MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter mathranii subsp. mathranii str. A3 chromosome

Total Repeats: 998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014209	AAAAGT	2	12	2907	2918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543501
2	NC_014209	ATGGCA	2	12	5632	5643	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297543504
3	NC_014209	TATATC	2	12	7235	7246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	297543505
4	NC_014209	TCAAAT	2	12	9131	9142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297543507
5	NC_014209	TATAAA	2	12	9701	9712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543507
6	NC_014209	ACAAGC	2	12	12260	12271	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	297543508
7	NC_014209	GAGAAA	2	12	12970	12981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543508
8	NC_014209	GAAGTA	2	12	17396	17407	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543511
9	NC_014209	TAAAAA	2	12	18389	18400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297543512
10	NC_014209	AGAAAA	2	12	19789	19800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297543515
11	NC_014209	TTTTGA	2	12	21343	21354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014209	AATTTA	2	12	21973	21984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014209	GATTTT	2	12	22416	22427	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014209	TAAAAC	2	12	25425	25436	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014209	TTTTGT	2	12	27316	27327	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	297543519
16	NC_014209	TGGATT	2	12	31378	31389	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	297543522
17	NC_014209	TGTAAT	2	12	31777	31788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297543522
18	NC_014209	TAAAGT	2	12	35719	35730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014209	GATAAA	2	12	35779	35790	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014209	TAAGAA	2	12	36613	36624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543527
21	NC_014209	TCATGC	2	12	36655	36666	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297543527
22	NC_014209	AAGTAG	2	12	38256	38267	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543528
23	NC_014209	GTAGAT	2	12	38842	38853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543529
24	NC_014209	ATATTG	2	12	44143	44154	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297543533
25	NC_014209	GGAGAA	2	12	45012	45023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014209	CAGAAC	2	12	48890	48901	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	297543538
27	NC_014209	TAAAAA	2	12	49734	49745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014209	TTTGAG	2	12	52737	52748	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	297543542
29	NC_014209	TTATTG	2	12	52942	52953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297543542
30	NC_014209	TGACAT	2	12	55034	55045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297543543
31	NC_014209	AATTAA	2	12	56636	56647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014209	GCTTTC	2	12	57877	57888	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	297543544
33	NC_014209	AAGGAA	2	12	60656	60667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543551
34	NC_014209	CAATGT	2	12	60798	60809	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297543551
35	NC_014209	AAGAAA	2	12	60876	60887	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297543551
36	NC_014209	GCTTTA	2	12	64230	64241	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297543557
37	NC_014209	GAAAAA	2	12	64662	64673	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297543557
38	NC_014209	TTGAAA	2	12	64738	64749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297543557
39	NC_014209	GTGGAA	2	12	65543	65554	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297543558
40	NC_014209	GTGCTT	2	12	68056	68067	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	297543561
41	NC_014209	TCAATA	2	12	68998	69009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297543563
42	NC_014209	TGCCAA	2	12	71848	71859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	297543567
43	NC_014209	TTGCTT	2	12	74583	74594	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	297543572
44	NC_014209	AGAAAG	2	12	74884	74895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543572
45	NC_014209	AGCAGA	2	12	74902	74913	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	297543572
46	NC_014209	CAGCCT	2	12	75940	75951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297543573
47	NC_014209	AAAAGA	2	12	76754	76765	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297543573
48	NC_014209	GGAGAT	2	12	76941	76952	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297543574
49	NC_014209	ATTTTA	2	12	77582	77593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297543575
50	NC_014209	TGAAAA	2	12	78451	78462	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543577
51	NC_014209	AAAAGC	2	12	78718	78729	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297543577
52	NC_014209	CTTCAG	2	12	78808	78819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297543577
53	NC_014209	AATCAT	2	12	79707	79718	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297543578
54	NC_014209	TAAGAT	2	12	79814	79825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297543578
55	NC_014209	CTGATT	2	12	80177	80188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	297543578
56	NC_014209	AAGTAA	2	12	81046	81057	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543579
57	NC_014209	ACGGCT	2	12	81412	81423	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297543579
58	NC_014209	CTACAC	2	12	87687	87698	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	297543587
59	NC_014209	AGAGTA	2	12	88589	88600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543587
60	NC_014209	AGTGGA	2	12	90723	90734	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297543587
61	NC_014209	TACAGT	2	12	91459	91470	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297543587
62	NC_014209	TTATTG	2	12	91488	91499	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297543587
63	NC_014209	GATAAA	2	12	92718	92729	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543588
64	NC_014209	AAAAAG	2	12	92734	92745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297543588
65	NC_014209	GAAAAA	2	12	92970	92981	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297543588
66	NC_014209	AAATTC	2	12	93672	93683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297543589
67	NC_014209	AAGCGA	2	12	107132	107143	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014209	AAATTT	2	12	116888	116899	50 %	50 %	0 %	0 %	297543610
69	NC_014209	CTTCAA	2	12	120065	120076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297543613
70	NC_014209	ATTACA	2	12	123052	123063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	297543615
71	NC_014209	AATAGT	2	12	128654	128665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297543616
72	NC_014209	GAAATA	2	12	135817	135828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543622
73	NC_014209	GTAGAT	2	12	136539	136550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543623
74	NC_014209	ATGTTG	2	12	139114	139125	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	297543625
75	NC_014209	AAGCGA	2	12	142478	142489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014209	AAAAAG	2	12	146266	146277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	297543628
77	NC_014209	TTAAAA	2	12	147482	147493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297543630
78	NC_014209	TGTAGA	2	12	148441	148452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543631
79	NC_014209	ACTTGA	2	12	149660	149671	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297543632
80	NC_014209	AGAAAG	2	12	153185	153196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297543636
81	NC_014209	AAAGTG	2	12	155852	155863	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543640
82	NC_014209	TAAATT	2	12	157546	157557	50 %	50 %	0 %	0 %	297543642
83	NC_014209	TTGAAT	2	12	162040	162051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297543648
84	NC_014209	AGAATG	2	12	162666	162677	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543648
85	NC_014209	GTACAT	2	12	166747	166758	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297543651
86	NC_014209	AAACTG	2	12	168759	168770	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	297543653
87	NC_014209	TTTTAT	2	12	169354	169365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014209	AGCTTC	2	12	173672	173683	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	297543658
89	NC_014209	AAATTT	2	12	176918	176929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014209	ATATTG	2	12	178178	178189	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297543662
91	NC_014209	ATTAAT	2	12	178635	178646	50 %	50 %	0 %	0 %	297543663
92	NC_014209	TTTTAG	2	12	182384	182395	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297543668
93	NC_014209	TAGCTA	2	12	183372	183383	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297543670
94	NC_014209	TGAAGA	2	12	186481	186492	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543674
95	NC_014209	TATTTT	2	12	186944	186955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	297543674
96	NC_014209	CAGAAA	2	12	187679	187690	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297543675
97	NC_014209	GCAGGA	2	12	188629	188640	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	297543676
98	NC_014209	GCAATT	2	12	189993	190004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297543677
99	NC_014209	GCAAAA	2	12	191561	191572	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	297543679
100	NC_014209	TGGCAA	2	12	192630	192641	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297543680
101	NC_014209	AATATG	2	12	196645	196656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297543685
102	NC_014209	TAAAAA	2	12	197485	197496	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297543686
103	NC_014209	GTTTTG	2	12	204356	204367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297543691
104	NC_014209	AATAAA	2	12	205377	205388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	297543692
105	NC_014209	AGTAGG	2	12	206778	206789	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297543694
106	NC_014209	ATGTAA	2	12	216460	216471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	297543704
107	NC_014209	ATTTTG	2	12	216913	216924	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297543705
108	NC_014209	GGAGTA	2	12	218791	218802	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297543707
109	NC_014209	TAAATT	2	12	219213	219224	50 %	50 %	0 %	0 %	297543707
110	NC_014209	TGTAGC	2	12	221929	221940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	297543710
111	NC_014209	TGCTTG	2	12	222679	222690	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	297543711
112	NC_014209	GATAAA	2	12	225853	225864	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543714
113	NC_014209	AAAGGG	2	12	234160	234171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014209	AGATGA	2	12	237245	237256	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543724
115	NC_014209	AGTAAG	2	12	240675	240686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	297543727
116	NC_014209	ATGTTA	2	12	255511	255522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297543738
117	NC_014209	ATTTTG	2	12	256831	256842	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	297543738
118	NC_014209	ACAAAA	2	12	257410	257421	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	297543739
119	NC_014209	TTTGAA	2	12	257787	257798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	297543739
120	NC_014209	GAAATA	2	12	258513	258524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	297543740
121	NC_014209	ACTTTT	2	12	259868	259879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	297543740
122	NC_014209	TAAATT	2	12	260522	260533	50 %	50 %	0 %	0 %	297543741
123	NC_014209	ATATTA	2	12	265155	265166	50 %	50 %	0 %	0 %	297543743
124	NC_014209	CACCAA	2	12	266601	266612	50 %	0 %	0 %	50 %	297543743
125	NC_014209	TAATTT	2	12	269052	269063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014209	TGGAAT	2	12	275568	275579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297543749
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240	NC_014209	GACTGT	2	12	542339	542350	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	297543979
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