MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Tsukamurella paurometabola DSM 20162 plasmid pTpau01

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014159	ACCG	2	8	4538	4545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014159	ACTG	2	8	4863	4870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014159	GGAC	2	8	4928	4935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014159	GCAG	2	8	5278	5285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014159	TGGT	2	8	8568	8575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014159	GCTC	2	8	8680	8687	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014159	ACGT	2	8	9290	9297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014159	CGCT	2	8	12614	12621	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014159	GGAC	2	8	12644	12651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014159	TCAC	2	8	12817	12824	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014159	GGCC	2	8	12965	12972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014159	CTTC	2	8	13286	13293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014159	ACAT	2	8	14332	14339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014159	ACAT	2	8	15154	15161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014159	CTGC	2	8	15783	15790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014159	CGCA	2	8	16926	16933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014159	CCTC	2	8	18074	18081	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_014159	TGGT	2	8	18172	18179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014159	CCCA	2	8	19512	19519	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_014159	GCCT	2	8	19784	19791	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014159	GCTC	2	8	21228	21235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014159	TGGG	2	8	24130	24137	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014159	TGGC	2	8	27728	27735	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014159	CCGC	2	8	30015	30022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014159	CCGC	2	8	30042	30049	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_014159	GCCG	2	8	30137	30144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014159	CCAA	2	8	30847	30854	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014159	CACT	2	8	30919	30926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014159	TTGA	2	8	31026	31033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014159	GCAA	2	8	35294	35301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014159	GGCG	2	8	39363	39370	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014159	AGCG	2	8	39465	39472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014159	GGTC	2	8	39546	39553	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014159	GCCA	2	8	41970	41977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014159	ACCA	2	8	43388	43395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014159	GACG	2	8	49190	49197	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014159	GTGG	2	8	49259	49266	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014159	AGAT	2	8	51035	51042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014159	CATG	2	8	51902	51909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014159	CGTT	2	8	56868	56875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014159	GGTC	2	8	56964	56971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014159	CGAA	2	8	57256	57263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014159	TGGG	2	8	57369	57376	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014159	CCCG	2	8	57498	57505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_014159	GCCA	2	8	60390	60397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014159	TTCC	2	8	60904	60911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014159	TCGA	2	8	63772	63779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014159	TACG	2	8	64369	64376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014159	TGGG	2	8	64493	64500	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014159	GCCG	2	8	65182	65189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014159	GATC	2	8	65202	65209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014159	CCGG	2	8	65532	65539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014159	CTCA	2	8	65605	65612	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014159	CGAC	2	8	65691	65698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014159	GTCG	2	8	67401	67408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014159	GATG	2	8	67443	67450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014159	GGCT	2	8	68419	68426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014159	GCGG	2	8	68547	68554	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014159	CTGT	2	8	71057	71064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014159	TCGT	2	8	91117	91124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014159	CGAG	2	8	96888	96895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.