MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermobispora bispora DSM 43833 chromosome

Total Repeats: 5047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014165	GAACG	2	10	217	226	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014165	CGGCA	2	10	679	688	20 %	0 %	40 %	40 %	296267999
3	NC_014165	GGCCG	2	10	692	701	0 %	0 %	60 %	40 %	296267999
4	NC_014165	ACCAC	2	10	1732	1741	40 %	0 %	0 %	60 %	296267999
5	NC_014165	CGTGG	2	10	2428	2437	0 %	20 %	60 %	20 %	296268000
6	NC_014165	GGTCC	2	10	3555	3564	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014165	GGGCA	2	10	4815	4824	20 %	0 %	60 %	20 %	296268002
8	NC_014165	ACGGC	2	10	5339	5348	20 %	0 %	40 %	40 %	296268002
9	NC_014165	CGCTC	2	10	5386	5395	0 %	20 %	20 %	60 %	296268002
10	NC_014165	CGCGG	2	10	6033	6042	0 %	0 %	60 %	40 %	296268003
11	NC_014165	CGGGC	2	10	6601	6610	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014165	CCGCG	2	10	7821	7830	0 %	0 %	40 %	60 %	296268004
13	NC_014165	GGCGA	2	10	8065	8074	20 %	0 %	60 %	20 %	296268004
14	NC_014165	ACCGG	2	10	9663	9672	20 %	0 %	40 %	40 %	296268005
15	NC_014165	CTCGG	2	10	10337	10346	0 %	20 %	40 %	40 %	296268005
16	NC_014165	CGCGG	2	10	10912	10921	0 %	0 %	60 %	40 %	296268005
17	NC_014165	GGGCC	2	10	11011	11020	0 %	0 %	60 %	40 %	296268005
18	NC_014165	GATCC	2	10	11495	11504	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014165	CGGCG	2	10	11894	11903	0 %	0 %	60 %	40 %	296268006
20	NC_014165	TCGCC	2	10	13460	13469	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_014165	GTGAT	2	10	15330	15339	20 %	40 %	40 %	0 %	296268009
22	NC_014165	CGATC	2	10	15526	15535	20 %	20 %	20 %	40 %	296268009
23	NC_014165	CGGCC	2	10	16723	16732	0 %	0 %	40 %	60 %	296268011
24	NC_014165	CCAGC	2	10	17783	17792	20 %	0 %	20 %	60 %	296268011
25	NC_014165	TACCC	2	10	18767	18776	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_014165	GCCCG	2	10	19820	19829	0 %	0 %	40 %	60 %	296268013
27	NC_014165	CCGTG	2	10	20201	20210	0 %	20 %	40 %	40 %	296268013
28	NC_014165	ACCCG	2	10	20978	20987	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_014165	AGGAA	2	10	26425	26434	60 %	0 %	40 %	0 %	296268020
30	NC_014165	CGACG	2	10	28871	28880	20 %	0 %	40 %	40 %	296268021
31	NC_014165	ACGGC	3	15	31291	31305	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014165	GCCGG	2	10	31404	31413	0 %	0 %	60 %	40 %	296268023
33	NC_014165	GGTCA	2	10	33950	33959	20 %	20 %	40 %	20 %	296268026
34	NC_014165	CGGAC	2	10	34168	34177	20 %	0 %	40 %	40 %	296268026
35	NC_014165	CTCCG	2	10	35614	35623	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_014165	TCAGG	2	10	36793	36802	20 %	20 %	40 %	20 %	296268029
37	NC_014165	CTGTC	2	10	38782	38791	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014165	GACCG	2	10	40130	40139	20 %	0 %	40 %	40 %	296268030
39	NC_014165	CGGCG	2	10	41766	41775	0 %	0 %	60 %	40 %	296268031
40	NC_014165	ACGGC	2	10	41825	41834	20 %	0 %	40 %	40 %	296268031
41	NC_014165	CGCGC	2	10	42016	42025	0 %	0 %	40 %	60 %	296268031
42	NC_014165	GCCGG	2	10	42275	42284	0 %	0 %	60 %	40 %	296268031
43	NC_014165	CGCGG	2	10	42474	42483	0 %	0 %	60 %	40 %	296268031
44	NC_014165	GCCTC	2	10	43493	43502	0 %	20 %	20 %	60 %	296268032
45	NC_014165	TCGCG	2	10	44286	44295	0 %	20 %	40 %	40 %	296268033
46	NC_014165	GCCGA	2	10	45362	45371	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014165	CCTCC	2	10	46139	46148	0 %	20 %	0 %	80 %	296268037
48	NC_014165	AGCGC	2	10	47615	47624	20 %	0 %	40 %	40 %	296268037
49	NC_014165	CGGGC	2	10	47980	47989	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014165	CGTGC	2	10	48497	48506	0 %	20 %	40 %	40 %	296268038
51	NC_014165	CGGCC	2	10	48616	48625	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_014165	CGAGC	2	10	49553	49562	20 %	0 %	40 %	40 %	296268039
53	NC_014165	GCCCG	2	10	49625	49634	0 %	0 %	40 %	60 %	296268039
54	NC_014165	CGCGG	2	10	50227	50236	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014165	GCCCG	2	10	50562	50571	0 %	0 %	40 %	60 %	296268040
56	NC_014165	GCCCT	2	10	51339	51348	0 %	20 %	20 %	60 %	296268041
57	NC_014165	TGCCG	2	10	51502	51511	0 %	20 %	40 %	40 %	296268041
58	NC_014165	AGGCG	2	10	52160	52169	20 %	0 %	60 %	20 %	296268042
59	NC_014165	GCCCG	2	10	55027	55036	0 %	0 %	40 %	60 %	296268045
60	NC_014165	GGCCG	2	10	55086	55095	0 %	0 %	60 %	40 %	296268045
61	NC_014165	AGGGG	2	10	56057	56066	20 %	0 %	80 %	0 %	296268045
62	NC_014165	GCCGC	2	10	56092	56101	0 %	0 %	40 %	60 %	296268045
63	NC_014165	GCGCG	2	10	57140	57149	0 %	0 %	60 %	40 %	296268046
64	NC_014165	GGCCC	2	10	57263	57272	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_014165	GCCGT	2	10	57312	57321	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014165	GACGC	2	10	57551	57560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014165	GCCCG	2	10	58736	58745	0 %	0 %	40 %	60 %	296268048
68	NC_014165	CTGCT	2	10	59625	59634	0 %	40 %	20 %	40 %	296268049
69	NC_014165	GGCGG	2	10	59969	59978	0 %	0 %	80 %	20 %	296268049
70	NC_014165	CCATC	2	10	60357	60366	20 %	20 %	0 %	60 %	296268050
71	NC_014165	TCGGG	2	10	61296	61305	0 %	20 %	60 %	20 %	296268050
72	NC_014165	GCGCG	2	10	62199	62208	0 %	0 %	60 %	40 %	296268051
73	NC_014165	GGCCA	2	10	62533	62542	20 %	0 %	40 %	40 %	296268051
74	NC_014165	CCCGG	2	10	64137	64146	0 %	0 %	40 %	60 %	296268052
75	NC_014165	CGCTC	2	10	64752	64761	0 %	20 %	20 %	60 %	296268053
76	NC_014165	CGGCC	2	10	65845	65854	0 %	0 %	40 %	60 %	296268053
77	NC_014165	GCGGT	2	10	66950	66959	0 %	20 %	60 %	20 %	296268054
78	NC_014165	GCCGA	2	10	67357	67366	20 %	0 %	40 %	40 %	296268054
79	NC_014165	GGTGC	2	10	68036	68045	0 %	20 %	60 %	20 %	296268056
80	NC_014165	GCCGA	2	10	68328	68337	20 %	0 %	40 %	40 %	296268056
81	NC_014165	GTCCG	2	10	70410	70419	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014165	TGGCG	2	10	70540	70549	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014165	TGGCG	2	10	71251	71260	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014165	CACCG	2	10	73767	73776	20 %	0 %	20 %	60 %	296268059
85	NC_014165	GGCCG	2	10	73870	73879	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014165	GGCCG	2	10	73959	73968	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_014165	CCCGG	2	10	74738	74747	0 %	0 %	40 %	60 %	296268060
88	NC_014165	TCGGT	2	10	74930	74939	0 %	40 %	40 %	20 %	296268060
89	NC_014165	CCTCG	2	10	75099	75108	0 %	20 %	20 %	60 %	296268060
90	NC_014165	TGGGG	2	10	75462	75471	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014165	GCCCG	2	10	75788	75797	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_014165	GCGCC	2	10	77148	77157	0 %	0 %	40 %	60 %	296268061
93	NC_014165	GGCCG	2	10	77624	77633	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
94	NC_014165	CGCCC	2	10	79130	79139	0 %	0 %	20 %	80 %	296268062
95	NC_014165	CCCGG	2	10	79316	79325	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014165	AGCCG	2	10	79933	79942	20 %	0 %	40 %	40 %	296268063
97	NC_014165	CCGGG	2	10	80735	80744	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014165	GTCCG	2	10	84157	84166	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014165	CGGCC	2	10	84561	84570	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_014165	GGCGG	2	10	85968	85977	0 %	0 %	80 %	20 %	296268067
101	NC_014165	TGCCC	2	10	86156	86165	0 %	20 %	20 %	60 %	296268068
102	NC_014165	GGCGA	2	10	86830	86839	20 %	0 %	60 %	20 %	296268068
103	NC_014165	GACGG	2	10	89767	89776	20 %	0 %	60 %	20 %	296268071
104	NC_014165	ACGGC	2	10	91838	91847	20 %	0 %	40 %	40 %	296268073
105	NC_014165	CGGGG	2	10	92061	92070	0 %	0 %	80 %	20 %	296268073
106	NC_014165	GGCGA	2	10	92256	92265	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014165	TCGCC	2	10	92399	92408	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_014165	CGGGC	2	10	92610	92619	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014165	CCGAT	2	10	93269	93278	20 %	20 %	20 %	40 %	345462086
110	NC_014165	GGATG	2	10	94937	94946	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014165	CAAGC	2	10	96233	96242	40 %	0 %	20 %	40 %	296268075
112	NC_014165	GCCGC	2	10	97582	97591	0 %	0 %	40 %	60 %	296268077
113	NC_014165	CGCGG	2	10	97848	97857	0 %	0 %	60 %	40 %	296268077
114	NC_014165	GGCAG	2	10	97860	97869	20 %	0 %	60 %	20 %	296268077
115	NC_014165	GGCGC	2	10	99040	99049	0 %	0 %	60 %	40 %	296268080
116	NC_014165	CAGGT	2	10	99254	99263	20 %	20 %	40 %	20 %	296268080
117	NC_014165	GGCCG	2	10	100406	100415	0 %	0 %	60 %	40 %	296268081
118	NC_014165	GCCGA	2	10	103122	103131	20 %	0 %	40 %	40 %	296268085
119	NC_014165	GCGCC	2	10	103171	103180	0 %	0 %	40 %	60 %	296268085
120	NC_014165	CGCGT	2	10	104232	104241	0 %	20 %	40 %	40 %	296268087
121	NC_014165	CGCGC	2	10	104272	104281	0 %	0 %	40 %	60 %	296268087
122	NC_014165	GGCGG	2	10	107903	107912	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014165	GATCG	2	10	108405	108414	20 %	20 %	40 %	20 %	296268090
124	NC_014165	CGGCC	2	10	108762	108771	0 %	0 %	40 %	60 %	296268090
125	NC_014165	GCGCT	2	10	109071	109080	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_014165	GTGCC	2	10	110013	110022	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_014165	CCGGG	2	10	112492	112501	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014165	ACCGT	2	10	112856	112865	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014165	ACGGC	2	10	112890	112899	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014165	CGTGC	2	10	112971	112980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014165	CTCGG	2	10	114548	114557	0 %	20 %	40 %	40 %	296268094
132	NC_014165	TCCGG	2	10	115241	115250	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014165	CGGGC	2	10	115440	115449	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014165	GGTGC	2	10	115510	115519	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014165	CGGCT	2	10	115723	115732	0 %	20 %	40 %	40 %	296268095
136	NC_014165	GCCCG	2	10	116013	116022	0 %	0 %	40 %	60 %	296268095
137	NC_014165	ACGGC	2	10	116446	116455	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014165	CGTGC	2	10	116782	116791	0 %	20 %	40 %	40 %	296268096
139	NC_014165	CGGTG	2	10	119605	119614	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014165	GCGGA	2	10	121378	121387	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014165	CGATC	2	10	122066	122075	20 %	20 %	20 %	40 %	296268101
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143	NC_014165	TGGGT	2	10	124330	124339	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_014165	CGATT	2	10	125042	125051	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014165	GCCGA	2	10	126026	126035	20 %	0 %	40 %	40 %	296268103
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152	NC_014165	CGCCC	2	10	132672	132681	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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158	NC_014165	GACCG	2	10	135213	135222	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
159	NC_014165	CGGGC	2	10	136035	136044	0 %	0 %	60 %	40 %	296268111
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255	NC_014165	CGGCT	2	10	222957	222966	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
256	NC_014165	GACCG	2	10	223244	223253	20 %	0 %	40 %	40 %	296268179
257	NC_014165	GCCGA	2	10	224576	224585	20 %	0 %	40 %	40 %	296268179
258	NC_014165	CCGTG	2	10	227180	227189	0 %	20 %	40 %	40 %	296268181
259	NC_014165	TCCGC	2	10	230097	230106	0 %	20 %	20 %	60 %	296268183
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262	NC_014165	GGACC	2	10	234155	234164	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
263	NC_014165	GCCGG	2	10	234171	234180	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
264	NC_014165	ACCGG	2	10	234497	234506	20 %	0 %	40 %	40 %	296268186
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272	NC_014165	CCGAT	2	10	243972	243981	20 %	20 %	20 %	40 %	296268196
273	NC_014165	CCCCG	2	10	244192	244201	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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409	NC_014165	GCCGT	2	10	369084	369093	0 %	20 %	40 %	40 %	296268315
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443	NC_014165	GCGCC	2	10	397685	397694	0 %	0 %	40 %	60 %	296268341
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