MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014168	CAAACA	2	12	1856	1867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014168	AACGGA	2	12	13067	13078	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014168	CCCGGC	2	12	75342	75353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014168	CGTTCG	2	12	106887	106898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014168	CGTTCG	2	12	107184	107195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014168	CCAGCG	2	12	120996	121007	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014168	GCCCGC	2	12	212051	212062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014168	CGTTTC	2	12	213121	213132	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014168	TGGCGG	2	12	238084	238095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014168	GCGCAT	2	12	238100	238111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014168	CAACGG	2	12	257285	257296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014168	GGGGAA	2	12	325387	325398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014168	CGGTTT	2	12	377042	377053	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014168	GCCCTG	2	12	402539	402550	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014168	AGCGGC	2	12	406667	406678	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014168	GGACCA	2	12	433209	433220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014168	GCATGG	2	12	455265	455276	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014168	CGTTCA	2	12	481923	481934	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014168	GCTGGT	2	12	489521	489532	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014168	TGGCGG	2	12	514326	514337	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014168	CTAGTT	2	12	525743	525754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014168	CCACGC	2	12	527602	527613	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014168	ATAAAT	2	12	608916	608927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014168	GCGGGC	2	12	616601	616612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014168	GCCCAG	2	12	618903	618914	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014168	CTCTTC	2	12	641958	641969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014168	GGCGAA	2	12	647039	647050	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014168	TCGGTT	2	12	664670	664681	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014168	TCCCGC	2	12	664757	664768	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_014168	CCGGCA	2	12	691746	691757	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014168	TGGGGG	2	12	769970	769981	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014168	CGAGCA	2	12	820673	820684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014168	TGACCG	2	12	826518	826529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014168	CTCGAG	2	12	840205	840216	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014168	AAGCCG	2	12	843723	843734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014168	GCGCCC	2	12	843786	843797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014168	AGGGGC	2	12	897538	897549	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014168	CCTGCC	2	12	899372	899383	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014168	GCAACC	2	12	899395	899406	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014168	GCGCAG	2	12	913454	913465	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014168	AAAGTC	2	12	1005283	1005294	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014168	GGGCAT	2	12	1073316	1073327	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014168	CGTTAG	2	12	1095476	1095487	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014168	ATTGTG	2	12	1095514	1095525	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014168	CGACTC	2	12	1138779	1138790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014168	GGTGCT	2	12	1139734	1139745	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014168	GCCTCG	2	12	1148956	1148967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014168	TATCAC	2	12	1150042	1150053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014168	TTCAAG	2	12	1231185	1231196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014168	TGCGTT	2	12	1286136	1286147	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014168	GCACGG	2	12	1301868	1301879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014168	GGAGAA	2	12	1315480	1315491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014168	GGCGGG	2	12	1388677	1388688	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014168	AGGGGC	2	12	1418381	1418392	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014168	TGCGTT	2	12	1445579	1445590	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014168	CCGACG	2	12	1461432	1461443	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014168	CGGGGG	2	12	1493583	1493594	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014168	CCGAGC	2	12	1499286	1499297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014168	ACGGCG	2	12	1550093	1550104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014168	GCAGGG	2	12	1561201	1561212	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014168	CGGCGA	2	12	1567857	1567868	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014168	CGGCCG	2	12	1612942	1612953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014168	CGGTTC	2	12	1622627	1622638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014168	CGAACG	2	12	1681613	1681624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014168	CTCTCC	2	12	1729867	1729878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014168	ACCGCG	2	12	1826045	1826056	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014168	GGGCGA	2	12	1845219	1845230	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014168	AGCCCG	2	12	1952065	1952076	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014168	TTTCTT	2	12	1958129	1958140	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014168	GCTCGC	2	12	1964957	1964968	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014168	GGAGCG	2	12	1975431	1975442	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014168	TTTTCT	2	12	1977851	1977862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014168	CGCCGG	2	12	2041463	2041474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014168	GATATT	2	12	2046173	2046184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014168	CGCGCC	2	12	2087094	2087105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014168	TGCCCC	2	12	2091049	2091060	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_014168	GCCGCA	2	12	2131694	2131705	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014168	GCCGGT	2	12	2142226	2142237	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014168	AGGCCG	2	12	2240440	2240451	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014168	GGCGTA	2	12	2266141	2266152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014168	GCGCGG	2	12	2280514	2280525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014168	TGCTGG	2	12	2291702	2291713	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014168	CGGGCG	2	12	2338261	2338272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014168	TCGCGG	2	12	2347754	2347765	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014168	TCGGGT	2	12	2393552	2393563	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014168	CCTTCG	2	12	2461156	2461167	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_014168	ATCGGC	2	12	2508177	2508188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014168	GGGAAC	2	12	2516616	2516627	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014168	ACAGCG	2	12	2595577	2595588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014168	GGTCCG	2	12	2626677	2626688	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014168	GCCACA	2	12	2647859	2647870	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014168	GGGCTT	2	12	2765970	2765981	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014168	ATATTT	2	12	2836111	2836122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014168	ATCCCG	2	12	2926089	2926100	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014168	GCCATT	2	12	2945598	2945609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014168	AAGGGA	2	12	2961543	2961554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014168	CTGGGC	2	12	2964607	2964618	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014168	GACACG	2	12	2992235	2992246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014168	CCGGAG	2	12	3021111	3021122	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014168	GGGCGG	2	12	3057431	3057442	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014168	CATTGC	2	12	3081703	3081714	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014168	GTTTTC	2	12	3098348	3098359	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014168	CGCAGT	2	12	3115032	3115043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014168	GCGGGG	2	12	3118025	3118036	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014168	GCTTTT	2	12	3150949	3150960	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.