MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014205	TTTATA	2	12	31793	31804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014205	TAGATC	2	12	68547	68558	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014205	TAAAGT	2	12	84255	84266	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014205	GGCTTT	2	12	92076	92087	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014205	GTAATG	2	12	98889	98900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014205	TAGTGA	2	12	99415	99426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014205	TTGTTT	2	12	117169	117180	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014205	TTTTAT	2	12	117203	117214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014205	ATGAAA	2	12	135052	135063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014205	CTTGTT	2	12	141740	141751	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014205	TATGTT	2	12	159061	159072	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014205	TGAGCG	2	12	161608	161619	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014205	AATTAT	2	12	186000	186011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014205	AATATA	2	12	187603	187614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014205	ATATTA	2	12	211337	211348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014205	CAATAA	2	12	237701	237712	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014205	ACCAAT	2	12	264944	264955	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014205	AAACCA	2	12	265786	265797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014205	AACATA	2	12	340050	340061	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014205	TTTTTA	2	12	354923	354934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014205	ACTATA	2	12	368747	368758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014205	CTCCTT	2	12	398995	399006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014205	AGTAGC	2	12	403206	403217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014205	AATAGT	2	12	422992	423003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014205	CAAACC	2	12	432739	432750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014205	AAAGCA	2	12	435975	435986	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014205	ACTATA	2	12	475109	475120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014205	TAACAA	2	12	532316	532327	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014205	ATTATC	2	12	534600	534611	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014205	GTGTCT	2	12	541568	541579	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014205	TTTTTG	2	12	542122	542133	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014205	AAAAGA	2	12	543568	543579	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014205	ATTTTT	2	12	548797	548808	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014205	CCTATT	2	12	569206	569217	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014205	TTTCAA	2	12	600856	600867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014205	CAAAAC	2	12	632433	632444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014205	TCATAT	2	12	656596	656607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014205	TATTTT	2	12	702749	702760	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014205	ACTATA	2	12	716008	716019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014205	CGAACA	2	12	716124	716135	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014205	TAACAT	2	12	716988	716999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014205	AATATA	2	12	749114	749125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014205	ATTTTT	2	12	774989	775000	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014205	GATAAT	2	12	776583	776594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014205	AAACAA	2	12	814033	814044	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014205	ATACGT	2	12	830066	830077	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014205	TATGAG	2	12	963370	963381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014205	TTAATG	2	12	989029	989040	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014205	TAAATG	2	12	1010236	1010247	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014205	GAGTTG	2	12	1049551	1049562	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014205	TGGTAT	2	12	1070324	1070335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014205	GATTAT	2	12	1080085	1080096	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014205	GTAGTT	2	12	1080410	1080421	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014205	GTTGTA	2	12	1080440	1080451	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014205	GTCGTG	2	12	1080569	1080580	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014205	GTAGTT	2	12	1080590	1080601	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014205	GTTGTA	2	12	1080617	1080628	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014205	GTGGTT	2	12	1080647	1080658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014205	TGGTAG	2	12	1080777	1080788	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014205	ACAAGT	2	12	1082072	1082083	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014205	AAAAAG	2	12	1137666	1137677	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014205	AGAATA	2	12	1137845	1137856	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014205	TATTCA	2	12	1193394	1193405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014205	GTAATA	2	12	1197690	1197701	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014205	GTTATT	2	12	1209687	1209698	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014205	ATAACA	2	12	1218394	1218405	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014205	TTTCTA	2	12	1221364	1221375	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014205	CTCTTC	2	12	1237120	1237131	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014205	TGTTTT	2	12	1242327	1242338	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014205	TTCCCC	2	12	1268407	1268418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014205	CCTACG	2	12	1269222	1269233	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014205	CGGAGC	2	12	1270834	1270845	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014205	TTTATT	2	12	1272622	1272633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014205	AAATTA	2	12	1284124	1284135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014205	GGTTGA	2	12	1318501	1318512	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014205	AAACAA	2	12	1338696	1338707	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014205	TAGTAA	2	12	1347449	1347460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014205	TCCTAA	2	12	1356679	1356690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014205	TATCTT	2	12	1482533	1482544	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014205	CTTCAA	2	12	1542623	1542634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014205	TTACAT	2	12	1543120	1543131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014205	GTAGGG	2	12	1553290	1553301	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.