MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 plasmid XNC1_p

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014170	GAACTC	2	12	5882	5893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296491834
2	NC_014170	AGCGGA	2	12	17046	17057	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	296491844
3	NC_014170	CAATTC	2	12	17150	17161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296491844
4	NC_014170	CTCTTC	2	12	17416	17427	0 %	50 %	0 %	50 %	296491845
5	NC_014170	GGTCTG	2	12	17740	17751	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296491845
6	NC_014170	ACAGGA	2	12	18355	18366	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296491847
7	NC_014170	AGGTAG	2	12	34865	34876	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296491857
8	NC_014170	GTAAGG	2	12	36979	36990	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296491859
9	NC_014170	GAACCC	2	12	43234	43245	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296491865
10	NC_014170	AGGAAA	2	12	44016	44027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296491866
11	NC_014170	GAAATA	2	12	67598	67609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296491898
12	NC_014170	TGGCAT	2	12	71953	71964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296491901
13	NC_014170	TCATTT	2	12	76563	76574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296491906
14	NC_014170	GGATTT	2	12	76725	76736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296491906
15	NC_014170	AGTCAG	2	12	78902	78913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296491907
16	NC_014170	TCCCGT	2	12	83013	83024	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	296491910
17	NC_014170	TTTCCA	2	12	91915	91926	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	296491917
18	NC_014170	GTTCAG	2	12	96680	96691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296491921
19	NC_014170	ACGCTC	2	12	99735	99746	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296491927
20	NC_014170	GTTAGA	2	12	130728	130739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296491959
21	NC_014170	ACCGTT	2	12	135263	135274	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296491967
22	NC_014170	CAAAGA	2	12	137054	137065	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296491971
23	NC_014170	TCCTGT	2	12	142775	142786	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	296491975
24	NC_014170	GAGCTT	2	12	143676	143687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296491978
25	NC_014170	CGGGTT	2	12	145075	145086	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296491980
26	NC_014170	GAAAGA	2	12	145609	145620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296491981
27	NC_014170	TGACTA	2	12	148956	148967	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296491987
28	NC_014170	TGCTGG	2	12	149013	149024	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296491987
29	NC_014170	CAAAAG	2	12	152024	152035	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296491994

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.