MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Arcobacter nitrofigilis DSM 7299 chromosome

Total Repeats: 2115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014166	ATTGAT	2	12	2430	2441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296271547
2	NC_014166	GAAGGT	2	12	2875	2886	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296271548
3	NC_014166	TGGGGT	2	12	2973	2984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296271548
4	NC_014166	CGGATG	2	12	4106	4117	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296271548
5	NC_014166	AATTTG	2	12	6248	6259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296271551
6	NC_014166	GAAGTT	2	12	10456	10467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296271556
7	NC_014166	CTTGTT	2	12	12798	12809	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296271557
8	NC_014166	TTATAT	2	12	21938	21949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296271569
9	NC_014166	TTTTGA	2	12	24237	24248	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296271570
10	NC_014166	AAGATA	2	12	25304	25315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296271570
11	NC_014166	CACTTT	2	12	27163	27174	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	296271573
12	NC_014166	AAATCA	2	12	27231	27242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296271573
13	NC_014166	CTGCAA	2	12	27319	27330	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296271573
14	NC_014166	AAATTT	2	12	27751	27762	50 %	50 %	0 %	0 %	296271574
15	NC_014166	ATGAAA	2	12	28647	28658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014166	ATAAAA	3	18	29054	29071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014166	ATTCTT	2	12	29169	29180	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296271575
18	NC_014166	AATCAA	2	12	29365	29376	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296271575
19	NC_014166	AAAATA	2	12	31416	31427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296271577
20	NC_014166	ACTACA	2	12	33113	33124	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296271578
21	NC_014166	TGTATT	2	12	33709	33720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296271579
22	NC_014166	ACCAAG	2	12	34137	34148	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	296271579
23	NC_014166	GGAATA	2	12	35122	35133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296271580
24	NC_014166	TGAAGT	2	12	36917	36928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296271581
25	NC_014166	CTATTT	2	12	38713	38724	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296271582
26	NC_014166	TTTCCC	2	12	42477	42488	0 %	50 %	0 %	50 %	296271587
27	NC_014166	ACTCAT	2	12	46312	46323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296271592
28	NC_014166	ATAAAA	2	12	50522	50533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296271596
29	NC_014166	TTGGAC	2	12	57452	57463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	296271604
30	NC_014166	TTAAAG	2	12	60416	60427	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296271609
31	NC_014166	CACTTG	2	12	62901	62912	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296271613
32	NC_014166	TAAAAT	2	12	63411	63422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014166	ACAATT	2	12	65176	65187	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	296271616
34	NC_014166	TTTCTA	2	12	66729	66740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296271617
35	NC_014166	TGGTTT	2	12	68158	68169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296271618
36	NC_014166	AAGGTG	2	12	69163	69174	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296271620
37	NC_014166	TGAAAA	2	12	70039	70050	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296271621
38	NC_014166	TCTTTA	2	12	78433	78444	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296271632
39	NC_014166	AATTTA	2	12	79677	79688	50 %	50 %	0 %	0 %	296271633
40	NC_014166	AAGATG	2	12	80550	80561	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296271634
41	NC_014166	ATTGCA	2	12	80861	80872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296271634
42	NC_014166	GAAAAA	2	12	81482	81493	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296271634
43	NC_014166	TCTATT	2	12	82010	82021	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296271634
44	NC_014166	AAGTAA	2	12	83169	83180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296271635
45	NC_014166	TTTTTC	2	12	85240	85251	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296271637
46	NC_014166	GCTAAA	2	12	85271	85282	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296271637
47	NC_014166	TTGTTT	2	12	85956	85967	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	296271637
48	NC_014166	ATTTAA	2	12	86518	86529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014166	TAAAAA	2	12	87204	87215	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296271639
50	NC_014166	TAAAAG	2	12	87332	87343	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296271639
51	NC_014166	CAATAC	2	12	87467	87478	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296271639
52	NC_014166	ATAAAA	2	12	91077	91088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296271644
53	NC_014166	AACTTG	2	12	95208	95219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014166	CCAACA	2	12	95251	95262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014166	TATTTT	2	12	98042	98053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	296271651
56	NC_014166	AAAGAT	2	12	98832	98843	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296271651
57	NC_014166	TTTAAA	2	12	99370	99381	50 %	50 %	0 %	0 %	296271652
58	NC_014166	TTGCAT	2	12	99489	99500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296271652
59	NC_014166	ATTGCT	2	12	99857	99868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296271652
60	NC_014166	TGAAAC	2	12	101772	101783	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296271653
61	NC_014166	ATATCT	2	12	103517	103528	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296271654
62	NC_014166	TACCAT	2	12	103669	103680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296271655
63	NC_014166	TCATGC	2	12	103933	103944	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296271655
64	NC_014166	TGCTTT	2	12	104553	104564	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296271655
65	NC_014166	CAAGTC	2	12	106292	106303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	296271658
66	NC_014166	TTAATT	2	12	109075	109086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296271661
67	NC_014166	ACTTTT	2	12	109184	109195	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296271661
68	NC_014166	AAATGT	2	12	109832	109843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296271661
69	NC_014166	CTAAAA	2	12	113583	113594	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	296271664
70	NC_014166	TAAGTA	2	12	115075	115086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296271666
71	NC_014166	TTGATT	2	12	120716	120727	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	296271670
72	NC_014166	AATTTT	2	12	121686	121697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296271671
73	NC_014166	GCACCT	2	12	123188	123199	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296271674
74	NC_014166	ACAAAG	2	12	125857	125868	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296271676
75	NC_014166	CATTTT	2	12	134861	134872	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296271686
76	NC_014166	AAACTA	2	12	135737	135748	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014166	CTTCAT	2	12	136480	136491	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	296271687
78	NC_014166	CTTTTG	2	12	141629	141640	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296271692
79	NC_014166	TTTTGG	2	12	142443	142454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296271692
80	NC_014166	TTTTAT	2	12	144197	144208	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	296271695
81	NC_014166	GAAAAA	2	12	144316	144327	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296271695
82	NC_014166	TGTACC	2	12	144789	144800	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296271695
83	NC_014166	AGATAC	2	12	146714	146725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296271698
84	NC_014166	AGAGTT	2	12	147563	147574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296271698
85	NC_014166	TTCTTT	2	12	149906	149917	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296271700
86	NC_014166	AAATAA	2	12	150968	150979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	296271701
87	NC_014166	TAAAAT	2	12	153070	153081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296271704
88	NC_014166	ATGAAG	2	12	154866	154877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296271705
89	NC_014166	GGTGAA	2	12	155726	155737	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	296271706
90	NC_014166	TTTATT	2	12	155941	155952	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	296271706
91	NC_014166	ATTATA	2	12	155972	155983	50 %	50 %	0 %	0 %	296271706
92	NC_014166	AATTGC	2	12	156064	156075	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296271706
93	NC_014166	TTAGAT	2	12	156459	156470	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	296271706
94	NC_014166	TGGTAT	2	12	156595	156606	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296271706
95	NC_014166	TCAAAC	2	12	160109	160120	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296271709
96	NC_014166	CATTAT	2	12	167165	167176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296271716
97	NC_014166	TTTATA	2	12	167649	167660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296271717
98	NC_014166	GATGAA	2	12	169577	169588	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	296271719
99	NC_014166	GCAATA	2	12	170321	170332	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296271721
100	NC_014166	AAAAGA	2	12	173203	173214	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296271723
101	NC_014166	AATATG	2	12	175488	175499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296271727
102	NC_014166	TGAAAA	2	12	176218	176229	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296271730
103	NC_014166	AAAAGA	2	12	178414	178425	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	296271733
104	NC_014166	TGGACC	2	12	180981	180992	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296271736
105	NC_014166	AGAAAT	2	12	182379	182390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296271738
106	NC_014166	ATTTTT	2	12	185393	185404	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014166	TATATT	2	12	185915	185926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014166	GTGTTA	2	12	186734	186745	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296271741
109	NC_014166	ACTTTA	2	12	187169	187180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296271741
110	NC_014166	AAAGCT	2	12	190123	190134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	296271744
111	NC_014166	CTATGA	2	12	191429	191440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296271745
112	NC_014166	TGCAAT	2	12	191634	191645	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296271746
113	NC_014166	ATAAGT	2	12	191979	191990	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296271748
114	NC_014166	TTTTCT	2	12	193072	193083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296271748
115	NC_014166	TTATCT	2	12	193291	193302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296271748
116	NC_014166	ATCTTT	2	12	193926	193937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	296271748
117	NC_014166	CAAAAG	2	12	196659	196670	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	296271751
118	NC_014166	ATGCTT	2	12	197830	197841	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296271752
119	NC_014166	GGTATT	2	12	198117	198128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296271752
120	NC_014166	TGATAA	2	12	200983	200994	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296271754
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231	NC_014166	TAAAAG	2	12	369316	369327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
232	NC_014166	GTTACA	2	12	371743	371754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	296271928
233	NC_014166	ATCCCA	2	12	374938	374949	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	296271931
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352	NC_014166	ACATCA	2	12	569715	569726	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	296272121
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462	NC_014166	TTGGAT	2	12	717636	717647	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	296272271
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464	NC_014166	TTTTTG	2	12	721211	721222	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	296272274
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469	NC_014166	ATTTAT	2	12	732657	732668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296272285
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