MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 plasmid XNC1_p

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014170	AG	3	6	889	894	50 %	0 %	50 %	0 %	296491825
2	NC_014170	TG	3	6	1432	1437	0 %	50 %	50 %	0 %	296491826
3	NC_014170	GA	3	6	3079	3084	50 %	0 %	50 %	0 %	296491828
4	NC_014170	TG	3	6	3897	3902	0 %	50 %	50 %	0 %	296491830
5	NC_014170	AT	3	6	4431	4436	50 %	50 %	0 %	0 %	296491832
6	NC_014170	TC	3	6	5191	5196	0 %	50 %	0 %	50 %	296491834
7	NC_014170	CT	3	6	6132	6137	0 %	50 %	0 %	50 %	296491834
8	NC_014170	TG	3	6	6178	6183	0 %	50 %	50 %	0 %	296491834
9	NC_014170	TC	3	6	6499	6504	0 %	50 %	0 %	50 %	296491834
10	NC_014170	AC	3	6	6515	6520	50 %	0 %	0 %	50 %	296491834
11	NC_014170	CT	3	6	11641	11646	0 %	50 %	0 %	50 %	296491838
12	NC_014170	TC	3	6	11766	11771	0 %	50 %	0 %	50 %	296491838
13	NC_014170	AC	3	6	13098	13103	50 %	0 %	0 %	50 %	296491839
14	NC_014170	AG	3	6	13231	13236	50 %	0 %	50 %	0 %	296491840
15	NC_014170	AG	3	6	15731	15736	50 %	0 %	50 %	0 %	296491843
16	NC_014170	AG	3	6	15782	15787	50 %	0 %	50 %	0 %	296491843
17	NC_014170	AG	3	6	16286	16291	50 %	0 %	50 %	0 %	296491843
18	NC_014170	GA	3	6	16974	16979	50 %	0 %	50 %	0 %	296491844
19	NC_014170	CT	3	6	17195	17200	0 %	50 %	0 %	50 %	296491844
20	NC_014170	AC	3	6	17326	17331	50 %	0 %	0 %	50 %	296491844
21	NC_014170	TG	3	6	20591	20596	0 %	50 %	50 %	0 %	296491848
22	NC_014170	CT	3	6	21722	21727	0 %	50 %	0 %	50 %	296491848
23	NC_014170	CA	3	6	23934	23939	50 %	0 %	0 %	50 %	296491848
24	NC_014170	TG	3	6	23965	23970	0 %	50 %	50 %	0 %	296491848
25	NC_014170	TC	3	6	24693	24698	0 %	50 %	0 %	50 %	296491848
26	NC_014170	TG	3	6	25746	25751	0 %	50 %	50 %	0 %	296491850
27	NC_014170	AG	3	6	26476	26481	50 %	0 %	50 %	0 %	296491850
28	NC_014170	CT	3	6	26589	26594	0 %	50 %	0 %	50 %	296491850
29	NC_014170	TC	3	6	27411	27416	0 %	50 %	0 %	50 %	296491850
30	NC_014170	AC	3	6	27841	27846	50 %	0 %	0 %	50 %	296491850
31	NC_014170	AG	3	6	29701	29706	50 %	0 %	50 %	0 %	296491853
32	NC_014170	CT	3	6	30614	30619	0 %	50 %	0 %	50 %	296491854
33	NC_014170	GA	3	6	30700	30705	50 %	0 %	50 %	0 %	296491854
34	NC_014170	AT	3	6	32730	32735	50 %	50 %	0 %	0 %	296491856
35	NC_014170	GA	3	6	33142	33147	50 %	0 %	50 %	0 %	296491856
36	NC_014170	AC	3	6	33336	33341	50 %	0 %	0 %	50 %	296491856
37	NC_014170	AT	3	6	34176	34181	50 %	50 %	0 %	0 %	296491856
38	NC_014170	AG	3	6	34330	34335	50 %	0 %	50 %	0 %	296491856
39	NC_014170	CT	3	6	34362	34367	0 %	50 %	0 %	50 %	296491856
40	NC_014170	GT	3	6	35847	35852	0 %	50 %	50 %	0 %	296491858
41	NC_014170	GT	3	6	35974	35979	0 %	50 %	50 %	0 %	296491858
42	NC_014170	AG	3	6	36246	36251	50 %	0 %	50 %	0 %	296491858
43	NC_014170	TG	3	6	39220	39225	0 %	50 %	50 %	0 %	296491863
44	NC_014170	AC	4	8	40237	40244	50 %	0 %	0 %	50 %	296491864
45	NC_014170	TC	3	6	45904	45909	0 %	50 %	0 %	50 %	296491867
46	NC_014170	GA	3	6	49985	49990	50 %	0 %	50 %	0 %	296491874
47	NC_014170	CT	3	6	50799	50804	0 %	50 %	0 %	50 %	296491874
48	NC_014170	GA	3	6	51035	51040	50 %	0 %	50 %	0 %	296491874
49	NC_014170	TC	3	6	51061	51066	0 %	50 %	0 %	50 %	296491874
50	NC_014170	TG	3	6	52509	52514	0 %	50 %	50 %	0 %	296491876
51	NC_014170	AC	3	6	54132	54137	50 %	0 %	0 %	50 %	296491879
52	NC_014170	AG	3	6	54978	54983	50 %	0 %	50 %	0 %	296491879
53	NC_014170	CT	3	6	57801	57806	0 %	50 %	0 %	50 %	296491883
54	NC_014170	TG	3	6	57858	57863	0 %	50 %	50 %	0 %	296491883
55	NC_014170	TC	3	6	58246	58251	0 %	50 %	0 %	50 %	296491884
56	NC_014170	CT	3	6	59310	59315	0 %	50 %	0 %	50 %	296491885
57	NC_014170	TC	3	6	59443	59448	0 %	50 %	0 %	50 %	296491885
58	NC_014170	GA	3	6	61162	61167	50 %	0 %	50 %	0 %	296491888
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61	NC_014170	GA	3	6	62197	62202	50 %	0 %	50 %	0 %	296491888
62	NC_014170	CA	3	6	63407	63412	50 %	0 %	0 %	50 %	296491891
63	NC_014170	AG	3	6	63906	63911	50 %	0 %	50 %	0 %	296491891
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68	NC_014170	AT	3	6	67505	67510	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
69	NC_014170	GA	3	6	67752	67757	50 %	0 %	50 %	0 %	296491898
70	NC_014170	TA	3	6	68214	68219	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
71	NC_014170	AT	3	6	68263	68268	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
72	NC_014170	AT	3	6	68557	68562	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
73	NC_014170	AT	3	6	68591	68596	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
74	NC_014170	TA	3	6	68823	68828	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
75	NC_014170	AT	3	6	69058	69063	50 %	50 %	0 %	0 %	296491898
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81	NC_014170	TA	3	6	73430	73435	50 %	50 %	0 %	0 %	296491901
82	NC_014170	TA	3	6	75985	75990	50 %	50 %	0 %	0 %	296491905
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91	NC_014170	TG	3	6	84223	84228	0 %	50 %	50 %	0 %	296491911
92	NC_014170	AG	3	6	85798	85803	50 %	0 %	50 %	0 %	296491913
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104	NC_014170	CG	3	6	109292	109297	0 %	0 %	50 %	50 %	296491932
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107	NC_014170	AT	4	8	110478	110485	50 %	50 %	0 %	0 %	296491933
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109	NC_014170	TA	3	6	111235	111240	50 %	50 %	0 %	0 %	296491934
110	NC_014170	AG	3	6	111859	111864	50 %	0 %	50 %	0 %	296491934
111	NC_014170	TA	3	6	112093	112098	50 %	50 %	0 %	0 %	296491935
112	NC_014170	AT	3	6	113509	113514	50 %	50 %	0 %	0 %	296491937
113	NC_014170	TA	3	6	113601	113606	50 %	50 %	0 %	0 %	296491938
114	NC_014170	TA	3	6	114818	114823	50 %	50 %	0 %	0 %	296491941
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124	NC_014170	TA	3	6	124957	124962	50 %	50 %	0 %	0 %	296491952
125	NC_014170	TC	3	6	125962	125967	0 %	50 %	0 %	50 %	296491953
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.