MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 plasmid XNC1_p

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014170	AAAAT	2	10	800	809	80 %	20 %	0 %	0 %	296491825
2	NC_014170	AAGGA	2	10	2051	2060	60 %	0 %	40 %	0 %	296491826
3	NC_014170	GAAGG	2	10	6272	6281	40 %	0 %	60 %	0 %	296491834
4	NC_014170	GGAGT	2	10	13264	13273	20 %	20 %	60 %	0 %	296491840
5	NC_014170	CGGTA	2	10	17982	17991	20 %	20 %	40 %	20 %	296491846
6	NC_014170	CGTTT	2	10	19426	19435	0 %	60 %	20 %	20 %	296491848
7	NC_014170	TTGGC	2	10	20168	20177	0 %	40 %	40 %	20 %	296491848
8	NC_014170	GTTCT	2	10	20478	20487	0 %	60 %	20 %	20 %	296491848
9	NC_014170	AAGAC	2	10	25396	25405	60 %	0 %	20 %	20 %	296491849
10	NC_014170	TGTTC	2	10	25840	25849	0 %	60 %	20 %	20 %	296491850
11	NC_014170	GTCAG	2	10	29244	29253	20 %	20 %	40 %	20 %	296491853
12	NC_014170	GTGAT	2	10	29774	29783	20 %	40 %	40 %	0 %	296491853
13	NC_014170	CTGAT	2	10	30032	30041	20 %	40 %	20 %	20 %	296491853
14	NC_014170	CCTTT	2	10	30688	30697	0 %	60 %	0 %	40 %	296491854
15	NC_014170	GCTTT	2	10	35087	35096	0 %	60 %	20 %	20 %	296491857
16	NC_014170	TGAGG	2	10	35381	35390	20 %	20 %	60 %	0 %	296491857
17	NC_014170	GACCA	2	10	35485	35494	40 %	0 %	20 %	40 %	296491857
18	NC_014170	GCTCC	2	10	36269	36278	0 %	20 %	20 %	60 %	296491858
19	NC_014170	TCAGC	2	10	38495	38504	20 %	20 %	20 %	40 %	296491862
20	NC_014170	AACCG	2	10	38833	38842	40 %	0 %	20 %	40 %	296491863
21	NC_014170	GGTTT	2	10	39485	39494	0 %	60 %	40 %	0 %	296491863
22	NC_014170	GATCC	2	10	40444	40453	20 %	20 %	20 %	40 %	296491864
23	NC_014170	ACGAC	2	10	42658	42667	40 %	0 %	20 %	40 %	296491865
24	NC_014170	CAAAG	2	10	51833	51842	60 %	0 %	20 %	20 %	296491875
25	NC_014170	GCTTT	2	10	52461	52470	0 %	60 %	20 %	20 %	296491876
26	NC_014170	GTTGG	2	10	54734	54743	0 %	40 %	60 %	0 %	296491879
27	NC_014170	TCGAT	2	10	58505	58514	20 %	40 %	20 %	20 %	296491884
28	NC_014170	GAGAA	2	10	61442	61451	60 %	0 %	40 %	0 %	296491888
29	NC_014170	TTTCA	2	10	66932	66941	20 %	60 %	0 %	20 %	296491896
30	NC_014170	CATCA	2	10	67298	67307	40 %	20 %	0 %	40 %	296491897
31	NC_014170	TTCAT	2	10	67853	67862	20 %	60 %	0 %	20 %	296491898
32	NC_014170	ATTCA	2	10	68794	68803	40 %	40 %	0 %	20 %	296491898
33	NC_014170	AAGAC	2	10	70828	70837	60 %	0 %	20 %	20 %	296491900
34	NC_014170	GTTCT	2	10	72125	72134	0 %	60 %	20 %	20 %	296491901
35	NC_014170	GTACA	2	10	73759	73768	40 %	20 %	20 %	20 %	296491901
36	NC_014170	ACTTA	2	10	76847	76856	40 %	40 %	0 %	20 %	296491906
37	NC_014170	ATTTC	2	10	79601	79610	20 %	60 %	0 %	20 %	296491907
38	NC_014170	CGGCA	2	10	84267	84276	20 %	0 %	40 %	40 %	296491911
39	NC_014170	CAAAG	2	10	84426	84435	60 %	0 %	20 %	20 %	296491911
40	NC_014170	AGTGT	2	10	92592	92601	20 %	40 %	40 %	0 %	296491917
41	NC_014170	GCCAG	2	10	92927	92936	20 %	0 %	40 %	40 %	296491917
42	NC_014170	TCAAT	2	10	94115	94124	40 %	40 %	0 %	20 %	296491917
43	NC_014170	GTAAA	2	10	95873	95882	60 %	20 %	20 %	0 %	296491920
44	NC_014170	GTAAT	2	10	96668	96677	40 %	40 %	20 %	0 %	296491921
45	NC_014170	TATTT	2	10	100406	100415	20 %	80 %	0 %	0 %	296491928
46	NC_014170	TCAGA	2	10	101504	101513	40 %	20 %	20 %	20 %	296491928
47	NC_014170	GGATT	2	10	107502	107511	20 %	40 %	40 %	0 %	296491931
48	NC_014170	GGATT	2	10	110321	110330	20 %	40 %	40 %	0 %	296491933
49	NC_014170	GCATG	2	10	111265	111274	20 %	20 %	40 %	20 %	296491934
50	NC_014170	TTCTT	2	10	112418	112427	0 %	80 %	0 %	20 %	296491936
51	NC_014170	GCGTG	2	10	113727	113736	0 %	20 %	60 %	20 %	296491938
52	NC_014170	TGGAA	2	10	115194	115203	40 %	20 %	40 %	0 %	296491941
53	NC_014170	TGGAT	2	10	115733	115742	20 %	40 %	40 %	0 %	296491942
54	NC_014170	CGGTA	2	10	117109	117118	20 %	20 %	40 %	20 %	296491944
55	NC_014170	AAAAT	2	10	121787	121796	80 %	20 %	0 %	0 %	296491947
56	NC_014170	AATCG	2	10	127044	127053	40 %	20 %	20 %	20 %	296491955
57	NC_014170	TCCAC	2	10	134139	134148	20 %	20 %	0 %	60 %	296491965
58	NC_014170	CTTTT	2	10	134189	134198	0 %	80 %	0 %	20 %	296491965
59	NC_014170	TCCCA	2	10	134666	134675	20 %	20 %	0 %	60 %	296491966
60	NC_014170	AAAAG	2	10	136507	136516	80 %	0 %	20 %	0 %	296491969
61	NC_014170	GTCAT	2	10	141856	141865	20 %	40 %	20 %	20 %	296491974
62	NC_014170	CTTGG	2	10	143028	143037	0 %	40 %	40 %	20 %	296491977
63	NC_014170	TCCCT	2	10	143502	143511	0 %	40 %	0 %	60 %	296491978
64	NC_014170	CAAAG	2	10	143879	143888	60 %	0 %	20 %	20 %	296491979
65	NC_014170	ACCAG	2	10	145380	145389	40 %	0 %	20 %	40 %	296491980
66	NC_014170	AGCTA	2	10	145441	145450	40 %	20 %	20 %	20 %	296491980
67	NC_014170	TGACA	2	10	145510	145519	40 %	20 %	20 %	20 %	296491981
68	NC_014170	GCAGA	2	10	146024	146033	40 %	0 %	40 %	20 %	296491981
69	NC_014170	CTCTG	2	10	147422	147431	0 %	40 %	20 %	40 %	296491984
70	NC_014170	AGCAA	2	10	149594	149603	60 %	0 %	20 %	20 %	296491988
71	NC_014170	CTTTG	2	10	150698	150707	0 %	60 %	20 %	20 %	296491991
72	NC_014170	CGTTA	2	10	152109	152118	20 %	40 %	20 %	20 %	296491994
73	NC_014170	GGCAA	2	10	153283	153292	40 %	0 %	40 %	20 %	296491995
74	NC_014170	CATTG	2	10	154650	154659	20 %	40 %	20 %	20 %	296491997
75	NC_014170	CAGCA	2	10	154851	154860	40 %	0 %	20 %	40 %	296491998

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.