MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 2695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014212	GCTGA	2	10	297	306	20 %	20 %	40 %	20 %	297564485
2	NC_014212	CTTTC	2	10	2099	2108	0 %	60 %	0 %	40 %	297564486
3	NC_014212	GAAGC	2	10	6851	6860	40 %	0 %	40 %	20 %	297564489
4	NC_014212	CACGA	2	10	7649	7658	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014212	CTTTT	2	10	9672	9681	0 %	80 %	0 %	20 %	297564490
6	NC_014212	GGGAA	2	10	10620	10629	40 %	0 %	60 %	0 %	297564491
7	NC_014212	GGGGA	2	10	10659	10668	20 %	0 %	80 %	0 %	297564491
8	NC_014212	CGGGG	2	10	11427	11436	0 %	0 %	80 %	20 %	297564492
9	NC_014212	CGGAA	2	10	13421	13430	40 %	0 %	40 %	20 %	297564494
10	NC_014212	CATAA	2	10	14045	14054	60 %	20 %	0 %	20 %	297564495
11	NC_014212	CCCCA	2	10	15935	15944	20 %	0 %	0 %	80 %	297564498
12	NC_014212	CCGCT	2	10	17798	17807	0 %	20 %	20 %	60 %	297564500
13	NC_014212	AGCCA	2	10	17827	17836	40 %	0 %	20 %	40 %	297564500
14	NC_014212	AGGCG	2	10	20455	20464	20 %	0 %	60 %	20 %	297564503
15	NC_014212	CTCCC	2	10	21353	21362	0 %	20 %	0 %	80 %	297564504
16	NC_014212	TTCCC	2	10	21393	21402	0 %	40 %	0 %	60 %	297564504
17	NC_014212	TCTAC	2	10	23257	23266	20 %	40 %	0 %	40 %	297564505
18	NC_014212	CAAGC	2	10	24511	24520	40 %	0 %	20 %	40 %	297564506
19	NC_014212	AGGGA	2	10	25546	25555	40 %	0 %	60 %	0 %	297564508
20	NC_014212	CCTTT	2	10	28013	28022	0 %	60 %	0 %	40 %	297564511
21	NC_014212	GTGGC	2	10	28080	28089	0 %	20 %	60 %	20 %	297564511
22	NC_014212	AGCCC	2	10	30493	30502	20 %	0 %	20 %	60 %	297564513
23	NC_014212	ACACC	2	10	31654	31663	40 %	0 %	0 %	60 %	297564513
24	NC_014212	CGCGG	2	10	33950	33959	0 %	0 %	60 %	40 %	297564515
25	NC_014212	GAGGT	2	10	34098	34107	20 %	20 %	60 %	0 %	297564515
26	NC_014212	GCGCG	2	10	34256	34265	0 %	0 %	60 %	40 %	297564515
27	NC_014212	CTGCC	2	10	35746	35755	0 %	20 %	20 %	60 %	297564517
28	NC_014212	CGAGC	2	10	36931	36940	20 %	0 %	40 %	40 %	297564518
29	NC_014212	GCCTG	2	10	37219	37228	0 %	20 %	40 %	40 %	297564518
30	NC_014212	GCCGC	3	15	37388	37402	0 %	0 %	40 %	60 %	297564518
31	NC_014212	TCAGC	2	10	37630	37639	20 %	20 %	20 %	40 %	297564518
32	NC_014212	CCCGG	2	10	39224	39233	0 %	0 %	40 %	60 %	297564519
33	NC_014212	GGAGG	2	10	43636	43645	20 %	0 %	80 %	0 %	297564522
34	NC_014212	GGAAG	2	10	43804	43813	40 %	0 %	60 %	0 %	297564523
35	NC_014212	GCAAG	2	10	44776	44785	40 %	0 %	40 %	20 %	297564524
36	NC_014212	CGAAG	2	10	47094	47103	40 %	0 %	40 %	20 %	297564526
37	NC_014212	GCACG	2	10	49376	49385	20 %	0 %	40 %	40 %	297564530
38	NC_014212	AAGGC	2	10	49631	49640	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014212	GAAAG	2	10	49697	49706	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014212	TTCCG	2	10	50740	50749	0 %	40 %	20 %	40 %	297564532
41	NC_014212	TGGGG	2	10	53239	53248	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014212	TGCTG	2	10	53610	53619	0 %	40 %	40 %	20 %	297564534
43	NC_014212	ACGAG	2	10	55244	55253	40 %	0 %	40 %	20 %	297564536
44	NC_014212	TGGCG	2	10	56565	56574	0 %	20 %	60 %	20 %	297564537
45	NC_014212	AGCCC	2	10	57952	57961	20 %	0 %	20 %	60 %	297564539
46	NC_014212	CGCTC	2	10	59197	59206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_014212	GCAGC	2	10	60120	60129	20 %	0 %	40 %	40 %	297564542
48	NC_014212	TGAGG	2	10	61093	61102	20 %	20 %	60 %	0 %	297564543
49	NC_014212	TTTTC	2	10	61741	61750	0 %	80 %	0 %	20 %	297564544
50	NC_014212	GCGGG	2	10	62254	62263	0 %	0 %	80 %	20 %	297564544
51	NC_014212	CGTGG	2	10	64159	64168	0 %	20 %	60 %	20 %	297564547
52	NC_014212	GGGGC	2	10	64428	64437	0 %	0 %	80 %	20 %	297564547
53	NC_014212	CCTTC	2	10	67430	67439	0 %	40 %	0 %	60 %	297564551
54	NC_014212	GCACC	2	10	67712	67721	20 %	0 %	20 %	60 %	297564551
55	NC_014212	CGTGG	2	10	69274	69283	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014212	CTGGC	2	10	72356	72365	0 %	20 %	40 %	40 %	297564555
57	NC_014212	GCCGG	2	10	72772	72781	0 %	0 %	60 %	40 %	297564556
58	NC_014212	GCCCG	2	10	73967	73976	0 %	0 %	40 %	60 %	297564558
59	NC_014212	TCGCC	2	10	74227	74236	0 %	20 %	20 %	60 %	297564558
60	NC_014212	GCCCC	2	10	74660	74669	0 %	0 %	20 %	80 %	297564558
61	NC_014212	CCCAA	2	10	74859	74868	40 %	0 %	0 %	60 %	297564558
62	NC_014212	CCTAC	2	10	77063	77072	20 %	20 %	0 %	60 %	297564560
63	NC_014212	CTGGC	2	10	77885	77894	0 %	20 %	40 %	40 %	297564560
64	NC_014212	GCTCG	2	10	80123	80132	0 %	20 %	40 %	40 %	297564563
65	NC_014212	TAGCT	2	10	82836	82845	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014212	GCCGC	2	10	82948	82957	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_014212	GTCCC	2	10	83236	83245	0 %	20 %	20 %	60 %	297564567
68	NC_014212	GCCGG	2	10	84360	84369	0 %	0 %	60 %	40 %	297564567
69	NC_014212	CGGTT	2	10	84596	84605	0 %	40 %	40 %	20 %	297564567
70	NC_014212	CACCC	2	10	87787	87796	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
71	NC_014212	CCCAC	2	10	89046	89055	20 %	0 %	0 %	80 %	297564568
72	NC_014212	AAAAG	2	10	89767	89776	80 %	0 %	20 %	0 %	297564569
73	NC_014212	TAGAA	2	10	89857	89866	60 %	20 %	20 %	0 %	297564569
74	NC_014212	GCTGG	2	10	95281	95290	0 %	20 %	60 %	20 %	297564573
75	NC_014212	CGGTA	2	10	96167	96176	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014212	GCGCT	2	10	99184	99193	0 %	20 %	40 %	40 %	297564578
77	NC_014212	GAGCG	2	10	99778	99787	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014212	CAAAC	2	10	99882	99891	60 %	0 %	0 %	40 %	297564579
79	NC_014212	GCAGC	2	10	100268	100277	20 %	0 %	40 %	40 %	297564579
80	NC_014212	GAGCC	2	10	103375	103384	20 %	0 %	40 %	40 %	297564582
81	NC_014212	GCGGG	2	10	103494	103503	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014212	GCCTC	2	10	103534	103543	0 %	20 %	20 %	60 %	297564583
83	NC_014212	GTTTG	2	10	104107	104116	0 %	60 %	40 %	0 %	297564583
84	NC_014212	AGCCC	2	10	104350	104359	20 %	0 %	20 %	60 %	297564583
85	NC_014212	CAGCC	2	10	104483	104492	20 %	0 %	20 %	60 %	297564583
86	NC_014212	ACCCC	2	10	104554	104563	20 %	0 %	0 %	80 %	297564583
87	NC_014212	GCGGG	2	10	104706	104715	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014212	GTGAG	2	10	106521	106530	20 %	20 %	60 %	0 %	297564584
89	NC_014212	CCGGC	2	10	108784	108793	0 %	0 %	40 %	60 %	297564587
90	NC_014212	GCCCC	2	10	108867	108876	0 %	0 %	20 %	80 %	297564587
91	NC_014212	GCTTG	2	10	108877	108886	0 %	40 %	40 %	20 %	297564587
92	NC_014212	CTGAC	2	10	111718	111727	20 %	20 %	20 %	40 %	297564588
93	NC_014212	CGGGA	2	10	111828	111837	20 %	0 %	60 %	20 %	297564588
94	NC_014212	CCAAG	2	10	113553	113562	40 %	0 %	20 %	40 %	297564589
95	NC_014212	TAAAA	2	10	114095	114104	80 %	20 %	0 %	0 %	297564590
96	NC_014212	CGACC	2	10	116541	116550	20 %	0 %	20 %	60 %	297564592
97	NC_014212	AGGTA	2	10	117747	117756	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014212	GCCGG	2	10	119856	119865	0 %	0 %	60 %	40 %	297564595
99	NC_014212	GCCTG	2	10	121464	121473	0 %	20 %	40 %	40 %	297564597
100	NC_014212	GCCCA	2	10	122124	122133	20 %	0 %	20 %	60 %	297564597
101	NC_014212	CTTTT	2	10	125383	125392	0 %	80 %	0 %	20 %	297564599
102	NC_014212	GCGCT	2	10	125915	125924	0 %	20 %	40 %	40 %	297564600
103	NC_014212	TGGGT	2	10	126335	126344	0 %	40 %	60 %	0 %	297564601
104	NC_014212	CCCCG	2	10	128778	128787	0 %	0 %	20 %	80 %	297564603
105	NC_014212	GGGAA	2	10	131211	131220	40 %	0 %	60 %	0 %	297564605
106	NC_014212	GGGGA	2	10	131250	131259	20 %	0 %	80 %	0 %	297564605
107	NC_014212	AATCC	2	10	131826	131835	40 %	20 %	0 %	40 %	297564606
108	NC_014212	TAGGG	2	10	135332	135341	20 %	20 %	60 %	0 %	297564609
109	NC_014212	GCCCC	2	10	135415	135424	0 %	0 %	20 %	80 %	297564609
110	NC_014212	GCCAC	2	10	135463	135472	20 %	0 %	20 %	60 %	297564609
111	NC_014212	GAGCG	2	10	136561	136570	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014212	GAGCG	2	10	136591	136600	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014212	GAGCG	2	10	136621	136630	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014212	GAGCG	2	10	136651	136660	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014212	GGGGT	2	10	136684	136693	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014212	GCCCC	2	10	137593	137602	0 %	0 %	20 %	80 %	297564610
117	NC_014212	GGCCC	2	10	139793	139802	0 %	0 %	40 %	60 %	297564612
118	NC_014212	AGGGG	2	10	139936	139945	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014212	GGCAT	2	10	140199	140208	20 %	20 %	40 %	20 %	297564613
120	NC_014212	ACCCC	2	10	140660	140669	20 %	0 %	0 %	80 %	297564614
121	NC_014212	CGAGC	2	10	144013	144022	20 %	0 %	40 %	40 %	297564617
122	NC_014212	GGGCA	2	10	145992	146001	20 %	0 %	60 %	20 %	297564620
123	NC_014212	CAACC	2	10	146617	146626	40 %	0 %	0 %	60 %	297564621
124	NC_014212	GGCCC	2	10	149235	149244	0 %	0 %	40 %	60 %	297564624
125	NC_014212	CTCTC	2	10	149498	149507	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_014212	GTACT	2	10	149548	149557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014212	CCTGG	2	10	149665	149674	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014212	GCCCA	2	10	154474	154483	20 %	0 %	20 %	60 %	297564629
129	NC_014212	TGCGC	2	10	155689	155698	0 %	20 %	40 %	40 %	297564630
130	NC_014212	CCGGG	2	10	157027	157036	0 %	0 %	60 %	40 %	297564631
131	NC_014212	ATCCG	2	10	158657	158666	20 %	20 %	20 %	40 %	297564634
132	NC_014212	GGTGA	2	10	159053	159062	20 %	20 %	60 %	0 %	297564635
133	NC_014212	GCCAG	2	10	159710	159719	20 %	0 %	40 %	40 %	297564636
134	NC_014212	CACAC	2	10	160147	160156	40 %	0 %	0 %	60 %	297564636
135	NC_014212	GCCCG	2	10	161596	161605	0 %	0 %	40 %	60 %	297564638
136	NC_014212	GCACC	2	10	162075	162084	20 %	0 %	20 %	60 %	297564638
137	NC_014212	TGGGC	2	10	163309	163318	0 %	20 %	60 %	20 %	297564639
138	NC_014212	GAAGA	2	10	165813	165822	60 %	0 %	40 %	0 %	297564641
139	NC_014212	GCCTG	2	10	166499	166508	0 %	20 %	40 %	40 %	297564642
140	NC_014212	CGGCC	2	10	167249	167258	0 %	0 %	40 %	60 %	297564643
141	NC_014212	CAGGC	2	10	167620	167629	20 %	0 %	40 %	40 %	297564643
142	NC_014212	TCGCT	2	10	168082	168091	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_014212	CGAGG	2	10	168374	168383	20 %	0 %	60 %	20 %	297564644
144	NC_014212	GATCA	2	10	169861	169870	40 %	20 %	20 %	20 %	297564646
145	NC_014212	TCACC	2	10	171193	171202	20 %	20 %	0 %	60 %	297564647
146	NC_014212	CCTAA	2	10	171962	171971	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_014212	GGGGT	2	10	171988	171997	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014212	GCGGG	2	10	173328	173337	0 %	0 %	80 %	20 %	297564650
149	NC_014212	AAAAG	2	10	174848	174857	80 %	0 %	20 %	0 %	297564652
150	NC_014212	TAGAA	2	10	174938	174947	60 %	20 %	20 %	0 %	297564652
151	NC_014212	TGCTA	2	10	175719	175728	20 %	40 %	20 %	20 %	297564652
152	NC_014212	GGCCG	2	10	176877	176886	0 %	0 %	60 %	40 %	297564653
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155	NC_014212	GTGGG	2	10	178217	178226	0 %	20 %	80 %	0 %	297564655
156	NC_014212	GGCGG	2	10	179898	179907	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
157	NC_014212	GGGGT	2	10	179912	179921	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014212	CCCGA	2	10	180766	180775	20 %	0 %	20 %	60 %	297564656
159	NC_014212	GTGGG	2	10	181234	181243	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014212	CGCTT	2	10	182712	182721	0 %	40 %	20 %	40 %	297564659
161	NC_014212	CCCGA	2	10	183219	183228	20 %	0 %	20 %	60 %	297564660
162	NC_014212	GTTGC	2	10	183662	183671	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
163	NC_014212	GCTGC	2	10	187532	187541	0 %	20 %	40 %	40 %	297564664
164	NC_014212	AGGGG	2	10	189122	189131	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014212	TTTCC	2	10	189425	189434	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_014212	AGGGG	2	10	192570	192579	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014212	CGCGA	2	10	193764	193773	20 %	0 %	40 %	40 %	297564668
168	NC_014212	GCCGG	2	10	194033	194042	0 %	0 %	60 %	40 %	297564668
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171	NC_014212	TCGCT	2	10	196924	196933	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_014212	CCACC	2	10	197295	197304	20 %	0 %	0 %	80 %	297564672
173	NC_014212	AGCGA	2	10	199026	199035	40 %	0 %	40 %	20 %	297564673
174	NC_014212	GCTAC	2	10	200270	200279	20 %	20 %	20 %	40 %	297564675
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177	NC_014212	CAGTA	2	10	201957	201966	40 %	20 %	20 %	20 %	297564676
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179	NC_014212	CCAGG	2	10	205195	205204	20 %	0 %	40 %	40 %	297564681
180	NC_014212	CCGAC	2	10	205313	205322	20 %	0 %	20 %	60 %	297564681
181	NC_014212	CACCG	2	10	205750	205759	20 %	0 %	20 %	60 %	297564681
182	NC_014212	TCGGC	2	10	206208	206217	0 %	20 %	40 %	40 %	297564681
183	NC_014212	GCTGC	2	10	206801	206810	0 %	20 %	40 %	40 %	297564682
184	NC_014212	CGGCC	2	10	207842	207851	0 %	0 %	40 %	60 %	297564683
185	NC_014212	CCATG	2	10	208632	208641	20 %	20 %	20 %	40 %	297564684
186	NC_014212	CCCTC	2	10	209152	209161	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
187	NC_014212	CGCAG	2	10	214452	214461	20 %	0 %	40 %	40 %	297564688
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189	NC_014212	TCCAG	2	10	215475	215484	20 %	20 %	20 %	40 %	297564688
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195	NC_014212	GCCAG	2	10	221351	221360	20 %	0 %	40 %	40 %	297564695
196	NC_014212	CTGCC	2	10	222036	222045	0 %	20 %	20 %	60 %	297564695
197	NC_014212	GCGCG	2	10	222317	222326	0 %	0 %	60 %	40 %	297564695
198	NC_014212	GCACC	2	10	222872	222881	20 %	0 %	20 %	60 %	297564695
199	NC_014212	GGCTG	2	10	224265	224274	0 %	20 %	60 %	20 %	297564695
200	NC_014212	CGCCC	2	10	224607	224616	0 %	0 %	20 %	80 %	297564696
201	NC_014212	CACTC	2	10	224760	224769	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
202	NC_014212	GGCCG	2	10	226647	226656	0 %	0 %	60 %	40 %	297564698
203	NC_014212	CGGGC	2	10	226769	226778	0 %	0 %	60 %	40 %	297564698
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241	NC_014212	GGCTG	2	10	276517	276526	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
242	NC_014212	GGCCC	2	10	277171	277180	0 %	0 %	40 %	60 %	297564745
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253	NC_014212	AGCCT	2	10	284500	284509	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
254	NC_014212	CCACC	2	10	284545	284554	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
255	NC_014212	CGCTC	2	10	284610	284619	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
256	NC_014212	CTTTA	2	10	284792	284801	20 %	60 %	0 %	20 %	297564755
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261	NC_014212	GGCTG	2	10	289276	289285	0 %	20 %	60 %	20 %	297564761
262	NC_014212	CATTG	2	10	291864	291873	20 %	40 %	20 %	20 %	297564763
263	NC_014212	CGCGG	2	10	294142	294151	0 %	0 %	60 %	40 %	297564765
264	NC_014212	CTGGG	2	10	294292	294301	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
265	NC_014212	CCGGC	2	10	294452	294461	0 %	0 %	40 %	60 %	297564766
266	NC_014212	ACCAA	2	10	297085	297094	60 %	0 %	0 %	40 %	297564768
267	NC_014212	GGCGG	2	10	298246	298255	0 %	0 %	80 %	20 %	297564769
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