MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014212	AGTT	2	8	1707	1714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014212	GCCT	2	8	2837	2844	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014212	ACCT	2	8	7224	7231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014212	GCCT	2	8	7271	7278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014212	TTCC	2	8	8009	8016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014212	GGAT	2	8	11141	11148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014212	TCCT	2	8	12463	12470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014212	GAGG	2	8	12500	12507	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014212	TGGG	2	8	26682	26689	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014212	CCTC	2	8	30020	30027	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_014212	TTGG	2	8	35548	35555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014212	TCGG	2	8	40805	40812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014212	GTTA	2	8	45750	45757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014212	CTTC	2	8	48341	48348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014212	TATC	2	8	49668	49675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014212	CGTT	2	8	51704	51711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014212	GCGG	2	8	51766	51773	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014212	GATT	2	8	51969	51976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014212	CGTT	2	8	52088	52095	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014212	ATTA	2	8	58467	58474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014212	CCAC	2	8	70626	70633	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014212	CGCT	2	8	70644	70651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014212	TCCT	2	8	71466	71473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014212	ATTC	2	8	72541	72548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014212	GCGG	2	8	82854	82861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014212	GATC	2	8	86057	86064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014212	CTCC	2	8	86542	86549	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_014212	TTCA	2	8	86661	86668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014212	GGCG	2	8	87469	87476	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014212	ACCC	2	8	88168	88175	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_014212	CGAG	2	8	88196	88203	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014212	GCCC	2	8	90733	90740	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014212	CGTG	2	8	90907	90914	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014212	CGGG	2	8	99728	99735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014212	CCCG	2	8	101496	101503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_014212	GTTT	2	8	101508	101515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014212	CTTT	2	8	102576	102583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014212	GGTT	2	8	107969	107976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014212	CGGG	2	8	110198	110205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014212	TGAG	2	8	110507	110514	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014212	CGGG	2	8	113451	113458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014212	GCGT	2	8	116291	116298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014212	CTGA	2	8	116322	116329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014212	GGAA	2	8	122439	122446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014212	GAAA	2	8	129613	129620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014212	CGGG	2	8	129688	129695	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014212	TCGG	2	8	130498	130505	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014212	GGGA	2	8	134525	134532	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014212	ACCC	2	8	136459	136466	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_014212	TCCC	2	8	139698	139705	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_014212	AGGG	2	8	139992	139999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014212	TCCC	2	8	143056	143063	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_014212	CAAA	2	8	143551	143558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014212	GGTT	2	8	149514	149521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014212	CTTT	2	8	150827	150834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014212	CGGG	2	8	151029	151036	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014212	CAAG	2	8	155903	155910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014212	ACAA	2	8	163886	163893	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014212	GTTG	2	8	163966	163973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014212	CGTG	2	8	171026	171033	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014212	GCTG	2	8	189341	189348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014212	CCTT	2	8	191180	191187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014212	ATGA	2	8	191324	191331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014212	AACC	2	8	196416	196423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014212	GCGG	2	8	197957	197964	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014212	ACTA	2	8	200149	200156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014212	TGAG	2	8	202978	202985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014212	GAGG	2	8	206334	206341	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014212	GCCC	2	8	206375	206382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_014212	GTCC	2	8	208557	208564	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014212	CCAT	2	8	212089	212096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014212	GGTG	2	8	212909	212916	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014212	CTTC	2	8	217819	217826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014212	CTGC	2	8	225630	225637	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014212	GACG	2	8	236892	236899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014212	CTCC	2	8	238180	238187	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_014212	CTCG	2	8	239413	239420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014212	TTCC	2	8	264637	264644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014212	AGCT	2	8	267265	267272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014212	CTGA	2	8	272550	272557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014212	AATG	2	8	272587	272594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014212	CACC	2	8	276297	276304	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_014212	ACCC	2	8	276334	276341	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
84	NC_014212	ACGA	2	8	294267	294274	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014212	CGCC	2	8	299923	299930	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_014212	GCCC	2	8	299947	299954	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_014212	GCTG	2	8	300068	300075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014212	TGGT	2	8	300344	300351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014212	AGGA	2	8	306183	306190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014212	TCCT	2	8	308117	308124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014212	GTGG	2	8	308423	308430	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014212	CCGG	2	8	308487	308494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014212	CCCG	2	8	308960	308967	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_014212	TCCG	2	8	310520	310527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014212	GCGT	2	8	314516	314523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014212	CAAG	2	8	314576	314583	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014212	GTTG	2	8	325775	325782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014212	GGTG	2	8	326633	326640	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014212	CGGA	2	8	327390	327397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014212	GCAA	2	8	327442	327449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014212	GAAG	2	8	327715	327722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014212	GGGA	2	8	327820	327827	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014212	TTGA	2	8	351914	351921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014212	GCCA	2	8	353671	353678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014212	GCGG	2	8	356246	356253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014212	ATAG	2	8	359385	359392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014212	CGGC	2	8	370188	370195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014212	CTTT	2	8	388559	388566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014212	TAGC	2	8	389703	389710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014212	ACCC	2	8	399530	399537	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_014212	CTAG	2	8	408143	408150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014212	CAGC	2	8	408364	408371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014212	GCGG	2	8	408515	408522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014212	GGTA	2	8	408671	408678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014212	CTAC	2	8	410270	410277	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014212	CAAG	2	8	410714	410721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014212	CACC	2	8	412668	412675	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_014212	TCCC	2	8	413417	413424	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_014212	CCTG	2	8	430003	430010	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014212	GCCT	2	8	431203	431210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014212	CCGA	2	8	439911	439918	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014212	TTTC	2	8	440461	440468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014212	GCCC	2	8	441216	441223	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_014212	CCTT	2	8	452599	452606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014212	GACT	2	8	460010	460017	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014212	GAGG	2	8	465405	465412	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014212	GGTG	2	8	465467	465474	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014212	CTGG	2	8	465492	465499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014212	TAGC	2	8	468294	468301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014212	CGTC	2	8	468566	468573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014212	TAGT	2	8	468706	468713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014212	GGGT	2	8	469022	469029	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014212	CTTT	2	8	469188	469195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014212	AAAG	2	8	469490	469497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014212	CTCC	2	8	474084	474091	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_014212	AAGG	2	8	485942	485949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014212	GCCT	2	8	497534	497541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014212	CTCC	2	8	519111	519118	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_014212	GAAG	2	8	534810	534817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014212	AGTC	2	8	534849	534856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014212	CCAA	2	8	535141	535148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014212	GTTG	2	8	535150	535157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014212	GGGT	2	8	535407	535414	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014212	GGTG	2	8	535433	535440	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014212	ATCC	2	8	536513	536520	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014212	CTCC	2	8	536931	536938	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_014212	AGGA	2	8	541487	541494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014212	CCTT	2	8	542951	542958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014212	TCGC	2	8	545987	545994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014212	CGGA	2	8	553145	553152	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014212	GCCC	2	8	554147	554154	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
152	NC_014212	CCCT	2	8	560095	560102	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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155	NC_014212	CCGC	2	8	565255	565262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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444	NC_014212	TCTT	2	8	1463029	1463036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
445	NC_014212	GCCA	2	8	1463160	1463167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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448	NC_014212	AGGG	2	8	1469558	1469565	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_014212	CACC	2	8	1476447	1476454	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
452	NC_014212	AGCC	2	8	1478551	1478558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
453	NC_014212	TAGG	2	8	1478830	1478837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
454	NC_014212	GCCA	2	8	1478947	1478954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
455	NC_014212	AGGG	2	8	1483837	1483844	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
456	NC_014212	GTAG	2	8	1492369	1492376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
457	NC_014212	GGCA	2	8	1493517	1493524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
458	NC_014212	GGAT	3	12	1498722	1498733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_014212	CTGG	2	8	1509519	1509526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_014212	CGAG	2	8	1546358	1546365	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
464	NC_014212	GGCG	2	8	1550157	1550164	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
465	NC_014212	TACC	2	8	1555022	1555029	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
466	NC_014212	GTAT	2	8	1566144	1566151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
467	NC_014212	GCGG	2	8	1566211	1566218	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
468	NC_014212	TGCA	2	8	1570411	1570418	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
469	NC_014212	AACG	2	8	1574182	1574189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
470	NC_014212	GCCA	2	8	1579111	1579118	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
471	NC_014212	GTTG	2	8	1581100	1581107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
472	NC_014212	CGGG	2	8	1582991	1582998	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
473	NC_014212	TACC	2	8	1583247	1583254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
474	NC_014212	CCTC	2	8	1587500	1587507	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
475	NC_014212	TACC	2	8	1594786	1594793	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
476	NC_014212	CTGG	2	8	1596015	1596022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
477	NC_014212	CCCA	2	8	1603614	1603621	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
478	NC_014212	CTGG	2	8	1606890	1606897	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
479	NC_014212	TTGT	2	8	1607469	1607476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
480	NC_014212	GCAG	2	8	1607582	1607589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
481	NC_014212	TACC	2	8	1607597	1607604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
482	NC_014212	AAAT	2	8	1612431	1612438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_014212	CTGC	2	8	1622822	1622829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_014212	TTCA	2	8	1622831	1622838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
485	NC_014212	CATA	2	8	1629364	1629371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_014212	GCAG	2	8	1632458	1632465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_014212	TGTT	2	8	1633984	1633991	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
488	NC_014212	ATGG	2	8	1634385	1634392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NC_014212	AAAC	2	8	1634446	1634453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_014212	GAAG	2	8	1636340	1636347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
491	NC_014212	GTCC	2	8	1644392	1644399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_014212	TCGG	2	8	1647501	1647508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_014212	TAGA	2	8	1652809	1652816	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
494	NC_014212	TTAG	2	8	1660146	1660153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
495	NC_014212	GCCG	2	8	1670853	1670860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
496	NC_014212	CTCG	2	8	1674447	1674454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_014212	GGAG	2	8	1686148	1686155	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
498	NC_014212	CCAG	2	8	1686647	1686654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_014212	CCCT	2	8	1686733	1686740	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
500	NC_014212	GACG	2	8	1687026	1687033	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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