MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014172	GAATTA	2	12	622	633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296506383
2	NC_014172	ACCAGC	2	12	7957	7968	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296506390
3	NC_014172	CTTTTG	2	12	8751	8762	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296506390
4	NC_014172	ATTAAG	2	12	9071	9082	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296506391
5	NC_014172	AATGGA	2	12	10905	10916	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296506394
6	NC_014172	TGGGAT	2	12	11868	11879	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296506395
7	NC_014172	GACTGT	2	12	20353	20364	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296506403
8	NC_014172	GAAGGA	2	12	20855	20866	50 %	0 %	50 %	0 %	296506403
9	NC_014172	AGTTAA	2	12	21972	21983	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296506404
10	NC_014172	ATGAAC	2	12	24537	24548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296506407
11	NC_014172	ATTTGT	2	12	25384	25395	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296506407
12	NC_014172	TTTTTC	2	12	26531	26542	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296506410
13	NC_014172	TTTTTC	2	12	28652	28663	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296506412
14	NC_014172	CTTACA	2	12	30383	30394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506413
15	NC_014172	TAATCC	2	12	30466	30477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506413
16	NC_014172	AAATTT	2	12	35370	35381	50 %	50 %	0 %	0 %	296506415
17	NC_014172	CAAAAA	2	12	39709	39720	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	296506423
18	NC_014172	CAAAAA	2	12	40394	40405	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	296506425
19	NC_014172	TTAACA	2	12	42808	42819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506428
20	NC_014172	TTAGAT	2	12	45330	45341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296506432
21	NC_014172	AGGCTT	2	12	48909	48920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296506438
22	NC_014172	GAAACT	2	12	49410	49421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296506438
23	NC_014172	AATATC	2	12	52169	52180	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506441
24	NC_014172	ATCTGC	2	12	53666	53677	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296506442
25	NC_014172	CATTAA	2	12	53874	53885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506443
26	NC_014172	TTTTTC	2	12	55611	55622	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296506445
27	NC_014172	GTTACT	2	12	60437	60448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296506452
28	NC_014172	CTTTTT	2	12	61201	61212	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296506452
29	NC_014172	GCTTCT	2	12	62257	62268	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	296506453
30	NC_014172	CGCTTC	2	12	62352	62363	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296506453
31	NC_014172	CGCTTC	2	12	62544	62555	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296506453
32	NC_014172	CGCTTC	2	12	62595	62606	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296506453
33	NC_014172	CGCTTC	2	12	62883	62894	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296506453
34	NC_014172	AATTAT	2	12	65181	65192	50 %	50 %	0 %	0 %	296506456
35	NC_014172	AATATC	2	12	74084	74095	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506461
36	NC_014172	ATTATA	2	12	75995	76006	50 %	50 %	0 %	0 %	296506462
37	NC_014172	GAAATT	2	12	76344	76355	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296506462
38	NC_014172	TTCTAT	2	12	76787	76798	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296506462
39	NC_014172	AAACTA	2	12	79001	79012	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296506465
40	NC_014172	TCATTT	2	12	81854	81865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296506467
41	NC_014172	TTCATT	2	12	83764	83775	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296506469
42	NC_014172	ATGAAG	2	12	85341	85352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296506470
43	NC_014172	GATTTT	2	12	87972	87983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296506471
44	NC_014172	TCATTT	2	12	90786	90797	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296506472
45	NC_014172	TATTTT	2	12	95018	95029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	296506474
46	NC_014172	GTTGGC	2	12	96850	96861	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296506475
47	NC_014172	TTTTCT	2	12	98087	98098	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296506476
48	NC_014172	CGAGTT	2	12	98129	98140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296506476
49	NC_014172	CTTGTT	2	12	99165	99176	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296506476
50	NC_014172	TGAAAA	2	12	100944	100955	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296506477
51	NC_014172	TATTTC	2	12	101040	101051	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296506477
52	NC_014172	GAAATT	2	12	102194	102205	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296506477
53	NC_014172	AGGATA	2	12	104363	104374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296506478
54	NC_014172	TACACA	2	12	104431	104442	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296506478
55	NC_014172	TGGAAA	2	12	111332	111343	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296506485
56	NC_014172	AGAAAA	2	12	112618	112629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296506485
57	NC_014172	TGCATA	2	12	116136	116147	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296506488
58	NC_014172	GTATTC	2	12	116352	116363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296506488
59	NC_014172	AGCAAA	2	12	119945	119956	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296506492
60	NC_014172	ACTAAT	2	12	122780	122791	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506495
61	NC_014172	TTGTTA	2	12	124395	124406	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296506497
62	NC_014172	TTGAAG	2	12	128694	128705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506502
63	NC_014172	AAAAAT	2	12	129614	129625	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296506503
64	NC_014172	TTCATT	2	12	141755	141766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296506517
65	NC_014172	AGTAAA	2	12	146445	146456	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296506520
66	NC_014172	AAAAGA	2	12	148187	148198	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296506521
67	NC_014172	TGAAAA	2	12	154043	154054	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296506525
68	NC_014172	CATATT	2	12	159842	159853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296506534
69	NC_014172	TGAAAA	2	12	162010	162021	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296506536
70	NC_014172	TGGGAA	2	12	173751	173762	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296506546
71	NC_014172	AGAGTT	2	12	175324	175335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506548
72	NC_014172	TCCAAT	2	12	176675	176686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506549
73	NC_014172	AGAAAT	2	12	177551	177562	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296506550
74	NC_014172	AAGGAA	2	12	180174	180185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506550
75	NC_014172	ATTTGA	2	12	181097	181108	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296506550
76	NC_014172	GTTGGA	2	12	183029	183040	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296506550
77	NC_014172	AGAAAC	2	12	183266	183277	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296506550
78	NC_014172	AAATAA	2	12	183803	183814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296506550
79	NC_014172	GTTATA	2	12	183927	183938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296506550
80	NC_014172	GTTGGA	2	12	190695	190706	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296506551
81	NC_014172	CTTCTA	2	12	194057	194068	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	296506551
82	NC_014172	TTTCAA	2	12	195899	195910	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296506552
83	NC_014172	TTGATA	2	12	200962	200973	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296506557
84	NC_014172	TCTTAT	2	12	203468	203479	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296506560
85	NC_014172	TTGCAG	2	12	203822	203833	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296506560
86	NC_014172	TTTGTA	2	12	203902	203913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296506560
87	NC_014172	TATTTG	2	12	207530	207541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296506563
88	NC_014172	GAACAA	2	12	218241	218252	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296506572
89	NC_014172	CTGTAC	2	12	220286	220297	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296506574
90	NC_014172	TAAAGT	2	12	220667	220678	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296506575
91	NC_014172	TTACAA	2	12	221187	221198	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506576
92	NC_014172	TCAGCT	2	12	227078	227089	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296506584
93	NC_014172	TGCTCT	2	12	235413	235424	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	296506593
94	NC_014172	TAGCAT	2	12	238255	238266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296506595
95	NC_014172	CTCTAA	2	12	239362	239373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506596
96	NC_014172	TGTATA	2	12	253633	253644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296506610
97	NC_014172	CTTTTA	2	12	254802	254813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296506611
98	NC_014172	GAGCAG	2	12	260847	260858	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296506617
99	NC_014172	TCCTGC	2	12	265793	265804	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296506622
100	NC_014172	TTTTAC	2	12	266783	266794	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296506623
101	NC_014172	TTTTTC	2	12	266981	266992	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296506623
102	NC_014172	GGTCTA	2	12	270295	270306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296506625
103	NC_014172	CTATAA	2	12	274550	274561	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506630
104	NC_014172	CCAAAT	2	12	283821	283832	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296506634
105	NC_014172	TACAGG	2	12	284414	284425	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296506634
106	NC_014172	AATTCT	2	12	285093	285104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296506634
107	NC_014172	TCCAAA	2	12	285398	285409	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296506634
108	NC_014172	CAAGTA	2	12	286962	286973	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296506634
109	NC_014172	CCCGAA	2	12	286982	286993	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296506634
110	NC_014172	AATGCA	2	12	287724	287735	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296506634
111	NC_014172	TTACAA	2	12	291160	291171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506634
112	NC_014172	CGTCAC	2	12	292919	292930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296506634
113	NC_014172	ATTACA	2	12	296574	296585	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506634
114	NC_014172	ATGAAC	2	12	297909	297920	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296506635
115	NC_014172	TAACAA	2	12	304873	304884	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296506642
116	NC_014172	GTTTAT	2	12	306742	306753	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296506644
117	NC_014172	CAATAT	2	12	312115	312126	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296506652

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.