MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 4225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014212	AAT	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014212	CGG	2	6	108	113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014212	ACA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014212	CTA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014212	TAC	3	9	1671	1679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014212	AGA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014212	AGG	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014212	AGG	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014212	GTC	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014212	CCT	2	6	7028	7033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014212	AGG	2	6	7194	7199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014212	TCC	2	6	7550	7555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014212	GAC	2	6	7662	7667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014212	GCA	2	6	7674	7679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014212	TCA	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014212	TTC	2	6	7752	7757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014212	GCT	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014212	TCA	2	6	8242	8247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014212	GCG	2	6	8295	8300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014212	CTG	2	6	8341	8346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014212	GTC	2	6	8391	8396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014212	CGT	2	6	8414	8419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014212	CCA	2	6	8440	8445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014212	CGC	2	6	8641	8646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014212	CCT	2	6	9902	9907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014212	TTC	2	6	9988	9993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014212	AGG	2	6	10002	10007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014212	TCG	2	6	11116	11121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014212	GAT	2	6	11969	11974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014212	AGA	2	6	14623	14628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014212	ACC	2	6	14674	14679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014212	CCT	2	6	16474	16479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014212	GAA	2	6	17617	17622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014212	CGG	2	6	18708	18713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014212	ATA	2	6	18738	18743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014212	ATT	2	6	18762	18767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014212	AGG	2	6	18856	18861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014212	GAA	2	6	19548	19553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014212	GCA	2	6	20150	20155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014212	GTT	2	6	20945	20950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014212	CTC	2	6	22013	22018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014212	GAA	2	6	22029	22034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014212	GCC	2	6	22109	22114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014212	TGC	2	6	24668	24673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014212	CAA	2	6	24680	24685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014212	TGC	2	6	24695	24700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014212	CAA	2	6	24707	24712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014212	TGC	2	6	24722	24727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014212	CGC	2	6	24844	24849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_014212	GCG	2	6	25311	25316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014212	ACC	2	6	25412	25417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014212	AGC	2	6	26662	26667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014212	CGA	2	6	26762	26767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014212	TGC	2	6	27768	27773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014212	CGT	2	6	29974	29979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014212	CGT	2	6	29981	29986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014212	ACT	2	6	35539	35544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014212	GCG	2	6	40886	40891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014212	TCC	2	6	41815	41820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014212	GGT	2	6	42626	42631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014212	GAC	2	6	44683	44688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014212	AGG	3	9	45799	45807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014212	CAG	2	6	45859	45864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014212	ACG	2	6	47531	47536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014212	GAA	2	6	48308	48313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014212	CGG	2	6	48375	48380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014212	ATC	2	6	51000	51005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014212	ACC	2	6	51025	51030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014212	GAC	2	6	51058	51063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014212	CAC	2	6	51111	51116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014212	GAC	2	6	51136	51141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014212	TGG	2	6	51176	51181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014212	TCG	2	6	51200	51205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014212	ACC	2	6	51239	51244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014212	GCT	2	6	51306	51311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014212	CGC	2	6	51315	51320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014212	GCT	2	6	51357	51362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014212	AGG	2	6	51422	51427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014212	GAG	2	6	51499	51504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014212	GCA	2	6	51513	51518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014212	CAC	2	6	51531	51536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014212	CGC	2	6	51549	51554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014212	GAG	2	6	51652	51657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014212	CCG	2	6	51804	51809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014212	CCG	2	6	51816	51821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014212	CAA	2	6	51909	51914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014212	AAC	2	6	51956	51961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014212	ATG	2	6	51993	51998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014212	CCG	2	6	52021	52026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014212	CCA	2	6	52062	52067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014212	TAT	2	6	52157	52162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014212	ATA	2	6	53269	53274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014212	GCG	2	6	56791	56796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014212	AAG	2	6	56798	56803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014212	GCG	2	6	56818	56823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014212	AAG	2	6	56825	56830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014212	ATA	2	6	58605	58610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014212	CTC	2	6	58639	58644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014212	TAA	2	6	58699	58704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014212	TCC	2	6	59100	59105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014212	AGG	2	6	59944	59949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014212	AGA	2	6	62385	62390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014212	ACC	2	6	62470	62475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014212	GGC	2	6	63224	63229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014212	CAG	2	6	65132	65137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014212	TCC	2	6	65567	65572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014212	TGC	2	6	67920	67925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014212	TGC	2	6	67928	67933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014212	CCT	2	6	69258	69263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_014212	GAT	2	6	70663	70668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014212	CGA	2	6	70706	70711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014212	CGG	2	6	70740	70745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014212	CGT	2	6	71384	71389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014212	AGG	2	6	72562	72567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014212	ACC	2	6	72579	72584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014212	CTG	2	6	72590	72595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014212	TCT	2	6	76419	76424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014212	AGG	2	6	76427	76432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014212	AGG	3	9	79854	79862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014212	GCC	2	6	81910	81915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014212	CTG	2	6	82868	82873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014212	ATG	2	6	82889	82894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014212	GAG	2	6	83021	83026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014212	CCT	2	6	85637	85642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014212	TGT	2	6	85663	85668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014212	CTC	2	6	85861	85866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014212	TGC	2	6	85956	85961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014212	GCT	2	6	86012	86017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014212	ACC	2	6	86028	86033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014212	CGG	2	6	86294	86299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014212	AGC	2	6	86346	86351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014212	GTT	2	6	86439	86444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014212	CCG	2	6	86477	86482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014212	CTT	2	6	86493	86498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014212	GAA	2	6	86595	86600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014212	CTG	2	6	86604	86609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014212	CAG	2	6	86683	86688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014212	GGT	2	6	86712	86717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014212	GTT	2	6	86718	86723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014212	GGC	2	6	86803	86808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_014212	GTT	2	6	87118	87123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_014212	CGG	3	9	190881	190889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_014212	GTT	2	6	190921	190926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014212	GCG	2	6	191072	191077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_014212	GCA	2	6	191093	191098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_014212	CGG	2	6	191130	191135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_014212	TGA	2	6	191139	191144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_014212	GAA	2	6	191197	191202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_014212	CCT	2	6	192443	192448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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292	NC_014212	TCC	2	6	196892	196897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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