MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 chromosome

Total Repeats: 3592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014171	CAAAT	2	10	1196	1205	60 %	20 %	0 %	20 %	296500839
2	NC_014171	TACAA	2	10	1810	1819	60 %	20 %	0 %	20 %	296500840
3	NC_014171	AAAAT	2	10	2114	2123	80 %	20 %	0 %	0 %	296500840
4	NC_014171	ATTGA	2	10	4197	4206	40 %	40 %	20 %	0 %	296500842
5	NC_014171	ATTAA	2	10	5081	5090	60 %	40 %	0 %	0 %	296500843
6	NC_014171	CCAGC	2	10	6158	6167	20 %	0 %	20 %	60 %	296500843
7	NC_014171	TAAAG	2	10	15833	15842	60 %	20 %	20 %	0 %	296500846
8	NC_014171	ATGCT	2	10	16270	16279	20 %	40 %	20 %	20 %	296500846
9	NC_014171	AAATT	2	10	23586	23595	60 %	40 %	0 %	0 %	296500853
10	NC_014171	ATTTT	2	10	24002	24011	20 %	80 %	0 %	0 %	296500854
11	NC_014171	AAGCG	2	10	26905	26914	40 %	0 %	40 %	20 %	296500856
12	NC_014171	TGAAG	2	10	27495	27504	40 %	20 %	40 %	0 %	296500857
13	NC_014171	GTATT	2	10	36800	36809	20 %	60 %	20 %	0 %	296500863
14	NC_014171	CCGTT	2	10	47723	47732	0 %	40 %	20 %	40 %	296500875
15	NC_014171	GAAAC	2	10	48114	48123	60 %	0 %	20 %	20 %	296500876
16	NC_014171	GCATC	2	10	55692	55701	20 %	20 %	20 %	40 %	296500886
17	NC_014171	GATTT	2	10	59713	59722	20 %	60 %	20 %	0 %	296500888
18	NC_014171	TATTT	2	10	60272	60281	20 %	80 %	0 %	0 %	296500888
19	NC_014171	TTGGA	2	10	62953	62962	20 %	40 %	40 %	0 %	296500892
20	NC_014171	TTATG	2	10	65275	65284	20 %	60 %	20 %	0 %	296500895
21	NC_014171	GGAAA	3	15	65599	65613	60 %	0 %	40 %	0 %	296500895
22	NC_014171	TCAAT	2	10	67053	67062	40 %	40 %	0 %	20 %	296500895
23	NC_014171	AATGA	2	10	69183	69192	60 %	20 %	20 %	0 %	296500896
24	NC_014171	GATTA	2	10	69658	69667	40 %	40 %	20 %	0 %	296500897
25	NC_014171	GAACA	2	10	73053	73062	60 %	0 %	20 %	20 %	296500900
26	NC_014171	GAAAA	2	10	75448	75457	80 %	0 %	20 %	0 %	296500902
27	NC_014171	AGAGC	2	10	75808	75817	40 %	0 %	40 %	20 %	296500902
28	NC_014171	ATTTA	2	10	76331	76340	40 %	60 %	0 %	0 %	296500903
29	NC_014171	TGATG	2	10	77077	77086	20 %	40 %	40 %	0 %	296500904
30	NC_014171	GGTAA	2	10	78575	78584	40 %	20 %	40 %	0 %	296500905
31	NC_014171	AAAAC	2	10	79351	79360	80 %	0 %	0 %	20 %	296500907
32	NC_014171	TGAGA	2	10	81353	81362	40 %	20 %	40 %	0 %	296500912
33	NC_014171	GTTAT	2	10	82221	82230	20 %	60 %	20 %	0 %	296500912
34	NC_014171	ATCAA	2	10	96127	96136	60 %	20 %	0 %	20 %	296500915
35	NC_014171	GAACA	2	10	96634	96643	60 %	0 %	20 %	20 %	296500916
36	NC_014171	GAACA	2	10	96856	96865	60 %	0 %	20 %	20 %	296500916
37	NC_014171	TGAAG	2	10	97796	97805	40 %	20 %	40 %	0 %	296500916
38	NC_014171	GAAAA	2	10	97819	97828	80 %	0 %	20 %	0 %	296500916
39	NC_014171	GAAAA	2	10	97942	97951	80 %	0 %	20 %	0 %	296500916
40	NC_014171	AATTG	2	10	98762	98771	40 %	40 %	20 %	0 %	296500916
41	NC_014171	TGAAA	2	10	99877	99886	60 %	20 %	20 %	0 %	296500917
42	NC_014171	GTAAT	2	10	100842	100851	40 %	40 %	20 %	0 %	296500918
43	NC_014171	GCAAA	2	10	103339	103348	60 %	0 %	20 %	20 %	296500920
44	NC_014171	GAAAA	2	10	105594	105603	80 %	0 %	20 %	0 %	296500922
45	NC_014171	GAAAA	2	10	106411	106420	80 %	0 %	20 %	0 %	296500923
46	NC_014171	GAAGA	2	10	108913	108922	60 %	0 %	40 %	0 %	296500926
47	NC_014171	GAAAG	2	10	110358	110367	60 %	0 %	40 %	0 %	296500928
48	NC_014171	GAAAA	2	10	111297	111306	80 %	0 %	20 %	0 %	296500930
49	NC_014171	GAAAA	2	10	111313	111322	80 %	0 %	20 %	0 %	296500930
50	NC_014171	AGAAA	2	10	114933	114942	80 %	0 %	20 %	0 %	296500935
51	NC_014171	TGCAA	2	10	122709	122718	40 %	20 %	20 %	20 %	296500939
52	NC_014171	ACGTG	2	10	123407	123416	20 %	20 %	40 %	20 %	296500940
53	NC_014171	TCGTA	2	10	124446	124455	20 %	40 %	20 %	20 %	296500941
54	NC_014171	TGGTA	2	10	131532	131541	20 %	40 %	40 %	0 %	296500949
55	NC_014171	GTGCG	2	10	138772	138781	0 %	20 %	60 %	20 %	296500964
56	NC_014171	GAAAT	2	10	143397	143406	60 %	20 %	20 %	0 %	296500972
57	NC_014171	TTATT	2	10	145570	145579	20 %	80 %	0 %	0 %	296500975
58	NC_014171	GAGCA	2	10	146411	146420	40 %	0 %	40 %	20 %	296500976
59	NC_014171	AAAAG	2	10	147074	147083	80 %	0 %	20 %	0 %	296500978
60	NC_014171	CTTGG	2	10	149745	149754	0 %	40 %	40 %	20 %	296500981
61	NC_014171	GTTTT	2	10	150464	150473	0 %	80 %	20 %	0 %	296500982
62	NC_014171	GGAGT	2	10	159088	159097	20 %	20 %	60 %	0 %	296500985
63	NC_014171	ATGTG	2	10	159288	159297	20 %	40 %	40 %	0 %	296500985
64	NC_014171	CAAAA	2	10	163247	163256	80 %	0 %	0 %	20 %	296500988
65	NC_014171	ATTAC	2	10	164502	164511	40 %	40 %	0 %	20 %	296500989
66	NC_014171	AAGTA	2	10	165571	165580	60 %	20 %	20 %	0 %	296500990
67	NC_014171	ACAGC	2	10	166541	166550	40 %	0 %	20 %	40 %	296500990
68	NC_014171	CGTAG	2	10	166736	166745	20 %	20 %	40 %	20 %	296500990
69	NC_014171	GAAGC	2	10	171140	171149	40 %	0 %	40 %	20 %	296500993
70	NC_014171	ATTTT	2	10	173879	173888	20 %	80 %	0 %	0 %	296500997
71	NC_014171	TTCAC	2	10	175299	175308	20 %	40 %	0 %	40 %	296500999
72	NC_014171	AAAAG	2	10	177342	177351	80 %	0 %	20 %	0 %	296501001
73	NC_014171	ACGTA	2	10	179190	179199	40 %	20 %	20 %	20 %	296501002
74	NC_014171	TGCTT	2	10	179779	179788	0 %	60 %	20 %	20 %	296501003
75	NC_014171	TCTAT	2	10	180024	180033	20 %	60 %	0 %	20 %	296501003
76	NC_014171	GTGAA	2	10	181039	181048	40 %	20 %	40 %	0 %	296501004
77	NC_014171	AAAGG	2	10	181059	181068	60 %	0 %	40 %	0 %	296501004
78	NC_014171	GTTAT	2	10	183173	183182	20 %	60 %	20 %	0 %	296501005
79	NC_014171	AAAAG	2	10	184211	184220	80 %	0 %	20 %	0 %	296501007
80	NC_014171	CTTTT	2	10	184643	184652	0 %	80 %	0 %	20 %	296501008
81	NC_014171	GAAGA	2	10	186120	186129	60 %	0 %	40 %	0 %	296501010
82	NC_014171	AACGT	2	10	187066	187075	40 %	20 %	20 %	20 %	296501010
83	NC_014171	GAAAA	2	10	187645	187654	80 %	0 %	20 %	0 %	296501011
84	NC_014171	ATGGG	2	10	190138	190147	20 %	20 %	60 %	0 %	296501013
85	NC_014171	TATTT	2	10	190464	190473	20 %	80 %	0 %	0 %	296501014
86	NC_014171	AGTTT	2	10	190783	190792	20 %	60 %	20 %	0 %	296501014
87	NC_014171	TAAAT	2	10	193529	193538	60 %	40 %	0 %	0 %	296501016
88	NC_014171	TTTGT	2	10	195301	195310	0 %	80 %	20 %	0 %	296501017
89	NC_014171	AAACC	2	10	197374	197383	60 %	0 %	0 %	40 %	296501018
90	NC_014171	TTGAT	2	10	197968	197977	20 %	60 %	20 %	0 %	296501019
91	NC_014171	GTTTT	2	10	198609	198618	0 %	80 %	20 %	0 %	296501020
92	NC_014171	CTTTA	2	10	200529	200538	20 %	60 %	0 %	20 %	296501022
93	NC_014171	GATAT	2	10	202205	202214	40 %	40 %	20 %	0 %	296501023
94	NC_014171	TACCT	2	10	202962	202971	20 %	40 %	0 %	40 %	296501024
95	NC_014171	TAATT	2	10	203614	203623	40 %	60 %	0 %	0 %	296501024
96	NC_014171	ATTTT	2	10	203928	203937	20 %	80 %	0 %	0 %	296501025
97	NC_014171	ATTGT	2	10	203974	203983	20 %	60 %	20 %	0 %	296501025
98	NC_014171	AGCTG	2	10	204903	204912	20 %	20 %	40 %	20 %	296501026
99	NC_014171	AATCA	2	10	206034	206043	60 %	20 %	0 %	20 %	296501028
100	NC_014171	AAAAG	2	10	206617	206626	80 %	0 %	20 %	0 %	296501030
101	NC_014171	AAAAC	2	10	206857	206866	80 %	0 %	0 %	20 %	296501030
102	NC_014171	GTTAA	2	10	208849	208858	40 %	40 %	20 %	0 %	296501031
103	NC_014171	ATGGA	2	10	210180	210189	40 %	20 %	40 %	0 %	296501034
104	NC_014171	GAAGA	2	10	210225	210234	60 %	0 %	40 %	0 %	296501034
105	NC_014171	GTTTC	2	10	212431	212440	0 %	60 %	20 %	20 %	296501035
106	NC_014171	TAATG	2	10	215245	215254	40 %	40 %	20 %	0 %	296501039
107	NC_014171	TTTTA	2	10	216531	216540	20 %	80 %	0 %	0 %	296501040
108	NC_014171	TATTC	2	10	222600	222609	20 %	60 %	0 %	20 %	296501044
109	NC_014171	TATTC	2	10	225769	225778	20 %	60 %	0 %	20 %	296501051
110	NC_014171	ACGTT	2	10	228126	228135	20 %	40 %	20 %	20 %	296501053
111	NC_014171	GGGAT	2	10	229010	229019	20 %	20 %	60 %	0 %	296501054
112	NC_014171	AATGA	2	10	231960	231969	60 %	20 %	20 %	0 %	296501056
113	NC_014171	AAATT	2	10	232735	232744	60 %	40 %	0 %	0 %	296501057
114	NC_014171	AAGAA	2	10	236225	236234	80 %	0 %	20 %	0 %	296501059
115	NC_014171	GAGAA	2	10	238619	238628	60 %	0 %	40 %	0 %	296501061
116	NC_014171	GTAAG	2	10	238732	238741	40 %	20 %	40 %	0 %	296501061
117	NC_014171	CTTTA	2	10	240124	240133	20 %	60 %	0 %	20 %	296501063
118	NC_014171	ACGTT	2	10	241094	241103	20 %	40 %	20 %	20 %	296501064
119	NC_014171	GATAT	2	10	253754	253763	40 %	40 %	20 %	0 %	296501071
120	NC_014171	TAATT	2	10	255923	255932	40 %	60 %	0 %	0 %	296501073
121	NC_014171	TCATT	2	10	255999	256008	20 %	60 %	0 %	20 %	296501073
122	NC_014171	AACTC	2	10	261308	261317	40 %	20 %	0 %	40 %	296501078
123	NC_014171	TAAAT	2	10	263051	263060	60 %	40 %	0 %	0 %	296501079
124	NC_014171	AATTT	2	10	264649	264658	40 %	60 %	0 %	0 %	296501080
125	NC_014171	GCGTA	2	10	267216	267225	20 %	20 %	40 %	20 %	296501081
126	NC_014171	GGCGT	2	10	268525	268534	0 %	20 %	60 %	20 %	296501082
127	NC_014171	TAAAT	2	10	277522	277531	60 %	40 %	0 %	0 %	296501086
128	NC_014171	TTATT	2	10	278983	278992	20 %	80 %	0 %	0 %	296501087
129	NC_014171	AATAG	2	10	286458	286467	60 %	20 %	20 %	0 %	296501090
130	NC_014171	TGTTT	2	10	287042	287051	0 %	80 %	20 %	0 %	296501090
131	NC_014171	TTTGC	2	10	287415	287424	0 %	60 %	20 %	20 %	296501091
132	NC_014171	ATGTT	2	10	288560	288569	20 %	60 %	20 %	0 %	296501092
133	NC_014171	TTGGA	2	10	289228	289237	20 %	40 %	40 %	0 %	296501093
134	NC_014171	ACTTT	2	10	297518	297527	20 %	60 %	0 %	20 %	296501095
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