MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 7210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014212	TACG	2	8	162	169	25 %	25 %	25 %	25 %	297564485
2	NC_014212	CTTC	2	8	262	269	0 %	50 %	0 %	50 %	297564485
3	NC_014212	TTTA	2	8	549	556	25 %	75 %	0 %	0 %	297564485
4	NC_014212	GCGG	2	8	1184	1191	0 %	0 %	75 %	25 %	297564485
5	NC_014212	AGTT	2	8	1707	1714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014212	ACCT	2	8	1826	1833	25 %	25 %	0 %	50 %	297564486
7	NC_014212	GGGA	2	8	1923	1930	25 %	0 %	75 %	0 %	297564486
8	NC_014212	GCCT	2	8	2837	2844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014212	GGGT	2	8	3548	3555	0 %	25 %	75 %	0 %	297564487
10	NC_014212	GGTC	2	8	3758	3765	0 %	25 %	50 %	25 %	297564487
11	NC_014212	CAAC	2	8	4136	4143	50 %	0 %	0 %	50 %	297564487
12	NC_014212	CAAC	2	8	5415	5422	50 %	0 %	0 %	50 %	297564488
13	NC_014212	GGTG	2	8	5940	5947	0 %	25 %	75 %	0 %	297564489
14	NC_014212	GGGA	2	8	5977	5984	25 %	0 %	75 %	0 %	297564489
15	NC_014212	TAGG	2	8	6079	6086	25 %	25 %	50 %	0 %	297564489
16	NC_014212	CGCT	2	8	6260	6267	0 %	25 %	25 %	50 %	297564489
17	NC_014212	ACCT	2	8	7224	7231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014212	GCCT	2	8	7271	7278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014212	TTCC	2	8	8009	8016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014212	AGGT	2	8	8953	8960	25 %	25 %	50 %	0 %	297564490
21	NC_014212	CTGC	2	8	8969	8976	0 %	25 %	25 %	50 %	297564490
22	NC_014212	CCAG	2	8	9661	9668	25 %	0 %	25 %	50 %	297564490
23	NC_014212	CGCT	2	8	10127	10134	0 %	25 %	25 %	50 %	297564491
24	NC_014212	AGGG	2	8	10248	10255	25 %	0 %	75 %	0 %	297564491
25	NC_014212	TGGC	2	8	10568	10575	0 %	25 %	50 %	25 %	297564491
26	NC_014212	GCGG	2	8	10778	10785	0 %	0 %	75 %	25 %	297564491
27	NC_014212	GGAT	2	8	11141	11148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014212	CGGT	2	8	11338	11345	0 %	25 %	50 %	25 %	297564492
29	NC_014212	CCAC	2	8	11570	11577	25 %	0 %	0 %	75 %	297564492
30	NC_014212	GGCT	2	8	11668	11675	0 %	25 %	50 %	25 %	297564492
31	NC_014212	CCCA	2	8	11680	11687	25 %	0 %	0 %	75 %	297564492
32	NC_014212	TCCT	2	8	12463	12470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014212	GAGG	2	8	12500	12507	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014212	GGCG	2	8	12695	12702	0 %	0 %	75 %	25 %	297564494
35	NC_014212	TGCG	2	8	12711	12718	0 %	25 %	50 %	25 %	297564494
36	NC_014212	GAGG	2	8	12852	12859	25 %	0 %	75 %	0 %	297564494
37	NC_014212	GCGG	2	8	13092	13099	0 %	0 %	75 %	25 %	297564494
38	NC_014212	GCGG	2	8	14838	14845	0 %	0 %	75 %	25 %	297564497
39	NC_014212	CGGA	2	8	15054	15061	25 %	0 %	50 %	25 %	297564497
40	NC_014212	AGCC	2	8	16320	16327	25 %	0 %	25 %	50 %	297564498
41	NC_014212	GAGC	2	8	17341	17348	25 %	0 %	50 %	25 %	297564499
42	NC_014212	GGGC	2	8	17576	17583	0 %	0 %	75 %	25 %	297564499
43	NC_014212	CAGC	2	8	18563	18570	25 %	0 %	25 %	50 %	297564500
44	NC_014212	GAAC	2	8	19718	19725	50 %	0 %	25 %	25 %	297564502
45	NC_014212	AGCC	2	8	19861	19868	25 %	0 %	25 %	50 %	297564502
46	NC_014212	CCGC	2	8	21237	21244	0 %	0 %	25 %	75 %	297564504
47	NC_014212	GCCA	2	8	21447	21454	25 %	0 %	25 %	50 %	297564504
48	NC_014212	CCCT	2	8	21767	21774	0 %	25 %	0 %	75 %	297564504
49	NC_014212	AGCG	2	8	21888	21895	25 %	0 %	50 %	25 %	297564504
50	NC_014212	GCCC	2	8	22993	23000	0 %	0 %	25 %	75 %	297564505
51	NC_014212	ACCC	2	8	23157	23164	25 %	0 %	0 %	75 %	297564505
52	NC_014212	GAAG	2	8	23582	23589	50 %	0 %	50 %	0 %	297564505
53	NC_014212	TGGG	2	8	23770	23777	0 %	25 %	75 %	0 %	297564505
54	NC_014212	CCCT	2	8	24014	24021	0 %	25 %	0 %	75 %	297564506
55	NC_014212	AGGA	2	8	24347	24354	50 %	0 %	50 %	0 %	297564506
56	NC_014212	CCAG	2	8	25247	25254	25 %	0 %	25 %	50 %	297564507
57	NC_014212	TGGG	2	8	26682	26689	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014212	GCCC	2	8	26842	26849	0 %	0 %	25 %	75 %	297564510
59	NC_014212	GCCC	2	8	27227	27234	0 %	0 %	25 %	75 %	297564510
60	NC_014212	GGAT	2	8	27499	27506	25 %	25 %	50 %	0 %	297564510
61	NC_014212	GGGA	2	8	27612	27619	25 %	0 %	75 %	0 %	297564510
62	NC_014212	GTTG	2	8	28705	28712	0 %	50 %	50 %	0 %	297564511
63	NC_014212	TTAT	2	8	28914	28921	25 %	75 %	0 %	0 %	297564512
64	NC_014212	CATA	2	8	29115	29122	50 %	25 %	0 %	25 %	297564512
65	NC_014212	CCTC	2	8	30020	30027	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_014212	ACCA	2	8	30948	30955	50 %	0 %	0 %	50 %	297564513
67	NC_014212	ACCG	2	8	31212	31219	25 %	0 %	25 %	50 %	297564513
68	NC_014212	CAAG	2	8	31301	31308	50 %	0 %	25 %	25 %	297564513
69	NC_014212	GCCC	2	8	31424	31431	0 %	0 %	25 %	75 %	297564513
70	NC_014212	CGGC	2	8	31930	31937	0 %	0 %	50 %	50 %	297564513
71	NC_014212	CGCC	2	8	31982	31989	0 %	0 %	25 %	75 %	297564513
72	NC_014212	GGCG	2	8	33017	33024	0 %	0 %	75 %	25 %	297564515
73	NC_014212	CGGG	2	8	33073	33080	0 %	0 %	75 %	25 %	297564515
74	NC_014212	GGGC	2	8	33318	33325	0 %	0 %	75 %	25 %	297564515
75	NC_014212	GCGG	2	8	33440	33447	0 %	0 %	75 %	25 %	297564515
76	NC_014212	CGGG	2	8	33571	33578	0 %	0 %	75 %	25 %	297564515
77	NC_014212	GGCG	2	8	33622	33629	0 %	0 %	75 %	25 %	297564515
78	NC_014212	GGTG	2	8	34174	34181	0 %	25 %	75 %	0 %	297564515
79	NC_014212	GTGG	2	8	34607	34614	0 %	25 %	75 %	0 %	297564515
80	NC_014212	CGGT	2	8	35435	35442	0 %	25 %	50 %	25 %	297564516
81	NC_014212	TTGG	2	8	35548	35555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014212	CCAC	2	8	36263	36270	25 %	0 %	0 %	75 %	297564517
83	NC_014212	CAAA	2	8	36416	36423	75 %	0 %	0 %	25 %	297564517
84	NC_014212	GCCC	2	8	37986	37993	0 %	0 %	25 %	75 %	297564518
85	NC_014212	GTGG	2	8	38246	38253	0 %	25 %	75 %	0 %	297564518
86	NC_014212	AGCA	2	8	38649	38656	50 %	0 %	25 %	25 %	297564519
87	NC_014212	TGCG	2	8	39540	39547	0 %	25 %	50 %	25 %	297564519
88	NC_014212	TCGG	2	8	40805	40812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014212	AGGT	2	8	41353	41360	25 %	25 %	50 %	0 %	297564520
90	NC_014212	TCGG	2	8	41966	41973	0 %	25 %	50 %	25 %	297564521
91	NC_014212	CAGC	2	8	42278	42285	25 %	0 %	25 %	50 %	297564521
92	NC_014212	GCCC	2	8	42491	42498	0 %	0 %	25 %	75 %	297564521
93	NC_014212	CGCC	2	8	42855	42862	0 %	0 %	25 %	75 %	297564522
94	NC_014212	GCCC	2	8	42914	42921	0 %	0 %	25 %	75 %	297564522
95	NC_014212	CAGG	2	8	43195	43202	25 %	0 %	50 %	25 %	297564522
96	NC_014212	CCAC	2	8	43356	43363	25 %	0 %	0 %	75 %	297564522
97	NC_014212	GCGG	2	8	43628	43635	0 %	0 %	75 %	25 %	297564522
98	NC_014212	TGGG	2	8	45359	45366	0 %	25 %	75 %	0 %	297564524
99	NC_014212	CCGC	2	8	45655	45662	0 %	0 %	25 %	75 %	297564524
100	NC_014212	GTTA	2	8	45750	45757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014212	TACC	2	8	46096	46103	25 %	25 %	0 %	50 %	297564525
102	NC_014212	GCGG	2	8	46567	46574	0 %	0 %	75 %	25 %	297564525
103	NC_014212	GTGA	2	8	46781	46788	25 %	25 %	50 %	0 %	297564525
104	NC_014212	CGGG	2	8	47418	47425	0 %	0 %	75 %	25 %	297564526
105	NC_014212	CTTC	2	8	48341	48348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014212	CCAG	2	8	49465	49472	25 %	0 %	25 %	50 %	297564530
107	NC_014212	TATC	2	8	49668	49675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014212	CCGC	2	8	50067	50074	0 %	0 %	25 %	75 %	297564531
109	NC_014212	GCTT	2	8	50374	50381	0 %	50 %	25 %	25 %	297564531
110	NC_014212	TAGC	2	8	50901	50908	25 %	25 %	25 %	25 %	297564532
111	NC_014212	TTGC	2	8	50920	50927	0 %	50 %	25 %	25 %	297564532
112	NC_014212	CGTT	2	8	51704	51711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014212	GCGG	2	8	51766	51773	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014212	GATT	2	8	51969	51976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014212	CGTT	2	8	52088	52095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014212	ACCG	2	8	52304	52311	25 %	0 %	25 %	50 %	297564533
117	NC_014212	CTGG	2	8	52555	52562	0 %	25 %	50 %	25 %	297564533
118	NC_014212	GCCC	2	8	52570	52577	0 %	0 %	25 %	75 %	297564533
119	NC_014212	AGGG	2	8	54523	54530	25 %	0 %	75 %	0 %	297564535
120	NC_014212	GCCT	2	8	55901	55908	0 %	25 %	25 %	50 %	297564536
121	NC_014212	CTGG	2	8	55918	55925	0 %	25 %	50 %	25 %	297564536
122	NC_014212	GCCC	2	8	56025	56032	0 %	0 %	25 %	75 %	297564537
123	NC_014212	GCCT	2	8	57137	57144	0 %	25 %	25 %	50 %	297564538
124	NC_014212	GCGG	2	8	58039	58046	0 %	0 %	75 %	25 %	297564539
125	NC_014212	ATTA	2	8	58467	58474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014212	GCTC	2	8	59043	59050	0 %	25 %	25 %	50 %	297564540
127	NC_014212	AGCC	2	8	60193	60200	25 %	0 %	25 %	50 %	297564543
128	NC_014212	GCTC	2	8	60217	60224	0 %	25 %	25 %	50 %	297564543
129	NC_014212	GACC	2	8	60959	60966	25 %	0 %	25 %	50 %	297564543
130	NC_014212	CGGG	2	8	60994	61001	0 %	0 %	75 %	25 %	297564543
131	NC_014212	ATCC	2	8	61151	61158	25 %	25 %	0 %	50 %	297564543
132	NC_014212	CCGC	2	8	62024	62031	0 %	0 %	25 %	75 %	297564544
133	NC_014212	CGGT	2	8	62072	62079	0 %	25 %	50 %	25 %	297564544
134	NC_014212	ACCC	2	8	62942	62949	25 %	0 %	0 %	75 %	297564546
135	NC_014212	GCTT	2	8	64492	64499	0 %	50 %	25 %	25 %	297564548
136	NC_014212	CCCG	2	8	64890	64897	0 %	0 %	25 %	75 %	297564548
137	NC_014212	CACC	2	8	64940	64947	25 %	0 %	0 %	75 %	297564548
138	NC_014212	GTGA	2	8	64992	64999	25 %	25 %	50 %	0 %	297564548
139	NC_014212	AGCC	2	8	68133	68140	25 %	0 %	25 %	50 %	297564552
140	NC_014212	TCGC	2	8	69920	69927	0 %	25 %	25 %	50 %	297564553
141	NC_014212	CCAC	2	8	70626	70633	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_014212	CGCT	2	8	70644	70651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014212	GCGA	2	8	71128	71135	25 %	0 %	50 %	25 %	297564554
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