MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014172	CGGTT	2	10	24	33	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014172	AATAA	2	10	90	99	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014172	TTTAA	2	10	1980	1989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014172	AGTTA	2	10	2269	2278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014172	ATCTT	2	10	2699	2708	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014172	GTATA	2	10	12566	12575	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014172	TTTAT	2	10	18203	18212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014172	AAGAT	2	10	22866	22875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014172	ATCTT	2	10	22887	22896	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014172	TTTGA	2	10	23681	23690	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014172	ATTTG	2	10	27071	27080	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014172	CATAA	2	10	44080	44089	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014172	CTATG	2	10	44288	44297	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014172	AAAAT	2	10	44302	44311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014172	CTCAA	2	10	46879	46888	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014172	TTATG	2	10	58056	58065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014172	ATTTT	2	10	58735	58744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014172	CAAAA	2	10	59369	59378	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014172	AATTA	2	10	63307	63316	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014172	TCATT	2	10	75286	75295	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014172	ATTAA	2	10	75498	75507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014172	TTTTA	2	10	77591	77600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014172	TTTCA	2	10	83129	83138	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014172	AATAT	2	10	83457	83466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014172	TTTCA	2	10	84718	84727	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014172	TTTAA	2	10	91221	91230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014172	TAATT	2	10	94726	94735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014172	ATATA	2	10	94761	94770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014172	TACAA	2	10	99582	99591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014172	TAAAA	2	10	100695	100704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014172	ATTTC	2	10	103215	103224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014172	TTAGT	2	10	105295	105304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014172	AAGGT	2	10	109602	109611	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014172	ATAAG	2	10	116694	116703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014172	AACTT	2	10	118747	118756	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014172	ATTTT	2	10	118775	118784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014172	GATAT	2	10	120654	120663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014172	TATGT	2	10	121895	121904	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014172	TTTTG	2	10	122913	122922	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014172	GATAA	2	10	124625	124634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014172	AAAAG	2	10	127677	127686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014172	TTTTA	2	10	130662	130671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014172	AAATC	2	10	130673	130682	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014172	AGGAA	2	10	131897	131906	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014172	AAAAG	2	10	133119	133128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014172	CAATA	2	10	133389	133398	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014172	TAAAG	2	10	135810	135819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014172	TTTAA	2	10	143010	143019	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014172	TTTAA	2	10	145975	145984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014172	ATTTT	2	10	147217	147226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014172	TTTTA	2	10	147234	147243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014172	TTTAT	2	10	155377	155386	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014172	TTAGA	2	10	156011	156020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014172	TTTTG	2	10	160884	160893	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014172	TTATG	2	10	162247	162256	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014172	ATACT	2	10	168309	168318	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014172	TTTTC	2	10	200569	200578	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014172	TGTTT	2	10	200747	200756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014172	TTATT	2	10	200913	200922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014172	AAAGA	2	10	207132	207141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014172	TCTAT	2	10	208575	208584	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014172	TAATG	2	10	209651	209660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014172	AGTAT	2	10	210302	210311	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014172	TAAAA	2	10	211044	211053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014172	AAAAT	2	10	211361	211370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014172	TAGTA	2	10	211586	211595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014172	GTAAT	2	10	216131	216140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014172	TTTTA	2	10	217486	217495	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014172	AAGCT	2	10	219185	219194	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014172	AGTTA	2	10	219498	219507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014172	TGTAT	2	10	219538	219547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014172	CTAAA	2	10	220026	220035	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014172	GGGAT	2	10	236311	236320	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014172	GTTTT	2	10	236578	236587	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014172	CAAAA	2	10	236688	236697	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014172	ATTAA	2	10	238360	238369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014172	TTTAG	2	10	242192	242201	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014172	TCCCT	2	10	249603	249612	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_014172	ATTTT	2	10	249812	249821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014172	TTTTA	2	10	252105	252114	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014172	CTTTA	2	10	252931	252940	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014172	AAACC	2	10	255194	255203	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_014172	GGTTT	2	10	255230	255239	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014172	TTAAA	2	10	258197	258206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014172	CTTCT	2	10	260674	260683	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014172	ATACC	2	10	262090	262099	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014172	CTAAA	2	10	262767	262776	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014172	GTTTG	2	10	265123	265132	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014172	GTCTT	2	10	265484	265493	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014172	TTTTA	2	10	265495	265504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014172	TATTC	2	10	270527	270536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014172	TTTAG	2	10	272500	272509	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014172	TGTAC	2	10	272529	272538	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014172	AAAAT	2	10	273311	273320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014172	AATAA	2	10	274830	274839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014172	TTTAG	2	10	274982	274991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014172	AAAGA	2	10	275117	275126	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014172	TTTAG	2	10	279404	279413	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014172	AACTT	2	10	280186	280195	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014172	GAAAA	2	10	297662	297671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014172	AAAAT	2	10	297780	297789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014172	TTAAC	2	10	299302	299311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014172	TTTTG	2	10	302426	302435	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014172	AACAA	2	10	304140	304149	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014172	CTTTT	2	10	304438	304447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014172	ATCTC	2	10	305311	305320	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014172	ATTAA	2	10	309823	309832	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014172	ATAAG	2	10	312306	312315	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.