MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 chromosome

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014171	CTATTA	2	12	1730	1741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014171	TTTCGT	2	12	10787	10798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014171	TTTCGT	2	12	30754	30765	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014171	TTTTCC	2	12	54670	54681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014171	TTATAT	2	12	82374	82385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014171	TATATT	2	12	82469	82480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014171	TTTCGT	2	12	84266	84277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014171	TTTCGT	2	12	90427	90438	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014171	AGTCAA	2	12	94246	94257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014171	AAGAGA	2	12	115168	115179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014171	TTTCGT	2	12	154095	154106	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014171	GTATGT	2	12	176086	176097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014171	AAAATA	2	12	209472	209483	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014171	AAGGGG	2	12	209555	209566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014171	AGAGGT	2	12	212937	212948	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014171	TTCATA	2	12	214535	214546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014171	CCCGAC	2	12	217371	217382	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014171	TTTCGT	2	12	248609	248620	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014171	TTTCGT	2	12	273368	273379	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014171	TTTCGT	2	12	281093	281104	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014171	TTTCGT	2	12	291955	291966	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014171	AGTATT	2	12	303753	303764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014171	TTTCGT	2	12	305703	305714	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014171	TTTATT	2	12	309377	309388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014171	TTTCGT	2	12	313262	313273	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014171	TATAAA	2	12	348136	348147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014171	AAAAAT	2	12	364675	364686	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014171	ATTTGA	2	12	366513	366524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014171	AATGAT	2	12	385200	385211	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014171	ATACTT	2	12	391022	391033	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014171	TACATA	2	12	441295	441306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014171	TAAAAA	2	12	443800	443811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014171	AAAAAT	2	12	445167	445178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014171	ATTTTT	2	12	469885	469896	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014171	CCAATT	2	12	475832	475843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014171	TTTTCT	2	12	491889	491900	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014171	CAAAAA	2	12	492261	492272	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014171	AATGAA	2	12	504638	504649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014171	TTTCGT	2	12	530766	530777	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014171	ATCATT	2	12	549321	549332	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014171	TGTATA	2	12	601357	601368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014171	AAAGTA	2	12	602947	602958	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014171	ATTTAT	2	12	609200	609211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014171	TAAAAT	2	12	619143	619154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014171	ATGAAA	2	12	639033	639044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014171	AAGAGT	2	12	656361	656372	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014171	GTTTTT	2	12	681495	681506	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014171	ACGATA	2	12	682751	682762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014171	GAAATA	2	12	690572	690583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014171	ATTATG	2	12	690632	690643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014171	ATTTTT	2	12	692400	692411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014171	ACTTAA	2	12	705762	705773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014171	CTTTTT	2	12	717396	717407	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014171	TTAAAA	2	12	727288	727299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014171	TTTCGT	2	12	735716	735727	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014171	AAAGTT	2	12	759517	759528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014171	ATCAAT	2	12	779006	779017	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014171	AAAAAT	2	12	785661	785672	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014171	GTATAT	2	12	786077	786088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014171	ACATTT	2	12	792057	792068	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014171	ATAAGT	2	12	792131	792142	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014171	ATGTAA	2	12	808651	808662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014171	TTAAAG	2	12	823705	823716	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014171	AAATGT	2	12	852257	852268	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014171	ACGAGA	2	12	852306	852317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014171	GTTTTT	2	12	857883	857894	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014171	GTATAT	2	12	871549	871560	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014171	ATTACC	2	12	882488	882499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014171	TATGAA	2	12	895424	895435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014171	TGGGAG	2	12	908266	908277	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014171	AATATT	2	12	914569	914580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014171	GAAGTA	2	12	922527	922538	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014171	GAAAAT	2	12	924962	924973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014171	TTTTAT	2	12	925152	925163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014171	GAATTA	2	12	951218	951229	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014171	TTTTTA	2	12	951714	951725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014171	GAAAGT	2	12	958408	958419	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014171	TTTCTT	2	12	968491	968502	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014171	CTTTTT	2	12	968507	968518	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014171	ATTAAA	2	12	993876	993887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014171	TACTTT	2	12	1003190	1003201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014171	AATTTT	2	12	1009004	1009015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014171	TCTTTT	2	12	1024680	1024691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014171	AAGAGG	2	12	1031738	1031749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014171	ATACAT	2	12	1041134	1041145	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014171	AAACAA	2	12	1053376	1053387	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014171	AGATAA	2	12	1056499	1056510	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014171	CTTTTC	2	12	1076126	1076137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014171	AAAAAG	2	12	1081017	1081028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014171	TAATAT	2	12	1081645	1081656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014171	TCCATT	2	12	1082939	1082950	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014171	ATTAAC	2	12	1094693	1094704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014171	ATAAAT	2	12	1094730	1094741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014171	GATCAA	2	12	1097416	1097427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014171	GTCTAA	2	12	1161222	1161233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014171	AAATAT	2	12	1173597	1173608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014171	GAAATA	2	12	1181300	1181311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014171	TTAAAA	2	12	1190987	1190998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014171	AGCGAA	2	12	1199978	1199989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014171	TTGAAA	2	12	1202923	1202934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014171	AAGTAT	2	12	1210654	1210665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014171	AGAACA	2	12	1211798	1211809	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014171	AGAACC	2	12	1211903	1211914	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014171	CAGTAA	2	12	1235758	1235769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014171	ATTTGA	2	12	1256725	1256736	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014171	TTACGT	2	12	1257846	1257857	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014171	GGAGAG	2	12	1259949	1259960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014171	AAATAA	2	12	1262366	1262377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014171	AAAGAA	2	12	1263171	1263182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014171	TAAGTT	2	12	1275111	1275122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014171	TTTTCT	2	12	1296265	1296276	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014171	AATGAT	2	12	1310937	1310948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014171	AGGATA	2	12	1316740	1316751	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014171	AAAAGT	2	12	1328832	1328843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014171	TTTACT	2	12	1336385	1336396	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014171	AATAAA	2	12	1337729	1337740	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014171	TCTTTT	2	12	1359917	1359928	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014171	ATACAA	2	12	1385616	1385627	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014171	GTATAT	2	12	1412284	1412295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014171	TTTATT	2	12	1419804	1419815	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014171	TTATCA	2	12	1422451	1422462	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014171	AATAAA	3	18	1453621	1453638	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014171	CAAATT	2	12	1459427	1459438	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014171	AAATGT	2	12	1509462	1509473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014171	TTTTCG	2	12	1513747	1513758	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014171	GATTGG	2	12	1534822	1534833	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014171	AGTTAC	2	12	1550843	1550854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014171	TATTCA	2	12	1551183	1551194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014171	TTGGAT	2	12	1559941	1559952	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014171	TACTTG	2	12	1559966	1559977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014171	TTTGGA	2	12	1561530	1561541	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014171	AGAATT	2	12	1561835	1561846	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014171	AATATT	2	12	1600725	1600736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014171	AATATT	2	12	1611796	1611807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014171	AAAAAC	2	12	1611961	1611972	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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150	NC_014171	TATGGA	2	12	1799278	1799289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_014171	ACCATT	2	12	2784021	2784032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_014171	GTAAAA	2	12	2795045	2795056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
251	NC_014171	TTTTCT	2	12	2811971	2811982	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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253	NC_014171	AATGCA	2	12	2833400	2833411	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_014171	CATAAA	2	12	2856513	2856524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_014171	TTATTC	2	12	2856641	2856652	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_014171	ATGATT	2	12	2870486	2870497	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_014171	GTAATT	2	12	2883061	2883072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.