MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylothermus hellenicus DSM 12710 chromosome

Total Repeats: 1104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014205	AAAAC	2	10	1204	1213	80 %	0 %	0 %	20 %	297526029
2	NC_014205	ATGCA	2	10	1513	1522	40 %	20 %	20 %	20 %	297526030
3	NC_014205	ATACT	2	10	3114	3123	40 %	40 %	0 %	20 %	297526031
4	NC_014205	TTCAT	2	10	4293	4302	20 %	60 %	0 %	20 %	297526032
5	NC_014205	AATAT	2	10	4587	4596	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014205	TCTCA	2	10	6785	6794	20 %	40 %	0 %	40 %	297526034
7	NC_014205	CTATA	2	10	10378	10387	40 %	40 %	0 %	20 %	297526039
8	NC_014205	GCATA	2	10	11105	11114	40 %	20 %	20 %	20 %	297526040
9	NC_014205	TTGTA	2	10	12321	12330	20 %	60 %	20 %	0 %	297526041
10	NC_014205	TTACT	2	10	12486	12495	20 %	60 %	0 %	20 %	297526041
11	NC_014205	TTAAC	2	10	14489	14498	40 %	40 %	0 %	20 %	297526042
12	NC_014205	CCCTT	2	10	18331	18340	0 %	40 %	0 %	60 %	297526047
13	NC_014205	TATTG	2	10	23147	23156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014205	AAACT	2	10	23729	23738	60 %	20 %	0 %	20 %	297526053
15	NC_014205	TTTCC	2	10	24447	24456	0 %	60 %	0 %	40 %	297526054
16	NC_014205	CCTTA	2	10	26634	26643	20 %	40 %	0 %	40 %	297526056
17	NC_014205	TCATC	2	10	26657	26666	20 %	40 %	0 %	40 %	297526056
18	NC_014205	TTTCA	2	10	26769	26778	20 %	60 %	0 %	20 %	297526056
19	NC_014205	ATGAG	2	10	31583	31592	40 %	20 %	40 %	0 %	297526060
20	NC_014205	AAACC	2	10	34002	34011	60 %	0 %	0 %	40 %	297526064
21	NC_014205	TTTAT	2	10	35556	35565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014205	GTGAA	2	10	36285	36294	40 %	20 %	40 %	0 %	297526067
23	NC_014205	ATACT	2	10	38334	38343	40 %	40 %	0 %	20 %	297526069
24	NC_014205	ATATT	2	10	39168	39177	40 %	60 %	0 %	0 %	297526070
25	NC_014205	AAAAT	2	10	41403	41412	80 %	20 %	0 %	0 %	297526073
26	NC_014205	TCAGG	2	10	42384	42393	20 %	20 %	40 %	20 %	297526074
27	NC_014205	AGCAT	2	10	42870	42879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014205	AAATA	2	10	43733	43742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014205	ATCCC	2	10	44594	44603	20 %	20 %	0 %	60 %	297526077
30	NC_014205	CTCTT	2	10	45846	45855	0 %	60 %	0 %	40 %	297526077
31	NC_014205	GGGGT	2	10	46052	46061	0 %	20 %	80 %	0 %	297526077
32	NC_014205	TATAC	2	10	47873	47882	40 %	40 %	0 %	20 %	297526079
33	NC_014205	ATTCT	2	10	49786	49795	20 %	60 %	0 %	20 %	297526081
34	NC_014205	TTATC	2	10	49967	49976	20 %	60 %	0 %	20 %	297526082
35	NC_014205	CTTGT	2	10	50388	50397	0 %	60 %	20 %	20 %	297526082
36	NC_014205	AGCAT	2	10	53542	53551	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014205	AGGAA	2	10	56018	56027	60 %	0 %	40 %	0 %	297526090
38	NC_014205	TTCTA	2	10	62059	62068	20 %	60 %	0 %	20 %	297526098
39	NC_014205	CAGCG	2	10	62776	62785	20 %	0 %	40 %	40 %	297526098
40	NC_014205	CTCTG	2	10	63164	63173	0 %	40 %	20 %	40 %	297526098
41	NC_014205	TTTCA	2	10	66596	66605	20 %	60 %	0 %	20 %	297526103
42	NC_014205	AGTAT	2	10	66968	66977	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014205	AGTGG	2	10	67863	67872	20 %	20 %	60 %	0 %	297526104
44	NC_014205	ATAAA	2	10	68373	68382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014205	ATTAT	2	10	70133	70142	40 %	60 %	0 %	0 %	297526105
46	NC_014205	ATATT	2	10	70573	70582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014205	CATTC	2	10	75134	75143	20 %	40 %	0 %	40 %	297526110
48	NC_014205	ATGGT	2	10	77944	77953	20 %	40 %	40 %	0 %	297526113
49	NC_014205	CCCAG	2	10	79401	79410	20 %	0 %	20 %	60 %	297526115
50	NC_014205	TCTAC	2	10	80843	80852	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014205	CTAAT	2	10	81096	81105	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014205	TAACC	2	10	86760	86769	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014205	AGCCC	2	10	88583	88592	20 %	0 %	20 %	60 %	297526123
54	NC_014205	GCAGG	2	10	89639	89648	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014205	CCCGG	2	10	91554	91563	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_014205	GTTTT	2	10	92107	92116	0 %	80 %	20 %	0 %	297526129
57	NC_014205	ATATA	2	10	92290	92299	60 %	40 %	0 %	0 %	297526129
58	NC_014205	ATAAC	2	10	94430	94439	60 %	20 %	0 %	20 %	297526131
59	NC_014205	CTATG	2	10	94572	94581	20 %	40 %	20 %	20 %	297526131
60	NC_014205	TCAGC	2	10	96901	96910	20 %	20 %	20 %	40 %	297526133
61	NC_014205	GATAG	2	10	97595	97604	40 %	20 %	40 %	0 %	297526133
62	NC_014205	CATTA	2	10	97854	97863	40 %	40 %	0 %	20 %	297526133
63	NC_014205	TCAAA	2	10	97974	97983	60 %	20 %	0 %	20 %	297526133
64	NC_014205	AAAAG	2	10	98161	98170	80 %	0 %	20 %	0 %	297526133
65	NC_014205	TTAAA	2	10	98316	98325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014205	TTATT	2	10	98950	98959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014205	ATTTC	2	10	99108	99117	20 %	60 %	0 %	20 %	297526134
68	NC_014205	ATAGC	2	10	99951	99960	40 %	20 %	20 %	20 %	297526136
69	NC_014205	TACAA	2	10	102807	102816	60 %	20 %	0 %	20 %	297526138
70	NC_014205	CAATA	2	10	103622	103631	60 %	20 %	0 %	20 %	297526139
71	NC_014205	CAAGT	2	10	104516	104525	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014205	TGCAG	2	10	104611	104620	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014205	GCTTA	2	10	105348	105357	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014205	TTAGG	2	10	107258	107267	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014205	TAATA	2	10	109404	109413	60 %	40 %	0 %	0 %	297526144
76	NC_014205	TGTAT	2	10	109471	109480	20 %	60 %	20 %	0 %	297526144
77	NC_014205	TACAC	2	10	109500	109509	40 %	20 %	0 %	40 %	297526144
78	NC_014205	TTTTA	2	10	111299	111308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014205	TGCGG	2	10	113947	113956	0 %	20 %	60 %	20 %	297526147
80	NC_014205	ATAAA	2	10	115344	115353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014205	ATATT	2	10	115450	115459	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014205	AGCTT	2	10	115999	116008	20 %	40 %	20 %	20 %	297526149
83	NC_014205	TTCTA	2	10	116493	116502	20 %	60 %	0 %	20 %	297526149
84	NC_014205	TTTTG	2	10	117229	117238	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014205	GTTGG	2	10	117391	117400	0 %	40 %	60 %	0 %	297526150
86	NC_014205	CTCGT	2	10	122733	122742	0 %	40 %	20 %	40 %	297526156
87	NC_014205	TAAAA	2	10	123889	123898	80 %	20 %	0 %	0 %	297526159
88	NC_014205	GCCAA	2	10	127251	127260	40 %	0 %	20 %	40 %	297526164
89	NC_014205	AGGAG	2	10	127384	127393	40 %	0 %	60 %	0 %	297526164
90	NC_014205	GAAAT	2	10	130630	130639	60 %	20 %	20 %	0 %	297526167
91	NC_014205	AGCTA	2	10	131647	131656	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014205	TTCCA	2	10	132713	132722	20 %	40 %	0 %	40 %	297526170
93	NC_014205	TTTTA	2	10	134900	134909	20 %	80 %	0 %	0 %	297526173
94	NC_014205	CTATG	2	10	138079	138088	20 %	40 %	20 %	20 %	297526178
95	NC_014205	TAGCA	2	10	140750	140759	40 %	20 %	20 %	20 %	297526181
96	NC_014205	AGCTC	2	10	141249	141258	20 %	20 %	20 %	40 %	297526181
97	NC_014205	GTTTA	2	10	144848	144857	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014205	GAGCC	2	10	146333	146342	20 %	0 %	40 %	40 %	297526185
99	NC_014205	CTTCT	2	10	148525	148534	0 %	60 %	0 %	40 %	297526188
100	NC_014205	CAATC	2	10	149629	149638	40 %	20 %	0 %	40 %	297526189
101	NC_014205	GTTTC	2	10	153193	153202	0 %	60 %	20 %	20 %	297526193
102	NC_014205	ATAGA	2	10	155878	155887	60 %	20 %	20 %	0 %	297526196
103	NC_014205	TAAAC	2	10	156919	156928	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014205	TAAAA	2	10	159014	159023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014205	GGTAG	2	10	159531	159540	20 %	20 %	60 %	0 %	297526202
106	NC_014205	ACATA	2	10	161158	161167	60 %	20 %	0 %	20 %	297526204
107	NC_014205	AACAA	2	10	162367	162376	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014205	TAGCC	2	10	162438	162447	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014205	TAAAA	2	10	163007	163016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014205	CAATC	2	10	163644	163653	40 %	20 %	0 %	40 %	297526206
111	NC_014205	AGCCT	2	10	164004	164013	20 %	20 %	20 %	40 %	297526207
112	NC_014205	ATTTT	2	10	167675	167684	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014205	TGTTT	2	10	168481	168490	0 %	80 %	20 %	0 %	297526210
114	NC_014205	GGGGA	2	10	168720	168729	20 %	0 %	80 %	0 %	297526210
115	NC_014205	GGATG	2	10	168755	168764	20 %	20 %	60 %	0 %	297526210
116	NC_014205	TTATC	2	10	169394	169403	20 %	60 %	0 %	20 %	297526211
117	NC_014205	AGGAG	2	10	169675	169684	40 %	0 %	60 %	0 %	297526211
118	NC_014205	GGAAA	2	10	170497	170506	60 %	0 %	40 %	0 %	297526212
119	NC_014205	AAAAC	2	10	170617	170626	80 %	0 %	0 %	20 %	297526212
120	NC_014205	ACACA	2	10	170755	170764	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_014205	TTTGT	2	10	171138	171147	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014205	TTTTA	2	10	171334	171343	20 %	80 %	0 %	0 %	297526213
123	NC_014205	TATAG	2	10	176341	176350	40 %	40 %	20 %	0 %	297526216
124	NC_014205	ATAGA	2	10	176455	176464	60 %	20 %	20 %	0 %	297526216
125	NC_014205	CTTCT	2	10	176579	176588	0 %	60 %	0 %	40 %	297526216
126	NC_014205	AGAAT	2	10	177526	177535	60 %	20 %	20 %	0 %	297526216
127	NC_014205	ATAGA	2	10	178702	178711	60 %	20 %	20 %	0 %	297526217
128	NC_014205	ATCAA	2	10	179567	179576	60 %	20 %	0 %	20 %	297526217
129	NC_014205	ATCTT	2	10	180509	180518	20 %	60 %	0 %	20 %	297526217
130	NC_014205	AGATG	2	10	185734	185743	40 %	20 %	40 %	0 %	297526219
131	NC_014205	TAATA	2	10	187720	187729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014205	AAATT	2	10	188390	188399	60 %	40 %	0 %	0 %	297526223
133	NC_014205	GAATA	2	10	188536	188545	60 %	20 %	20 %	0 %	297526223
134	NC_014205	AACTG	2	10	189129	189138	40 %	20 %	20 %	20 %	297526225
135	NC_014205	CTATA	2	10	192851	192860	40 %	40 %	0 %	20 %	297526227
136	NC_014205	ATTTA	2	10	193836	193845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014205	AAGAT	2	10	194002	194011	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014205	GAGAG	2	10	195741	195750	40 %	0 %	60 %	0 %	297526228
139	NC_014205	TTCTC	2	10	198060	198069	0 %	60 %	0 %	40 %	297526230
140	NC_014205	ATAGT	2	10	198789	198798	40 %	40 %	20 %	0 %	297526231
141	NC_014205	CATAA	2	10	199018	199027	60 %	20 %	0 %	20 %	297526231
142	NC_014205	ATTCC	2	10	199574	199583	20 %	40 %	0 %	40 %	297526232
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146	NC_014205	GAAGA	2	10	206678	206687	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014205	GAAGA	2	10	207501	207510	60 %	0 %	40 %	0 %	297526240
148	NC_014205	TGAGA	2	10	208095	208104	40 %	20 %	40 %	0 %	297526240
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152	NC_014205	CATAT	2	10	212692	212701	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_014205	TTATT	2	10	219193	219202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014205	GTATA	2	10	219577	219586	40 %	40 %	20 %	0 %	297526251
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250	NC_014205	GCTTA	2	10	353740	353749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
251	NC_014205	ATATT	2	10	354135	354144	40 %	60 %	0 %	0 %	297526402
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256	NC_014205	ACTAT	2	10	362986	362995	40 %	40 %	0 %	20 %	297526411
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266	NC_014205	AGCTC	2	10	370959	370968	20 %	20 %	20 %	40 %	297526420
267	NC_014205	TGCTT	2	10	371169	371178	0 %	60 %	20 %	20 %	297526420
268	NC_014205	TTCTT	2	10	372531	372540	0 %	80 %	0 %	20 %	297526422
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443	NC_014205	ATATA	2	10	619453	619462	60 %	40 %	0 %	0 %	297526663
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