MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 plasmid XNC1_p

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014170	GTTT	2	8	29	36	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014170	GAAA	2	8	126	133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014170	TTAT	2	8	3423	3430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014170	TGAT	2	8	7281	7288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014170	GATC	2	8	8627	8634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014170	TTTC	2	8	8788	8795	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014170	TGCT	2	8	8976	8983	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014170	AAAC	2	8	9687	9694	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014170	TTGC	2	8	12530	12537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014170	AAAC	2	8	36577	36584	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014170	AAAC	2	8	37619	37626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014170	TGGC	2	8	39649	39656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014170	CCTG	2	8	41086	41093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014170	GGTT	2	8	41287	41294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014170	GACT	2	8	41531	41538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014170	TGCT	2	8	41669	41676	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014170	AAAC	2	8	41953	41960	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014170	TCCA	2	8	45277	45284	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014170	CAGG	2	8	45424	45431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014170	GCAA	2	8	45452	45459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014170	TGTA	2	8	45539	45546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014170	AAAC	2	8	45786	45793	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014170	GCTG	2	8	47460	47467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014170	GCGA	2	8	47489	47496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014170	GCAA	2	8	47874	47881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014170	CAGG	2	8	47886	47893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014170	AGGT	2	8	47927	47934	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014170	CAAA	2	8	49486	49493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014170	TGGC	2	8	49868	49875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014170	GCTG	2	8	52880	52887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014170	AAAC	2	8	52892	52899	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014170	AAAC	2	8	59586	59593	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014170	AATT	2	8	66453	66460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014170	ATAA	2	8	66466	66473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014170	TTAT	2	8	66478	66485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014170	TAAA	2	8	69547	69554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014170	TAAG	2	8	69617	69624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014170	GTTG	2	8	75107	75114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014170	TAAA	2	8	77893	77900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014170	AATT	2	8	78301	78308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014170	TAAT	2	8	79656	79663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014170	TTTA	2	8	79867	79874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014170	GCTG	2	8	80299	80306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014170	TGGC	2	8	80432	80439	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014170	AATT	2	8	80654	80661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014170	TCAG	2	8	82184	82191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014170	CTGA	2	8	82604	82611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014170	ATAA	2	8	86407	86414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014170	GCTG	2	8	86509	86516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014170	AATA	2	8	86594	86601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014170	CTTT	2	8	87075	87082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014170	AATT	2	8	87742	87749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014170	TGAC	2	8	88382	88389	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014170	ATGG	2	8	88834	88841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014170	AAAT	2	8	89410	89417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014170	AATC	2	8	89790	89797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014170	TAAA	2	8	90406	90413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014170	TCTG	2	8	90541	90548	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014170	TCCA	2	8	96145	96152	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014170	TACA	2	8	96811	96818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014170	CACT	2	8	98726	98733	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014170	ATAG	2	8	98737	98744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014170	CGAT	2	8	103471	103478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014170	CCTT	2	8	103560	103567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014170	TTTC	2	8	103623	103630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014170	CTGG	2	8	105023	105030	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014170	CCGA	2	8	105157	105164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014170	ATGG	2	8	105361	105368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014170	GAGG	2	8	105601	105608	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014170	TTCA	2	8	105703	105710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014170	CAGG	2	8	106098	106105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014170	TAGA	2	8	107256	107263	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014170	GATA	2	8	113974	113981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014170	CGTT	2	8	114714	114721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014170	AGTA	2	8	116587	116594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014170	TTGA	2	8	118790	118797	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014170	TTTA	2	8	122795	122802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014170	TTAT	2	8	123784	123791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014170	CTAT	2	8	124481	124488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014170	AGTG	2	8	124492	124499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014170	ATGT	2	8	126406	126413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014170	ATCA	2	8	127068	127075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014170	TGAA	2	8	127082	127089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014170	ATCT	2	8	129677	129684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014170	AGAT	2	8	136136	136143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014170	AACG	2	8	139346	139353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014170	ACTC	2	8	139414	139421	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014170	ATCA	2	8	139638	139645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014170	GACA	2	8	140710	140717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014170	TGGC	2	8	151130	151137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.