MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 plasmid XNC1_p

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014170	GGT	2	6	109	114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014170	AGG	2	6	2119	2124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014170	GAA	2	6	3168	3173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014170	CCG	2	6	3176	3181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014170	TGT	2	6	3381	3386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014170	AGA	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014170	ATT	2	6	3432	3437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014170	CAT	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014170	ATA	2	6	3451	3456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014170	AAT	2	6	3483	3488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014170	TTC	3	9	3554	3562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014170	ATG	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014170	AGC	2	6	7123	7128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014170	CCT	2	6	7269	7274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014170	TGG	2	6	8145	8150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014170	GAA	2	6	8215	8220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014170	GAC	2	6	8335	8340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014170	TGC	2	6	8393	8398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014170	GAG	2	6	8423	8428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014170	TGG	2	6	8430	8435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014170	GTT	2	6	8436	8441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014170	CGC	2	6	8524	8529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014170	ATG	2	6	8579	8584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014170	GCT	2	6	8745	8750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014170	ATT	2	6	8764	8769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014170	AGA	2	6	8890	8895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014170	TGA	2	6	9069	9074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014170	TAT	2	6	9178	9183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014170	CAA	2	6	9236	9241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014170	TCC	2	6	9322	9327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_014170	ACA	2	6	9364	9369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014170	CAA	2	6	9395	9400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014170	CCT	2	6	9495	9500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_014170	GAA	2	6	9533	9538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014170	TGT	2	6	9586	9591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014170	ACC	2	6	9673	9678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014170	CTT	2	6	9718	9723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014170	GCC	2	6	9724	9729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014170	GAA	2	6	9815	9820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014170	GCT	2	6	9825	9830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014170	CAA	2	6	9883	9888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014170	GCT	2	6	12661	12666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014170	CAT	3	9	12681	12689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014170	AGC	2	6	12740	12745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014170	TTC	2	6	12805	12810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014170	ATC	2	6	13948	13953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014170	TGA	2	6	14039	14044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014170	GTT	2	6	14163	14168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014170	TTC	2	6	17849	17854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014170	GAG	2	6	17862	17867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014170	CAT	2	6	19076	19081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014170	ATA	2	6	35671	35676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014170	CAT	2	6	35683	35688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014170	ATT	2	6	36662	36667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014170	CTG	2	6	37186	37191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014170	TCT	2	6	37538	37543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014170	TCC	2	6	37665	37670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014170	GTG	2	6	37682	37687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014170	CCT	2	6	40787	40792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014170	GGC	2	6	40858	40863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014170	CGC	2	6	40886	40891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014170	GAG	2	6	41059	41064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014170	ATG	2	6	41069	41074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014170	CTC	2	6	41080	41085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014170	TTA	2	6	41238	41243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014170	TCT	2	6	41297	41302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014170	GTA	2	6	41395	41400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014170	AAG	2	6	41404	41409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014170	GGT	2	6	41452	41457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014170	TTG	2	6	41466	41471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014170	TGC	3	9	41475	41483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014170	ATG	2	6	41501	41506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014170	ACT	2	6	41609	41614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014170	GCG	2	6	41615	41620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014170	TTG	2	6	41780	41785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014170	CTC	2	6	41801	41806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014170	TGA	2	6	41808	41813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014170	GAA	2	6	41821	41826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014170	ATC	2	6	45298	45303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014170	TCC	2	6	45365	45370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014170	TCA	2	6	45474	45479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014170	GAA	2	6	45576	45581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014170	GAG	2	6	45680	45685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014170	GGT	2	6	46318	46323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014170	TAA	2	6	46430	46435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014170	ATG	2	6	47056	47061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014170	ATC	2	6	47079	47084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014170	ACA	2	6	47120	47125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014170	TGG	2	6	47198	47203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014170	CTG	2	6	47296	47301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014170	TCC	2	6	47355	47360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014170	CAA	2	6	47406	47411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014170	TGG	2	6	47591	47596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014170	ATC	2	6	47602	47607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014170	GCA	2	6	47613	47618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014170	TCG	2	6	47691	47696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014170	ACG	2	6	47699	47704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014170	TCT	2	6	47721	47726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014170	TGC	2	6	47727	47732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014170	ACA	2	6	47764	47769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014170	GGT	2	6	47984	47989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014170	TCA	2	6	47995	48000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014170	CAA	2	6	48043	48048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014170	CTC	2	6	48277	48282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014170	GAG	2	6	48293	48298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014170	TGA	2	6	49452	49457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014170	GTG	2	6	49825	49830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014170	TAA	2	6	52790	52795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014170	ATT	2	6	53268	53273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014170	TCC	2	6	53289	53294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014170	ATT	2	6	56168	56173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014170	CTA	2	6	56232	56237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014170	GAT	2	6	56279	56284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014170	TCG	2	6	56306	56311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014170	ACA	2	6	56336	56341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014170	CCT	2	6	56369	56374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014170	GGA	2	6	56518	56523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014170	CCT	2	6	56528	56533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_014170	CAT	2	6	57937	57942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014170	TCT	2	6	59505	59510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014170	CTG	2	6	59638	59643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014170	ACG	2	6	62251	62256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014170	ATG	2	6	62358	62363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014170	CTT	2	6	62371	62376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014170	AAG	2	6	62381	62386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014170	CGA	2	6	62425	62430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014170	CCT	2	6	62536	62541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014170	GTT	2	6	62994	62999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014170	TCC	2	6	64465	64470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014170	AAT	2	6	65862	65867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014170	AGG	2	6	65877	65882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014170	GAA	2	6	65926	65931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014170	TAA	2	6	66438	66443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014170	AAG	2	6	66503	66508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014170	AAT	2	6	66532	66537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014170	TAG	2	6	66590	66595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014170	GTG	2	6	69342	69347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014170	ATT	3	9	69361	69369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014170	TGA	2	6	69373	69378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014170	TCA	2	6	69445	69450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014170	TAT	2	6	69486	69491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014170	TAT	2	6	69496	69501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014170	TCC	2	6	69574	69579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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147	NC_014170	CAA	2	6	70380	70385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_014170	TCA	2	6	75002	75007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014170	TCC	2	6	77204	77209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_014170	TTA	2	6	77312	77317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_014170	ATA	2	6	77651	77656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_014170	AAT	2	6	77971	77976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.