	12	3171880	3171891	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014212	TCCTGG	2	12	3181523	3181534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014212	CCAAAG	2	12	3182488	3182499	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014212	AAGGGT	2	12	3186653	3186664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014212	GAAGCG	2	12	3224691	3224702	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_014212	GATGGC	2	12	3225237	3225248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_014212	TGGAGC	2	12	3225496	3225507	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.