MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 plasmid XNC1_p

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014170	GTTT	2	8	29	36	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014170	GAAA	2	8	126	133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014170	AAAG	2	8	246	253	75 %	0 %	25 %	0 %	296491825
4	NC_014170	ATGG	2	8	268	275	25 %	25 %	50 %	0 %	296491825
5	NC_014170	TTTG	2	8	453	460	0 %	75 %	25 %	0 %	296491825
6	NC_014170	TGAT	2	8	542	549	25 %	50 %	25 %	0 %	296491825
7	NC_014170	ATGG	2	8	730	737	25 %	25 %	50 %	0 %	296491825
8	NC_014170	AGGA	2	8	1142	1149	50 %	0 %	50 %	0 %	296491826
9	NC_014170	CTGT	2	8	1529	1536	0 %	50 %	25 %	25 %	296491826
10	NC_014170	GAAT	2	8	2315	2322	50 %	25 %	25 %	0 %	296491827
11	NC_014170	TCCA	2	8	2726	2733	25 %	25 %	0 %	50 %	296491828
12	NC_014170	TTAT	2	8	3423	3430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014170	AAGG	2	8	3734	3741	50 %	0 %	50 %	0 %	296491830
14	NC_014170	TCTG	2	8	4314	4321	0 %	50 %	25 %	25 %	296491832
15	NC_014170	GTTT	2	8	4335	4342	0 %	75 %	25 %	0 %	296491832
16	NC_014170	GGCA	2	8	4450	4457	25 %	0 %	50 %	25 %	296491832
17	NC_014170	AATG	2	8	4606	4613	50 %	25 %	25 %	0 %	296491833
18	NC_014170	TAAA	2	8	4691	4698	75 %	25 %	0 %	0 %	296491833
19	NC_014170	GAGG	2	8	5220	5227	25 %	0 %	75 %	0 %	296491834
20	NC_014170	AGAC	2	8	5341	5348	50 %	0 %	25 %	25 %	296491834
21	NC_014170	CAAA	2	8	5791	5798	75 %	0 %	0 %	25 %	296491834
22	NC_014170	CCAG	2	8	6622	6629	25 %	0 %	25 %	50 %	296491834
23	NC_014170	TCGT	2	8	6953	6960	0 %	50 %	25 %	25 %	296491834
24	NC_014170	TGAT	2	8	7281	7288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014170	GATC	2	8	8627	8634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014170	TTTC	2	8	8788	8795	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014170	TGCT	2	8	8976	8983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014170	AAAC	2	8	9687	9694	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014170	GGCT	2	8	10051	10058	0 %	25 %	50 %	25 %	296491836
30	NC_014170	TCCA	2	8	10658	10665	25 %	25 %	0 %	50 %	296491837
31	NC_014170	TTTC	2	8	10708	10715	0 %	75 %	0 %	25 %	296491837
32	NC_014170	ATTC	2	8	10734	10741	25 %	50 %	0 %	25 %	296491837
33	NC_014170	CTGT	2	8	10880	10887	0 %	50 %	25 %	25 %	296491837
34	NC_014170	GTCA	2	8	11167	11174	25 %	25 %	25 %	25 %	296491837
35	NC_014170	CTTT	2	8	11196	11203	0 %	75 %	0 %	25 %	296491837
36	NC_014170	CCCG	2	8	11434	11441	0 %	0 %	25 %	75 %	296491837
37	NC_014170	TTGC	2	8	12530	12537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014170	AGCA	2	8	13196	13203	50 %	0 %	25 %	25 %	296491839
39	NC_014170	AGCA	2	8	13837	13844	50 %	0 %	25 %	25 %	296491840
40	NC_014170	AGCC	2	8	15084	15091	25 %	0 %	25 %	50 %	296491842
41	NC_014170	CAAA	2	8	15743	15750	75 %	0 %	0 %	25 %	296491843
42	NC_014170	AGAA	2	8	16245	16252	75 %	0 %	25 %	0 %	296491843
43	NC_014170	CCTA	2	8	16338	16345	25 %	25 %	0 %	50 %	296491843
44	NC_014170	TCGC	2	8	17594	17601	0 %	25 %	25 %	50 %	296491845
45	NC_014170	ACAA	2	8	17965	17972	75 %	0 %	0 %	25 %	296491846
46	NC_014170	TCAC	2	8	18102	18109	25 %	25 %	0 %	50 %	296491846
47	NC_014170	AAAG	2	8	18158	18165	75 %	0 %	25 %	0 %	296491846
48	NC_014170	AATC	2	8	18440	18447	50 %	25 %	0 %	25 %	296491847
49	NC_014170	ATTG	2	8	18787	18794	25 %	50 %	25 %	0 %	296491847
50	NC_014170	GATA	2	8	19012	19019	50 %	25 %	25 %	0 %	296491847
51	NC_014170	TCGG	2	8	19480	19487	0 %	25 %	50 %	25 %	296491848
52	NC_014170	CAGA	2	8	19652	19659	50 %	0 %	25 %	25 %	296491848
53	NC_014170	AACC	2	8	20152	20159	50 %	0 %	0 %	50 %	296491848
54	NC_014170	CCAG	2	8	20785	20792	25 %	0 %	25 %	50 %	296491848
55	NC_014170	GAAG	2	8	21238	21245	50 %	0 %	50 %	0 %	296491848
56	NC_014170	ATGG	2	8	21353	21360	25 %	25 %	50 %	0 %	296491848
57	NC_014170	TGTT	2	8	22235	22242	0 %	75 %	25 %	0 %	296491848
58	NC_014170	TGGG	2	8	22594	22601	0 %	25 %	75 %	0 %	296491848
59	NC_014170	GAGC	2	8	22640	22647	25 %	0 %	50 %	25 %	296491848
60	NC_014170	GCCT	2	8	23754	23761	0 %	25 %	25 %	50 %	296491848
61	NC_014170	CGTT	2	8	25528	25535	0 %	50 %	25 %	25 %	296491849
62	NC_014170	TGTT	2	8	26034	26041	0 %	75 %	25 %	0 %	296491850
63	NC_014170	CAAT	2	8	26055	26062	50 %	25 %	0 %	25 %	296491850
64	NC_014170	TGCT	2	8	26559	26566	0 %	50 %	25 %	25 %	296491850
65	NC_014170	CTGC	2	8	26767	26774	0 %	25 %	25 %	50 %	296491850
66	NC_014170	ACCG	2	8	26783	26790	25 %	0 %	25 %	50 %	296491850
67	NC_014170	TTCT	2	8	27264	27271	0 %	75 %	0 %	25 %	296491850
68	NC_014170	TATC	2	8	27514	27521	25 %	50 %	0 %	25 %	296491850
69	NC_014170	AATC	2	8	28073	28080	50 %	25 %	0 %	25 %	296491851
70	NC_014170	GAAC	2	8	28137	28144	50 %	0 %	25 %	25 %	296491851
71	NC_014170	TGCC	2	8	28527	28534	0 %	25 %	25 %	50 %	296491852
72	NC_014170	AAGA	2	8	29338	29345	75 %	0 %	25 %	0 %	296491853
73	NC_014170	TTCG	2	8	29952	29959	0 %	50 %	25 %	25 %	296491853
74	NC_014170	ATGA	2	8	30128	30135	50 %	25 %	25 %	0 %	296491853
75	NC_014170	CCAA	2	8	30152	30159	50 %	0 %	0 %	50 %	296491854
76	NC_014170	GTTT	2	8	30178	30185	0 %	75 %	25 %	0 %	296491854
77	NC_014170	TTTC	2	8	30740	30747	0 %	75 %	0 %	25 %	296491854
78	NC_014170	AGCC	2	8	31071	31078	25 %	0 %	25 %	50 %	296491855
79	NC_014170	ATGG	2	8	31181	31188	25 %	25 %	50 %	0 %	296491855
80	NC_014170	GGTA	2	8	32036	32043	25 %	25 %	50 %	0 %	296491856
81	NC_014170	GGTA	2	8	32828	32835	25 %	25 %	50 %	0 %	296491856
82	NC_014170	CGGG	2	8	33355	33362	0 %	0 %	75 %	25 %	296491856
83	NC_014170	CCAA	2	8	33780	33787	50 %	0 %	0 %	50 %	296491856
84	NC_014170	AGCC	2	8	33901	33908	25 %	0 %	25 %	50 %	296491856
85	NC_014170	ATTG	2	8	34467	34474	25 %	50 %	25 %	0 %	296491856
86	NC_014170	AATT	2	8	34481	34488	50 %	50 %	0 %	0 %	296491856
87	NC_014170	CAAT	2	8	34543	34550	50 %	25 %	0 %	25 %	296491856
88	NC_014170	GATT	2	8	34759	34766	25 %	50 %	25 %	0 %	296491857
89	NC_014170	CATT	2	8	35123	35130	25 %	50 %	0 %	25 %	296491857
90	NC_014170	GAAA	2	8	35231	35238	75 %	0 %	25 %	0 %	296491857
91	NC_014170	TGTC	2	8	35430	35437	0 %	50 %	25 %	25 %	296491857
92	NC_014170	TTGG	2	8	35524	35531	0 %	50 %	50 %	0 %	296491857
93	NC_014170	CAGA	2	8	35577	35584	50 %	0 %	25 %	25 %	296491857
94	NC_014170	TTCG	2	8	36062	36069	0 %	50 %	25 %	25 %	296491858
95	NC_014170	AAAC	2	8	36577	36584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014170	AAAC	2	8	37619	37626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014170	GCTG	2	8	38159	38166	0 %	25 %	50 %	25 %	296491862
98	NC_014170	TATT	2	8	38762	38769	25 %	75 %	0 %	0 %	296491863
99	NC_014170	AAAG	2	8	38938	38945	75 %	0 %	25 %	0 %	296491863
100	NC_014170	ACAA	2	8	39051	39058	75 %	0 %	0 %	25 %	296491863
101	NC_014170	ATCC	2	8	39286	39293	25 %	25 %	0 %	50 %	296491863
102	NC_014170	TGGC	2	8	39649	39656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014170	ACCG	2	8	39870	39877	25 %	0 %	25 %	50 %	296491864
104	NC_014170	CCTG	2	8	41086	41093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014170	GGTT	2	8	41287	41294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014170	GACT	2	8	41531	41538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014170	TGCT	2	8	41669	41676	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014170	AAAC	2	8	41953	41960	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014170	ACGA	2	8	42431	42438	50 %	0 %	25 %	25 %	296491865
110	NC_014170	CTTT	2	8	42803	42810	0 %	75 %	0 %	25 %	296491865
111	NC_014170	AGGT	2	8	43025	43032	25 %	25 %	50 %	0 %	296491865
112	NC_014170	TGAA	2	8	43728	43735	50 %	25 %	25 %	0 %	296491866
113	NC_014170	CGAG	2	8	43894	43901	25 %	0 %	50 %	25 %	296491866
114	NC_014170	GCCA	2	8	44543	44550	25 %	0 %	25 %	50 %	296491866
115	NC_014170	TCCA	2	8	45277	45284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014170	CAGG	2	8	45424	45431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014170	GCAA	2	8	45452	45459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014170	TGTA	2	8	45539	45546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014170	AAAC	2	8	45786	45793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014170	TTGA	2	8	46134	46141	25 %	50 %	25 %	0 %	296491867
121	NC_014170	AGCA	2	8	46156	46163	50 %	0 %	25 %	25 %	296491867
122	NC_014170	ACTG	2	8	46736	46743	25 %	25 %	25 %	25 %	296491868
123	NC_014170	GCTG	2	8	47460	47467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014170	GCGA	2	8	47489	47496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014170	GCAA	2	8	47874	47881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014170	CAGG	2	8	47886	47893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014170	AGGT	2	8	47927	47934	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014170	ATCC	2	8	48244	48251	25 %	25 %	0 %	50 %	296491869
129	NC_014170	GATT	2	8	48584	48591	25 %	50 %	25 %	0 %	296491870
130	NC_014170	GGCT	2	8	49322	49329	0 %	25 %	50 %	25 %	296491872
131	NC_014170	CAAA	2	8	49486	49493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014170	CCAT	2	8	49633	49640	25 %	25 %	0 %	50 %	296491873
133	NC_014170	TGGC	2	8	49868	49875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014170	TTGG	2	8	50048	50055	0 %	50 %	50 %	0 %	296491874
135	NC_014170	CAGT	2	8	50161	50168	25 %	25 %	25 %	25 %	296491874
136	NC_014170	TCAA	2	8	52032	52039	50 %	25 %	0 %	25 %	296491875
137	NC_014170	ACCA	2	8	52431	52438	50 %	0 %	0 %	50 %	296491876
138	NC_014170	GCTG	2	8	52880	52887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014170	AAAC	2	8	52892	52899	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014170	TCGT	2	8	53146	53153	0 %	50 %	25 %	25 %	296491877
141	NC_014170	ACTG	2	8	53893	53900	25 %	25 %	25 %	25 %	296491879
142	NC_014170	TTGA	2	8	53990	53997	25 %	50 %	25 %	0 %	296491879
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144	NC_014170	TGGC	2	8	54161	54168	0 %	25 %	50 %	25 %	296491879
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.