MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Meiothermus silvanus DSM 9946 chromosome

Total Repeats: 41760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014212	CAG	2	6	132	137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564485
2	NC_014212	ACG	2	6	181	186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564485
3	NC_014212	CGG	2	6	233	238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564485
4	NC_014212	AAG	2	6	285	290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564485
5	NC_014212	GTG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564485
6	NC_014212	AAC	2	6	480	485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564485
7	NC_014212	CGC	2	6	497	502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564485
8	NC_014212	AGG	2	6	784	789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564485
9	NC_014212	ATC	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564485
10	NC_014212	TCC	2	6	843	848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564485
11	NC_014212	CGT	2	6	1084	1089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564485
12	NC_014212	GCC	2	6	1119	1124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564485
13	NC_014212	GAT	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564485
14	NC_014212	CGA	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564485
15	NC_014212	CGC	2	6	1239	1244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564485
16	NC_014212	GGT	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564485
17	NC_014212	TTC	2	6	1326	1331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564485
18	NC_014212	ACC	2	6	1347	1352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564485
19	NC_014212	CAA	2	6	1407	1412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564485
20	NC_014212	CAA	2	6	1849	1854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564486
21	NC_014212	GAG	2	6	2186	2191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564486
22	NC_014212	TGA	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564486
23	NC_014212	AAC	2	6	2567	2572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564486
24	NC_014212	CTG	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564486
25	NC_014212	GAG	2	6	2645	2650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564486
26	NC_014212	TGG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564486
27	NC_014212	GTG	2	6	2777	2782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564486
28	NC_014212	GGA	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564486
29	NC_014212	CGG	2	6	3095	3100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564487
30	NC_014212	ACG	2	6	3178	3183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564487
31	NC_014212	TGA	2	6	3370	3375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564487
32	NC_014212	TCA	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564487
33	NC_014212	CGG	2	6	3386	3391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564487
34	NC_014212	ACA	2	6	3403	3408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564487
35	NC_014212	CTG	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564487
36	NC_014212	GAG	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564487
37	NC_014212	GGA	2	6	3800	3805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564487
38	NC_014212	TGG	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564487
39	NC_014212	TGA	2	6	3866	3871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564487
40	NC_014212	TCC	2	6	4144	4149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564487
41	NC_014212	CCT	2	6	4238	4243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564488
42	NC_014212	GGA	2	6	4320	4325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564488
43	NC_014212	GGA	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564488
44	NC_014212	GTT	2	6	4560	4565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564488
45	NC_014212	TGA	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564488
46	NC_014212	GGT	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564488
47	NC_014212	CAA	3	9	4653	4661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297564488
48	NC_014212	GAC	2	6	4786	4791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564488
49	NC_014212	CGG	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564488
50	NC_014212	GGA	2	6	4893	4898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564488
51	NC_014212	TGG	2	6	4913	4918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564488
52	NC_014212	GGT	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564488
53	NC_014212	CGG	2	6	5337	5342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564488
54	NC_014212	GCC	2	6	5344	5349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564488
55	NC_014212	TTG	2	6	5449	5454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564488
56	NC_014212	GTG	2	6	5542	5547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564488
57	NC_014212	GAC	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564488
58	NC_014212	GGT	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564489
59	NC_014212	GAT	2	6	5782	5787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564489
60	NC_014212	GGT	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564489
61	NC_014212	GCT	2	6	5868	5873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
62	NC_014212	TCG	2	6	5909	5914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
63	NC_014212	GAA	2	6	5923	5928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564489
64	NC_014212	TTC	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297564489
65	NC_014212	GGT	2	6	6208	6213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564489
66	NC_014212	TGA	2	6	6228	6233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564489
67	NC_014212	GTT	2	6	6282	6287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297564489
68	NC_014212	AGG	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564489
69	NC_014212	TCG	2	6	6317	6322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
70	NC_014212	CGG	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564489
71	NC_014212	CAC	2	6	6385	6390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564489
72	NC_014212	CAC	2	6	6460	6465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564489
73	NC_014212	CTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
74	NC_014212	ATC	2	6	6505	6510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564489
75	NC_014212	ACG	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564489
76	NC_014212	TCG	2	6	6572	6577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
77	NC_014212	GCG	2	6	6580	6585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564489
78	NC_014212	GGC	2	6	6687	6692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564489
79	NC_014212	TGC	2	6	6695	6700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564489
80	NC_014212	GGT	2	6	6865	6870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564489
81	NC_014212	AGA	2	6	8792	8797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564490
82	NC_014212	CTC	2	6	8871	8876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
83	NC_014212	CGG	2	6	8935	8940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564490
84	NC_014212	GTA	2	6	8943	8948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564490
85	NC_014212	CTC	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
86	NC_014212	CTC	2	6	9067	9072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
87	NC_014212	CAG	2	6	9106	9111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564490
88	NC_014212	CCT	2	6	9113	9118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
89	NC_014212	CCT	2	6	9518	9523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564490
90	NC_014212	AGC	2	6	9595	9600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564490
91	NC_014212	GCG	2	6	9639	9644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564490
92	NC_014212	GGT	2	6	9698	9703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564490
93	NC_014212	GGT	2	6	9879	9884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564490
94	NC_014212	CGC	2	6	10094	10099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564491
95	NC_014212	ATG	2	6	10165	10170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297564491
96	NC_014212	CTG	2	6	10182	10187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564491
97	NC_014212	GCC	2	6	10196	10201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564491
98	NC_014212	CGG	2	6	10207	10212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564491
99	NC_014212	AGG	2	6	10222	10227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564491
100	NC_014212	GCT	2	6	10256	10261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564491
101	NC_014212	GAC	2	6	10269	10274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564491
102	NC_014212	ACC	2	6	10275	10280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564491
103	NC_014212	GGT	2	6	10346	10351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564491
104	NC_014212	CTG	2	6	10374	10379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564491
105	NC_014212	GGT	2	6	10670	10675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564491
106	NC_014212	CCT	3	9	10892	10900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564491
107	NC_014212	TCC	2	6	10915	10920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564491
108	NC_014212	CTG	2	6	11158	11163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564492
109	NC_014212	CGA	3	9	11181	11189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564492
110	NC_014212	GGA	2	6	11203	11208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564492
111	NC_014212	TCA	2	6	11249	11254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564492
112	NC_014212	AGA	2	6	11325	11330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564492
113	NC_014212	CAC	2	6	11442	11447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564492
114	NC_014212	TGC	2	6	11504	11509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564492
115	NC_014212	CAT	2	6	11520	11525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564492
116	NC_014212	GGA	2	6	11612	11617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564492
117	NC_014212	CTA	2	6	11628	11633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564492
118	NC_014212	GTG	2	6	12096	12101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564493
119	NC_014212	CAG	2	6	12102	12107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564493
120	NC_014212	GGT	2	6	12122	12127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564493
121	NC_014212	TAC	2	6	12171	12176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564493
122	NC_014212	GGC	2	6	12200	12205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564493
123	NC_014212	CCA	2	6	12233	12238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564493
124	NC_014212	ACT	2	6	12310	12315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564493
125	NC_014212	GTG	2	6	12360	12365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564493
126	NC_014212	TGC	2	6	12388	12393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564493
127	NC_014212	GCT	2	6	12541	12546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564494
128	NC_014212	GCT	2	6	12645	12650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564494
129	NC_014212	GGA	3	9	12651	12659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564494
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132	NC_014212	GGA	2	6	12804	12809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564494
133	NC_014212	GCT	2	6	12930	12935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564494
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250	NC_014212	GGC	2	6	21821	21826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564504
251	NC_014212	GCA	2	6	21834	21839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564504
252	NC_014212	CAT	2	6	21852	21857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564504
253	NC_014212	GCG	2	6	21923	21928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564504
254	NC_014212	GAA	2	6	22164	22169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564505
255	NC_014212	CCA	2	6	22328	22333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564505
256	NC_014212	AGG	2	6	22390	22395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564505
257	NC_014212	ACG	2	6	22435	22440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564505
258	NC_014212	GGC	2	6	22574	22579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564505
259	NC_014212	ATC	2	6	22617	22622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564505
260	NC_014212	TGG	2	6	22768	22773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564505
261	NC_014212	AGG	2	6	22783	22788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564505
262	NC_014212	TGC	2	6	22801	22806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564505
263	NC_014212	CCA	2	6	22918	22923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564505
264	NC_014212	GCG	2	6	23052	23057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564505
265	NC_014212	TCA	2	6	23107	23112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564505
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268	NC_014212	ATC	2	6	23292	23297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564505
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270	NC_014212	GGC	2	6	23487	23492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564505
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273	NC_014212	TCA	2	6	23686	23691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297564505
274	NC_014212	GGA	2	6	23753	23758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564505
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278	NC_014212	CAC	2	6	24154	24159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564506
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281	NC_014212	GGT	2	6	24375	24380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564506
282	NC_014212	GCT	2	6	24414	24419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564506
283	NC_014212	ACC	2	6	24583	24588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297564506
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285	NC_014212	CAG	2	6	24888	24893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297564507
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290	NC_014212	CCG	2	6	25232	25237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297564507
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321	NC_014212	GTC	2	6	28457	28462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564511
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364	NC_014212	CTC	2	6	31242	31247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297564513
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370	NC_014212	CGG	2	6	31544	31549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564513
371	NC_014212	GCT	2	6	31586	31591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564513
372	NC_014212	GAA	4	12	31592	31603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297564513
373	NC_014212	TGG	2	6	31639	31644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297564513
374	NC_014212	AGG	2	6	31645	31650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297564513
375	NC_014212	GGC	2	6	31683	31688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564513
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377	NC_014212	GGC	2	6	31751	31756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297564513
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500	NC_014212	CTG	2	6	39669	39674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297564519

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