MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 chromosome

Total Repeats: 2051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014171	TAGCTG	2	12	683	694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296500839
2	NC_014171	TCTTTG	2	12	3537	3548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296500842
3	NC_014171	TGGCGG	2	12	4792	4803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296500843
4	NC_014171	TGCACG	2	12	5617	5628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296500843
5	NC_014171	CCGATG	2	12	5970	5981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296500843
6	NC_014171	TGAAGA	2	12	7964	7975	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500844
7	NC_014171	GAACTG	2	12	17851	17862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500847
8	NC_014171	AAAGAT	2	12	18131	18142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296500847
9	NC_014171	CAGGAA	2	12	19079	19090	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296500848
10	NC_014171	ACAGGA	2	12	21061	21072	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296500850
11	NC_014171	CAAGAT	2	12	24649	24660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500855
12	NC_014171	TGCACA	2	12	35381	35392	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296500862
13	NC_014171	CGTATA	2	12	36016	36027	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296500862
14	NC_014171	AGCTTT	2	12	37520	37531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296500864
15	NC_014171	AAATGA	2	12	38107	38118	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296500865
16	NC_014171	TGTAGA	2	12	38212	38223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500865
17	NC_014171	TGGAAG	2	12	43407	43418	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296500870
18	NC_014171	GCACGT	2	12	52667	52678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296500881
19	NC_014171	AAGCAA	2	12	55143	55154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296500886
20	NC_014171	ATTAAC	2	12	57059	57070	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296500886
21	NC_014171	TTTCAT	2	12	59557	59568	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296500888
22	NC_014171	TTTAGG	2	12	60806	60817	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296500889
23	NC_014171	TATTGA	2	12	66661	66672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296500895
24	NC_014171	CAGGTA	2	12	70427	70438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500898
25	NC_014171	TGTCGG	2	12	70521	70532	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296500898
26	NC_014171	GGTGTT	2	12	73232	73243	0 %	50 %	50 %	0 %	296500900
27	NC_014171	AAAGTA	2	12	73427	73438	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296500900
28	NC_014171	CTGGTG	2	12	74294	74305	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296500901
29	NC_014171	CAAGGT	2	12	77907	77918	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500905
30	NC_014171	GTATCT	2	12	79498	79509	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296500908
31	NC_014171	ATATCA	2	12	80785	80796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296500912
32	NC_014171	CAAATA	2	12	95126	95137	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296500914
33	NC_014171	GTGAAG	2	12	96886	96897	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296500916
34	NC_014171	ATGCAA	2	12	99219	99230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500917
35	NC_014171	AGAGGC	2	12	101146	101157	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296500918
36	NC_014171	AGAGGT	2	12	102161	102172	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296500919
37	NC_014171	CAGATG	2	12	103720	103731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500921
38	NC_014171	GCAGTA	2	12	104774	104785	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500922
39	NC_014171	GTAGAA	2	12	111275	111286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500930
40	NC_014171	TCTGGT	2	12	112105	112116	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	296500931
41	NC_014171	GAAGCT	2	12	112704	112715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296500932
42	NC_014171	TGAGGT	2	12	114918	114929	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296500935
43	NC_014171	GCAAGA	2	12	124221	124232	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296500941
44	NC_014171	AGTAGA	2	12	124326	124337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500941
45	NC_014171	AGCGTG	2	12	125099	125110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296500941
46	NC_014171	ATTCGA	2	12	125619	125630	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296500941
47	NC_014171	AAGTTG	2	12	125873	125884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500941
48	NC_014171	GCTAAA	2	12	126259	126270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500942
49	NC_014171	GAAACT	2	12	126466	126477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500942
50	NC_014171	CAAGCT	2	12	127060	127071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296500942
51	NC_014171	AACTGA	2	12	128304	128315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500944
52	NC_014171	TAAAGG	2	12	128526	128537	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500944
53	NC_014171	GAAATC	2	12	129730	129741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500946
54	NC_014171	ACAAGC	2	12	132079	132090	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	296500950
55	NC_014171	TTGAAG	2	12	135258	135269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296500958
56	NC_014171	AAAGGT	2	12	135368	135379	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296500958
57	NC_014171	TAGTTG	2	12	135955	135966	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296500960
58	NC_014171	CTGAAA	2	12	138498	138509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296500964
59	NC_014171	TAAACA	2	12	140185	140196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296500967
60	NC_014171	TTAGGT	2	12	142106	142117	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296500970
61	NC_014171	ATTTTT	2	12	144458	144469	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	296500974
62	NC_014171	TGCAGT	2	12	148561	148572	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296500980
63	NC_014171	TTTCTT	2	12	151635	151646	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296500983
64	NC_014171	TTAGAT	2	12	160738	160749	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296500986
65	NC_014171	AGCAAA	2	12	162282	162293	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296500988
66	NC_014171	CAAAAT	2	12	163414	163425	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296500988
67	NC_014171	AAGATA	2	12	163427	163438	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296500988
68	NC_014171	GATGGC	2	12	164219	164230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296500989
69	NC_014171	CGCATC	2	12	165585	165596	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296500990
70	NC_014171	ATCGTA	2	12	165965	165976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296500990
71	NC_014171	CTCCGT	2	12	167510	167521	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296500991
72	NC_014171	CAAAGA	2	12	177491	177502	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296501001
73	NC_014171	CAAAAT	2	12	178906	178917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296501002
74	NC_014171	CCATCT	2	12	184538	184549	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296501008
75	NC_014171	ATTTTG	2	12	185358	185369	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296501009
76	NC_014171	GTGGTT	2	12	192900	192911	0 %	50 %	50 %	0 %	296501016
77	NC_014171	AAGTTA	2	12	196612	196623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501018
78	NC_014171	TCTGGA	2	12	196624	196635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296501018
79	NC_014171	ATTTAT	2	12	204312	204323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501025
80	NC_014171	TTCATT	2	12	205199	205210	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296501027
81	NC_014171	TATGAA	2	12	209251	209262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501032
82	NC_014171	CTAATA	2	12	212392	212403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296501035
83	NC_014171	TATATT	2	12	212990	213001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501036
84	NC_014171	GGAACA	2	12	215554	215565	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296501040
85	NC_014171	AGTTAT	2	12	215857	215868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296501040
86	NC_014171	TTATAT	2	12	219042	219053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501041
87	NC_014171	ATACGA	2	12	219219	219230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296501041
88	NC_014171	GAAAGA	2	12	222032	222043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296501044
89	NC_014171	TAAATG	2	12	222709	222720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501044
90	NC_014171	GAGAAT	2	12	223093	223104	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296501045
91	NC_014171	AAAAGA	2	12	225207	225218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296501047
92	NC_014171	CCATAT	2	12	231993	232004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296501056
93	NC_014171	TGAAAA	2	12	236727	236738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296501059
94	NC_014171	CATCTC	2	12	237305	237316	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	296501060
95	NC_014171	ATATGA	2	12	237566	237577	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501060
96	NC_014171	TAAAGA	2	12	237735	237746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296501060
97	NC_014171	AAAACA	2	12	239768	239779	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	296501063
98	NC_014171	GTAAGT	2	12	240173	240184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501063
99	NC_014171	AGCTGA	2	12	253695	253706	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296501070
100	NC_014171	GGATAT	2	12	257987	257998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501074
101	NC_014171	GGCATG	2	12	261713	261724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296501078
102	NC_014171	AATTTA	2	12	264836	264847	50 %	50 %	0 %	0 %	296501080
103	NC_014171	GGATAA	2	12	265209	265220	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296501080
104	NC_014171	AGTTGG	2	12	287029	287040	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296501090
105	NC_014171	GTTTTA	2	12	287133	287144	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296501090
106	NC_014171	CAGTTC	2	12	289382	289393	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296501093
107	NC_014171	TCTGTA	2	12	298864	298875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296501097
108	NC_014171	TTATAT	2	12	300468	300479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501098
109	NC_014171	CATTTT	2	12	301707	301718	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296501100
110	NC_014171	GTAATC	2	12	302591	302602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296501100
111	NC_014171	TTTATT	2	12	316936	316947	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	296501103
112	NC_014171	TGTACG	2	12	323681	323692	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296501110
113	NC_014171	TTATGA	2	12	325918	325929	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296501111
114	NC_014171	ATCTTT	2	12	330825	330836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296501116
115	NC_014171	GCAGGT	2	12	333568	333579	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296501120
116	NC_014171	CAGAAG	2	12	333722	333733	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296501120
117	NC_014171	AGGTGA	2	12	335634	335645	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296501120
118	NC_014171	CAAATC	2	12	336493	336504	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296501121
119	NC_014171	TTTATT	2	12	339768	339779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	296501123
120	NC_014171	TTAAAA	2	12	340433	340444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296501124
121	NC_014171	TTGCAA	2	12	341289	341300	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296501124
122	NC_014171	GATTAA	2	12	344694	344705	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501128
123	NC_014171	AAAGAT	2	12	345232	345243	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296501128
124	NC_014171	ACTTTT	2	12	346214	346225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296501129
125	NC_014171	TTGCTG	2	12	347365	347376	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	296501130
126	NC_014171	AATGAC	2	12	354780	354791	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296501138
127	NC_014171	CAGCTT	2	12	359986	359997	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296501143
128	NC_014171	ACCAGC	2	12	360176	360187	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296501143
129	NC_014171	AATTGC	2	12	364461	364472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296501147
130	NC_014171	AAATTA	2	12	365133	365144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296501148
131	NC_014171	AGATAT	2	12	367923	367934	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501150
132	NC_014171	GAAAAT	2	12	368196	368207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296501150
133	NC_014171	TCGTAT	2	12	379212	379223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296501160
134	NC_014171	TCAATT	2	12	382296	382307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296501163
135	NC_014171	TGCAAA	2	12	382520	382531	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296501163
136	NC_014171	GTTAAT	2	12	382542	382553	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296501163
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139	NC_014171	TTATAT	2	12	389891	389902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296501170
140	NC_014171	GAGAAA	2	12	390125	390136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296501170
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142	NC_014171	GTAGGA	2	12	392266	392277	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296501171
143	NC_014171	TAGAAC	2	12	392775	392786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296501172
144	NC_014171	TGAAGT	2	12	394651	394662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501174
145	NC_014171	GTTAAT	2	12	402709	402720	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296501181
146	NC_014171	GCAATG	2	12	404086	404097	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296501183
147	NC_014171	GAATAT	2	12	407777	407788	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501186
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151	NC_014171	TGTATT	2	12	409745	409756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296501188
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159	NC_014171	TTCATG	2	12	418047	418058	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296501194
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201	NC_014171	AATGGC	2	12	508925	508936	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296501280
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205	NC_014171	TGCTCG	2	12	517470	517481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296501290
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213	NC_014171	CAAAAA	2	12	548384	548395	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	296501309
214	NC_014171	AGTGAT	2	12	549649	549660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296501310
215	NC_014171	TACATT	2	12	557291	557302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296501313
216	NC_014171	GCAGAA	2	12	558657	558668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296501314
217	NC_014171	GCTGAA	2	12	559656	559667	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296501315
218	NC_014171	GCAGAT	2	12	559887	559898	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296501315
219	NC_014171	AGCAGA	2	12	560123	560134	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296501315
220	NC_014171	AGCGCA	2	12	563885	563896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296501317
221	NC_014171	ACCATC	2	12	566188	566199	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	296501319
222	NC_014171	ATTAAT	2	12	566438	566449	50 %	50 %	0 %	0 %	296501319
223	NC_014171	TATGTT	2	12	567202	567213	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296501321
224	NC_014171	TAAAAA	2	12	567533	567544	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296501321
225	NC_014171	GTAACA	2	12	571922	571933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296501326
226	NC_014171	TCTGAA	2	12	575274	575285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296501329
227	NC_014171	AAAGAT	2	12	576114	576125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296501330
228	NC_014171	AAGAAA	2	12	577233	577244	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296501331
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230	NC_014171	ATGAAT	2	12	578549	578560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296501333
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