MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcobacter nitrofigilis DSM 7299 chromosome

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014166	TATAT	2	10	53070	53079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014166	TTTAT	2	10	65279	65288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014166	AGAGA	2	10	77439	77448	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014166	CATAT	2	10	78582	78591	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014166	TTATT	2	10	97428	97437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014166	AATGA	2	10	116183	116192	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014166	TTTAA	2	10	126892	126901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014166	AACTT	2	10	143370	143379	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014166	AGATA	2	10	143386	143395	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014166	TTTAA	2	10	159804	159813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014166	ATTAT	2	10	167489	167498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014166	AAGCT	2	10	168463	168472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014166	ATCAA	2	10	171364	171373	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014166	AAGAA	2	10	176168	176177	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014166	ATTTG	2	10	180190	180199	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014166	ATTTT	2	10	185962	185971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014166	TAAAT	2	10	195291	195300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014166	TTTTA	2	10	214674	214683	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014166	TACAA	2	10	216532	216541	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014166	TAATA	2	10	220125	220134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014166	TTAAT	2	10	231632	231641	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014166	AACTT	2	10	231658	231667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014166	TAAAC	2	10	237917	237926	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014166	TCGTG	2	10	238979	238988	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014166	GTGAA	2	10	240199	240208	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014166	CCGTA	2	10	241659	241668	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014166	TAAAA	2	10	247559	247568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014166	AAAAG	2	10	267051	267060	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014166	ATAAA	2	10	270135	270144	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014166	ATAAA	2	10	270891	270900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014166	GAATT	2	10	275614	275623	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014166	TTATA	2	10	303164	303173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014166	TGTAT	2	10	303191	303200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014166	ATTAT	2	10	317613	317622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014166	TAATG	2	10	377760	377769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014166	ATTAT	2	10	407007	407016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014166	TTAAA	2	10	427763	427772	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014166	ATTAA	2	10	437440	437449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014166	ATTTT	3	15	442597	442611	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014166	ACTAA	2	10	446885	446894	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014166	ACTAA	2	10	455358	455367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014166	TAAAT	2	10	456103	456112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014166	CTTTT	2	10	475638	475647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014166	TAATT	2	10	483042	483051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014166	TTTAT	2	10	484215	484224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014166	TAATT	2	10	484253	484262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014166	TAATT	2	10	491964	491973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014166	TTAAT	2	10	491998	492007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014166	TAAAA	2	10	494922	494931	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014166	TAGAT	2	10	536433	536442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014166	CTAAA	2	10	557557	557566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014166	TAATT	2	10	559620	559629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014166	TTTAA	2	10	562059	562068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014166	AGAAT	2	10	565067	565076	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014166	TAAAA	2	10	584580	584589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014166	TTTAA	2	10	596442	596451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014166	ATAAA	2	10	604213	604222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014166	AGAAT	2	10	605909	605918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014166	CAATA	2	10	606510	606519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014166	TAAAA	2	10	608888	608897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014166	TAAAA	2	10	609063	609072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014166	CATTT	2	10	615376	615385	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014166	TAATA	2	10	636540	636549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014166	AATTA	2	10	662572	662581	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014166	TAATA	2	10	662727	662736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014166	ATTTT	2	10	668633	668642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014166	AGTTC	2	10	673385	673394	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014166	TAAAA	2	10	681269	681278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014166	ATTTT	2	10	683191	683200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014166	TTTTA	2	10	692573	692582	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014166	TTTTA	3	15	694232	694246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014166	ATTAA	2	10	704726	704735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014166	ATAAA	2	10	710820	710829	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014166	AAGTT	2	10	711461	711470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014166	ATAAA	2	10	716083	716092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014166	ATGTA	2	10	743106	743115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014166	TAAAG	2	10	745874	745883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014166	AACTA	2	10	753124	753133	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014166	AACTA	2	10	753486	753495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014166	TAAAA	2	10	755781	755790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014166	ATAAA	2	10	763301	763310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014166	TTAAA	2	10	765069	765078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014166	ATATA	2	10	773514	773523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014166	TAAAA	3	15	783044	783058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014166	CTCTC	2	10	795572	795581	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_014166	ATAAA	2	10	802207	802216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014166	AAAAT	2	10	802779	802788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014166	TAGAA	2	10	810591	810600	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014166	CATTA	2	10	838283	838292	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014166	TATTC	2	10	858767	858776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014166	ATTTA	2	10	870365	870374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014166	ATAAA	2	10	889909	889918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014166	TTTTG	2	10	901160	901169	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014166	TTAAA	2	10	905275	905284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014166	AAAAG	2	10	923621	923630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014166	TATAA	2	10	928133	928142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014166	ATTTA	2	10	948345	948354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014166	ATAAA	2	10	950444	950453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014166	TAAAA	2	10	950618	950627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014166	TTACT	2	10	976444	976453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014166	CCTGC	2	10	983300	983309	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
102	NC_014166	AAAAG	2	10	983912	983921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014166	AAATT	2	10	995126	995135	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014166	TAGAA	2	10	1000406	1000415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014166	TAAAA	2	10	1018705	1018714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014166	TAAAA	2	10	1025731	1025740	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014166	ATATA	2	10	1030796	1030805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014166	TAAAA	2	10	1053204	1053213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014166	ATTTT	2	10	1062403	1062412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014166	AGCTT	2	10	1064410	1064419	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014166	CCTGC	2	10	1072476	1072485	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_014166	AATTA	2	10	1076451	1076460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014166	TTTTA	2	10	1080922	1080931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014166	TTATT	2	10	1081960	1081969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014166	TATAA	2	10	1095714	1095723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014166	TTAAT	2	10	1111126	1111135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014166	AATTA	2	10	1111258	1111267	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014166	ATAAA	2	10	1113173	1113182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014166	TAATA	2	10	1113187	1113196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014166	AAAGT	2	10	1115828	1115837	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014166	TTTTA	2	10	1116056	1116065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014166	TAATT	2	10	1118146	1118155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014166	CTTTT	2	10	1122512	1122521	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014166	TATAA	2	10	1130446	1130455	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014166	ATTAA	2	10	1139999	1140008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014166	AAGAA	2	10	1150485	1150494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014166	TTGTT	2	10	1162476	1162485	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014166	TTTTG	2	10	1162562	1162571	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014166	TAATT	2	10	1166768	1166777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014166	CCTGC	2	10	1172942	1172951	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_014166	GTATG	2	10	1173407	1173416	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014166	TGAAT	2	10	1175222	1175231	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014166	TCCTT	2	10	1194791	1194800	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014166	TTATA	2	10	1201148	1201157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014166	AAATA	2	10	1201193	1201202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014166	ATAAC	2	10	1201792	1201801	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014166	TTTTA	2	10	1204390	1204399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014166	CAAAC	2	10	1204504	1204513	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014166	CCTGC	2	10	1205988	1205997	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_014166	ACAAA	2	10	1207454	1207463	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014166	ATAAA	2	10	1219454	1219463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014166	ATTTA	2	10	1241327	1241336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014166	TTTTA	2	10	1243319	1243328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014166	TATGT	2	10	1248475	1248484	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014166	ATTCT	2	10	1248525	1248534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014166	TGTAA	2	10	1252802	1252811	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_014166	GAGAC	2	10	2639281	2639290	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
288	NC_014166	TACGG	2	10	2658111	2658120	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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321	NC_014166	TAAAA	2	10	2827207	2827216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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328	NC_014166	TAATT	2	10	2929170	2929179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_014166	TAAAA	2	10	2980017	2980026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_014166	CTATT	2	10	3003799	3003808	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
332	NC_014166	GCTTA	2	10	3003824	3003833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
333	NC_014166	AAATA	2	10	3003834	3003843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_014166	TTTTA	2	10	3007112	3007121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_014166	GAAAA	2	10	3013440	3013449	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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350	NC_014166	TTATT	2	10	3094544	3094553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_014166	ATTTT	2	10	3103493	3103502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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360	NC_014166	TAAAT	2	10	3156362	3156371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
361	NC_014166	ACTAT	2	10	3169958	3169967	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
362	NC_014166	TAAAA	2	10	3169972	3169981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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364	NC_014166	AAAAT	2	10	3187502	3187511	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.