MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JDM301 chromosome

Total Repeats: 36454

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014169	CCA	2	6	205	210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453188
2	NC_014169	GCC	2	6	243	248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453188
3	NC_014169	GTT	2	6	327	332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453188
4	NC_014169	ACA	2	6	373	378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453188
5	NC_014169	CGG	2	6	505	510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453188
6	NC_014169	CAG	2	6	645	650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453188
7	NC_014169	CGG	2	6	1019	1024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453188
8	NC_014169	TTC	2	6	1047	1052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453188
9	NC_014169	GCC	2	6	1184	1189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453188
10	NC_014169	TTC	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453188
11	NC_014169	CTT	2	6	1394	1399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453188
12	NC_014169	CAC	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453188
13	NC_014169	CAT	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453188
14	NC_014169	CAC	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453188
15	NC_014169	GCA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453188
16	NC_014169	CCA	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453189
17	NC_014169	GCT	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453189
18	NC_014169	GAA	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453189
19	NC_014169	GTC	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453189
20	NC_014169	ACC	2	6	3015	3020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453189
21	NC_014169	GCT	2	6	3113	3118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453189
22	NC_014169	CGG	2	6	3175	3180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453189
23	NC_014169	CGA	2	6	3197	3202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453189
24	NC_014169	CAA	2	6	3224	3229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453189
25	NC_014169	CCG	2	6	3325	3330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453189
26	NC_014169	CGA	2	6	3338	3343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453189
27	NC_014169	CGA	2	6	3383	3388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453189
28	NC_014169	AGG	2	6	3421	3426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453189
29	NC_014169	CCG	2	6	3433	3438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453189
30	NC_014169	GAC	2	6	3467	3472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453189
31	NC_014169	CAG	2	6	3501	3506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453189
32	NC_014169	CGA	2	6	3518	3523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453189
33	NC_014169	CAA	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453189
34	NC_014169	AGT	2	6	3647	3652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453190
35	NC_014169	TGG	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453190
36	NC_014169	CCA	2	6	3802	3807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453190
37	NC_014169	TGA	2	6	3824	3829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453190
38	NC_014169	GTC	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453190
39	NC_014169	CGC	2	6	3996	4001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453190
40	NC_014169	ATG	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453190
41	NC_014169	TTG	2	6	4092	4097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453190
42	NC_014169	CGA	2	6	4310	4315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453190
43	NC_014169	GAT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453190
44	NC_014169	GAT	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453190
45	NC_014169	GAC	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453190
46	NC_014169	CGC	2	6	4940	4945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453191
47	NC_014169	TGA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453191
48	NC_014169	CCA	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453191
49	NC_014169	GCG	2	6	5039	5044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453191
50	NC_014169	GTG	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453191
51	NC_014169	CGG	3	9	5294	5302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453191
52	NC_014169	AGC	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453192
53	NC_014169	GGC	2	6	5521	5526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453192
54	NC_014169	CAA	2	6	5539	5544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453192
55	NC_014169	CAC	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453192
56	NC_014169	TCG	2	6	5706	5711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453192
57	NC_014169	CGA	2	6	5722	5727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453192
58	NC_014169	GTG	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453192
59	NC_014169	TGA	2	6	5859	5864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453192
60	NC_014169	CGG	2	6	5878	5883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453192
61	NC_014169	CGG	4	12	5890	5901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453192
62	NC_014169	CGG	2	6	5914	5919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453192
63	NC_014169	ACC	2	6	6119	6124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453192
64	NC_014169	CAG	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453192
65	NC_014169	CGA	2	6	6202	6207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453192
66	NC_014169	CGA	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453192
67	NC_014169	CGC	2	6	6247	6252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
68	NC_014169	TCA	2	6	6366	6371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453192
69	NC_014169	CCG	2	6	6405	6410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
70	NC_014169	ACC	2	6	6428	6433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453192
71	NC_014169	CCA	2	6	6474	6479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453192
72	NC_014169	GGC	2	6	6485	6490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453192
73	NC_014169	GAG	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453192
74	NC_014169	CGA	2	6	6589	6594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453192
75	NC_014169	CCG	2	6	6612	6617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
76	NC_014169	TGA	2	6	6708	6713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453192
77	NC_014169	CAT	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453192
78	NC_014169	GCC	2	6	6803	6808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
79	NC_014169	CGC	2	6	6830	6835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
80	NC_014169	CCG	2	6	6852	6857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
81	NC_014169	TCC	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453192
82	NC_014169	GGC	2	6	6938	6943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453192
83	NC_014169	ATG	2	6	7034	7039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453192
84	NC_014169	CGG	3	9	7075	7083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453192
85	NC_014169	TCA	3	9	7128	7136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453192
86	NC_014169	TTC	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453192
87	NC_014169	GAT	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453192
88	NC_014169	CCG	2	6	7218	7223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
89	NC_014169	GCC	2	6	7243	7248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
90	NC_014169	ACC	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453192
91	NC_014169	CGC	3	9	7468	7476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
92	NC_014169	CGA	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453192
93	NC_014169	CGC	2	6	7523	7528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453192
94	NC_014169	ACA	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453193
95	NC_014169	CGA	2	6	7667	7672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
96	NC_014169	AGG	2	6	7714	7719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453193
97	NC_014169	ACC	2	6	7725	7730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453193
98	NC_014169	GCA	2	6	7778	7783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
99	NC_014169	TCG	2	6	7825	7830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453193
100	NC_014169	CGC	2	6	7875	7880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453193
101	NC_014169	ACG	2	6	7897	7902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
102	NC_014169	ACA	2	6	7927	7932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453193
103	NC_014169	ACC	2	6	7969	7974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453193
104	NC_014169	TCG	2	6	8044	8049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453193
105	NC_014169	CGA	2	6	8078	8083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
106	NC_014169	GCC	3	9	8088	8096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453193
107	NC_014169	ACG	2	6	8185	8190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
108	NC_014169	TGC	2	6	8212	8217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453193
109	NC_014169	CCG	2	6	8251	8256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453193
110	NC_014169	CCA	2	6	8275	8280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453193
111	NC_014169	CGC	2	6	8287	8292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453193
112	NC_014169	ACA	2	6	8293	8298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453193
113	NC_014169	CTG	2	6	8361	8366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453193
114	NC_014169	CAT	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453193
115	NC_014169	CCA	2	6	8413	8418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453193
116	NC_014169	GAG	2	6	8496	8501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453193
117	NC_014169	TGG	2	6	8521	8526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453193
118	NC_014169	TCG	2	6	8563	8568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453193
119	NC_014169	CGA	2	6	8624	8629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
120	NC_014169	GGT	2	6	8690	8695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453193
121	NC_014169	AAC	2	6	8700	8705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296453193
122	NC_014169	GCA	2	6	8726	8731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
123	NC_014169	ACC	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453193
124	NC_014169	GCT	2	6	8984	8989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453193
125	NC_014169	ATC	2	6	9147	9152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453193
126	NC_014169	CGA	2	6	9164	9169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
127	NC_014169	CGA	2	6	9188	9193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
128	NC_014169	CCG	2	6	9194	9199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453193
129	NC_014169	GTG	2	6	9261	9266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453193
130	NC_014169	TCA	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453193
131	NC_014169	CGA	2	6	9308	9313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
132	NC_014169	GGC	2	6	9333	9338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453193
133	NC_014169	GAC	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
134	NC_014169	GTG	2	6	9375	9380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453193
135	NC_014169	CTT	2	6	9386	9391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453193
136	NC_014169	GCT	2	6	9413	9418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453193
137	NC_014169	TTC	2	6	9420	9425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453193
138	NC_014169	CTG	2	6	9510	9515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453193
139	NC_014169	CGA	2	6	9527	9532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
140	NC_014169	AAG	2	6	9612	9617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453193
141	NC_014169	GGC	2	6	9651	9656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453193
142	NC_014169	CGA	2	6	9680	9685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
143	NC_014169	CGA	2	6	9701	9706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453193
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146	NC_014169	GCC	2	6	9814	9819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453193
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150	NC_014169	GTG	2	6	9912	9917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453193
151	NC_014169	GTG	2	6	10015	10020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453193
152	NC_014169	GTG	2	6	10038	10043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453193
153	NC_014169	CAT	2	6	10067	10072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453193
154	NC_014169	GAG	2	6	10194	10199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453193
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159	NC_014169	GAA	2	6	10500	10505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453194
160	NC_014169	CTT	2	6	10516	10521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453194
161	NC_014169	GCC	2	6	10527	10532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453194
162	NC_014169	CGC	2	6	10575	10580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453194
163	NC_014169	ATT	2	6	10656	10661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296453194
164	NC_014169	TGC	2	6	10690	10695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453194
165	NC_014169	ACC	2	6	10791	10796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453194
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169	NC_014169	CTG	2	6	10848	10853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453194
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239	NC_014169	ATC	2	6	16498	16503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453198
240	NC_014169	GCC	2	6	16540	16545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453198
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242	NC_014169	CGA	2	6	16599	16604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453198
243	NC_014169	TGG	2	6	16715	16720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453198
244	NC_014169	CTG	2	6	16768	16773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453198
245	NC_014169	CTC	2	6	16824	16829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453198
246	NC_014169	GCA	2	6	16861	16866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453198
247	NC_014169	GCC	2	6	16891	16896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453198
248	NC_014169	CTG	2	6	17047	17052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453198
249	NC_014169	GAG	2	6	17095	17100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296453198
250	NC_014169	CGA	2	6	17139	17144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453198
251	NC_014169	CCA	2	6	17208	17213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453198
252	NC_014169	CTG	2	6	17648	17653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453199
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254	NC_014169	CGC	2	6	17712	17717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453199
255	NC_014169	CCG	2	6	17804	17809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453199
256	NC_014169	AAG	2	6	17836	17841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453199
257	NC_014169	CGC	2	6	17847	17852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453199
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