MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 plasmid pTpau01

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014159	TCGATC	2	12	2605	2616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296141911
2	NC_014159	CTGATC	2	12	4194	4205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	296141914
3	NC_014159	GCCGGT	2	12	6061	6072	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141917
4	NC_014159	CGTGCC	2	12	7097	7108	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296141918
5	NC_014159	GCTGCG	2	12	7150	7161	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141918
6	NC_014159	CGCGAC	2	12	7269	7280	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296141918
7	NC_014159	TCACCG	2	12	7619	7630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	296141918
8	NC_014159	GCGTTC	2	12	7754	7765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141919
9	NC_014159	CTGCTC	2	12	9075	9086	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014159	CGCGGC	2	12	9435	9446	0 %	0 %	50 %	50 %	296141921
11	NC_014159	CCGGTC	2	12	10310	10321	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296141921
12	NC_014159	CCGGCA	2	12	11233	11244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296141921
13	NC_014159	GTCGAC	2	12	16827	16838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296141928
14	NC_014159	CCGCAC	2	12	20347	20358	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	296141932
15	NC_014159	CGGTGA	2	12	22188	22199	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296141933
16	NC_014159	AGCGGC	2	12	22551	22562	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296141934
17	NC_014159	GCCGCG	2	12	22942	22953	0 %	0 %	50 %	50 %	296141934
18	NC_014159	CGGGCG	2	12	24293	24304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296141935
19	NC_014159	TCTGCG	2	12	26030	26041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141936
20	NC_014159	CCGGCA	2	12	26048	26059	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296141936
21	NC_014159	CGTGGC	2	12	29060	29071	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014159	TCGGCG	2	12	29567	29578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141940
23	NC_014159	CGGAGC	2	12	31865	31876	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296141942
24	NC_014159	CTCCGC	2	12	34360	34371	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	296141945
25	NC_014159	GCCACG	2	12	40634	40645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014159	TGGCGG	2	12	49469	49480	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014159	CCCCTC	2	12	50594	50605	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	296141956
28	NC_014159	GTCGAG	2	12	52158	52169	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296141958
29	NC_014159	CCCGAG	2	12	55439	55450	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296141961
30	NC_014159	CAGCGC	2	12	55574	55585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296141961
31	NC_014159	GCCACG	2	12	59054	59065	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014159	CGATCG	2	12	61328	61339	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296141968
33	NC_014159	CGCGAT	2	12	61830	61841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296141968
34	NC_014159	GGTGAT	2	12	62133	62144	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	296141968
35	NC_014159	GCGGAG	2	12	64453	64464	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014159	TGCCGG	2	12	67754	67765	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014159	ACCGAC	2	12	67770	67781	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014159	GTCGGT	2	12	67886	67897	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014159	GGTCGT	2	12	71988	71999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296141977
40	NC_014159	CAGGGG	2	12	72301	72312	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	296141977
41	NC_014159	GCGACG	2	12	73344	73355	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296141977
42	NC_014159	CGAAGA	2	12	74412	74423	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296141977
43	NC_014159	CGGCCT	2	12	74499	74510	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296141977
44	NC_014159	GCGTCC	2	12	75098	75109	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296141977
45	NC_014159	GTCGCG	2	12	75622	75633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141978
46	NC_014159	CCGTGG	2	12	77468	77479	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141978
47	NC_014159	CCGGGT	2	12	78567	78578	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141978
48	NC_014159	GCGTCC	2	12	79984	79995	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296141978
49	NC_014159	CACGGT	2	12	80691	80702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296141979
50	NC_014159	GCCTCG	2	12	81025	81036	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296141979
51	NC_014159	GGCCGC	2	12	81162	81173	0 %	0 %	50 %	50 %	296141979
52	NC_014159	CCGGCG	2	12	81259	81270	0 %	0 %	50 %	50 %	296141979
53	NC_014159	GATCGA	2	12	81656	81667	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	296141979
54	NC_014159	GACGGG	2	12	83007	83018	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	296141979
55	NC_014159	GGGCGT	2	12	83581	83592	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296141980
56	NC_014159	CAGCGC	2	12	83675	83686	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296141980
57	NC_014159	CTGCGC	2	12	85926	85937	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296141982
58	NC_014159	TTGCCG	2	12	88060	88071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296141984
59	NC_014159	CGTCGA	2	12	89918	89929	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296141984
60	NC_014159	CGAGGC	2	12	90971	90982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296141984
61	NC_014159	CGACCA	2	12	92010	92021	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296141986
62	NC_014159	TCGCGG	2	12	92352	92363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296141986
63	NC_014159	TCCGCG	2	12	95283	95294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	296141989

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.