MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111 chromosome 2

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014211	TACCGG	2	12	9822	9833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014211	ACGGGG	2	12	11724	11735	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014211	TTTCTC	2	12	17986	17997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014211	CCGGGG	2	12	29044	29055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014211	GCCGGG	2	12	66944	66955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014211	CCCCGG	2	12	77113	77124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014211	ACCGGT	2	12	92462	92473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014211	GTGGGC	2	12	92502	92513	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014211	GCACCG	2	12	101899	101910	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014211	CGGAGA	2	12	104315	104326	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014211	GTGCGC	2	12	104507	104518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014211	CGCAAT	2	12	119480	119491	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014211	TCCGGG	2	12	125552	125563	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014211	CCGGCC	2	12	126312	126323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014211	TGCGCG	2	12	131638	131649	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014211	ACCCGA	2	12	132226	132237	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014211	GCAGCC	2	12	135680	135691	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014211	CGGGGT	2	12	136575	136586	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014211	GCGACC	2	12	143397	143408	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014211	TCCCCC	2	12	145670	145681	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
21	NC_014211	CCCCCA	2	12	150593	150604	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
22	NC_014211	TCGGGG	2	12	190124	190135	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014211	TCGCGC	2	12	191851	191862	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014211	GCGCCC	2	12	193762	193773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014211	TCATGT	2	12	210544	210555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014211	CACAGA	2	12	228695	228706	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014211	CTTCGG	2	12	229429	229440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014211	CAGGAG	2	12	249915	249926	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014211	CGGGCG	2	12	255316	255327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014211	GGCCCG	2	12	261212	261223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014211	CCCGCT	2	12	261741	261752	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014211	GACCTC	2	12	267178	267189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014211	CCGGAT	2	12	268449	268460	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014211	GTGACG	2	12	277200	277211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014211	GCCCCG	2	12	304836	304847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014211	CGGGCG	2	12	328414	328425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014211	CGGAGC	2	12	332238	332249	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014211	CGGCCC	2	12	335624	335635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014211	CGGCTG	2	12	359624	359635	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014211	GGCGCG	2	12	363310	363321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014211	CGTTCG	2	12	366204	366215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014211	GGCCGG	2	12	374082	374093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014211	CGTGCC	2	12	376987	376998	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014211	CACCGC	2	12	381380	381391	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014211	CCGCGG	2	12	397508	397519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014211	TGGGAG	2	12	401189	401200	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014211	GCGGCC	2	12	413761	413772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014211	CCCCGG	2	12	415479	415490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014211	CGGGCG	2	12	424997	425008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014211	GGGCCC	2	12	444548	444559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014211	TTTCTA	2	12	445855	445866	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014211	CTGCGA	2	12	452111	452122	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014211	GCCCGC	2	12	485027	485038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014211	CCGGGT	2	12	494822	494833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014211	TGCCGC	2	12	535558	535569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014211	GACCCC	2	12	539333	539344	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014211	GGATGA	2	12	576401	576412	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014211	CCGGGG	2	12	593216	593227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014211	GGAGGG	3	18	603808	603825	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014211	CGACGC	2	12	624405	624416	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014211	GACCCG	2	12	641623	641634	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014211	CCCGGT	2	12	653084	653095	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014211	CGGCCG	2	12	660588	660599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014211	GCGCCG	2	12	663670	663681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014211	CGGGGG	2	12	667967	667978	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014211	CGGGGG	2	12	670052	670063	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014211	CGGGGC	2	12	676688	676699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014211	GGGCAG	2	12	692159	692170	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014211	CGTGCG	2	12	738959	738970	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014211	TCGAAG	2	12	767355	767366	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014211	AGCCGC	2	12	770454	770465	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.