MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcobacter nitrofigilis DSM 7299 chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014166	ATGAAA	2	12	28647	28658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014166	ATAAAA	3	18	29054	29071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014166	TAAAAT	2	12	63411	63422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014166	ATTTAA	2	12	86518	86529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014166	AACTTG	2	12	95208	95219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014166	CCAACA	2	12	95251	95262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014166	AAACTA	2	12	135737	135748	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014166	ATTTTT	2	12	185393	185404	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014166	TATATT	2	12	185915	185926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014166	TAAAAA	2	12	214745	214756	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014166	ACTTGT	2	12	241218	241229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014166	TATTTC	2	12	270095	270106	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014166	AAGTAA	2	12	275281	275292	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014166	TTATAT	2	12	275366	275377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014166	AAAATC	2	12	275519	275530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014166	TAAGTT	2	12	289957	289968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014166	TAAAAG	2	12	369316	369327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014166	ATAAAA	2	12	387298	387309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014166	TTTATG	2	12	505399	505410	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014166	TTTTAA	2	12	536367	536378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014166	ATTTGT	2	12	542050	542061	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014166	AATTTA	2	12	553278	553289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014166	AAATAT	2	12	590937	590948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014166	ATAAAA	2	12	616050	616061	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014166	AATATA	2	12	634846	634857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014166	AGAAAT	2	12	634867	634878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014166	TATAAA	2	12	668675	668686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014166	ATTTTA	2	12	706704	706715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014166	AAAGTA	2	12	715902	715913	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014166	TAAAAA	2	12	743151	743162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014166	TGTAAT	2	12	750685	750696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014166	TTAATT	2	12	767826	767837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014166	AAATCT	2	12	892471	892482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014166	ATATTA	2	12	988369	988380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014166	ATATTT	2	12	998399	998410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014166	ATAATT	2	12	1009346	1009357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014166	ATAACA	2	12	1009369	1009380	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014166	ATTTTA	2	12	1013982	1013993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014166	TAAAAT	2	12	1043821	1043832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014166	TTGCTT	2	12	1072815	1072826	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014166	TCTTTT	2	12	1111112	1111123	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014166	ATAAAA	2	12	1116479	1116490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014166	AATTTA	2	12	1116790	1116801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014166	ACTTTA	2	12	1118952	1118963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014166	TTAAAA	2	12	1137748	1137759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014166	AGATAA	2	12	1194968	1194979	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014166	TATAAA	2	12	1219547	1219558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014166	GCTAAG	2	12	1279335	1279346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014166	TATAAA	2	12	1328521	1328532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014166	TTATTT	2	12	1346155	1346166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014166	TAGGAG	2	12	1346265	1346276	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014166	TAATAC	2	12	1390382	1390393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014166	AGCTTT	2	12	1401903	1401914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014166	TATTCA	2	12	1405633	1405644	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014166	TTTTAA	2	12	1512932	1512943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014166	AAAGTA	2	12	1517676	1517687	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014166	AAGAAT	2	12	1526198	1526209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014166	GATAAC	2	12	1536197	1536208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014166	TCAAAA	2	12	1543982	1543993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014166	TTAATT	2	12	1548076	1548087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014166	TATAAA	2	12	1578696	1578707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014166	TAAAAA	2	12	1581867	1581878	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014166	ATTACT	2	12	1588075	1588086	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014166	TATAAT	2	12	1615713	1615724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014166	TTTTAT	2	12	1645785	1645796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014166	AGTAAA	2	12	1650239	1650250	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014166	GATAAT	2	12	1764327	1764338	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014166	TTTTAA	2	12	1808120	1808131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014166	TTTAAT	2	12	1831259	1831270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014166	GATTTT	2	12	1831316	1831327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014166	TATTTA	2	12	1884769	1884780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014166	TAAATA	2	12	1957180	1957191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014166	ATTATA	2	12	1957886	1957897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014166	ATAGTT	2	12	1983048	1983059	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014166	TCATTT	2	12	1990630	1990641	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014166	ATATTA	2	12	2029719	2029730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014166	ATTGAT	2	12	2112775	2112786	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014166	GATAAC	2	12	2128449	2128460	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014166	ATCTTA	2	12	2128618	2128629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014166	TTCAAG	2	12	2131758	2131769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014166	CCTAGC	2	12	2131837	2131848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014166	TTCAAG	2	12	2133213	2133224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014166	TAAATA	2	12	2140532	2140543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014166	TTTAAA	2	12	2176110	2176121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014166	TAAAAA	2	12	2208249	2208260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014166	ATAAAT	2	12	2218924	2218935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014166	AAAGCT	2	12	2221626	2221637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014166	AATATT	2	12	2238018	2238029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014166	GTACAA	2	12	2327154	2327165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014166	ATAAAA	2	12	2332518	2332529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014166	AGAATA	2	12	2357497	2357508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014166	AGTTAA	2	12	2365843	2365854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014166	TATTCC	2	12	2371929	2371940	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014166	ATTATA	2	12	2386920	2386931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014166	AATTTC	2	12	2386948	2386959	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014166	TTATAT	2	12	2427188	2427199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014166	TAAATC	2	12	2427889	2427900	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014166	AAAAGA	2	12	2428027	2428038	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014166	AGGAAA	2	12	2428882	2428893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014166	TATAAA	2	12	2444009	2444020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014166	AAATTT	2	12	2454981	2454992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014166	TTAAAT	2	12	2503630	2503641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014166	TTGTTT	2	12	2505196	2505207	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014166	ATTAAT	2	12	2518117	2518128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014166	AATTAT	2	12	2539109	2539120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014166	CTGTGC	2	12	2569287	2569298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014166	CTCTTT	2	12	2570124	2570135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014166	ATTTTT	2	12	2574377	2574388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014166	CTTAAA	2	12	2613894	2613905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014166	ATTTTT	2	12	2634672	2634683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014166	TAAAAA	2	12	2656373	2656384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014166	GTACAA	2	12	2658548	2658559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014166	TACCAA	2	12	2669374	2669385	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014166	TACTTT	2	12	2714268	2714279	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014166	ATAAAT	2	12	2735460	2735471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014166	AACAAA	2	12	2746358	2746369	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014166	TTATAT	2	12	2769471	2769482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014166	GAAAAA	2	12	2826747	2826758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014166	TTTTAT	2	12	2852662	2852673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014166	TTATAT	2	12	2888017	2888028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014166	TAATTA	2	12	2890224	2890235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014166	TGTAGA	2	12	2921851	2921862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014166	AGAAAT	2	12	3004016	3004027	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014166	TTTTAG	2	12	3045309	3045320	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014166	GTACAA	2	12	3085599	3085610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014166	TTAAAT	2	12	3103641	3103652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014166	CTTTAT	2	12	3113306	3113317	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014166	TTTTAT	2	12	3148576	3148587	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014166	AAAATG	2	12	3155437	3155448	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014166	TTTGGA	2	12	3155815	3155826	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014166	TCTTTA	2	12	3155956	3155967	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.