MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 chromosome

Total Repeats: 4882

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014171	TTATC	2	10	60	69	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014171	CAAAT	2	10	1196	1205	60 %	20 %	0 %	20 %	296500839
3	NC_014171	TACAA	2	10	1810	1819	60 %	20 %	0 %	20 %	296500840
4	NC_014171	AAAAT	2	10	2114	2123	80 %	20 %	0 %	0 %	296500840
5	NC_014171	ATTGA	2	10	4197	4206	40 %	40 %	20 %	0 %	296500842
6	NC_014171	ATTAA	2	10	5081	5090	60 %	40 %	0 %	0 %	296500843
7	NC_014171	CCAGC	2	10	6158	6167	20 %	0 %	20 %	60 %	296500843
8	NC_014171	TTTTA	2	10	9161	9170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014171	TCGTG	2	10	10269	10278	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014171	ATGGT	2	10	11478	11487	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014171	CTGAA	2	10	13242	13251	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014171	TAAAG	2	10	15833	15842	60 %	20 %	20 %	0 %	296500846
13	NC_014171	ATGCT	2	10	16270	16279	20 %	40 %	20 %	20 %	296500846
14	NC_014171	TGGAA	2	10	20267	20276	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014171	TAAAA	2	10	20423	20432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014171	TTTCC	2	10	21800	21809	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014171	ATATT	2	10	21853	21862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014171	TTTTA	2	10	22032	22041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014171	AAATT	2	10	23586	23595	60 %	40 %	0 %	0 %	296500853
20	NC_014171	ATTTT	2	10	24002	24011	20 %	80 %	0 %	0 %	296500854
21	NC_014171	AAGCG	2	10	26905	26914	40 %	0 %	40 %	20 %	296500856
22	NC_014171	TGAAG	2	10	27495	27504	40 %	20 %	40 %	0 %	296500857
23	NC_014171	TTGTC	2	10	28618	28627	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014171	TTTTA	2	10	29128	29137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014171	TCGTG	2	10	30236	30245	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014171	ATGGT	2	10	31445	31454	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014171	CTGAA	2	10	33209	33218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014171	GTATT	2	10	36800	36809	20 %	60 %	20 %	0 %	296500863
29	NC_014171	TCTAT	2	10	44863	44872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014171	CCGTT	2	10	47723	47732	0 %	40 %	20 %	40 %	296500875
31	NC_014171	GAAAC	2	10	48114	48123	60 %	0 %	20 %	20 %	296500876
32	NC_014171	AAGAC	2	10	48385	48394	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014171	GCATC	2	10	55692	55701	20 %	20 %	20 %	40 %	296500886
34	NC_014171	TTCTT	2	10	59116	59125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014171	GATTT	2	10	59713	59722	20 %	60 %	20 %	0 %	296500888
36	NC_014171	TATTT	2	10	60272	60281	20 %	80 %	0 %	0 %	296500888
37	NC_014171	TTGGA	2	10	62953	62962	20 %	40 %	40 %	0 %	296500892
38	NC_014171	ATTTA	2	10	64717	64726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014171	TTATG	2	10	65275	65284	20 %	60 %	20 %	0 %	296500895
40	NC_014171	GGAAA	3	15	65599	65613	60 %	0 %	40 %	0 %	296500895
41	NC_014171	TCAAT	2	10	67053	67062	40 %	40 %	0 %	20 %	296500895
42	NC_014171	AATGA	2	10	69183	69192	60 %	20 %	20 %	0 %	296500896
43	NC_014171	GATTA	2	10	69658	69667	40 %	40 %	20 %	0 %	296500897
44	NC_014171	ATAAG	2	10	71943	71952	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014171	GAACA	2	10	73053	73062	60 %	0 %	20 %	20 %	296500900
46	NC_014171	AATTA	2	10	74781	74790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014171	GAAAA	2	10	75448	75457	80 %	0 %	20 %	0 %	296500902
48	NC_014171	AGAGC	2	10	75808	75817	40 %	0 %	40 %	20 %	296500902
49	NC_014171	ATTTA	2	10	76331	76340	40 %	60 %	0 %	0 %	296500903
50	NC_014171	TGATG	2	10	77077	77086	20 %	40 %	40 %	0 %	296500904
51	NC_014171	GGTAA	2	10	78575	78584	40 %	20 %	40 %	0 %	296500905
52	NC_014171	AAAAC	2	10	79351	79360	80 %	0 %	0 %	20 %	296500907
53	NC_014171	TGAGA	2	10	81353	81362	40 %	20 %	40 %	0 %	296500912
54	NC_014171	GTTAT	2	10	82221	82230	20 %	60 %	20 %	0 %	296500912
55	NC_014171	TTTTA	2	10	82640	82649	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014171	TCGTG	2	10	83748	83757	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014171	ATGGT	2	10	84957	84966	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014171	CTGAA	2	10	86721	86730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014171	TTTTA	2	10	88801	88810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014171	TCGTG	2	10	89909	89918	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014171	ATGGT	2	10	91118	91127	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014171	CTGAA	2	10	92882	92891	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014171	ATCAA	2	10	96127	96136	60 %	20 %	0 %	20 %	296500915
64	NC_014171	GAACA	2	10	96634	96643	60 %	0 %	20 %	20 %	296500916
65	NC_014171	GAACA	2	10	96856	96865	60 %	0 %	20 %	20 %	296500916
66	NC_014171	TGAAG	2	10	97796	97805	40 %	20 %	40 %	0 %	296500916
67	NC_014171	GAAAA	2	10	97819	97828	80 %	0 %	20 %	0 %	296500916
68	NC_014171	GAAAA	2	10	97942	97951	80 %	0 %	20 %	0 %	296500916
69	NC_014171	AATTG	2	10	98762	98771	40 %	40 %	20 %	0 %	296500916
70	NC_014171	TGAAA	2	10	99877	99886	60 %	20 %	20 %	0 %	296500917
71	NC_014171	GTAAT	2	10	100842	100851	40 %	40 %	20 %	0 %	296500918
72	NC_014171	TATAA	2	10	101548	101557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014171	TATGA	2	10	101580	101589	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014171	GCAAA	2	10	103339	103348	60 %	0 %	20 %	20 %	296500920
75	NC_014171	ATATA	2	10	103562	103571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014171	GAAAA	2	10	105594	105603	80 %	0 %	20 %	0 %	296500922
77	NC_014171	GAAAA	2	10	106411	106420	80 %	0 %	20 %	0 %	296500923
78	NC_014171	GAAGA	2	10	108913	108922	60 %	0 %	40 %	0 %	296500926
79	NC_014171	GAAAG	2	10	110358	110367	60 %	0 %	40 %	0 %	296500928
80	NC_014171	GAAAA	2	10	111297	111306	80 %	0 %	20 %	0 %	296500930
81	NC_014171	GAAAA	2	10	111313	111322	80 %	0 %	20 %	0 %	296500930
82	NC_014171	AAAGA	2	10	114360	114369	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014171	AGAAA	2	10	114933	114942	80 %	0 %	20 %	0 %	296500935
84	NC_014171	TGCAA	2	10	122709	122718	40 %	20 %	20 %	20 %	296500939
85	NC_014171	ACGTG	2	10	123407	123416	20 %	20 %	40 %	20 %	296500940
86	NC_014171	TAAAA	2	10	124014	124023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014171	TCGTA	2	10	124446	124455	20 %	40 %	20 %	20 %	296500941
88	NC_014171	CATGG	2	10	127770	127779	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014171	TGGTA	2	10	131532	131541	20 %	40 %	40 %	0 %	296500949
90	NC_014171	GTGCG	2	10	138772	138781	0 %	20 %	60 %	20 %	296500964
91	NC_014171	GAAAT	2	10	143397	143406	60 %	20 %	20 %	0 %	296500972
92	NC_014171	TTATT	2	10	145570	145579	20 %	80 %	0 %	0 %	296500975
93	NC_014171	GAGCA	2	10	146411	146420	40 %	0 %	40 %	20 %	296500976
94	NC_014171	AAAAG	2	10	147074	147083	80 %	0 %	20 %	0 %	296500978
95	NC_014171	GGGCT	2	10	148381	148390	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014171	CTTGG	2	10	149745	149754	0 %	40 %	40 %	20 %	296500981
97	NC_014171	GTTTT	2	10	150464	150473	0 %	80 %	20 %	0 %	296500982
98	NC_014171	TTTTA	2	10	152469	152478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014171	TCGTG	2	10	153577	153586	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014171	ATGGT	2	10	154786	154795	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014171	CTGAA	2	10	156550	156559	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014171	GGAGT	2	10	159088	159097	20 %	20 %	60 %	0 %	296500985
103	NC_014171	ATGTG	2	10	159288	159297	20 %	40 %	40 %	0 %	296500985
104	NC_014171	CAAAA	2	10	163247	163256	80 %	0 %	0 %	20 %	296500988
105	NC_014171	ATTAC	2	10	164502	164511	40 %	40 %	0 %	20 %	296500989
106	NC_014171	AAGTA	2	10	165571	165580	60 %	20 %	20 %	0 %	296500990
107	NC_014171	ACAGC	2	10	166541	166550	40 %	0 %	20 %	40 %	296500990
108	NC_014171	CGTAG	2	10	166736	166745	20 %	20 %	40 %	20 %	296500990
109	NC_014171	GAAGC	2	10	171140	171149	40 %	0 %	40 %	20 %	296500993
110	NC_014171	ATTTT	2	10	173879	173888	20 %	80 %	0 %	0 %	296500997
111	NC_014171	TTCAC	2	10	175299	175308	20 %	40 %	0 %	40 %	296500999
112	NC_014171	AAAAG	2	10	177342	177351	80 %	0 %	20 %	0 %	296501001
113	NC_014171	ACGTA	2	10	179190	179199	40 %	20 %	20 %	20 %	296501002
114	NC_014171	TGCTT	2	10	179779	179788	0 %	60 %	20 %	20 %	296501003
115	NC_014171	TCTAT	2	10	180024	180033	20 %	60 %	0 %	20 %	296501003
116	NC_014171	AAAAG	2	10	180128	180137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014171	GTGAA	2	10	181039	181048	40 %	20 %	40 %	0 %	296501004
118	NC_014171	AAAGG	2	10	181059	181068	60 %	0 %	40 %	0 %	296501004
119	NC_014171	GTTAT	2	10	183173	183182	20 %	60 %	20 %	0 %	296501005
120	NC_014171	AAAAG	2	10	184211	184220	80 %	0 %	20 %	0 %	296501007
121	NC_014171	CTTTT	2	10	184643	184652	0 %	80 %	0 %	20 %	296501008
122	NC_014171	GAAGA	2	10	186120	186129	60 %	0 %	40 %	0 %	296501010
123	NC_014171	AACGT	2	10	187066	187075	40 %	20 %	20 %	20 %	296501010
124	NC_014171	GAAAA	2	10	187645	187654	80 %	0 %	20 %	0 %	296501011
125	NC_014171	ATGGG	2	10	190138	190147	20 %	20 %	60 %	0 %	296501013
126	NC_014171	TATTT	2	10	190464	190473	20 %	80 %	0 %	0 %	296501014
127	NC_014171	AGTTT	2	10	190783	190792	20 %	60 %	20 %	0 %	296501014
128	NC_014171	TTAGT	2	10	192049	192058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014171	TATTG	2	10	192394	192403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014171	TAAAA	2	10	192485	192494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014171	TAAAT	2	10	193529	193538	60 %	40 %	0 %	0 %	296501016
132	NC_014171	TTTGT	2	10	195301	195310	0 %	80 %	20 %	0 %	296501017
133	NC_014171	AAACC	2	10	197374	197383	60 %	0 %	0 %	40 %	296501018
134	NC_014171	TTGAT	2	10	197968	197977	20 %	60 %	20 %	0 %	296501019
135	NC_014171	AAAAG	2	10	198312	198321	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014171	ATGGA	2	10	198333	198342	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014171	GTTTT	2	10	198609	198618	0 %	80 %	20 %	0 %	296501020
138	NC_014171	CTTTA	2	10	200529	200538	20 %	60 %	0 %	20 %	296501022
139	NC_014171	TTCTT	2	10	201287	201296	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014171	GATAT	2	10	202205	202214	40 %	40 %	20 %	0 %	296501023
141	NC_014171	TACCT	2	10	202962	202971	20 %	40 %	0 %	40 %	296501024
142	NC_014171	TAATT	2	10	203614	203623	40 %	60 %	0 %	0 %	296501024
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151	NC_014171	ATTAC	2	10	209702	209711	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_014171	TGTAA	2	10	209739	209748	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_014171	ACGTT	2	10	228126	228135	20 %	40 %	20 %	20 %	296501053
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164	NC_014171	AATGA	2	10	231960	231969	60 %	20 %	20 %	0 %	296501056
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166	NC_014171	ATTTT	2	10	232568	232577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_014171	AAGAG	2	10	244819	244828	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014171	TGTTT	2	10	245072	245081	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014171	GATAA	2	10	246655	246664	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_014171	TCGTG	2	10	280575	280584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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204	NC_014171	CTGAA	2	10	283548	283557	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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225	NC_014171	CTGAA	2	10	308158	308167	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_014171	CTTTT	2	10	346948	346957	0 %	80 %	0 %	20 %	296501130
252	NC_014171	TGTTT	2	10	347062	347071	0 %	80 %	20 %	0 %	296501130
253	NC_014171	AATAC	2	10	347725	347734	60 %	20 %	0 %	20 %	296501131
254	NC_014171	TAGAA	2	10	348047	348056	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_014171	CTACG	2	10	349319	349328	20 %	20 %	20 %	40 %	296501134
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257	NC_014171	TTTTA	2	10	353348	353357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_014171	ATTAT	2	10	353866	353875	40 %	60 %	0 %	0 %	296501137
259	NC_014171	ATTTA	2	10	353939	353948	40 %	60 %	0 %	0 %	296501137
260	NC_014171	AGAAA	2	10	354240	354249	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
261	NC_014171	TAATT	2	10	356419	356428	40 %	60 %	0 %	0 %	296501139
262	NC_014171	GGGAA	2	10	356871	356880	40 %	0 %	60 %	0 %	296501139
263	NC_014171	TGGAG	2	10	362590	362599	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
264	NC_014171	GAAAT	2	10	362604	362613	60 %	20 %	20 %	0 %	296501146
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266	NC_014171	CAGAA	2	10	363124	363133	60 %	0 %	20 %	20 %	296501146
267	NC_014171	ACTTA	2	10	365262	365271	40 %	40 %	0 %	20 %	296501148
268	NC_014171	GGCTT	2	10	366343	366352	0 %	40 %	40 %	20 %	296501148
269	NC_014171	CATGA	2	10	367549	367558	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_014171	CAAAA	2	10	368927	368936	80 %	0 %	0 %	20 %	296501151
271	NC_014171	AAAGC	2	10	369476	369485	60 %	0 %	20 %	20 %	296501152
272	NC_014171	ATTGT	2	10	370950	370959	20 %	60 %	20 %	0 %	296501153
273	NC_014171	ATCGA	2	10	372083	372092	40 %	20 %	20 %	20 %	296501154
274	NC_014171	CATGC	2	10	378142	378151	20 %	20 %	20 %	40 %	296501159
275	NC_014171	AGTGA	2	10	378158	378167	40 %	20 %	40 %	0 %	296501159
276	NC_014171	TTTTA	2	10	380127	380136	20 %	80 %	0 %	0 %	296501160
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282	NC_014171	ATAGT	2	10	389548	389557	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_014171	TATTT	2	10	391568	391577	20 %	80 %	0 %	0 %	296501171
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400	NC_014171	TTTTA	2	10	535428	535437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_014171	ATTAT	2	10	538606	538615	40 %	60 %	0 %	0 %	296501302
404	NC_014171	GTTTC	2	10	540371	540380	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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